Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PLGSRHVACLARSEGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEGGAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLT
AASPTIALLLERE

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6xa7:B 96 94 1.0000 0.9688 0.9894 5.69e-60 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
2 5wou:A 95 79 0.4409 0.4316 0.5190 6.57e-23
3 8b82:A 108 87 0.4516 0.3889 0.4828 7.10e-21 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
4 8bq8:C 93 93 0.3978 0.3978 0.3978 8.88e-18 8bq8:A, 8bq8:B
5 7pc3:A 405 75 0.3871 0.0889 0.4800 8.57e-17 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
6 2ka9:A 189 83 0.3656 0.1799 0.4096 5.86e-16 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
7 2ka9:A 189 80 0.3763 0.1852 0.4375 3.32e-13 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
8 2l4t:A 124 81 0.3763 0.2823 0.4321 4.95e-15 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
9 7p73:A 420 77 0.3763 0.0833 0.4545 2.30e-14 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
10 8cn1:H 101 80 0.3656 0.3366 0.4250 2.36e-14 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
11 1n7t:A 103 80 0.3656 0.3301 0.4250 4.84e-14 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
12 7qqm:A 413 94 0.3656 0.0823 0.3617 1.78e-13
13 3ch8:A 190 83 0.3763 0.1842 0.4217 1.81e-13 2qbw:A
14 5heb:A 119 89 0.3656 0.2857 0.3820 2.85e-12 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
15 8bv7:A 95 60 0.2688 0.2632 0.4167 3.00e-12 8buw:A, 8buw:B
16 4wyu:A 201 80 0.3656 0.1692 0.4250 3.38e-12 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
17 4wyu:A 201 95 0.3763 0.1741 0.3684 4.04e-09 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
18 6q0m:B 94 80 0.3333 0.3298 0.3875 5.38e-12
19 2r4h:C 98 80 0.2903 0.2755 0.3375 5.78e-12
20 3jxt:A 96 71 0.3441 0.3333 0.4507 5.48e-11 3jxt:B
21 8bp4:A 93 96 0.3656 0.3656 0.3542 4.55e-10 8bp4:C, 8bp4:B
22 7p70:A 407 74 0.3333 0.0762 0.4189 7.23e-10 7pc4:A, 7qql:A
23 2pdz:A 86 74 0.3226 0.3488 0.4054 8.85e-10
24 4e34:A 87 67 0.3011 0.3218 0.4179 1.54e-09 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
25 8c1t:A 90 86 0.3011 0.3111 0.3256 1.56e-09 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
26 2m0z:A 97 84 0.3548 0.3402 0.3929 4.79e-09 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
27 1ihj:B 95 88 0.2903 0.2842 0.3068 1.60e-08 1ihj:A
28 2qt5:A 194 89 0.3226 0.1546 0.3371 1.83e-08 2qt5:B
29 2qt5:A 194 91 0.3118 0.1495 0.3187 4.46e-06 2qt5:B
30 2exg:A 101 99 0.3226 0.2970 0.3030 3.88e-08 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
31 6yx0:B 112 101 0.3441 0.2857 0.3168 4.10e-08 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
32 2os6:A 89 61 0.2688 0.2809 0.4098 4.32e-08
33 7x2e:A 163 78 0.3011 0.1718 0.3590 6.69e-08 2kbs:A
34 6gbe:A 119 87 0.2688 0.2101 0.2874 1.47e-07
35 2i0i:A 81 63 0.2903 0.3333 0.4286 1.84e-07 2i0i:B, 2i0i:C
36 2ejy:A 85 45 0.2366 0.2588 0.4889 3.57e-07
37 3vqg:A 85 64 0.2366 0.2588 0.3438 4.02e-07
38 1rzx:A 98 79 0.2688 0.2551 0.3165 4.64e-07 5i7z:A, 1x8s:A
39 7d6f:A 87 78 0.2688 0.2874 0.3205 8.16e-07
40 6x23:A 89 92 0.3011 0.3146 0.3043 1.03e-06
41 7qqn:C 414 74 0.2688 0.0604 0.3378 1.11e-06 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
42 2koh:A 111 73 0.2688 0.2252 0.3425 1.14e-06 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
43 1n7f:A 86 78 0.2581 0.2791 0.3077 1.73e-06 1n7f:B
44 4wsi:A 372 55 0.2151 0.0538 0.3636 2.24e-06 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
45 2m0u:A 117 85 0.2903 0.2308 0.3176 2.89e-06
46 4xhv:A 94 86 0.2903 0.2872 0.3140 2.92e-06
47 2kaw:A 90 70 0.2581 0.2667 0.3429 8.40e-06 6lcb:A, 2mx6:A
48 7pcb:A 415 93 0.3333 0.0747 0.3333 1.84e-05 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
49 1l6o:A 95 70 0.2366 0.2316 0.3143 2.03e-05 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
50 6nid:B 88 52 0.2043 0.2159 0.3654 2.62e-05 6nid:A, 6nid:C
51 7qct:A 90 63 0.2258 0.2333 0.3333 3.02e-05 7qct:B
52 5f67:A 98 58 0.2581 0.2449 0.4138 3.53e-05 5f67:B
53 1zub:A 109 79 0.2258 0.1927 0.2658 1.20e-04
54 5ez0:D 95 68 0.2473 0.2421 0.3382 1.68e-04 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
55 1b8q:A 127 79 0.2581 0.1890 0.3038 4.15e-04
56 6zbq:A 89 49 0.1720 0.1798 0.3265 7.59e-04 6zc4:A
57 6hks:B 94 82 0.2796 0.2766 0.3171 0.001 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
58 7pc5:A 405 69 0.2258 0.0519 0.3043 0.001
59 3cyy:B 81 58 0.1935 0.2222 0.3103 0.001 3cyy:A
60 5zys:A 90 75 0.2688 0.2778 0.3333 0.003
61 2egn:A 83 52 0.2043 0.2289 0.3654 0.004
62 1u38:A 89 29 0.1183 0.1236 0.3793 0.004
63 6kz1:A 97 45 0.1720 0.1649 0.3556 0.005 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
64 7weg:B 96 78 0.2366 0.2292 0.2821 0.005 7weg:A
65 4xh7:A 110 87 0.2473 0.2091 0.2644 0.009
66 5gmj:B 224 86 0.2796 0.1161 0.3023 0.017 5gmi:A, 5gmi:B, 5gmj:A, 5h3j:A
67 8blu:B 195 60 0.2258 0.1077 0.3500 0.16 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
68 2kpl:A 129 76 0.1935 0.1395 0.2368 0.21
69 5n7d:A 423 76 0.1935 0.0426 0.2368 0.30 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
70 2m0v:A 128 80 0.2581 0.1875 0.3000 0.43
71 7t2r:C 152 46 0.1505 0.0921 0.3043 0.72 7t2r:H
72 3pv3:A 392 60 0.2151 0.0510 0.3333 0.85 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
73 5oak:A 90 45 0.1613 0.1667 0.3333 0.87 5oak:C
74 3th0:A 552 59 0.2366 0.0399 0.3729 1.3 1tyu:A, 1tyw:A, 1tyx:A
75 5izu:A 124 81 0.3011 0.2258 0.3457 1.7 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
76 4d1t:A 229 54 0.2151 0.0873 0.3704 1.8 4d1u:A, 4d1v:A, 4d1w:A, 2y87:A, 2y8a:A, 2y8b:A
77 7w6z:A 414 56 0.1935 0.0435 0.3214 2.6 7w6y:A
78 8kar:A 414 66 0.2258 0.0507 0.3182 5.4 8kao:C, 8kar:B, 8kar:C
79 7xr4:A 425 34 0.1828 0.0400 0.5000 5.5 7vr7:A, 7vr8:A, 7xr4:B, 7xr4:C, 7xr6:A, 7xr6:B, 7xr6:C
80 1h7a:A 563 69 0.2366 0.0391 0.3188 6.0 1h78:A, 1h79:A, 1h7b:A, 1hk8:A
81 8xud:D 651 47 0.1398 0.0200 0.2766 6.9 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C
82 5zm3:B 286 27 0.1075 0.0350 0.3704 9.0 7wpy:A, 7wpy:B, 7wpy:C, 7wpy:D, 5zm3:A, 5zm3:C, 5zm3:D, 5zm4:A, 5zm4:B, 5zm4:C, 5zm4:D
83 1isv:A 436 42 0.1398 0.0298 0.3095 9.4 2d20:A, 2d20:B, 2d22:A, 2d22:B, 2d23:A, 2d23:B, 2d24:A, 2d24:B, 1e0v:A, 1e0x:A, 1e0x:B, 2g3j:A, 5gqd:A, 5gqd:B, 5gqe:A, 5gqe:B, 1isv:B, 1isw:A, 1isw:B, 1isx:A, 1isx:B, 1isy:A, 1isy:B, 1isz:A, 1isz:B, 1it0:A, 1it0:B, 1od8:A, 1v0k:A, 1v0l:A, 1v0m:A, 1v0n:A, 1v6u:A, 1v6u:B, 1v6v:A, 1v6v:B, 1v6w:A, 1v6w:B, 1v6x:A, 1v6x:B
84 1e6y:A 568 77 0.2366 0.0387 0.2857 9.7 1e6y:D, 8gf5:A, 8gf5:B
85 5hj1:A 97 78 0.2151 0.2062 0.2564 9.8

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417