BioLiP

>protein
PEFMDTCFFCGAVDLMRYETLSAKVPSSQKTVSLVLTHLANCIQTQLDLKPGARLCPRCFQELSDYDTIMVNLMTTQKRL
TTQLKLDK

The query sequence (length=88) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7poh:B	92	92	0.9886	0.9457	0.9457	7.83e-59	7poh:A
2	7o7g:A	627	56	0.1818	0.0255	0.2857	0.26	4lm8:A, 8qbq:A, 8qbz:A, 8qc9:A, 7qth:A
3	7sa4:8	203	38	0.1932	0.0837	0.4474	0.81
4	2drp:D	65	52	0.1705	0.2308	0.2885	0.83	2drp:A
5	6u05:A	413	49	0.1705	0.0363	0.3061	2.2	6tzm:A, 6tzo:A, 6tzx:A, 6u00:B, 6u03:A, 5u32:A
6	8a3t:U	114	60	0.2045	0.1579	0.3000	3.2	8a5y:U
7	5aaz:A	31	19	0.0909	0.2581	0.4211	3.2
8	7mla:A	67	50	0.1477	0.1940	0.2600	3.8	5mnj:D, 5mnj:H, 2vje:B, 2vje:D, 2vjf:B, 2vjf:D
9	5f4b:A	173	24	0.1023	0.0520	0.3750	4.2	5f4b:B
10	5ero:A	301	80	0.2955	0.0864	0.3250	4.3	5ero:B, 5ero:C
11	2xrg:A	758	26	0.1136	0.0132	0.3846	4.6
12	3way:A	787	26	0.1136	0.0127	0.3846	4.6	8c3o:B, 8c3p:A, 8c3p:B, 8c4w:A, 8c7r:A, 5dlv:A, 5dlv:B, 5dlw:A, 5inh:A, 5l0b:A, 5l0b:B, 5l0e:A, 5l0e:B, 5l0k:A, 5l0k:B, 6leh:A, 5lqq:A, 5m0d:A, 5m0e:A, 5m0m:A, 5m0s:A, 7mfh:A, 5mhp:A, 3nkn:A, 3nko:A, 3nkq:A, 3nkr:A, 5ohi:A, 5olb:A, 7p0k:AAA, 7p4j:A, 7p4o:A, 3waw:A, 6y5m:A, 4zg7:A
13	5s9m:A	809	26	0.1136	0.0124	0.3846	4.6	8c3o:A, 5dlt:A, 9ent:A, 9eu5:A, 5hrt:A, 5ijq:A, 5ijs:A, 5lia:A, 3nkm:A, 3nkp:A, 5s9l:A, 5s9n:A, 6w35:A, 3wav:A, 3wax:A, 2xr9:A, 7z0n:AAA, 7z3k:AAA, 7z3l:AAA
14	7oik:A	4426	24	0.1364	0.0027	0.5000	5.7	7oim:A, 6tax:A, 6tay:A
15	1wog:A	303	18	0.1023	0.0297	0.5000	8.2	1wog:B, 1wog:C, 1wog:D, 1wog:E, 1wog:F, 1woi:A, 1woi:B, 1woi:C, 1woi:D, 1woi:E, 1woi:F

[Back]