Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
QIVNSVDTMTLTNANVSPDGFTRAGILVNGVHGPLIRGGKNDNFELNVVNDLDNPTMLRPTSIHWHGLFQRGTNWADGAD
GVNQCPISPGHAFLYKFTPAGHAGTFWYHSHFGTQYCDGLRGPMVIYDDNDPHAALYDEDDENTIITLADWYHIPAPSIQ
GAAQPDATLINGKGRYVGGPAAELSIVNVEQGKKYRMRLISLSCDPNWQFSIDGHELTIIEVDGELTEPHTVDRLQIFTG
QRYSFVLDANQPVDNYWIRAQPNKGRNGLAGTFANGVNSAILRYAGAANADPTTSANPNPAQLNEADLHALIDPAAPGIP
TPGAADVNLRFQLGFSGGRFTINGTAYESPSVPTLLQIMSGAQSANDLLPAGSVYELPRNQVVELVVPAGVLGGPHPFHL
HGHAFSVVRSAGSSTYNFVNPVKRDVVSLGVTGDEVTIRFVTDNPGPWFFHCHIEFHLMNGLAIVFAEDMANTVDANNPP
VEWAQLCEIYDDLPPEATSIQTVV

The query sequence (length=504) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1a65:A 504 504 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 1hfu:A
2 4a2e:A 496 497 0.6032 0.6129 0.6117 0.0 4a2d:A, 4a2f:A, 4a2g:A, 4a2h:A, 5a7e:A, 5anh:A, 5anh:B, 5anh:C, 6h5y:A, 6h5y:B, 2hrg:A, 2hrh:A, 4jhu:A, 4jhv:A
3 2qt6:A 498 502 0.5933 0.6004 0.5956 0.0 2qt6:B
4 3kw7:A 502 505 0.5893 0.5916 0.5881 0.0 3kw7:B
5 5mej:A 499 498 0.5893 0.5952 0.5964 0.0 5e9n:A, 5mew:A, 5mhu:A, 5mhv:A, 5mhw:A, 5mhx:A, 5mhy:A, 5mhz:A, 5mi1:A, 5mi2:A, 5mia:A, 5mib:A, 5mic:A, 5mid:A, 5mie:A, 5mig:A, 6rgh:A, 6rgp:A, 6rhh:A, 6rhi:A, 6rho:A, 6rhp:A, 6rhr:A, 6rhu:A, 6rhx:A, 6ri0:A, 6ri2:A, 6ri4:A, 6ri6:A, 6ri8:A, 6rii:A, 6rik:A, 6ril:A
6 5z1x:A 495 493 0.5794 0.5899 0.5923 0.0 5z1x:B, 5z22:A
7 1gyc:A 499 494 0.5873 0.5932 0.5992 0.0
8 5nq7:A 497 501 0.5933 0.6016 0.5968 0.0 5nq8:A, 5nq9:A, 5nq9:C, 2xyb:A
9 3x1b:A 500 500 0.5833 0.5880 0.5880 0.0 3x1b:B
10 1kya:A 499 502 0.5813 0.5872 0.5837 0.0 1kya:B, 1kya:C, 1kya:D
11 3div:A 499 495 0.5675 0.5731 0.5778 0.0 3fpx:A, 2h5u:A, 5ldu:A, 3pxl:A, 3v9c:A
12 3t6v:A 495 494 0.5575 0.5677 0.5688 0.0 3t6v:B, 3t6v:C, 3t6w:A, 3t6w:B, 3t6w:C, 3t6x:A, 3t6x:B, 3t6x:C, 3t6z:A, 3t6z:B, 3t6z:C, 3t71:A, 3t71:B, 3t71:C
13 2hzh:A 499 491 0.5357 0.5411 0.5499 0.0
14 1v10:A 487 488 0.5456 0.5647 0.5635 0.0
15 5ehf:A 497 496 0.5397 0.5473 0.5484 0.0
16 3sqr:A 539 496 0.3512 0.3284 0.3569 1.73e-72 3v9e:A, 4x4k:A
17 3pps:A 564 516 0.3452 0.3085 0.3372 1.71e-62 3pps:B, 3pps:C, 3pps:D
18 6f5k:A 558 503 0.3333 0.3011 0.3340 2.26e-60
19 3fu7:A 559 503 0.3155 0.2844 0.3161 2.16e-55 3dkh:A, 3dkh:B, 3fu7:B, 3fu8:A, 3fu8:B, 3fu9:A, 3fu9:B, 1gw0:A, 1gw0:B, 2ih8:A, 2ih8:B, 2ih9:A, 2ih9:B, 2q9o:A, 2q9o:B, 3qpk:A, 3qpk:B
20 1zpu:A 529 512 0.3115 0.2968 0.3066 5.53e-54 1zpu:B, 1zpu:C, 1zpu:D, 1zpu:E, 1zpu:F
21 1aoz:A 552 509 0.2956 0.2699 0.2927 8.03e-52 1aoz:B, 1aso:A, 1aso:B, 1asp:A, 1asp:B, 1asq:A, 1asq:B
22 5lwx:A 554 510 0.3175 0.2888 0.3137 1.74e-50 5lm8:A, 5lww:A
23 8r7i:A 628 542 0.3075 0.2468 0.2860 1.01e-44
24 6klg:A 547 534 0.2917 0.2687 0.2753 1.99e-37 6kli:A, 6klj:A
25 7zn6:A 576 550 0.2917 0.2552 0.2673 2.21e-30
26 6vow:A 409 437 0.2282 0.2812 0.2632 2.21e-23
27 6vox:A 407 412 0.1964 0.2432 0.2403 1.87e-21
28 4e9v:A 317 232 0.1389 0.2208 0.3017 8.23e-18 4e9v:C, 4e9v:B, 4e9w:A, 4e9w:B, 4e9w:C, 4e9x:A, 4e9x:C, 4e9x:B, 4e9y:A, 4e9y:C, 4e9y:B, 2zwn:A, 2zwn:B, 2zwn:C
29 4e9v:A 317 72 0.0476 0.0757 0.3333 0.16 4e9v:C, 4e9v:B, 4e9w:A, 4e9w:B, 4e9w:C, 4e9x:A, 4e9x:C, 4e9x:B, 4e9y:A, 4e9y:C, 4e9y:B, 2zwn:A, 2zwn:B, 2zwn:C
30 4e9v:A 317 60 0.0357 0.0568 0.3000 6.4 4e9v:C, 4e9v:B, 4e9w:A, 4e9w:B, 4e9w:C, 4e9x:A, 4e9x:C, 4e9x:B, 4e9y:A, 4e9y:C, 4e9y:B, 2zwn:A, 2zwn:B, 2zwn:C
31 6w2k:A 440 466 0.2381 0.2727 0.2575 1.16e-16 5afa:A, 5g3b:A, 5g3c:A, 5g3d:A, 5g3e:A, 5g3f:A, 5g3g:A, 5g3h:A, 5jrr:A, 5jx9:A, 5k0d:A, 5k15:A, 5k3k:A, 5k5k:A, 5k7a:A, 5k84:A, 6q29:A, 6tyr:A, 6w2k:B, 6w9x:A, 6wcg:A, 6wch:A, 6wcl:A, 6wcm:A, 6wcn:A, 6wcp:A, 2xu9:A, 2yae:A, 2yaf:A, 2yah:A, 2yam:A, 2yao:A, 2yap:A, 2yaq:A, 2yar:A
32 3g5w:A 318 232 0.1468 0.2327 0.3190 2.70e-16 3g5w:B, 3g5w:C, 3g5w:D, 3g5w:E, 3g5w:F
33 3g5w:A 318 66 0.0437 0.0692 0.3333 0.002 3g5w:B, 3g5w:C, 3g5w:D, 3g5w:E, 3g5w:F
34 3zx1:A 471 457 0.2183 0.2335 0.2407 3.57e-11
35 6evg:A 444 484 0.2262 0.2568 0.2355 1.26e-10
36 6iqy:A 536 423 0.2163 0.2034 0.2577 4.85e-10 3abg:A, 3abg:B, 6i3j:A, 6i3j:B, 6i3k:A, 6i3k:B, 6i3l:A, 6i3l:B, 6iqx:A, 6iqx:B, 6iqy:B, 6iqz:A, 2xll:A, 2xll:B, 2xll:C, 2xll:D
37 3aw5:A 438 484 0.2202 0.2534 0.2293 6.08e-10 6k3d:A, 8p4g:A, 8p4g:B
38 6ttd:A 457 470 0.2103 0.2319 0.2255 1.37e-06 6syy:A, 6ttd:B
39 7f19:A 444 236 0.1131 0.1284 0.2415 6.85e-04 2yxv:A, 2yxv:B, 2yxw:A, 2yxw:B
40 7f19:A 444 73 0.0437 0.0495 0.3014 0.089 2yxv:A, 2yxv:B, 2yxw:A, 2yxw:B
41 5b7e:A 477 240 0.1171 0.1237 0.2458 8.96e-04 5b7f:A, 5b7m:A, 5b7m:B, 5b7m:C, 4ef3:A, 2fqd:A, 2fqe:A, 2fqf:A, 2fqg:A, 6im7:A, 1kv7:A, 1n68:A, 3nsc:A, 3nsd:A, 3nsy:A, 3nt0:A, 3pau:A, 3pav:A, 1pf3:A, 3qqx:A, 5ys1:A, 5ys5:A
42 5b7e:A 477 73 0.0437 0.0461 0.3014 0.095 5b7f:A, 5b7m:A, 5b7m:B, 5b7m:C, 4ef3:A, 2fqd:A, 2fqe:A, 2fqf:A, 2fqg:A, 6im7:A, 1kv7:A, 1n68:A, 3nsc:A, 3nsd:A, 3nsy:A, 3nt0:A, 3pau:A, 3pav:A, 1pf3:A, 3qqx:A, 5ys1:A, 5ys5:A
43 3gdc:A 288 215 0.1091 0.1910 0.2558 0.001 3gdc:B, 3gdc:C
44 3od3:A 488 242 0.1190 0.1230 0.2479 0.001 4e9q:A, 4e9r:A, 4e9s:A, 4e9t:A, 7f0v:A, 7f0v:B, 4hak:A, 4hal:A, 4ner:A, 3uaa:A, 3uab:A, 3uac:A, 3uad:A, 3uae:A
45 3od3:A 488 73 0.0437 0.0451 0.3014 0.100 4e9q:A, 4e9r:A, 4e9s:A, 4e9t:A, 7f0v:A, 7f0v:B, 4hak:A, 4hal:A, 4ner:A, 3uaa:A, 3uab:A, 3uac:A, 3uad:A, 3uae:A
46 6xj0:A 508 209 0.1032 0.1024 0.2488 0.002
47 6xj0:A 508 95 0.0575 0.0571 0.3053 0.004
48 9f1t:A 477 98 0.0655 0.0692 0.3367 0.005 9f1t:B, 9f3z:B, 9f3z:A
49 9f1t:A 477 140 0.0734 0.0776 0.2643 0.005 9f1t:B, 9f3z:B, 9f3z:A
50 5zl1:A 306 204 0.1012 0.1667 0.2500 0.017 5zl1:B, 5zl1:C, 5zl1:D
51 5n0k:A 1034 72 0.0397 0.0193 0.2778 0.024 5n4l:A, 5n4l:B
52 3ta4:F 282 73 0.0476 0.0851 0.3288 0.026 3t9w:A, 3ta4:E, 3ta4:D
53 6xiz:A 477 124 0.0675 0.0713 0.2742 0.027 6xiz:B, 6z0j:A, 6z0k:A
54 8aip:A 275 119 0.0714 0.1309 0.3025 0.081
55 8aip:A 275 121 0.0635 0.1164 0.2645 0.49
56 4ejx:A 1034 72 0.0377 0.0184 0.2639 0.091 4enz:A, 2j5w:A, 1kcw:A
57 7k66:A 1265 143 0.0794 0.0316 0.2797 0.25 1d7p:M, 3hnb:M, 7kbt:A, 6mf0:A, 6mf0:B, 4xzu:M
58 4bxs:V 1262 112 0.0536 0.0214 0.2411 0.27
59 4ako:A 506 262 0.1329 0.1324 0.2557 0.34 4a66:A, 4a67:A, 4a68:A, 4akp:A, 4akq:A, 2bhf:A, 1gsk:A, 1of0:A, 4q89:A, 4q89:B, 4q8b:A, 4q8b:B, 1w6l:A, 1w6w:A, 1w8e:A, 2wsd:A, 2x87:A, 2x88:A, 7y8b:A, 7y8b:B, 7y8c:A, 7y8c:B, 4yvn:A, 4yvu:A, 3zdw:A, 5zlj:A, 5zlk:A, 5zll:A, 5zlm:A
60 6mf2:A 1222 130 0.0714 0.0295 0.2769 0.59 4bdv:A, 4bdv:B, 3cdz:B, 3j2q:B, 5k8d:A, 5k8d:B, 2r7e:B
61 7rab:A 299 122 0.0655 0.1104 0.2705 1.0 7rab:B, 7rab:C, 7rab:D, 7rab:E, 7rab:F, 7rab:G, 7rab:H, 7rac:A, 7rac:B, 7rac:C, 7rac:D, 7rac:E, 7rac:F, 7rac:G, 7rac:H, 7rac:I, 7rac:J, 7rac:K, 7rac:L
62 7kwo:A 1200 124 0.0675 0.0283 0.2742 1.9
63 2r7e:A 693 115 0.0635 0.0462 0.2783 2.5
64 3cdz:A 630 115 0.0635 0.0508 0.2783 2.8 3j2q:A
65 3tas:B 301 77 0.0437 0.0731 0.2857 3.0 6fc7:A, 6fc7:B, 6fc7:C, 6fc7:D, 6fc7:E, 6fc7:F, 6fc7:G, 6fc7:H, 6fc7:I, 6fc7:J, 6fc7:L, 6fc7:K, 6fdj:A, 6fdj:B, 6fdj:C, 6fdj:D, 6fdj:F, 6fdj:E, 6fdj:G, 6fdj:I, 6fdj:H, 6fdj:J, 6fdj:K, 6fdj:L, 5lhl:A, 5lhl:B, 5lhl:C, 5lhl:D, 5lhl:F, 5lhl:E, 4m3h:A, 4m3h:B, 4m3h:C, 5mkm:A, 5mkm:B, 5mkm:C, 5mkm:D, 5mkm:E, 5mkm:F, 5o3k:A, 5o3k:C, 5o3k:B, 5o3k:D, 5o3k:E, 5o3k:F, 5o3k:G, 5o3k:H, 5o3k:I, 5o3k:J, 5o3k:K, 5o3k:L, 5o4i:A, 5o4i:B, 5o4i:C, 5o4i:D, 5o4i:E, 5o4i:F, 5o4i:G, 5o4i:H, 5o4i:I, 5o4i:J, 5o4i:K, 5o4i:L, 5o4q:A, 5o4q:B, 5o4q:C, 5o4q:D, 5o4q:E, 5o4q:F, 5o4q:G, 5o4q:H, 5o4q:I, 5o4q:J, 5o4q:K, 5o4q:L, 8p9u:A, 8p9u:C, 8p9u:B, 8p9u:D, 8p9u:F, 8p9u:E, 8p9v:A, 8p9v:B, 8p9v:C, 8p9v:D, 8p9v:E, 8p9v:F, 7pen:A, 7pen:B, 7pen:C, 7pen:D, 7pen:E, 7pen:F, 7pes:A, 7pes:B, 7pes:C, 7pes:D, 7pes:E, 7pes:F, 7pfr:A, 7pfr:B, 7pfr:C, 7pfr:D, 7pfr:E, 7pfr:F, 7ptm:A, 7ptm:C, 7ptm:B, 7ptm:D, 7ptm:F, 7ptm:E, 7pu0:A, 7pu0:B, 7pu0:C, 7pu0:D, 7pu0:E, 7pu0:F, 7puh:A, 7puh:C, 7puh:B, 7puh:D, 7puh:F, 7puh:E, 6rh9:A, 6rh9:B, 6rh9:C, 6rh9:D, 6rh9:E, 6rh9:F, 6rh9:G, 6rh9:H, 6rh9:I, 6rh9:J, 6rh9:K, 6rh9:L, 6rhq:A, 6rhq:B, 6rhq:C, 6rhq:D, 6rhq:E, 6rhq:F, 6s0o:A, 6s0o:B, 6s0o:C, 6s0o:D, 6s0o:E, 6s0o:F, 3tas:A, 3tas:C, 3tbb:A, 3tbb:B, 3tbb:C, 3tbc:A, 3tbc:B, 3tbc:C, 4uah:A, 4uah:B, 4uah:C, 4uan:A, 4uan:B, 4uan:C, 4w1t:A, 4w1t:B, 4w1t:C, 4wtq:A, 4wtq:B, 4wtq:C, 6y4a:AAA, 6y4a:BBB, 6y4a:CCC, 6yo5:AAA, 6yo5:BBB, 6yo5:CCC, 6yzd:AAA, 6yzd:BBB, 6yzd:CCC, 6yzf:CCC, 6yzf:AAA, 6yzf:BBB, 6yzy:AAA, 6yzy:BBB, 6yzy:CCC, 6zij:A, 6zij:C, 6zij:B, 6zij:D, 6zij:F, 6zij:E, 6zip:A, 6zip:B, 6zip:C, 6zip:D, 6zip:E, 6zip:F, 6zip:G, 6zip:H, 6zip:I, 6zip:J, 6zip:L, 6zip:K
66 7b2k:A 282 76 0.0397 0.0709 0.2632 3.5 7b2k:B, 7b4y:A, 7b4y:B, 7bdn:A, 7bdn:B, 7bfm:A, 7bfm:C, 3cg8:A, 3cg8:C, 3cg8:B, 4gxf:A, 4gxf:B, 4gxf:C, 4gy4:A, 4gy4:B, 4gy4:C, 4gyb:A, 3kw8:A, 4naj:A, 4nb7:A, 8u8p:A, 8u8p:C, 8u8p:B, 8u8q:A, 8u8q:B, 8u8q:C, 8u8r:A, 8u8r:B, 8u8r:C, 8u8s:A, 8u8s:B, 8u8s:C, 8u8t:A, 8u8t:C, 8u8t:B, 7w6v:A
67 5akr:A 337 44 0.0317 0.0475 0.3636 3.9 2avf:A, 2avf:B, 2avf:C, 2avf:D, 2avf:E, 2avf:F, 2bw4:A, 2bw5:A, 2bwd:A, 2bwi:A, 6gb8:A, 6gbb:A, 6gby:A, 6gcg:A, 6gsq:A, 6gt0:A, 6gt2:A, 6gti:A, 6gtj:A, 6gtk:A, 6gtl:A, 6gtn:A, 5i6k:A, 5i6l:A, 5i6m:A, 5i6n:A, 5i6o:A, 5i6p:A, 1kcb:A, 6knf:A, 6knf:B, 6knf:C, 6kng:A, 6kng:B, 6kng:C, 5n8f:A, 5n8g:A, 5n8h:A, 5n8i:A, 1nia:A, 1nia:B, 1nia:C, 1nib:A, 1nib:B, 1nib:C, 1nic:A, 1nid:A, 1nie:A, 1nif:A, 2nrd:A, 5of5:A, 5of6:A, 5of7:A, 5of8:A, 5ofc:A, 5ofd:A, 5ofe:A, 5off:A, 5ofg:A, 5ofh:A, 5og2:A, 5og3:A, 5og4:A, 5og5:A, 5og6:A, 5ogf:A, 5ogg:A, 6qwg:A, 1rzp:A, 1rzp:B, 1rzp:C, 1rzq:A, 1rzq:B, 1rzq:C, 2y1a:A, 6zu6:A, 6zua:A, 6zub:A, 6zud:A, 6zut:A
68 2ihn:A 299 22 0.0198 0.0334 0.4545 4.6
69 5ju7:A 107 52 0.0337 0.1589 0.3269 5.7
70 7olc:SB 232 122 0.0675 0.1466 0.2787 5.9 7old:SB, 8oo0:SB, 5oql:l, 7r81:C2, 6rxt:Ca, 6rxu:Ca, 6rxv:Ca, 6rxx:Ca, 7z3n:SB, 7z3o:SB
71 4n8u:B 276 83 0.0476 0.0870 0.2892 6.3 4n8u:A, 4n8u:C
72 1ndr:A 330 46 0.0298 0.0455 0.3261 7.0 1ndr:B, 1ndr:C, 1nds:A, 1nds:B, 1nds:C
73 8bjd:A 208 65 0.0417 0.1010 0.3231 8.9 8bje:A, 8bk5:A, 2vcd:A
74 2e52:A 299 31 0.0258 0.0435 0.4194 9.0 3a4k:A, 3a4k:B, 3a4k:C, 3a4k:D, 2e52:B, 2e52:C, 2e52:D, 3wvg:C, 3wvg:D, 3wvg:A, 3wvg:B, 3wvh:B, 3wvh:A, 3wvh:D, 3wvh:C, 3wvi:A, 3wvi:B, 3wvi:C, 3wvi:D, 3wvk:D, 3wvk:A, 3wvk:B, 3wvk:C, 3wvp:C, 3wvp:D, 3wvp:A, 3wvp:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218