BioLiP

>protein
NLPSILVPMVGIVLPAIVMALLFVYIETDE

The query sequence (length=30) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7dr0:I	30	30	1.0000	1.0000	1.0000	2.16e-14	7dr1:I, 7dr2:aI, 7dr2:bI, 7dr2:cI, 7dr2:dI
2	8htu:I	34	29	0.6667	0.5882	0.6897	3.71e-09	7ksq:I, 7kux:I, 6l35:I, 7xqp:I
3	8wm6:I	34	29	0.6000	0.5294	0.6207	2.25e-08	8wmj:I, 8wmv:I, 8wmw:I
4	7a4p:I	35	29	0.6333	0.5429	0.6552	2.55e-08	6zzx:I, 6zzy:I
5	7wfd:AI	33	30	0.6000	0.5455	0.6000	4.05e-08	8j6z:I, 8j7a:I, 8j7b:I, 7wfe:BI, 7wg5:AI, 7wg5:BI
6	6l4u:I	35	29	0.6000	0.5143	0.6207	5.38e-08
7	7yca:I	35	29	0.6000	0.5143	0.6207	8.91e-08
8	8bcv:I	33	30	0.5667	0.5152	0.5667	1.28e-07	8bcw:I, 7ew6:I, 7ewk:I, 7f9o:I, 7f9o:l, 5zji:I
9	7qco:I	39	29	0.6000	0.4615	0.6207	1.75e-07	7qco:P, 7qco:p, 7qco:i
10	7dz7:I	42	27	0.6000	0.4286	0.6667	2.51e-07	7bgi:I, 7blx:I, 8cmo:I, 7d0j:I, 7dz8:I, 6ijj:I, 6ijo:I, 6jo5:I, 6jo6:I, 7r3k:I, 7zq9:I, 7zq9:I2, 7zqc:I, 7zqd:I, 7zqd:I2
11	7y5e:IN	31	26	0.6333	0.6129	0.7308	3.58e-07	7y5e:I2, 7y7a:I7, 7y7a:Io
12	6kif:I	38	28	0.5667	0.4474	0.6071	3.91e-07	6kif:S, 6kif:k, 6kig:I, 6kig:S, 6kig:k
13	6vpv:I	38	28	0.6000	0.4737	0.6429	6.77e-07	6vpv:i, 6vpv:7
14	8am5:i	40	28	0.5333	0.4000	0.5714	8.46e-07	8asl:i, 8asp:i, 6hqb:I, 4l6v:I, 4l6v:i, 4l6v:9, 6nwa:I, 6nwa:i, 6nwa:R, 5oy0:I, 5oy0:i, 5oy0:h, 7umh:I, 7umh:R, 7umh:i, 6uzv:I, 6uzv:i, 6uzv:h
15	6igz:I	32	27	0.6000	0.5625	0.6667	1.82e-06
16	7y7b:I	33	28	0.5000	0.4545	0.5357	1.96e-06	7y8a:I
17	6ly5:i	33	29	0.5000	0.4545	0.5172	3.24e-06	7dkz:I, 5l8r:I, 3lw5:I, 2o01:I, 2wsc:I, 2wse:I, 2wsf:I, 4xk8:i, 6yac:I, 6yez:I, 6zoo:I, 6zxs:I
18	6kmw:aI	38	28	0.5333	0.4211	0.5714	7.34e-06	6kmw:cI, 6kmw:bI
19	8wey:I	32	26	0.6000	0.5625	0.6923	2.52e-05	7blz:I, 5zgb:I, 5zgh:I
20	6sl5:I	39	25	0.4333	0.3333	0.5200	2.38e-04
21	4fe1:I	38	28	0.4667	0.3684	0.5000	4.56e-04	7fix:I1, 7fix:I2, 7fix:I3, 1jb0:I, 6k33:aI, 6k33:bI, 6k33:cI, 6lu1:I, 7m75:I, 7m76:I, 7m78:I, 3pcq:I, 6pfy:I, 6pfy:R, 6pfy:e, 6pgk:I, 6pgk:R, 6pgk:e, 6tra:I, 6trc:I, 6trc:7, 6trc:i, 6trd:I, 6trd:7, 6trd:i, 5zf0:I1, 5zf0:I2, 5zf0:I3, 5zf0:I4, 5zf0:I5, 5zf0:I6
22	6k61:I	34	29	0.4333	0.3824	0.4483	0.001	6jeo:aI, 6jeo:bI, 6jeo:cI, 6jeo:dI, 6k61:i, 6tcl:I1, 6tcl:I2, 6tcl:I, 6tcl:II, 7y3f:I
23	7lx0:R	42	28	0.4000	0.2857	0.4286	0.026	7lx0:I, 7lx0:i, 6pnj:I, 6pnj:R, 6pnj:i
24	7s3d:I	42	28	0.3667	0.2619	0.3929	0.029	7s3d:i, 7s3d:R
25	6kmx:aI	41	28	0.3333	0.2439	0.3571	0.074	6kmx:cI, 6kmx:bI
26	8jze:i	119	22	0.2667	0.0672	0.3636	0.17	8jzf:i
27	8jjr:i	120	22	0.2667	0.0667	0.3636	0.82
28	7coy:aI	30	26	0.3000	0.3000	0.3462	4.5	7coy:bI, 7coy:cI

[Back]