Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
NIVTVTLNMERHHFLGISIVGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNDVNFENMSNDDAVRVLREIVSQTGPISLTVA
KA

The query sequence (length=82) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2kaw:A 90 90 0.9756 0.8889 0.8889 3.66e-51 6lcb:A, 2mx6:A
2 6zbq:A 89 85 0.8659 0.7978 0.8353 1.43e-46 6zc4:A
3 1l6o:A 95 89 0.8537 0.7368 0.7865 2.04e-43 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
4 8bq8:C 93 61 0.2927 0.2581 0.3934 3.46e-09 8bq8:A, 8bq8:B
5 2exg:A 101 92 0.4024 0.3267 0.3587 6.52e-09 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
6 8bp4:A 93 77 0.3171 0.2796 0.3377 1.47e-08 8bp4:C, 8bp4:B
7 7p73:A 420 46 0.2439 0.0476 0.4348 4.39e-07 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 2m0z:A 97 46 0.2439 0.2062 0.4348 5.48e-07 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
9 1b8q:A 127 78 0.3293 0.2126 0.3462 5.57e-07
10 2ka9:A 189 64 0.3049 0.1323 0.3906 8.32e-07 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
11 2ka9:A 189 65 0.2927 0.1270 0.3692 1.04e-04 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
12 7pc3:A 405 64 0.2927 0.0593 0.3750 9.20e-07 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
13 8cn1:H 101 65 0.2927 0.2376 0.3692 1.84e-06 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
14 2koh:A 111 66 0.2927 0.2162 0.3636 1.89e-06 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
15 8bv7:A 95 46 0.1951 0.1684 0.3478 8.86e-06 8buw:A, 8buw:B
16 3jxt:A 96 71 0.2927 0.2500 0.3380 1.21e-04 3jxt:B
17 3tsz:A 341 49 0.2073 0.0499 0.3469 1.66e-04 3shw:A
18 4xh7:A 110 69 0.2805 0.2091 0.3333 1.74e-04
19 7x2e:A 163 64 0.2927 0.1472 0.3750 5.96e-04 2kbs:A
20 4wyu:A 201 48 0.2073 0.0846 0.3542 8.60e-04 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
21 5heb:A 119 58 0.2561 0.1765 0.3621 0.001 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
22 5zys:A 90 60 0.2561 0.2333 0.3500 0.002
23 8c1t:A 90 69 0.2683 0.2444 0.3188 0.002 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
24 6xa7:B 96 46 0.1951 0.1667 0.3478 0.003 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
25 3cyy:B 81 40 0.1951 0.1975 0.4000 0.003 3cyy:A
26 4xhv:A 94 51 0.2073 0.1809 0.3333 0.003
27 2ejy:A 85 56 0.2195 0.2118 0.3214 0.007
28 7p70:A 407 59 0.2561 0.0516 0.3559 0.013 7pc4:A, 7qql:A
29 5n7d:A 423 61 0.2073 0.0402 0.2787 0.014 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
30 6gbe:A 119 45 0.1585 0.1092 0.2889 0.020
31 1n7f:A 86 72 0.2561 0.2442 0.2917 0.044 1n7f:B
32 5f67:A 98 71 0.2927 0.2449 0.3380 0.046 5f67:B
33 2kpl:A 129 61 0.2073 0.1318 0.2787 0.047
34 7qct:A 90 74 0.2561 0.2333 0.2838 0.052 7qct:B
35 7pc5:A 405 72 0.2927 0.0593 0.3333 0.053
36 2qt5:A 194 77 0.2683 0.1134 0.2857 0.061 2qt5:B
37 2qt5:A 194 45 0.1220 0.0515 0.2222 3.0 2qt5:B
38 2pdz:A 86 60 0.2561 0.2442 0.3500 0.072
39 8b82:A 108 46 0.2073 0.1574 0.3696 0.073 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
40 7qqm:A 413 46 0.1829 0.0363 0.3261 0.075
41 7qqn:C 414 84 0.2805 0.0556 0.2738 0.076 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
42 7pcb:A 415 44 0.1707 0.0337 0.3182 0.095 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
43 6ar4:B 87 71 0.2195 0.2069 0.2535 0.098 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
44 6nid:B 88 45 0.1463 0.1364 0.2667 0.12 6nid:A, 6nid:C
45 3ch8:A 190 46 0.1707 0.0737 0.3043 0.20 2qbw:A
46 1n7t:A 103 46 0.1707 0.1359 0.3043 0.27 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
47 6kz1:A 97 42 0.1341 0.1134 0.2619 0.41 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
48 4wsi:A 372 47 0.1463 0.0323 0.2553 0.51 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
49 2jk8:A 291 38 0.1707 0.0481 0.3684 0.74 5nh2:A
50 2i0i:A 81 46 0.1951 0.1975 0.3478 0.91 2i0i:B, 2i0i:C
51 3vqg:A 85 47 0.1829 0.1765 0.3191 1.2
52 8gym:s1 689 33 0.1341 0.0160 0.3333 1.9 8b6f:AB, 8bqs:AB, 8gym:S1, 8gzu:s1, 8gzu:S1, 7tgh:S1
53 8blu:B 195 26 0.1341 0.0564 0.4231 2.0 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
54 2r4h:C 98 45 0.1220 0.1020 0.2222 2.8
55 5yzg:s 374 40 0.1707 0.0374 0.3500 2.9
56 1ihj:B 95 76 0.2317 0.2000 0.2500 3.0 1ihj:A
57 8sxg:A 366 48 0.1829 0.0410 0.3125 3.1 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
58 6q0m:B 94 46 0.1585 0.1383 0.2826 3.6
59 6gua:A 821 31 0.1341 0.0134 0.3548 3.7 6gua:B, 6gua:C, 6gua:D, 6gua:E, 6gua:F, 6gua:G, 6gua:H
60 4gt2:A 371 79 0.2927 0.0647 0.3038 3.8 4gt2:B, 4gt2:E, 4gt2:G, 6gzw:A, 6gzw:B, 5map:A, 5map:B, 5mjh:A, 5mjh:B
61 6l2u:A 103 36 0.1463 0.1165 0.3333 3.9 6l2u:B
62 5ocs:A 369 56 0.2317 0.0515 0.3393 4.0 5ocs:C
63 7re7:H 212 36 0.1585 0.0613 0.3611 4.1
64 1zub:A 109 76 0.2073 0.1560 0.2237 5.0
65 4od5:A 274 30 0.1707 0.0511 0.4667 5.1 4od5:B, 4od5:C, 4od5:D, 4od5:E
66 8cmb:B 194 74 0.2439 0.1031 0.2703 5.2 8cmh:B, 4fqx:B, 2fse:B, 2fse:D, 1fv1:B, 1fv1:E, 4gbx:B, 1h15:B, 1h15:E, 8pje:E, 4x5w:B, 7yx9:B, 1zgl:B, 1zgl:E
67 3gwz:A 339 58 0.1951 0.0472 0.2759 6.0 3gwz:D, 3gwz:C, 3gwz:B, 3gxo:A, 3gxo:D, 3gxo:C, 3gxo:B
68 2q6w:B 188 74 0.2439 0.1064 0.2703 6.5 1a6a:B, 3c5j:B, 4h1l:B, 4h1l:E, 4h25:E, 7n19:B, 7n19:E, 7n19:H, 7n19:K, 2q6w:E
69 8v9l:z 375 39 0.1707 0.0373 0.3590 6.9 8v9j:z
70 4u63:A 482 18 0.0976 0.0166 0.4444 7.1
71 5nig:B 197 74 0.2439 0.1015 0.2703 8.0 4aen:B, 1aqd:B, 1aqd:E, 1aqd:H, 1aqd:K, 6atf:B, 6atf:E, 6ati:B, 6ati:E, 6atz:B, 6atz:D, 6bij:B, 6bil:B, 6bin:B, 6bir:B, 6biv:A, 6bix:B, 6biy:B, 6biz:B, 1bx2:B, 1bx2:E, 4c56:E, 4c56:K, 8cmc:B, 8cmd:B, 8cmd:E, 8cmd:H, 8cme:B, 8cme:E, 8cme:H, 8cmf:B, 8cmf:E, 8cmg:B, 8cmi:B, 8cmi:E, 8cmi:H, 6cpl:B, 6cpn:B, 6cpo:B, 6cpo:E, 6cqj:B, 6cqj:E, 6cqj:H, 6cql:B, 6cqn:B, 6cqq:B, 6cqq:G, 6cqr:B, 6cqr:G, 1d5m:B, 1d5x:B, 1d5z:B, 1d6e:B, 1dlh:B, 1dlh:E, 4e41:B, 4e41:G, 1fyt:B, 2g9h:B, 4h25:B, 4h26:B, 4h26:E, 6hby:B, 6hby:E, 1hqr:B, 1hxy:B, 4i5b:B, 4i5b:E, 2iam:B, 2ian:B, 2ian:G, 2ian:L, 2ian:Q, 2icw:B, 2icw:E, 2ipk:B, 4is6:B, 1j8h:B, 5jlz:B, 5jlz:D, 1jwm:B, 1jws:B, 1jwu:B, 1kg0:B, 1klg:B, 1klu:B, 3l6f:B, 5lax:B, 5lax:D, 1lo5:B, 4mcy:B, 4mcz:B, 4md0:B, 4md4:B, 4md5:B, 4mdi:B, 4mdj:B, 5ni9:B, 6nix:B, 7nze:DDD, 7nze:BBB, 7nzf:BBB, 7nzh:BBB, 7nzh:DDD, 7o00:BBB, 2oje:B, 2oje:F, 4ov5:B, 4ov5:E, 4ov5:H, 4ov5:K, 4ov5:N, 4ov5:Q, 3pdo:B, 3pgc:B, 3pgc:E, 3pgd:B, 3pgd:E, 8pje:B, 8pjf:B, 8pjg:B, 1pyw:B, 3qxa:B, 3qxa:E, 3qxd:E, 3qxd:B, 6qza:BBB, 6qza:EEE, 6qzc:BBB, 6qzd:BBB, 6qzd:EEE, 6r0e:BBB, 1r5i:B, 1r5i:F, 3s4s:B, 3s4s:E, 3s5l:B, 3s5l:E, 1seb:B, 1seb:F, 2seb:B, 1sje:B, 1sjh:B, 1t5w:B, 1t5w:E, 1t5x:B, 8tbp:B, 8tbp:D, 8trl:B, 8trl:E, 8trq:B, 8trr:B, 8trr:G, 6v0y:B, 6v13:B, 6v15:B, 6v18:B, 6v19:B, 6v1a:B, 2xn9:E, 4y19:B, 4y1a:B, 1ymm:B, 7yx9:D, 7yxb:B, 7yxb:D, 1zgl:K
72 1u38:A 89 77 0.1951 0.1798 0.2078 9.8

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417