Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
PIPEEYDDTRIMGYDPLIPPALLQNEIKASKKSLETVIKGRVDASRIIGGKDDRCLVIVGPCSIHDPEAALEYANRLKKI
SEELENDLVIIMRAYLEKGWKGLINDPNVDNSFDINKGLRVSRKLYADLTGAVGIPIGSEMLDTISPQYFSDLLSFGAVG
ARTTESQLHRELASGLSFPIGFKNGTDGNVGVALDAVQASSKGHHFMGVTKNGLAAITTTKGNDHCFIILRGGKNLTNYD
LQSVQSAKSAIAKSSNPNIKIMIDCSHDNSKKDYRNQPAVLEDVSRQIEAGENALMGVMIESNINEGKQSMALKYGVSIT
DSCVSWDTTVKMLNNLARAVQKRRQKNG

The query sequence (length=348) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7reu:B 358 358 0.9914 0.9637 0.9637 0.0 7reu:A
2 1of6:A 350 351 0.6638 0.6600 0.6581 1.19e-164 1hfb:A, 1hfb:B, 1hfb:C, 1hfb:D, 1hfb:E, 1hfb:F, 1hfb:G, 1hfb:H, 1oab:A, 1oab:B, 1of6:B, 1of6:C, 1of6:D, 1of6:E, 1of6:F, 1of6:G, 1of6:H, 1of8:A, 1of8:B, 1ofa:B, 1ofa:A, 1ofb:A, 1ofb:B, 1ofo:A, 1ofo:B, 1ofq:A, 1ofq:B, 1ofq:C, 1ofq:D, 1ofr:A, 1ofr:H, 1ofr:C, 1ofr:D, 1ofr:E, 1ofr:F, 1ofr:G, 1ofr:B, 1og0:A, 1og0:B, 1og0:C, 1og0:D, 1og0:E, 1og0:F, 1og0:G, 1og0:H
3 5dcb:C 348 342 0.5029 0.5029 0.5117 3.59e-120 5cz0:A, 5cz0:B, 5cz0:C, 5cz0:D, 5czs:A, 5czs:B, 5czs:C, 5czs:D, 5czt:A, 5czt:B, 5czt:C, 5czt:D, 5d02:A, 5d02:B, 5d02:C, 5d02:D, 5d03:A, 5d03:B, 5d03:C, 5d03:D, 5d04:C, 5d04:D, 5d05:A, 5d05:B, 5d05:C, 5d05:D, 5d09:A, 5d09:B, 5d09:C, 5d09:D, 5dcb:A, 5dcb:B, 5dcb:D, 5dcd:A, 5dcd:B, 5dcd:C, 5dcd:D, 5dce:A, 5dce:B, 5dce:C, 5dce:D, 4hsn:A, 4hsn:B, 4hsn:C, 4hsn:D, 4hso:A, 4hso:B, 4hso:C, 4hso:D, 4ixx:A, 4ixx:B, 4ixx:C, 4ixx:D, 4uc5:A, 4uc5:B, 4uc5:C, 4uc5:D, 4ucg:A, 4ucg:B, 4ucg:C, 4ucg:D, 4uma:A, 4uma:B, 4uma:C, 4uma:D, 4umb:A, 4umb:B, 4umb:C, 4umb:D, 4umc:A, 4umc:B, 4umc:C, 4umc:D
4 1kfl:A 350 347 0.5144 0.5114 0.5159 5.21e-120 5cks:A, 5cks:B, 5cks:C, 5cks:D, 8e0s:A, 8e0s:B, 8e0s:C, 8e0s:D, 8e0t:B, 8e0t:C, 8e0v:A, 8e0v:B, 8e0v:C, 8e0v:D, 8e0x:A, 8e0x:B, 8e0x:C, 8e0x:D, 8e0y:C, 1gg1:A, 1gg1:B, 1gg1:C, 1gg1:D, 1kfl:B, 1kfl:C, 1kfl:D, 1kfl:E, 1kfl:F, 1kfl:G, 1kfl:H, 1n8f:A, 1n8f:B, 1n8f:C, 1n8f:D, 1qr7:A, 1qr7:B, 1qr7:C, 1qr7:D, 7rud:B, 7rud:C, 7rud:D, 7rue:A, 7rue:B, 7rue:C, 7rue:D
5 3tqk:A 341 336 0.5029 0.5132 0.5208 1.92e-117
6 6agm:A 334 326 0.4282 0.4461 0.4571 2.49e-99 6agm:B, 6agm:C, 6agm:D
7 7x7w:A 288 60 0.0460 0.0556 0.2667 0.068 7x7w:B
8 2a21:A 263 34 0.0345 0.0456 0.3529 0.63 2a21:B, 2a2i:A, 2a2i:B, 3e0i:A, 3e0i:B, 3e12:A, 3e12:B, 2ef9:A, 2ef9:B, 1fwn:A, 1fwn:B, 1fws:A, 1fws:B, 1fwt:A, 1fwt:B, 1fww:A, 1fww:B, 1fx6:A, 1fx6:B, 1fxp:A, 1fxp:B, 1fxq:A, 1fxq:B, 1fy6:A, 1fy6:B, 1jcx:A, 1jcx:B, 1jcy:A, 1jcy:B, 1lrn:A, 1lrn:B, 1lro:A, 1lro:B, 1lrq:A, 1lrq:B, 2nwr:A, 2nwr:B, 2nws:A, 2nws:B, 2nx1:A, 2nx1:B, 2nx3:A, 2nx3:B, 2nx3:C, 2nx3:D, 2nx3:E, 2nx3:F, 2nx3:G, 2nx3:H, 2nx3:I, 2nx3:J, 2nx3:K, 2nx3:L, 2nxg:A, 2nxg:B, 2nxh:A, 2nxh:B, 2nxh:C, 2nxh:D, 2nxh:E, 2nxh:F, 2nxh:G, 2nxh:H, 2nxh:I, 2nxh:J, 2nxh:K, 2nxh:L, 2nxi:A, 2nxi:B, 2nxi:C, 2nxi:D, 2nxi:E, 2nxi:F, 2nxi:G, 2nxi:H, 2nxi:I, 2nxi:J, 2nxi:K, 2nxi:L, 1pck:A, 1pck:B, 1pcw:A, 1pcw:B, 1pe1:A, 1pe1:B, 1t8x:A, 1t8x:B, 1t96:A, 1t96:B, 1zha:A, 1zha:B, 1zji:A, 1zji:B
9 7p8n:a 642 65 0.0575 0.0312 0.3077 0.67 7p5h:A, 7p5h:D, 7p5h:a, 7p5h:d, 7p8n:A, 7p91:a, 7p91:A, 7p92:A
10 1vs1:D 271 291 0.1839 0.2362 0.2199 1.1 1vs1:A, 1vs1:B, 1vs1:C
11 3vnl:A 291 60 0.0431 0.0515 0.2500 1.4 7e9w:A, 7e9w:B, 7e9w:C, 7e9w:D, 3vni:A, 3vni:B, 3vni:C, 3vni:D, 3vnj:A, 3vnj:B, 3vnj:C, 3vnj:D, 3vnk:A, 3vnk:B, 3vnk:C, 3vnk:D, 3vnl:B, 3vnl:C, 3vnl:D, 3vnm:A, 3vnm:B, 3vnm:C, 3vnm:D
12 5g26:A 241 38 0.0460 0.0664 0.4211 2.6
13 6qfo:A 1348 63 0.0603 0.0156 0.3333 2.8 8a19:A, 8a1a:A, 6qep:A, 6qev:B, 6qfk:A, 6sh9:B, 2zxq:A
14 5xnp:A 361 58 0.0431 0.0416 0.2586 4.0 5xnp:B, 5xnq:A
15 8p5v:A 1121 30 0.0374 0.0116 0.4333 4.1 8p5t:A, 8p5t:B, 8p5t:C, 8p5t:D, 8p5t:E, 8p5t:F, 8p5u:A, 8p5u:B, 8p5u:C, 8p5u:D, 8p5u:E, 8p5u:F, 8p5v:B, 8p5v:E, 8p5v:D, 8p5v:C, 8p5v:F, 8p5w:A, 8p5w:B, 8p5w:C, 8p5w:D, 8p5w:E, 8p5w:F
16 8p5s:A 1087 30 0.0374 0.0120 0.4333 4.2 8p5x:A, 8p5x:B, 8p5x:C, 8p5x:D, 8p5x:E, 8p5x:F
17 4zqw:B 167 141 0.1092 0.2275 0.2695 6.7 4zqw:D
18 5xla:A 490 49 0.0402 0.0286 0.2857 8.4 3eyk:B, 5xl3:B, 5xl3:A, 5xl4:A, 5xl4:B, 5xl6:A, 5xl7:A, 5xl7:B, 5xl9:A, 5xla:B, 5xlc:A, 5xlc:B, 5xld:A, 5xld:B
19 6wzt:A 494 49 0.0259 0.0182 0.1837 9.0 6aos:A, 6aot:A, 6aou:A, 6aov:A, 6bkr:A, 6bks:A, 6bkt:A, 6cex:D, 6cex:B, 3eym:B, 3eym:D, 3eym:F, 8faw:A, 1hgg:B, 1hgg:D, 1hgg:F, 1hgh:B, 1hgh:D, 1hgh:F, 1htm:B, 1htm:D, 1htm:F, 6nsa:A, 6nsb:A, 6nsf:A, 6nsg:A, 5t6n:B, 5t6n:D, 5t6n:F, 8tj6:B, 8tj9:A, 8tja:A, 8tjb:A, 4uny:D, 4uo0:D, 8uwa:B, 4wea:A, 2yp3:A, 2yp4:A, 2yp5:A, 2yp8:A, 2yp9:A
20 4xdd:A 582 91 0.0632 0.0378 0.2418 9.9 8aio:A, 8aio:B, 8aj6:A, 8aj6:B, 8aln:A, 8aln:B, 8ap2:A, 8ap2:B, 5byq:A, 5byq:B, 5byr:A, 5byr:B, 5bys:A, 5bys:B, 1c4a:A, 1c4c:A, 3c8y:A, 8cjy:A, 8cjy:B, 1feh:A, 6gly:A, 6gly:B, 6glz:A, 6glz:B, 6gm0:A, 6gm0:B, 6gm1:A, 6gm1:B, 6gm2:A, 6gm2:B, 6gm3:A, 6gm3:B, 6gm4:A, 6gm4:B, 6gm8:A, 6gm8:B, 6h63:A, 6h63:B, 5la3:A, 5la3:B, 6n59:A, 6n6p:A, 6nac:A, 5oef:A, 5oef:B, 8pvm:A, 8pvm:B, 7qhf:A, 7qhf:B, 8qm3:A, 8qm3:B, 4xdc:A, 4xdc:B, 4xdd:B, 6yf4:A, 6yf4:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218