BioLiP

>protein
NSVIETILNHRSIRKYEDKPLSEEQIQTIVESAQAASTSSYIQAYSIIGVKDKETKRKLAQLAGNQPYVETNGHFFVFCA
DFHRHDVIAEMEKKDLSTALESTEQFMVAIIDVALAAQNATLAAESMGLGACYIGGLRNELEEVSKLLKLPHHVIPLFGL
TVGHPAGITDKKPRLPFKHVYHEETYEPNDEQTKKELTAYNEEISAYYNERTNGKRQDTWTGQMAEMLSNPKRMYMKEFV
EKQGFNK

The query sequence (length=247) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5hdj:B	248	247	1.0000	0.9960	1.0000	0.0	5hdj:A
2	3n2s:A	248	247	0.5951	0.5927	0.5951	8.36e-113	3n2s:B, 3n2s:C, 3n2s:D
3	8ajx:A	240	242	0.4372	0.4500	0.4463	1.00e-67	1f5v:A, 1f5v:B, 7nb9:A, 7niy:A, 7nmp:A, 7nnx:A, 7q0o:A, 7z0w:A, 7z0w:B, 7z0w:C, 7z0w:D, 7z0w:E, 7z0w:F, 7z0w:G, 7z0w:H
4	1zch:A	249	248	0.4251	0.4217	0.4234	7.99e-66
5	5uu6:C	236	247	0.4049	0.4237	0.4049	7.12e-63	5uu6:A, 5uu6:B, 5uu6:D
6	1bkj:A	230	247	0.4089	0.4391	0.4089	3.48e-61	1bkj:B, 2bkj:A, 2bkj:B
7	5hei:A	246	245	0.4008	0.4024	0.4041	3.26e-58	5hei:B, 5hei:C, 5hei:D, 5hei:E, 5hei:F, 5hei:G, 5hei:H
8	3eof:A	248	202	0.2591	0.2581	0.3168	5.75e-30	3eof:B
9	3m5k:A	168	184	0.2227	0.3274	0.2989	3.63e-21	3m5k:B
10	4dn2:A	191	189	0.2024	0.2618	0.2646	2.76e-14	4dn2:B
11	3kwk:A	168	179	0.1862	0.2738	0.2570	4.41e-14
12	4g8s:A	182	176	0.1943	0.2637	0.2727	1.07e-12	4g8s:B
13	3ge5:A	176	179	0.1660	0.2330	0.2291	1.99e-12	3ge5:B
14	8uc3:A	180	162	0.1943	0.2667	0.2963	5.89e-12	8uc3:B
15	8cqt:B	164	172	0.1822	0.2744	0.2616	4.34e-10	8cqt:A
16	1nox:A	200	86	0.1174	0.1450	0.3372	1.07e-08
17	5j6c:A	173	132	0.1700	0.2428	0.3182	1.46e-08	5j6c:B
18	3gfa:A	197	194	0.1862	0.2335	0.2371	2.53e-08	3gfa:B
19	5j62:B	209	146	0.1619	0.1914	0.2740	3.40e-08	5j62:A
20	3e10:B	167	170	0.1700	0.2515	0.2471	1.26e-07	3e10:A
21	3ek3:A	187	150	0.1457	0.1925	0.2400	5.38e-07
22	3gag:A	206	172	0.1579	0.1893	0.2267	8.12e-06	3gag:B, 3gag:C, 3gag:D
23	3e39:A	175	189	0.1822	0.2571	0.2381	8.64e-05	3e39:B
24	3gr3:A	226	197	0.1619	0.1770	0.2030	1.60e-04	3gr3:B
25	2isj:A	219	206	0.1862	0.2100	0.2233	2.50e-04	2isj:B, 2isj:C, 2isj:D, 2isj:E, 2isj:F, 2isj:G, 2isj:H, 2isk:A, 2isk:B, 2isk:C, 2isk:D, 2isk:E, 2isk:F, 2isk:G, 2isk:H, 2isl:A, 2isl:B, 2isl:C, 2isl:D, 2isl:E, 2isl:F, 2isl:G, 2isl:H
26	3eo8:A	219	172	0.1336	0.1507	0.1919	3.68e-04	3eo8:B, 3eo8:C, 3eo8:D, 3eo8:E, 3eo8:F
27	3koq:A	173	181	0.1538	0.2197	0.2099	5.46e-04	3h4o:A, 3koq:B, 3koq:C, 3koq:D
28	3pxv:B	189	199	0.2308	0.3016	0.2864	0.001	3pxv:A, 3pxv:C, 3pxv:D
29	4xoq:A	204	66	0.0850	0.1029	0.3182	0.036	4xoo:A, 4xoo:B, 4xoo:C, 4xoo:D, 4xoq:B, 4xoq:C, 4xoq:D
30	5hxd:A	237	105	0.1215	0.1266	0.2857	0.12	5hxd:B
31	4ttc:A	220	76	0.0729	0.0818	0.2368	0.23	4ttc:B, 4ttc:C, 4ttc:D, 4ttc:E, 4ttc:F, 5yak:A, 5yak:F, 5yak:B, 5yak:C, 5yak:D, 5yak:E
32	7dp0:A	223	44	0.0526	0.0583	0.2955	0.34	7dp0:B, 7dp1:A, 7dp1:B, 7dp2:A, 7dp2:B
33	4ttb:A	189	55	0.0526	0.0688	0.2364	0.57	4ttb:B
34	3tnz:A	222	55	0.0526	0.0586	0.2364	1.4	3gfd:A, 3gfd:B, 3gh8:A, 3gh8:B, 3gh8:C, 3gh8:D, 3gh8:E, 3gh8:F, 3gh8:G, 3gh8:H, 3tnz:B
35	8fkp:NS	305	57	0.0810	0.0656	0.3509	1.8	8fkr:NS, 8fkt:NS, 8fkv:NS
36	3gb5:A	185	46	0.0445	0.0595	0.2391	4.4	3to0:A, 3to0:B
37	4f0c:A	228	89	0.1053	0.1140	0.2921	4.4	5o00:A
38	2r01:A	195	67	0.0769	0.0974	0.2836	6.0
39	1m0u:A	203	34	0.0486	0.0591	0.3529	7.0
40	6s2e:A	1006	96	0.1012	0.0249	0.2604	7.2	6s2f:A
41	8wbu:A	391	73	0.0810	0.0512	0.2740	9.1	7d5g:A, 8wbv:A
42	8w1o:K	1290	34	0.0526	0.0101	0.3824	9.4
43	6g0a:A	1104	81	0.0891	0.0199	0.2716	9.5	8b67:A, 6fwk:B, 6i8a:B, 7r3y:B
44	4m8o:A	1126	81	0.0891	0.0195	0.2716	9.7	8b6k:A, 8b6k:B, 8b76:B, 8b76:A, 8b77:A, 8b79:B, 8b79:A, 8b7e:B, 8b7e:A, 6fwk:A, 6h1v:A, 6i8a:A, 5oki:B, 4ptf:A, 6qib:A, 7r3x:A, 7r3y:A, 8tw9:E, 8twa:E

[Back]