Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PKKLQTDELATVRLFQENTPSVVYITNLAVRQDAFTLDVLEVPQGSGSGFVWDKQGHIVTNYHVIRGASDLRVTLADQTT
FDAKVVGFDQDKDVAVLRIDAPKNKLRPIPVGVSADLLVGQKVFAIGNPFGLDHTLTTGVISGLRREISSAATGRPIQDV
IQTDAAINPGNSGGPLLDSSGTLIGINTAIYSPSGASSGVGFSIPVDTVGGIVDQLVRFGKVTRPILGIKFAPDQSVEQL
GVSGVLVLDAPPSGPAGKAGLQSTKRDGYGRLVLGDIITSVNGTKVSNGSDLYRILDQCKVGDEVTVEVLRGDHKEKISV
TLEPKP

The query sequence (length=326) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3qo6:B 328 326 1.0000 0.9939 1.0000 0.0 3qo6:A, 3qo6:C
2 4ic5:A 210 220 0.3282 0.5095 0.4864 3.69e-56 4ic5:B, 4ic5:C
3 3cs0:A 392 318 0.3712 0.3087 0.3805 3.62e-51 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
4 5t63:A 283 274 0.3313 0.3816 0.3942 9.93e-51 5b6l:A, 5gnd:A
5 4ynn:A 400 282 0.3374 0.2750 0.3901 1.47e-49 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
6 8kic:A 300 287 0.3344 0.3633 0.3798 2.02e-49 8kic:C, 8kic:B, 3stj:A, 3stj:B, 3stj:C, 3stj:D, 3stj:E, 3stj:F, 3stj:G, 3stj:H, 3stj:I, 3stj:J, 3stj:K, 3stj:L, 8w69:A, 8w69:C, 8w69:B
7 7xs0:A 376 277 0.3313 0.2872 0.3899 2.79e-48
8 3pv3:A 392 278 0.3436 0.2857 0.4029 1.34e-46 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
9 7co7:D 329 287 0.3252 0.3222 0.3693 3.71e-45 7co2:A, 7co3:A, 7co5:H, 7co5:B, 7co5:D, 7co5:F, 7co5:J, 7co5:L
10 6ew9:A 305 314 0.3466 0.3705 0.3599 1.42e-44 6ew9:B, 6ew9:C, 3gcn:A, 3gco:A, 3gds:A, 3gdu:A, 3gdu:C, 3gdv:A, 3gdv:C, 2r3y:B, 2r3y:C, 1soz:A, 1soz:B
11 2z9i:A 284 202 0.2669 0.3063 0.4307 3.69e-43 2z9i:B, 2z9i:C
12 5y28:A 268 282 0.3190 0.3881 0.3688 1.10e-42 5y2d:A
13 3gdv:B 284 243 0.2945 0.3380 0.3951 3.76e-40 3gdu:B, 2r3y:A, 4rqz:A, 4rqz:B, 4rqz:C
14 3nzi:A 211 190 0.2331 0.3602 0.4000 1.84e-33 8se7:Q
15 4fln:B 464 299 0.2669 0.1875 0.2910 2.21e-17 4fln:A, 4fln:C
16 5hma:A 191 166 0.1319 0.2251 0.2590 2.66e-08 5hm9:A
17 1exf:A 241 103 0.0982 0.1328 0.3107 2.52e-04
18 2as9:A 207 106 0.0859 0.1353 0.2642 0.003 2as9:B
19 4mvn:D 200 153 0.1227 0.2000 0.2614 0.058 4mvn:A, 4mvn:B, 4mvn:C, 3ufa:A, 3ufa:B
20 1syo:A 422 38 0.0429 0.0332 0.3684 0.51 1syo:B, 1sz0:A, 1sz0:B
21 1sgc:A 181 71 0.0675 0.1215 0.3099 0.68 3sga:E, 4sga:E, 5sga:E
22 4q5f:D 206 68 0.0613 0.0971 0.2941 0.78 4q5f:A
23 9j9a:A 248 154 0.1135 0.1492 0.2403 1.6
24 4k1t:C 203 184 0.1319 0.2118 0.2337 1.6 4k1t:A, 4k1t:B
25 6bqj:C 207 40 0.0521 0.0821 0.4250 2.1 1a1r:A, 1a1r:B, 2a4g:A, 2a4g:C, 2a4q:A, 2a4q:C, 2a4r:A, 2a4r:C, 6bqj:A, 6bqj:B, 6bqk:A, 6bqk:B, 6c2m:A, 6c2m:B, 6c2m:C, 6c2m:D, 6c2n:A, 6c2o:A, 6cvw:A, 6cvx:A, 6cvy:A, 7d5l:A, 7d5l:B, 7d5l:D, 7d5l:E, 6diq:A, 6dir:A, 6dis:A, 6dit:A, 6diu:A, 6div:A, 6diw:A, 5epn:A, 5epy:A, 5eqq:A, 5eqr:A, 5eqs:A, 5esb:A, 5etx:A, 5etx:B, 5etx:C, 5etx:D, 3eyd:A, 3eyd:C, 2f9u:A, 2f9u:C, 2f9v:A, 2f9v:C, 2fm2:A, 2fm2:C, 2gvf:A, 2gvf:C, 3kf2:A, 3kf2:B, 3kn2:A, 3kn2:C, 3knx:A, 3knx:C, 7l7l:A, 7l7n:A, 7l7o:A, 7l7p:A, 3lon:A, 3lon:C, 3lox:A, 3lox:C, 3m5l:A, 3m5m:B, 3m5m:A, 3m5n:B, 3m5n:C, 3m5n:D, 3m5n:A, 3m5o:A, 3m5o:B, 7mm2:A, 7mm3:A, 7mm4:A, 7mm5:A, 7mm6:A, 7mm7:A, 7mm8:A, 7mm9:A, 7mma:A, 7mmb:A, 7mmc:A, 7mmd:A, 7mme:A, 7mmf:A, 7mmg:A, 7mmg:B, 7mmh:A, 7mmi:A, 7mmj:A, 7mmk:A, 7mml:A, 1n1l:A, 1n1l:B, 6n4n:A, 6n4n:B, 4nwk:A, 4nwl:A, 4nwl:B, 6nzt:A, 6nzv:A, 2o8m:B, 2obo:A, 2obo:C, 2obq:A, 2obq:C, 2oc0:A, 2oc0:C, 2oc1:A, 2oc1:C, 2oc7:A, 2oc7:C, 2oc8:A, 2oc8:C, 2oin:A, 2oin:B, 2p59:A, 2p59:B, 6p6l:A, 6p6m:A, 6p6o:A, 6p6q:A, 6p6q:B, 6p6r:A, 6piu:A, 6piv:A, 6piw:A, 6pix:A, 6piy:A, 6piz:A, 6pj0:A, 6pj1:A, 6pj2:A, 2qv1:A, 2qv1:B, 3rc4:A, 3rc5:A, 3rc6:A, 1rgq:A, 1rtl:A, 1rtl:B, 3su0:A, 3su1:A, 3su2:A, 3su3:A, 3su4:A, 3su4:B, 3su5:A, 3su6:A, 3sud:A, 3sud:B, 3sud:C, 3sud:D, 3sue:A, 3sue:B, 3sue:C, 3sue:D, 3suf:A, 3suf:B, 3suf:C, 3suf:D, 3sug:A, 3sv6:A, 3sv7:A, 3sv8:A, 3sv9:A, 6ue3:A, 6vdl:A, 6vdm:A, 6vdn:A, 6vdo:A, 5voj:A, 5vp9:A, 4wf8:A, 4wh6:A, 4wh8:A, 4wh8:B, 2xcf:A, 2xcf:B, 2xcn:A, 2xcn:B, 2xni:A, 2xni:B
26 4b6f:A 645 40 0.0521 0.0264 0.4250 2.2 1a1v:A, 4a1t:A, 4a1t:B, 4a1v:A, 4a1v:B, 4a1x:A, 4a1x:B, 4a92:A, 4a92:B, 4b6e:B, 4b6f:B, 4b71:A, 4b71:B, 4b73:A, 4b73:B, 4b74:A, 4b74:B, 4b75:A, 4b75:B, 4b76:A, 4b76:B, 1bt7:A, 1cu1:A, 1cu1:B, 1dxp:A, 1dxp:B, 1dxw:A, 1dy8:A, 1dy8:B, 1dy9:A, 1dy9:B, 5e4f:A, 5e4f:B, 2f55:A, 2f55:B, 2f55:C, 6fe6:A, 5fps:A, 5fps:B, 5fpt:A, 5fpt:B, 5fpy:A, 5fpy:B, 1hei:A, 4i31:A, 4i31:B, 4i32:A, 4i32:B, 4i33:A, 4i33:B, 4jmy:A, 4jmy:B, 1jxp:A, 1jxp:B, 2k1q:A, 4k8b:A, 4k8b:B, 3kee:A, 3kee:B, 3kee:C, 3kee:D, 3kqh:B, 3kqh:A, 3kqk:B, 3kqk:A, 3kql:A, 3kql:B, 3kqn:A, 3kqu:A, 3kqu:B, 3kqu:C, 3kqu:D, 3kqu:E, 3kqu:F, 4ktc:A, 4ktc:C, 1ns3:A, 1ns3:B, 3o8b:A, 3o8b:B, 3o8c:A, 3o8c:B, 3o8d:A, 3o8d:B, 3o8r:A, 3o8r:B, 4ojq:A, 4ok3:A, 4ok5:A, 4ok6:A, 4oks:A, 4oks:B, 3oyp:A, 3oyp:B, 3p8n:A, 3p8n:B, 3p8o:A, 3p8o:B, 3rvb:A, 4tyd:A, 4tyd:D, 4tyd:B, 4tyd:E, 4tyd:C, 4tyd:F, 4tyd:G, 4tyd:M, 4tyd:H, 4tyd:J, 4tyd:L, 4tyd:K, 4u01:A, 4u01:B, 4u01:C, 4u01:D, 4u01:E, 4u01:F, 4u01:G, 4u01:H, 4u01:J, 1w3c:A, 1w3c:B, 4wxp:A, 4wxr:A, 4wxr:B, 2zjo:A
27 6p6s:A 192 40 0.0521 0.0885 0.4250 2.8
28 3c0y:A 386 132 0.1166 0.0984 0.2879 2.9 3c0y:B, 3c0z:A, 3c0z:B, 3c10:A, 3c10:B, 3znr:A, 3znr:B, 3zns:A, 3zns:B
29 3c0z:C 359 132 0.1166 0.1058 0.2879 3.0 3c0y:C, 3c10:C, 3znr:C, 3zns:C
30 2joa:A 105 84 0.0706 0.2190 0.2738 3.2
31 6x23:A 89 71 0.0675 0.2472 0.3099 4.7
32 6aef:B 458 58 0.0491 0.0349 0.2759 5.2 6aef:A
33 6jtc:A 699 18 0.0307 0.0143 0.5556 5.3 6jtc:B, 7r51:A, 7r51:B, 5sdc:A, 5sdc:B, 5sdd:A, 5sdd:B, 5sde:A, 5sde:B, 5sdf:A, 5sdf:B, 5sdg:A, 5sdg:B, 5sdh:A, 5sdh:B, 5sdi:A, 5sdi:B, 5sdj:A, 5sdk:A, 5sdl:A, 5sdl:B, 5sdm:A, 5sdm:B, 5sdn:A, 5sdn:B, 5sdo:A, 5sdo:B, 5sdp:A, 5sdp:B, 5sdq:A, 5sdq:B, 5sdr:A, 5sdr:B
34 2kpl:A 129 45 0.0460 0.1163 0.3333 5.5
35 5jxf:A 694 18 0.0337 0.0159 0.6111 5.6 5jxf:B
36 3woj:A 698 24 0.0368 0.0172 0.5000 5.8 3woi:B, 3woj:B, 3wol:A, 3wol:B, 3wom:A, 3wom:B, 3won:A, 3won:B, 3woo:A, 3woo:B, 3wop:A, 3wop:B, 3woq:A, 3woq:B, 3wor:A, 3wor:B, 4y06:A, 4y06:B
37 1rgq:B 186 40 0.0491 0.0860 0.4000 6.0 2o8m:A
38 7dkb:A 697 20 0.0337 0.0158 0.5500 7.9 7dkb:B, 7dkc:A, 7dkc:B, 7dkd:A, 7dkd:B, 7dke:A, 7dke:B, 8grt:A, 8grt:B
39 6et4:A 367 69 0.0644 0.0572 0.3043 8.1 2b0m:A, 9bkm:A, 9bkn:A, 9bko:A, 2bxv:A, 6cjf:A, 6cjf:B, 6cjg:A, 1d3g:A, 1d3h:A, 8dhf:A, 8dhg:A, 8dhh:A, 3f1q:A, 3fj6:A, 3fjl:A, 6fmd:A, 2fpt:A, 2fpv:A, 2fpy:A, 2fqi:A, 3g0u:A, 3g0x:A, 6gk0:A, 5h2z:A, 5h73:A, 5hin:A, 5hqe:A, 6idj:A, 4igh:A, 6j3b:A, 6j3c:A, 4jgd:A, 6jmd:A, 6jme:A, 4js3:A, 4jts:A, 4jtt:A, 4jtu:A, 7k2u:A, 8k4f:A, 5k9c:A, 5k9d:A, 3kvj:A, 3kvk:A, 3kvl:A, 3kvm:A, 6lp6:A, 6lp7:A, 6lp8:A, 4ls0:A, 4ls1:A, 4ls2:A, 6lzl:A, 6m2b:A, 5mut:A, 5mvc:A, 5mvd:A, 6oc0:A, 6oc1:A, 4oqv:A, 2prh:A, 2prl:A, 2prm:A, 6qu7:A, 8rak:A, 4rk8:A, 4rka:A, 4rli:A, 4rr4:A, 6syp:AAA, 3u2o:A, 8vhl:A, 8vhm:A, 6vnd:A, 3w7r:A, 2wv8:A, 8yhr:A, 4ylw:A, 7z6c:A, 5zf4:A, 5zf7:A, 5zf8:A, 5zf9:A, 5zfa:A, 5zfb:A, 4zl1:A, 4zmg:A, 3zws:A, 3zwt:A
40 5wdx:A 642 40 0.0460 0.0234 0.3750 8.8

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218