Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PLGSEVIQALIFKDDGSLGLSISGGVGSSSFKSGDDGIFVSKIAKGGPCDNEGTLKIGDKILSVNEISFTGITHEKAVEI
LKNDSKYMVVVER

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8bv7:A 95 94 1.0000 0.9789 0.9894 1.23e-59 8buw:A, 8buw:B
2 6xa7:B 96 94 0.4409 0.4271 0.4362 2.16e-21 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
3 8bq8:C 93 94 0.4624 0.4624 0.4574 1.39e-18 8bq8:A, 8bq8:B
4 8b82:A 108 72 0.3333 0.2870 0.4306 3.54e-17 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
5 5wou:A 95 77 0.4086 0.4000 0.4935 3.86e-17
6 2ka9:A 189 94 0.4194 0.2063 0.4149 7.32e-16 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
7 2ka9:A 189 66 0.3226 0.1587 0.4545 6.85e-10 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
8 7pc3:A 405 73 0.3656 0.0840 0.4658 2.39e-15 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
9 8bp4:A 93 92 0.3871 0.3871 0.3913 9.58e-14 8bp4:C, 8bp4:B
10 1n7t:A 103 83 0.3871 0.3495 0.4337 8.20e-13 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
11 2m0z:A 97 88 0.3118 0.2990 0.3295 4.36e-12 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
12 3ch8:A 190 67 0.3441 0.1684 0.4776 1.15e-11 2qbw:A
13 8cn1:H 101 66 0.3333 0.3069 0.4697 1.83e-11 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
14 7qqm:A 413 68 0.3548 0.0799 0.4853 1.83e-11
15 3jxt:A 96 83 0.3441 0.3333 0.3855 2.41e-11 3jxt:B
16 2exg:A 101 90 0.3656 0.3366 0.3778 1.75e-10 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
17 2qt5:A 194 79 0.3011 0.1443 0.3544 2.08e-10 2qt5:B
18 2qt5:A 194 88 0.3011 0.1443 0.3182 3.21e-05 2qt5:B
19 4wyu:A 201 77 0.2903 0.1343 0.3506 2.71e-10 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
20 4wyu:A 201 73 0.3118 0.1443 0.3973 4.55e-07 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
21 5heb:A 119 87 0.3333 0.2605 0.3563 5.29e-10 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
22 6q0m:B 94 95 0.3763 0.3723 0.3684 7.90e-10
23 2l4t:A 124 78 0.3118 0.2339 0.3718 1.07e-09 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
24 7p73:A 420 66 0.2903 0.0643 0.4091 1.37e-08 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
25 1l6o:A 95 66 0.2688 0.2632 0.3788 1.38e-08 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
26 2pdz:A 86 77 0.3333 0.3605 0.4026 1.49e-08
27 8c1t:A 90 80 0.2473 0.2556 0.2875 3.06e-08 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
28 2kaw:A 90 65 0.2581 0.2667 0.3692 3.68e-08 6lcb:A, 2mx6:A
29 4e34:A 87 79 0.3118 0.3333 0.3671 5.19e-08 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
30 2koh:A 111 71 0.2688 0.2252 0.3521 9.86e-08 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
31 2r4h:C 98 66 0.2151 0.2041 0.3030 1.10e-07
32 3tsz:A 341 70 0.3011 0.0821 0.4000 2.80e-07 3shw:A
33 7p70:A 407 75 0.3226 0.0737 0.4000 3.32e-07 7pc4:A, 7qql:A
34 6zbq:A 89 49 0.2043 0.2135 0.3878 6.64e-07 6zc4:A
35 2i0i:A 81 87 0.3226 0.3704 0.3448 1.76e-06 2i0i:B, 2i0i:C
36 1n7f:A 86 67 0.2473 0.2674 0.3433 1.03e-05 1n7f:B
37 7qqn:C 414 68 0.2796 0.0628 0.3824 1.03e-05 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
38 4xhv:A 94 83 0.3011 0.2979 0.3373 1.12e-05
39 1rzx:A 98 87 0.2473 0.2347 0.2644 2.68e-05 5i7z:A, 1x8s:A
40 4xh7:A 110 71 0.2473 0.2091 0.3239 4.12e-05
41 1u38:A 89 59 0.2043 0.2135 0.3220 4.69e-05
42 7x2e:A 163 66 0.2796 0.1595 0.3939 5.83e-05 2kbs:A
43 6kz1:A 97 69 0.2366 0.2268 0.3188 1.41e-04 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
44 7pcb:A 415 52 0.1935 0.0434 0.3462 2.59e-04 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
45 1zub:A 109 85 0.2903 0.2477 0.3176 2.72e-04
46 2os6:A 89 83 0.2581 0.2697 0.2892 3.69e-04
47 7d6f:A 87 44 0.1720 0.1839 0.3636 4.01e-04
48 1ihj:B 95 66 0.2258 0.2211 0.3182 0.001 1ihj:A
49 7weg:B 96 74 0.2473 0.2396 0.3108 0.002 7weg:A
50 8blu:B 195 77 0.2688 0.1282 0.3247 0.002 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
51 1b8q:A 127 45 0.1398 0.1024 0.2889 0.002
52 4wsi:A 372 48 0.1613 0.0403 0.3125 0.002 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
53 7pc5:A 405 66 0.2258 0.0519 0.3182 0.003
54 6nid:B 88 44 0.1720 0.1818 0.3636 0.003 6nid:A, 6nid:C
55 5zys:A 90 77 0.1828 0.1889 0.2208 0.004
56 2egn:A 83 44 0.1828 0.2048 0.3864 0.010
57 2kpl:A 129 82 0.2258 0.1628 0.2561 0.011
58 5n7d:A 423 82 0.2258 0.0496 0.2561 0.020 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
59 3vqg:A 85 60 0.1613 0.1765 0.2500 0.059
60 6gbe:A 119 72 0.2043 0.1597 0.2639 0.075
61 5oak:A 90 47 0.1505 0.1556 0.2979 0.19 5oak:C
62 6x23:A 89 74 0.1935 0.2022 0.2432 0.21
63 6ezi:A 86 59 0.1935 0.2093 0.3051 0.27 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
64 2ejy:A 85 32 0.1290 0.1412 0.3750 0.31
65 7qct:A 90 78 0.2043 0.2111 0.2436 0.32 7qct:B
66 6hks:B 94 70 0.2151 0.2128 0.2857 0.48 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
67 5zmw:A 1000 29 0.1398 0.0130 0.4483 0.89 5a3q:A, 5a3r:A, 5a3s:A, 5a3s:B, 2agv:A, 2agv:B, 3ar2:A, 3ar3:A, 3ar4:A, 3ar5:A, 3ar6:A, 3ar7:A, 3ar8:A, 3ar9:A, 3b9b:A, 3b9r:A, 3b9r:B, 3ba6:A, 4bew:A, 4bew:B, 2by4:A, 2c88:A, 2c8k:A, 2c8l:A, 2c9m:A, 2c9m:B, 2dqs:A, 2ear:A, 2eat:A, 2eau:A, 3fgo:A, 3fgo:B, 3fpb:A, 3fps:A, 4h1w:A, 6hef:A, 1iwo:A, 1iwo:B, 4j2t:A, 3j7t:A, 4kyt:A, 3n5k:A, 3n5k:B, 3n8g:A, 3nal:A, 3nam:A, 3nan:A, 4nab:A, 5ncq:A, 2o9j:A, 2oa0:A, 8owa:A, 8owl:A, 6rb2:A, 1su4:A, 1t5s:A, 1t5t:A, 3tlm:A, 4uu0:A, 4uu1:A, 1vfp:A, 1vfp:B, 3w5a:A, 3w5a:B, 3w5b:A, 1wpg:A, 1wpg:B, 1wpg:C, 1wpg:D, 5xa7:A, 5xa8:A, 5xa9:A, 5xaa:A, 4xou:A, 1xp5:A, 6yaa:A, 4ycl:A, 4ycm:A, 4ycn:A, 2yfy:A, 6yso:A, 6yso:B, 2zbd:A, 2zbe:A, 2zbe:B, 2zbf:A, 2zbg:A
68 8xud:D 651 55 0.1720 0.0246 0.2909 0.95 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C
69 7xn7:u 208 79 0.2258 0.1010 0.2658 1.5 7xse:u, 7xsx:u, 7xt7:u, 7xti:u
70 3bpu:A 86 38 0.1398 0.1512 0.3421 2.5
71 5f67:A 98 30 0.1290 0.1224 0.4000 2.7 5f67:B
72 3qw4:C 447 32 0.1183 0.0246 0.3438 3.0 3qw4:B
73 1i8q:A 814 44 0.1398 0.0160 0.2955 3.6 1lxm:A
74 1gu6:A 441 17 0.1075 0.0227 0.5882 4.9 1gu6:G, 1gu6:C, 1gu6:E, 3l1t:A, 3l1t:B, 3l1t:C, 3l1t:D, 2rdz:A, 2rdz:B, 2rdz:C, 2rdz:D, 2rf7:A, 2rf7:B, 2rf7:C, 2rf7:D, 3tor:A, 3tor:D, 3tor:B, 3tor:C, 4wjy:A, 4wjy:B
75 6p73:A 439 17 0.1075 0.0228 0.5882 5.5 6p73:B, 3ubr:A, 3ubr:B
76 6cq2:A 688 31 0.1183 0.0160 0.3548 6.0 6cqi:A
77 7dl0:B 355 50 0.1613 0.0423 0.3000 6.5 7dl1:A, 7dl1:C, 7dl3:A, 7dl3:C, 7dl7:D, 7dl7:G
78 7siq:A 524 22 0.1075 0.0191 0.4545 6.6
79 8fzi:v 525 48 0.1720 0.0305 0.3333 9.8 8fzd:v, 8fzf:v, 8fzg:v, 8fzj:v, 6gwt:w, 6gxm:w, 6gxn:w, 6gxo:w, 6gxp:w, 2h5e:A, 2h5e:B, 6lkq:v, 7m5d:7, 4v85:AW, 4v89:AW, 4v8o:AY

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218