Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
NLKVLLLYCAFLLVMLLAYASIFRYLMWHLEGRAYSFMAGIYWTITVMTTLGFGDITFESDAGYLFASIVTVSGVIFLDI
ILPFGFVSMFLAPWIERRLRYHPTIELPDDTRGHILIFGIDPITRTLIRKLESRNHLFVVVTDNYDQALHLEEQEGFKVV
YGSPTDAHVLAGLRVAAARSIIANLSDPDNANLCLTVRSLCQTPIIAVVKEPVHGELLRLAGANQVVPLTRILGRYLGIR
ATTCGALAHILDSFGNLQIAELPVHGTPFAGKTIGESGIRQRTGLSIIGVWERGSLTTPQRETVLTEQSLLVLAGTKSQL
AALEYLIGEAPEDELIFIIGHGRIGCAAAAFLDRKPVPFILIDRQESPVCNDHVVVYGDATVGQTLRQAGIDRASGIIVT
TNDDSTNIFLTLACRHLHSHIRIVARANGEENVDQLYAAGADFVVSNASVGANILGNLLEHKESAFLSEGMAVFRRPLPP
AMAGKTIAETRLRPLTGCSIVAIEAPDRADILISPPPETILAEGARLILIGTSEQEKTFDQTIAAR

The query sequence (length=546) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4gx2:B 548 546 1.0000 0.9964 1.0000 0.0 4gvl:A, 4gvl:B, 4gvl:D, 4gvl:C, 4gx0:B, 4gx0:C, 4gx1:B, 4gx1:C, 4gx2:C, 4gx5:B, 4gx5:C
2 4gx0:D 376 309 0.4725 0.6862 0.8350 1.76e-175 4gx0:A, 4gx1:A, 4gx1:D, 4gx2:A, 4gx2:D, 4gx5:A, 4gx5:D
3 4gx0:D 376 160 0.2582 0.3750 0.8812 6.85e-88 4gx0:A, 4gx1:A, 4gx1:D, 4gx2:A, 4gx2:D, 4gx5:A, 4gx5:D
4 6oly:C 318 302 0.1465 0.2516 0.2649 6.89e-12 2aef:A, 2aef:B, 5bkj:A, 5bkj:C, 5bkj:E, 5bkj:G, 5bkk:A, 5bkk:C, 5bkk:G, 8fz7:A, 8fz7:C, 8fz7:E, 8fz7:G, 3kxd:A, 3kxd:B, 4l73:A, 4l73:B, 4l74:A, 4l74:B, 4l75:A, 4l75:B, 4l75:C, 4l75:D, 4l75:E, 4l75:F, 4l76:A, 4l76:B, 4l76:C, 4l76:D, 4l76:E, 4l76:F, 1lnq:A, 1lnq:B, 1lnq:C, 1lnq:D, 1lnq:E, 1lnq:F, 1lnq:G, 1lnq:H, 6oly:A, 6oly:B, 6oly:D, 3rbx:A, 3rbx:B, 3rbx:C, 3rbx:D, 3rbx:E, 3rbx:F, 6u5n:A, 6u5n:E, 6u5n:B, 6u5n:F, 6u5n:C, 6u5n:G, 6u5n:D, 6u5n:H, 6u5p:A, 6u5p:E, 6u5p:B, 6u5p:F, 6u5p:C, 6u5p:G, 6u5p:D, 6u5p:H, 6u5r:A, 6u5r:B, 6u5r:C, 6u5r:D, 6u5r:E, 6u5r:F, 6u5r:G, 6u5r:H, 6uwn:A, 6uwn:E, 6uwn:B, 6uwn:F, 6uwn:C, 6uwn:G, 6uwn:D, 6uwn:H, 6ux4:A, 6ux4:E, 6ux4:B, 6ux4:F, 6ux4:C, 6ux4:G, 6ux4:D, 6ux4:H
5 6oly:C 318 179 0.0861 0.1478 0.2626 2.57e-11 2aef:A, 2aef:B, 5bkj:A, 5bkj:C, 5bkj:E, 5bkj:G, 5bkk:A, 5bkk:C, 5bkk:G, 8fz7:A, 8fz7:C, 8fz7:E, 8fz7:G, 3kxd:A, 3kxd:B, 4l73:A, 4l73:B, 4l74:A, 4l74:B, 4l75:A, 4l75:B, 4l75:C, 4l75:D, 4l75:E, 4l75:F, 4l76:A, 4l76:B, 4l76:C, 4l76:D, 4l76:E, 4l76:F, 1lnq:A, 1lnq:B, 1lnq:C, 1lnq:D, 1lnq:E, 1lnq:F, 1lnq:G, 1lnq:H, 6oly:A, 6oly:B, 6oly:D, 3rbx:A, 3rbx:B, 3rbx:C, 3rbx:D, 3rbx:E, 3rbx:F, 6u5n:A, 6u5n:E, 6u5n:B, 6u5n:F, 6u5n:C, 6u5n:G, 6u5n:D, 6u5n:H, 6u5p:A, 6u5p:E, 6u5p:B, 6u5p:F, 6u5p:C, 6u5p:G, 6u5p:D, 6u5p:H, 6u5r:A, 6u5r:B, 6u5r:C, 6u5r:D, 6u5r:E, 6u5r:F, 6u5r:G, 6u5r:H, 6uwn:A, 6uwn:E, 6uwn:B, 6uwn:F, 6uwn:C, 6uwn:G, 6uwn:D, 6uwn:H, 6ux4:A, 6ux4:E, 6ux4:B, 6ux4:F, 6ux4:C, 6ux4:G, 6ux4:D, 6ux4:H
6 3rbz:A 289 179 0.0861 0.1626 0.2626 2.31e-11 3rbz:B, 3rbz:C, 3rbz:D
7 3rbz:A 289 301 0.1337 0.2526 0.2425 1.58e-10 3rbz:B, 3rbz:C, 3rbz:D
8 4j9v:A 456 327 0.1484 0.1776 0.2477 1.08e-09 4j9u:H, 4j9u:G, 4j9u:E, 4j9u:F, 4j9v:B, 6v4k:E, 6v4k:F, 6v4k:G, 6v4k:H, 6v4l:C, 6v4l:D
9 1lss:A 132 131 0.0751 0.3106 0.3130 1.82e-07 1lss:B, 1lss:C, 1lss:D
10 8by2:A 548 165 0.0824 0.0821 0.2727 7.67e-07 8bxg:A, 8bxg:B, 8by2:B, 9emb:A, 9emb:B
11 8by2:A 548 90 0.0513 0.0511 0.3111 9.9 8bxg:A, 8bxg:B, 8by2:B, 9emb:A, 9emb:B
12 2g1u:A 137 107 0.0531 0.2117 0.2710 1.35e-06 3l4b:A, 3l4b:B, 3l4b:E, 3l4b:F
13 6i8v:A 216 218 0.1007 0.2546 0.2523 2.73e-06
14 3l9x:A 336 132 0.0696 0.1131 0.2879 3.76e-05 3l9x:B
15 3l9x:A 336 90 0.0513 0.0833 0.3111 4.5 3l9x:B
16 7e8e:D 459 78 0.0513 0.0610 0.3590 4.40e-05 7e87:B, 7e87:A, 7e87:C, 7e87:D, 7e8e:B, 1nn7:A, 7ukg:A, 7ukg:B, 7ukg:C, 7ukg:D
17 3l9w:B 357 132 0.0696 0.1064 0.2879 5.05e-05 3eyw:A, 3eyw:B, 3l9w:A
18 3l9w:B 357 90 0.0513 0.0784 0.3111 5.4 3eyw:A, 3eyw:B, 3l9w:A
19 4j7c:B 217 75 0.0403 0.1014 0.2933 0.001 2hms:A, 2hms:B, 2hms:C, 2hms:D, 2hmt:A, 2hmt:B, 2hmu:A, 2hmu:B, 2hmv:A, 2hmv:B, 2hmw:A, 2hmw:B, 4j7c:A, 4j7c:C, 4j7c:D, 4j7c:E, 4j7c:F, 4j7c:G, 4j7c:H, 4j90:A, 4j90:B, 4j91:A, 4j91:B, 4j91:C, 4j91:D, 8k16:A, 8k16:B, 8k1k:A, 8k1k:B, 8k1s:A, 8k1s:B, 8k1s:C, 8k1s:D, 8k1s:E, 8k1s:F, 8k1s:G, 8k1s:H, 8k1t:A, 8k1t:B, 8k1t:C, 8k1t:D, 8k1t:E, 8k1t:F, 8k1t:G, 8k1t:H, 8k1u:A, 8k1u:B, 8k1u:C, 8k1u:D, 8k1u:E, 8k1u:F, 8k1u:G, 8k1u:H, 1lsu:A, 1lsu:B, 6s2j:A, 6s2j:B, 6s5b:A, 6s5b:B, 6s5b:C, 6s5b:D, 6s5b:E, 6s5b:F, 6s5b:G, 6s5b:H, 6s5c:A, 6s5c:B, 6s5d:A, 6s5d:B, 6s5e:A, 6s5e:B, 6s5e:C, 6s5e:D, 6s5e:E, 6s5e:F, 6s5e:G, 6s5e:H, 6s5g:A, 6s5g:B, 6s5g:C, 6s5g:D, 6s5g:E, 6s5g:F, 6s5g:G, 6s5g:H, 6s5n:A, 6s5n:B, 6s5n:C, 6s5n:D, 6s5n:E, 6s5n:F, 6s5n:G, 6s5n:H, 6s5o:A, 6s5o:B, 6s5o:C, 6s5o:D, 6s5o:E, 6s5o:F, 6s5o:G, 6s5o:H, 6s7r:A, 6s7r:B, 6s7r:C, 6s7r:D, 6s7r:E, 6s7r:F, 6s7r:G, 6s7r:H, 6s7r:I, 6s7r:J, 6s7r:K, 6s7r:L, 6s7r:M, 6s7r:N, 6s7r:O, 6s7r:P, 8xmh:A, 8xmh:B, 8xmh:C, 8xmh:D, 8xmh:E, 8xmh:F, 8xmh:G, 8xmh:H, 8xmi:A, 8xmi:B, 8xmi:C, 8xmi:D, 8xmi:E, 8xmi:F, 8xmi:G, 8xmi:H
20 7yid:A 660 114 0.0513 0.0424 0.2456 0.005 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
21 7agv:F 163 81 0.0440 0.1472 0.2963 0.015 7agv:A, 7agv:B, 7agv:C, 7agv:D, 7agv:E, 7agv:G, 7agv:H, 7ahm:A, 7ahm:B, 7ahm:C, 7ahm:D
22 8quc:A 395 44 0.0256 0.0354 0.3182 0.028 8f1c:A, 8f1c:B, 8f1c:C, 8f1c:D, 8f1d:A, 8f1d:B, 8f1d:C, 8f1d:D, 7phi:C, 7phi:B, 7phi:D, 8quc:B, 8quc:D, 8quc:C, 8qud:A, 8qud:B, 8qud:C, 8qud:D
23 8vt9:A 406 46 0.0238 0.0320 0.2826 0.030 6cjq:A, 6cjq:B, 6cjq:C, 6cjq:D, 6cjt:A, 6cjt:B, 6cjt:C, 6cjt:D, 6cju:A, 6cju:B, 6cju:C, 6cju:D, 4d7s:A, 4d7s:B, 4d7t:A, 7rsh:A, 7rsh:B, 7rsh:C, 7rsh:D, 7rtf:A, 7rtf:B, 7rtf:C, 7rtf:D, 7rtj:A, 7rtj:B, 7rtj:C, 7rtj:D, 7tj5:A, 7tj5:B, 7tj5:C, 7tj5:D, 7tj6:A, 7tj6:B, 7tj6:C, 7tj6:D, 7tkt:A, 7tkt:B, 7tkt:C, 7tkt:D, 8vt9:D, 8vt9:B, 8vt9:C, 8vta:A, 8vta:B, 8vta:C, 8vta:D, 8vtb:A, 8vtb:B, 8vtb:C, 8vtb:D, 6vxz:A, 6vxz:B, 6vxz:C, 6vxz:D
24 7ryr:A 389 38 0.0238 0.0334 0.3421 0.034 7ru0:A, 7ru0:B, 7ru0:C, 7ru0:D, 7ryr:C, 7ryr:D, 7ryr:B, 7rys:A, 7rys:B, 7rys:C, 7rys:D
25 4xtt:A 85 62 0.0385 0.2471 0.3387 0.039 4xtt:B
26 5nc8:A 159 93 0.0476 0.1635 0.2796 0.062 5nc8:B
27 8hir:A 918 98 0.0476 0.0283 0.2653 0.064 8hir:B, 8hir:C, 8hir:D, 8hk6:A, 8hk6:B, 8hk6:C, 8hk6:D, 8hkf:A, 8hkf:B, 8hkf:C, 8hkf:D, 8hkk:A, 8hkk:B, 8hkk:C, 8hkk:D, 8hkm:A, 8hkm:B, 8hkm:C, 8hkm:D, 8hkq:D, 8hkq:A, 8hkq:C, 8hkq:B
28 4uuj:C 111 74 0.0403 0.1982 0.2973 0.064 2bob:C, 2dwd:C, 2dwe:C, 2h8p:C, 2h8p:D, 2hfe:C, 2hfe:D, 2hg5:C, 2hg5:D, 2hvj:C, 3ifx:A, 3ifx:B, 3ifx:C, 3ifx:D, 2jk5:C, 7m2h:C, 7m2h:F, 3stz:C, 8thn:C, 2w0f:C
29 7b5y:A 206 178 0.0806 0.2136 0.2472 0.12 7b5u:A, 7b5u:B, 7b5y:C, 7b5y:B, 7b5y:D, 7oz3:A, 7oz3:B, 7oz3:C, 7oz3:D
30 8k1j:B 242 47 0.0311 0.0702 0.3617 0.18 8k1j:A, 8k1q:A, 8k1q:B, 8k1v:A, 8k1v:B, 8k1z:A, 8k1z:B
31 3um7:A 259 49 0.0256 0.0541 0.2857 0.20 4i9w:A, 7lj4:A, 7lj5:A, 7lja:A, 7ljb:A, 4rue:A, 4rue:B, 4ruf:A, 4ruf:B, 3um7:B, 4wfe:A, 4wff:A, 4wfg:A, 4wfh:A
32 8ctn:B 96 47 0.0293 0.1667 0.3404 0.23 8cts:B, 8ctu:B, 8cu2:B, 8cu3:B, 8cu4:B, 6dz1:B, 6fiz:C, 6fiz:D, 6fiz:E, 6fiz:G, 6fiz:H, 6fiz:J, 6fiz:L, 6fiz:N, 6fiz:A, 6fiz:O, 6fiz:P, 4r50:B, 4r6z:A, 4r6z:B, 4r7c:C, 4r8c:A, 4ro2:A, 4ro2:B, 4ro2:D
33 3fwz:A 140 130 0.0568 0.2214 0.2385 0.25 3fwz:B
34 6rv2:D 261 47 0.0275 0.0575 0.3191 0.32 6rv2:A, 6rv2:B, 6rv2:C, 6rv3:A, 6rv3:B, 6rv3:C, 6rv3:D, 6rv4:A, 6rv4:B, 6rv4:C, 6rv4:D
35 1jw9:B 240 58 0.0385 0.0875 0.3621 0.50 1jwa:B, 1jwb:B
36 6v35:A 914 173 0.0696 0.0416 0.2197 1.1 6v35:D, 6v35:B, 6v35:C, 8z3s:A, 8z3s:B, 8z3s:C, 8z3s:D
37 4chv:D 343 35 0.0220 0.0350 0.3429 1.1 4chw:D, 3cl1:A, 3cl1:B, 3clp:A, 3clp:C, 2k0g:A, 4muv:A, 4muv:B, 1u12:A, 1u12:B, 1vp6:A, 1vp6:C
38 5wie:B 390 82 0.0440 0.0615 0.2927 1.2 4jta:B, 4jtc:B, 4jtd:B, 3lnm:B, 2r9r:B
39 8ghf:A 910 173 0.0696 0.0418 0.2197 1.2 8ghf:B, 8ghf:C, 8ghf:D, 3mt5:A, 8s3e:A, 8s3e:B, 8s3e:C, 8s3e:D, 3u6n:A, 3u6n:B, 3u6n:C, 3u6n:D, 3u6n:E, 3u6n:F, 3u6n:G, 3u6n:H, 6v22:A, 6v22:B, 6v22:C, 6v22:D, 6v38:A, 6v38:B, 6v38:C, 6v38:D, 6v5a:A, 7ynz:A, 7ynz:C, 7ynz:E, 7ynz:G, 7yo0:A, 7yo0:C, 7yo0:E, 7yo0:G, 7yo1:A, 7yo1:C, 7yo1:E, 7yo1:G, 7yo3:A, 7yo5:A, 7yo5:B, 7yo5:C, 7yo5:D
40 5dgx:A 233 84 0.0495 0.1159 0.3214 1.7
41 5wie:H 328 82 0.0440 0.0732 0.2927 1.8 3lnm:D
42 1vrg:A 515 69 0.0440 0.0466 0.3478 1.9 1vrg:B, 1vrg:C, 1vrg:D, 1vrg:E, 1vrg:F
43 7cr7:A 354 83 0.0476 0.0734 0.3133 2.0 7cr1:A, 7cr1:B, 7cr1:C, 7cr1:D, 7cr2:B, 7cr2:C, 7cr2:D, 7cr2:A, 7cr4:A, 7cr4:B, 7cr4:D, 7cr4:F, 7cr7:G, 7cr7:B, 7cr7:D, 8ijk:A, 8ijk:C, 8ijk:B, 8ijk:D, 8izy:A, 8izy:B, 8izy:D, 8izy:C, 8j01:G, 8j01:A, 8j01:B, 8j01:D, 8j02:G, 8j02:A, 8j02:B, 8j02:D, 8j03:A, 8j03:D, 8j03:G, 8j03:I, 8j04:A, 8j04:G, 8j04:B, 8j04:D, 8w4u:A, 8w4u:B, 8w4u:D, 8w4u:G
44 4jta:Q 363 82 0.0440 0.0661 0.2927 2.1 4jtc:H, 4jtd:H, 2r9r:H
45 7ssy:A 346 44 0.0275 0.0434 0.3409 2.4 7ssy:B, 7ssy:C, 7ssy:D, 7wf3:B, 7wf3:D, 7wf3:F, 7wf3:H
46 8x43:A 327 83 0.0476 0.0795 0.3133 2.5 8j00:A, 8j00:B, 8j00:C, 8j00:D, 8x43:G, 8x43:C, 8x43:E
47 6v1x:A 446 30 0.0220 0.0269 0.4000 2.6 6v1x:B, 6v1x:C, 6v1x:D, 6v1y:A, 6v1y:B, 6v1y:C, 6v1y:D, 6v1y:M, 6v1y:N, 6v1y:O, 6v1y:P
48 7m6j:E 296 163 0.0568 0.1047 0.1902 4.3 7m6j:B, 6upa:B
49 8qz3:B 266 62 0.0311 0.0639 0.2742 4.5 4bw5:A, 4bw5:B, 4bw5:D, 8qz2:A, 8qz2:B, 8qz3:A, 8qz4:A, 8qz4:B, 4xdj:A, 4xdj:B, 4xdj:D, 4xdk:A, 4xdk:B, 4xdl:A, 4xdl:B, 4xdl:D
50 7xnk:A 348 74 0.0348 0.0546 0.2568 6.3 7tci:A, 7tci:G, 7tci:E, 7tci:C, 4umo:A, 6v01:A, 6v01:J, 6v01:D, 6v01:G, 7xnk:C, 7xnk:E, 7xnk:G, 7xnl:A, 7xnl:C, 7xnl:E, 7xnl:G, 7xnn:B, 7xnn:G, 7xnn:C, 7xnn:E
51 1a8h:A 500 83 0.0385 0.0420 0.2530 6.4 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
52 6z5s:W 94 95 0.0495 0.2872 0.2842 6.4
53 6cq6:B 282 47 0.0348 0.0674 0.4043 8.6 6cq6:A, 6cq8:A, 6cq8:B, 6cq9:A, 6cq9:B, 4twk:A, 8ue2:A, 8ue2:B, 8ue9:A, 8ue9:B, 8uec:A, 8uec:B, 8uf6:A, 8uf6:B, 6v36:B, 6v37:A, 6v37:B, 6v3i:B, 6w7b:B, 6w7c:A, 6w7c:B, 6w7d:B, 6w7e:B, 6w82:A, 6w82:B, 6w83:A, 6w83:B, 6w84:A, 6w84:B, 6w85:A, 6w85:B, 6w86:A, 6w86:B, 6w87:A, 6w87:B, 6w88:A, 6w88:B, 6w8a:A, 6w8a:B, 6w8c:A, 6w8c:B, 6w8f:A, 6w8f:B
54 8dp2:A 446 31 0.0183 0.0224 0.3226 9.6 7u35:A, 7u35:B, 7u35:C
55 7cb9:A 466 66 0.0348 0.0408 0.2879 9.8 5ylw:A, 5ym3:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218