BioLiP

>protein
NTTGGRFVDKDNRKYYVKDDHKAIYWHKIDGKTYYFGDIGEMVVGWQYLEIPGTGYRDNLFDNQPVNEIGLQEKWYYFGQ
DGALLEQTDKQVLEAKTSENTGKVYGEQYPLSAEKRTYYFDNNYAVKTGWIYEDGNWYYLNKLGNFGDDSYNPLPIGEVA
KGWTQDFAPWYYLDASGKMLTDWQKVNGKWYYFGSSGSMATGWKYVRGKWYYLDNKNGDMKTGWQYLGNKWYYLRSSGAM
VTGWYQDGLTWYYLNAGNGDMKTGWFQVNGKWYYAYSSGALAVNTTVDGYSVNYNGEWVQ

The query sequence (length=300) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7bay:AA	311	311	1.0000	0.9646	0.9646	0.0	2v04:A, 2vyu:A, 2x8m:A, 2x8o:A, 2x8p:A
2	6jyx:B	293	302	0.5800	0.5939	0.5762	2.86e-103	6jyx:A
3	2bib:A	540	230	0.2700	0.1500	0.3522	1.11e-28	1wra:A, 1wra:B
4	2bib:A	540	269	0.2600	0.1444	0.2900	3.06e-18	1wra:A, 1wra:B
5	3hia:B	83	80	0.1533	0.5542	0.5750	4.00e-21	3hia:A, 3hia:C
6	3hia:B	83	78	0.1000	0.3614	0.3846	4.62e-08	3hia:A, 3hia:C
7	3hia:B	83	65	0.0600	0.2169	0.2769	0.011	3hia:A, 3hia:C
8	3hia:B	83	65	0.0633	0.2289	0.2923	3.7	3hia:A, 3hia:C
9	2ixu:A	338	142	0.1867	0.1657	0.3944	1.88e-19	2ixv:A, 2j8f:A, 2j8g:A, 1oba:A
10	2ixu:A	338	99	0.0933	0.0828	0.2828	0.009	2ixv:A, 2j8f:A, 2j8g:A, 1oba:A
11	2ixu:A	338	86	0.0900	0.0799	0.3140	9.9	2ixv:A, 2j8f:A, 2j8g:A, 1oba:A
12	4x36:A	318	130	0.1800	0.1698	0.4154	1.98e-19	2bml:B, 5ctv:A, 1h8g:A, 1h8g:B, 1hcx:A, 1hcx:B, 4ivv:A, 4iwt:A, 4iwt:B
13	4x36:A	318	144	0.1500	0.1415	0.3125	4.42e-14	2bml:B, 5ctv:A, 1h8g:A, 1h8g:B, 1hcx:A, 1hcx:B, 4ivv:A, 4iwt:A, 4iwt:B
14	7pog:A	2382	302	0.2567	0.0323	0.2550	2.37e-14	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
15	7pog:A	2382	305	0.2667	0.0336	0.2623	8.67e-13	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
16	7pog:A	2382	300	0.2700	0.0340	0.2700	3.35e-12	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
17	7pog:A	2382	302	0.2900	0.0365	0.2881	1.38e-11	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
18	7pog:A	2382	221	0.1800	0.0227	0.2443	4.73e-09	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
19	7pog:A	2382	217	0.1933	0.0243	0.2673	1.25e-08	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
20	7pog:A	2382	120	0.0967	0.0122	0.2417	5.24e-04	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
21	7pog:A	2382	83	0.0733	0.0092	0.2651	0.073	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
22	7pog:A	2382	48	0.0600	0.0076	0.3750	0.11	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
23	8jhz:A	2615	342	0.3033	0.0348	0.2661	9.33e-14
24	8jhz:A	2615	266	0.2533	0.0291	0.2857	1.53e-13
25	8jhz:A	2615	283	0.2367	0.0272	0.2509	3.17e-12
26	8jhz:A	2615	295	0.2700	0.0310	0.2746	9.64e-12
27	8jhz:A	2615	265	0.2100	0.0241	0.2377	1.97e-08
28	8jhz:A	2615	260	0.2333	0.0268	0.2692	7.04e-05
29	8jhz:A	2615	307	0.2600	0.0298	0.2541	1.01e-04
30	8jhz:A	2615	52	0.0533	0.0061	0.3077	0.092
31	8jhz:A	2615	83	0.0733	0.0084	0.2651	1.3
32	8x2i:A	2303	185	0.2067	0.0269	0.3351	4.28e-12
33	8x2i:A	2303	284	0.2500	0.0326	0.2641	1.13e-10
34	8x2i:A	2303	233	0.2000	0.0261	0.2575	2.24e-06
35	8x2i:A	2303	294	0.2367	0.0308	0.2415	1.22e-05
36	8x2i:A	2303	270	0.2200	0.0287	0.2444	1.66e-05
37	8x2i:A	2303	116	0.1000	0.0130	0.2586	7.62e-04
38	8x2i:A	2303	74	0.0767	0.0100	0.3108	0.015
39	8x2i:A	2303	243	0.2167	0.0282	0.2675	0.045
40	8x2h:A	2363	185	0.2067	0.0262	0.3351	4.49e-12	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
41	8x2h:A	2363	284	0.2500	0.0317	0.2641	1.29e-10	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
42	8x2h:A	2363	233	0.2000	0.0254	0.2575	2.50e-06	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
43	8x2h:A	2363	294	0.2367	0.0300	0.2415	1.47e-05	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
44	8x2h:A	2363	270	0.2200	0.0279	0.2444	1.95e-05	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
45	8x2h:A	2363	116	0.1000	0.0127	0.2586	6.99e-04	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
46	8x2h:A	2363	74	0.0767	0.0097	0.3108	0.016	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
47	8x2h:A	2363	243	0.2167	0.0275	0.2675	0.055	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
48	6oq5:A	2346	269	0.2300	0.0294	0.2565	1.22e-11	6oq7:A, 7s0z:B, 7s0z:A
49	6oq5:A	2346	250	0.2167	0.0277	0.2600	2.28e-07	6oq7:A, 7s0z:B, 7s0z:A
50	6oq5:A	2346	164	0.1433	0.0183	0.2622	0.001	6oq7:A, 7s0z:B, 7s0z:A
51	6oq5:A	2346	289	0.2400	0.0307	0.2491	0.011	6oq7:A, 7s0z:B, 7s0z:A
52	8qen:A	2363	269	0.2300	0.0292	0.2565	1.06e-10	9bja:A, 9bja:B, 2bvl:A, 2bvm:A, 6c0b:A, 7lou:A, 7lou:B, 7lov:A, 7lov:B, 3pa8:A, 3pa8:B, 3pee:B, 3pee:A, 7s0y:A, 5uqm:A, 5uqn:A, 5uqt:A, 5uqt:B
53	8qen:A	2363	250	0.2167	0.0275	0.2600	3.73e-07	9bja:A, 9bja:B, 2bvl:A, 2bvm:A, 6c0b:A, 7lou:A, 7lou:B, 7lov:A, 7lov:B, 3pa8:A, 3pa8:B, 3pee:B, 3pee:A, 7s0y:A, 5uqm:A, 5uqn:A, 5uqt:A, 5uqt:B
54	8qen:A	2363	185	0.1633	0.0207	0.2649	1.32e-05	9bja:A, 9bja:B, 2bvl:A, 2bvm:A, 6c0b:A, 7lou:A, 7lou:B, 7lov:A, 7lov:B, 3pa8:A, 3pa8:B, 3pee:B, 3pee:A, 7s0y:A, 5uqm:A, 5uqn:A, 5uqt:A, 5uqt:B
55	8qen:A	2363	164	0.1433	0.0182	0.2622	0.001	9bja:A, 9bja:B, 2bvl:A, 2bvm:A, 6c0b:A, 7lou:A, 7lou:B, 7lov:A, 7lov:B, 3pa8:A, 3pa8:B, 3pee:B, 3pee:A, 7s0y:A, 5uqm:A, 5uqn:A, 5uqt:A, 5uqt:B
56	8qen:A	2363	292	0.2433	0.0309	0.2500	0.008	9bja:A, 9bja:B, 2bvl:A, 2bvm:A, 6c0b:A, 7lou:A, 7lou:B, 7lov:A, 7lov:B, 3pa8:A, 3pa8:B, 3pee:B, 3pee:A, 7s0y:A, 5uqm:A, 5uqn:A, 5uqt:A, 5uqt:B
57	8qeo:A	2146	269	0.2300	0.0322	0.2565	1.40e-10
58	8qeo:A	2146	250	0.2167	0.0303	0.2600	4.31e-07
59	8qeo:A	2146	185	0.1633	0.0228	0.2649	1.55e-05
60	8qeo:A	2146	164	0.1433	0.0200	0.2622	0.001
61	4cnl:A	182	189	0.2300	0.3791	0.3651	7.08e-10
62	4cnl:A	182	203	0.1900	0.3132	0.2808	0.21
63	2g7c:B	254	220	0.2133	0.2520	0.2909	1.21e-07	2g7c:A
64	2g7c:B	254	138	0.1133	0.1339	0.2464	1.31e-06	2g7c:A
65	2g7c:B	254	234	0.1767	0.2087	0.2265	0.011	2g7c:A
66	2g7c:B	254	193	0.1567	0.1850	0.2435	2.2	2g7c:A
67	7pl5:BBB	183	150	0.1500	0.2459	0.3000	1.85e-05	7pl5:AAA
68	7pl5:BBB	183	125	0.1067	0.1749	0.2560	0.002	7pl5:AAA
69	5ngy:A	1265	177	0.1700	0.0403	0.2881	8.16e-05	6htv:A, 5lfc:A, 5lfc:B, 5ngy:B, 5o8l:A
70	5ngy:A	1265	107	0.1000	0.0237	0.2804	0.064	6htv:A, 5lfc:A, 5lfc:B, 5ngy:B, 5o8l:A
71	5ngy:A	1265	48	0.0600	0.0142	0.3750	7.2	6htv:A, 5lfc:A, 5lfc:B, 5ngy:B, 5o8l:A
72	6hvg:A	1278	132	0.1233	0.0290	0.2803	2.55e-04	6hvg:B, 6syq:A, 6syq:B, 6szi:A, 6szi:B, 6t16:B, 6t16:A, 6t18:A, 6t18:B, 6t1p:A, 6t1p:B
73	6hvg:A	1278	118	0.1100	0.0258	0.2797	0.002	6hvg:B, 6syq:A, 6syq:B, 6szi:A, 6szi:B, 6t16:B, 6t16:A, 6t18:A, 6t18:B, 6t1p:A, 6t1p:B
74	8y9c:B	1609	136	0.1033	0.0193	0.2279	0.002
75	2wwd:A	432	209	0.1667	0.1157	0.2392	0.003	2ww5:A, 2wwc:A
76	2wwd:A	432	141	0.1367	0.0949	0.2908	0.004	2ww5:A, 2wwc:A
77	2wwd:A	432	58	0.0667	0.0463	0.3448	0.24	2ww5:A, 2wwc:A
78	2wwd:A	432	82	0.0833	0.0579	0.3049	8.6	2ww5:A, 2wwc:A
79	8y9b:B	1607	139	0.1267	0.0236	0.2734	0.083
80	4ayg:A	1028	104	0.0933	0.0272	0.2692	0.090	4ayg:B, 3hz3:A, 3klk:A, 3kll:A
81	3tto:A	1055	185	0.1500	0.0427	0.2432	0.40	3tto:B, 3tto:C, 3tto:D, 3ttq:A, 4ttu:A, 4tvc:A, 4tvd:A
82	8tkd:A	2249	61	0.0600	0.0080	0.2951	1.2	8tkd:B, 8tkd:C, 8tkd:D, 8tke:A, 8tke:B, 8tke:C, 8tke:D, 8tkg:A, 8tkg:B, 8tkg:C, 8tkg:D, 8tl9:A, 8tl9:B, 8tla:A, 8tla:B
83	8tkf:A	2272	61	0.0600	0.0079	0.2951	1.2	8tkf:D, 8tkf:B, 8tkf:C
84	7ml7:A	1216	95	0.0833	0.0206	0.2632	1.2
85	7ml7:A	1216	74	0.0700	0.0173	0.2838	1.6
86	6qtc:A	195	127	0.1100	0.1692	0.2598	1.5
87	8olu:L	202	82	0.0900	0.1337	0.3293	1.6	8olu:Z, 6qm7:L, 6qm7:Z, 6tcz:L, 6tcz:l, 6td5:L, 6td5:l, 7zyj:L, 7zyj:l
88	2bv8:B	172	83	0.0800	0.1395	0.2892	2.5
89	4amc:A	1019	226	0.1967	0.0579	0.2611	3.5
90	8sm6:D	354	72	0.0633	0.0537	0.2639	5.5	8sm6:A, 8sm6:B, 8sm6:C, 8sma:A, 8sma:B, 8sma:G, 8sma:J
91	8do6:E	205	111	0.0833	0.1220	0.2252	7.1	8do6:G, 8do6:F, 7uzw:A, 7uzw:B, 7uzw:C, 7uzw:D, 7uzx:A, 7uzx:B, 7uzx:C, 7uzx:D, 7uzy:D, 7uzy:C, 7uzy:A, 7uzy:B, 7uzz:D, 7uzz:C, 7uzz:A, 7uzz:B, 7v00:A, 7v00:B, 7v00:C, 7v00:D, 7v01:A, 7v01:B, 7v01:C, 7v02:A, 7v02:B, 7v02:C
92	7t3q:A	2103	61	0.0567	0.0081	0.2787	9.1	7t3q:B, 7t3q:C, 7t3q:D, 7t3u:B
93	6jgz:B	3485	83	0.0667	0.0057	0.2410	9.2	6jg3:A, 6jg3:B, 6jg3:C, 6jg3:D, 6jgz:D, 6jgz:F, 6jgz:H, 6jh6:B, 6jh6:D, 6jh6:F, 6jh6:H, 6jhn:A, 6jhn:C, 6jhn:E, 6jhn:G, 6ji0:A, 6ji0:C, 6ji0:E, 6ji0:G, 6jrr:A, 6jrr:C, 6jrr:E, 6jrr:G
94	5go9:A	3423	83	0.0667	0.0058	0.2410	9.3	5go9:B, 5go9:C, 5go9:D, 5goa:A, 5goa:B, 5goa:C, 5goa:D
95	6jrs:A	3488	83	0.0667	0.0057	0.2410	9.3	6jrs:D, 6jrs:G, 6jrs:J
96	6jiy:A	3521	83	0.0667	0.0057	0.2410	9.3	6ji8:A, 6ji8:D, 6ji8:G, 6ji8:J, 6jii:B, 6jii:E, 6jii:H, 6jii:K, 6jiu:A, 6jiu:D, 6jiu:G, 6jiu:J, 6jiy:D, 6jiy:G, 6jiy:J, 6jv2:A, 6jv2:C, 6jv2:E, 6jv2:G

[Back]