BioLiP

>protein
PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHV
IAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIE
IGVVGEKLYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEAL
RYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLTHHH

The query sequence (length=320) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4lv4:A	320	320	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	4del:A	345	345	1.0000	0.9275	0.9275	0.0	4a22:A, 4a22:B, 4def:A, 3ekl:A, 3ekz:A, 3elf:A
3	3qm3:A	350	332	0.3875	0.3543	0.3735	1.66e-58	3qm3:B, 3qm3:C, 3qm3:D, 3qm3:E, 3qm3:F, 3qm3:G, 3qm3:H
4	5gk5:C	335	317	0.3688	0.3522	0.3722	3.73e-57	5gk3:A, 5gk3:B, 5gk4:A, 5gk4:B, 5gk5:A, 5gk5:B, 5gk5:D, 5gk5:E, 5gk5:F, 5gk5:G, 5gk5:H, 5gk6:A, 5gk6:B, 5gk7:A, 5gk7:B, 5gk8:A, 5gk8:B, 1gyn:A
5	1dos:A	358	337	0.3719	0.3324	0.3531	6.45e-55	1b57:A, 1b57:B, 1dos:B, 5vjd:A, 5vjd:B, 5vje:A, 5vje:B, 1zen:A
6	7rgn:A	340	325	0.3688	0.3471	0.3631	6.91e-53
7	7v6g:B	338	325	0.3844	0.3639	0.3785	8.86e-52	6lnk:A, 6lnk:B, 7v6f:A, 7v6f:B, 7v6g:A, 7yva:A, 7yva:B
8	4to8:A	279	301	0.2594	0.2975	0.2757	3.55e-19	4to8:B
9	3q94:A	285	323	0.2719	0.3053	0.2693	8.09e-17	3q94:B
10	2isv:A	298	326	0.2437	0.2617	0.2393	9.52e-15	3gak:A
11	8q5a:A	276	263	0.2469	0.2862	0.3004	4.10e-14	8q58:A
12	3gay:A	319	339	0.2500	0.2508	0.2360	5.59e-13	3gak:B, 3gay:B, 3gb6:A, 3gb6:B, 2isv:B, 2isw:A, 3ohi:A, 3ohi:B
13	8q59:A	280	263	0.2281	0.2607	0.2776	2.07e-12	8q57:A, 8q57:B, 8q59:B
14	1rv8:B	305	335	0.2719	0.2852	0.2597	1.30e-10	1rv8:A, 1rv8:C, 1rv8:D, 1rvg:A, 1rvg:B, 1rvg:C, 1rvg:D
15	1gvf:B	275	311	0.2281	0.2655	0.2347	1.47e-10	1gvf:A
16	5ud0:A	282	284	0.2281	0.2589	0.2570	1.41e-09	5ud1:A, 5ud1:B
17	3pm6:B	264	243	0.2094	0.2538	0.2757	2.14e-07
18	3n9s:A	307	306	0.2344	0.2443	0.2451	4.06e-07	3c4u:A, 3c4u:B, 3c52:A, 3c52:B, 3c56:A, 3c56:B, 3n9r:A, 3n9r:B, 3n9r:K, 3n9r:P, 3n9r:U, 3n9r:Z, 3n9r:e, 3n9r:j, 3n9s:B, 5uck:A, 5uck:B, 5ucn:A, 5ucn:B, 5ucp:A, 5ucp:B, 5ucs:A, 5ucs:B, 5ucz:A, 5ucz:B, 5ud0:B, 5ud2:A, 5ud2:B, 5ud3:A, 5ud3:B, 5ud4:A, 5ud4:B, 5vjf:A, 5vjf:B
19	6ofu:B	264	249	0.1844	0.2235	0.2369	4.45e-07	6ofu:A, 6ofu:C, 6ofu:D
20	3pm6:A	287	257	0.2094	0.2334	0.2607	6.62e-05
21	2yxx:A	385	97	0.0875	0.0727	0.2887	0.064
22	4q7f:A	510	66	0.0594	0.0373	0.2879	0.46	3qfk:A
23	3c5q:A	394	69	0.0656	0.0533	0.3043	1.3	2qgh:A
24	4b09:A	218	41	0.0406	0.0596	0.3171	4.5	4b09:B, 4b09:C, 4b09:D, 4b09:E, 4b09:F, 4b09:G, 4b09:I, 4b09:K
25	5nr8:A	377	46	0.0437	0.0371	0.3043	5.4	1hki:A, 1hkj:A, 1hkk:A, 1hkm:A, 6jjr:A, 6jk6:A, 5nra:A, 5nrf:A, 1waw:A, 1wb0:A, 6ze8:A, 6ze8:B, 6ze8:C, 6ze8:D, 6ze8:E, 6ze8:F
26	4mlm:A	188	84	0.0688	0.1170	0.2619	8.5	4mlm:B, 4mln:A, 4mln:B, 4n6w:A, 4n71:A, 4n71:B, 4n71:D, 4n71:E
27	6bmc:A	380	103	0.0875	0.0737	0.2718	8.8	6bmc:B

[Back]