BioLiP

>protein
PLVKRLREQPQNILTYLSISPVLSGDKLLGYRLNPGKDASLFRQSGLQANDLAIALNGIDLRDQEQAQQALQNLADMTEI
TLTVEREGQRHDIAFAL

The query sequence (length=97) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5hj1:A	97	97	1.0000	1.0000	1.0000	2.03e-66
2	1af0:A	470	42	0.1546	0.0319	0.3571	0.052	5d7w:A, 4i35:A, 1sat:A, 1smp:A, 1srp:A
3	4e34:A	87	44	0.1546	0.1724	0.3409	0.064	4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
4	4wyu:A	201	48	0.1649	0.0796	0.3333	0.31	8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
5	7ok0:B	1109	48	0.1546	0.0135	0.3125	0.81	7oq4:B, 7oqy:B
6	4ydp:A	83	77	0.2268	0.2651	0.2857	1.1	4ydp:B
7	6x23:A	89	51	0.1753	0.1910	0.3333	1.2
8	4jj0:A	181	45	0.1443	0.0773	0.3111	1.5	4jj0:B, 4jj3:A, 4jj3:B
9	7ptr:A	725	48	0.1340	0.0179	0.2708	1.6	7ptr:B, 7ptr:C, 7ptr:D, 7ptr:E, 7ptr:F, 7ptu:A, 7ptu:B, 7ptu:C, 7ptu:D, 7ptu:E
10	8wwy:D	135	80	0.2474	0.1778	0.3000	2.7
11	7pub:IB	511	31	0.1237	0.0235	0.3871	3.0	7pua:IB
12	5heb:A	119	36	0.1443	0.1176	0.3889	3.0	1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
13	7esn:A	435	78	0.2268	0.0506	0.2821	3.5	7esk:A, 7esm:A, 8i4d:A, 7yqs:A
14	5ha5:D	244	52	0.1649	0.0656	0.3077	4.7	5ha5:B, 5ha5:C
15	7qct:A	90	55	0.2062	0.2222	0.3636	5.7	7qct:B
16	3vqg:A	85	47	0.1753	0.2000	0.3617	6.2
17	7p70:A	407	47	0.1546	0.0369	0.3191	6.7	7pc4:A, 7qql:A
18	5j06:B	215	46	0.1340	0.0605	0.2826	7.6	7aw6:A, 7aw6:B, 6d49:A, 6d49:B, 6d4a:A, 6d4a:B, 5j06:D, 5j0b:A, 5j0b:B, 5j0b:C
19	4qoq:A	481	42	0.1340	0.0270	0.3095	7.8	4qol:A, 4qol:B, 4qol:C, 4qol:D, 4qom:A, 4qom:B, 4qom:C, 4qom:D, 4qon:A, 4qon:B, 4qon:C, 4qon:D, 4qoo:A, 4qoo:B, 4qoo:C, 4qoo:D, 4qop:A, 4qop:B, 4qop:C, 4qop:D, 4qoq:B, 4qoq:C, 4qoq:D, 4qor:A, 4qor:B, 4qor:C, 4qor:D
20	6xa7:B	96	81	0.2062	0.2083	0.2469	8.3	7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
21	2vs1:A	398	35	0.1340	0.0327	0.3714	9.0	2jjq:A
22	5wou:A	95	44	0.1753	0.1789	0.3864	9.2

[Back]