BioLiP

>protein
PLRVPPSAPARLVVLASGTGSLLRSLLDAAVGDYPARVVAVGVDRECRAAEIAAEASVPVFTVRLADHPSRDAWDVAITA
ATAAHEPDLVVSAGFMRILGPQFLSRFYGRTLNTHPALLPAFPGTHGVADALAYGVKVTGATVHLVDAGTDTGPILAQQP
VPVLDGDDEETLHERIKVTERRLLVAAVAALATHGVTVVGRTATM

The query sequence (length=205) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3da8:A	213	205	1.0000	0.9624	1.0000	5.81e-144	3da8:B, 3dcj:A, 3dcj:B
2	2ywr:A	216	194	0.3463	0.3287	0.3660	9.01e-36
3	4ew2:A	205	186	0.3366	0.3366	0.3710	2.81e-33	4ew3:A, 8fdx:A, 8fdy:A, 8fdz:A, 8fe0:A, 8fjv:A, 8fjw:A, 8fjx:A, 8fjy:A, 5j9f:A, 7jg0:A, 7jg3:A, 7jg4:A, 1men:A, 1men:B, 1men:C, 1njs:A, 1njs:B, 1rbm:A, 1rbm:B, 1rbq:A, 1rbq:B, 1rbq:C, 1rbq:D, 1rby:A, 1rby:B, 1rby:C, 1rby:D, 1rbz:A, 1rbz:B, 1rc0:A, 1rc0:B, 1rc1:A, 1rc1:B, 1zly:A, 4zyt:A, 4zyu:A, 4zyv:A, 4zyw:A, 4zyx:A, 4zyy:A, 4zyz:A, 4zz0:A, 4zz1:A, 4zz2:A, 4zz3:A
4	1c2t:A	209	184	0.3268	0.3206	0.3641	3.38e-31	1c2t:B, 1c3e:A, 1c3e:B, 1cde:A, 1cde:B, 1cde:C, 1cde:D, 1gar:A, 1gar:B, 1jkx:A, 1jkx:B, 1jkx:C, 1jkx:D
5	5vyt:C	256	93	0.1561	0.1250	0.3441	3.56e-11	5vyr:A, 5vyr:B, 5vys:A, 5vys:B, 5vyt:A, 5vyt:B, 5vyt:D, 5vyu:A, 5vyu:B
6	6edk:A	193	102	0.1561	0.1658	0.3137	9.53e-11	6ci4:A, 6ci5:A
7	6v2t:B	251	108	0.1707	0.1394	0.3241	1.45e-09	6v2t:A
8	4xcz:A	397	128	0.1756	0.0907	0.2812	1.52e-09	4xd0:A, 4xd1:A
9	6mg0:B	1687	83	0.1561	0.0190	0.3855	2.00e-09
10	6mfz:A	1789	83	0.1561	0.0179	0.3855	2.21e-09	5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
11	8gjh:A	639	132	0.1951	0.0626	0.3030	2.85e-08	8gjh:B, 8gjh:C, 8gjh:D, 8gjh:E, 8gjh:F
12	1z7e:D	644	146	0.2000	0.0637	0.2808	3.76e-07	2bln:A, 2bln:B, 5j63:A, 5j63:B, 5j63:C, 5j63:D, 1z7e:A, 1z7e:B, 1z7e:C, 1z7e:E, 1z7e:F
13	5uin:A	399	103	0.1415	0.0727	0.2816	4.25e-07	5uij:A, 5uij:B, 5uik:A, 5uik:B, 5uil:A, 5uil:B, 5uim:A, 5uim:B, 5uin:B
14	4qpd:A	308	80	0.1463	0.0974	0.3750	6.05e-07	4qpd:B, 4tt8:A, 4tts:A
15	6nbp:A	246	120	0.1756	0.1463	0.3000	6.11e-06
16	5vyq:A	235	82	0.1220	0.1064	0.3049	2.35e-05	4q12:A, 4q12:B, 5vyq:B
17	2cfi:A	310	79	0.1366	0.0903	0.3544	3.69e-05	1s3i:A
18	2fmt:A	314	142	0.1805	0.1178	0.2606	9.59e-05	2fmt:B
19	6v33:A	246	82	0.1171	0.0976	0.2927	1.79e-04	6v33:B
20	4nv1:E	242	91	0.1073	0.0909	0.2418	7.34e-04	4nv1:C, 4nv1:D, 4nv1:F, 4nv1:B, 4nv1:A, 4nv1:G, 4nv1:H
21	4lxq:B	274	54	0.0829	0.0620	0.3148	0.002	4lxq:A, 4lxt:A, 4lxt:B, 4lxu:A, 4lxu:B, 4lxx:A, 4lxx:B, 4lxy:A, 4lxy:B, 4ly0:A, 4ly0:B, 4ly3:A, 4ly3:B
22	7n7b:B	271	58	0.0829	0.0627	0.2931	0.004	7n7b:A, 7n7c:A, 7n7c:B
23	3r8x:A	309	89	0.1171	0.0777	0.2697	0.007
24	7wi4:A	410	100	0.1366	0.0683	0.2800	2.7	7wi4:D, 7wi4:E, 7wi4:F, 7wi4:B, 7wi4:C
25	6opc:B	741	21	0.0488	0.0135	0.4762	5.2	8dar:A, 8dar:B, 8dar:C, 8dar:D, 8dar:E, 8dar:F, 8das:A, 8das:B, 8das:C, 8das:D, 8das:E, 8das:F, 8dat:A, 8dat:B, 8dat:C, 8dat:D, 8dat:E, 8dat:F, 8dau:A, 8dau:B, 8dau:C, 8dau:D, 8dau:E, 8dau:F, 8dav:A, 8dav:B, 8dav:C, 8dav:D, 8dav:E, 8dav:F, 8daw:A, 8daw:B, 8daw:C, 8daw:D, 8daw:E, 8daw:F, 6oa9:A, 6oa9:B, 6oa9:C, 6oa9:E, 6oa9:F, 6oaa:B, 6oaa:C, 6oaa:D, 6oab:D, 6oab:B, 6oab:C, 6oab:A, 6omb:A, 6omb:B, 6omb:C, 6omb:D, 6omb:E, 6opc:A, 6opc:C, 6opc:D, 6opc:E
26	6oa9:D	489	21	0.0488	0.0204	0.4762	5.5	6oaa:E, 6oab:E
27	6xm7:A	488	33	0.0585	0.0246	0.3636	6.0	6xm6:A, 6xm8:A, 6xm9:A, 6xma:A
28	5vc7:A	544	19	0.0390	0.0147	0.4211	6.2	5vc7:C, 5vc7:D, 5vc7:E, 5vc7:F, 5vc7:G
29	3jze:A	344	99	0.1415	0.0843	0.2929	6.2	3jze:B, 3jze:C, 3jze:D
30	5kqb:A	145	52	0.0780	0.1103	0.3077	9.0	5kqc:A
31	4nz2:A	464	26	0.0585	0.0259	0.4615	9.8	4nz2:B

[Back]