Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
NCERTFIAIKPDGVQRGLVGEIIKRFEQKGFRLVGLKFMQASEDLLKEHYVDLKDRPFFAGLVKYMHSGPVVAMVWEGLN
VVKTGRVMLGETNPADSKPGTIRGDFCIQVGRNIIHGSDSVESAEKEIGLWFHPEELVDYTSCAQNWIYE

The query sequence (length=150) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8oov:B 157 150 1.0000 0.9554 1.0000 1.11e-111 1be4:A, 1be4:B, 1be4:C, 1bhn:A, 1bhn:B, 1bhn:C, 1bhn:D, 1bhn:E, 1bhn:F, 4eno:A, 4eno:B, 2hvd:A, 2hvd:B, 2hvd:C, 2hve:A, 2hve:B, 2hve:C, 8oov:A, 8oov:C, 1ucn:A, 1ucn:B, 1ucn:C, 5ui4:A, 5ui4:B, 5ui4:C, 5ui4:D, 5ui4:E, 5ui4:F, 7zl8:A, 7zl8:B, 7zl8:C, 7zl8:D, 7zl8:E, 7zl8:F, 7zl8:G, 7zl8:H, 7zl8:I, 7zl8:J, 7zl8:K, 7zl8:L, 7zlw:A, 7zlw:B, 7zlw:C, 7zlw:D, 7zlw:F, 7ztk:A, 7ztk:B, 7ztk:C, 7ztk:D, 7ztk:E, 7ztk:F
2 7kpf:A 152 150 0.8800 0.8684 0.8800 3.80e-99 3bbb:B, 3bbb:C, 3bbb:E, 3bbb:F, 3bbf:A, 3bbf:B, 3bbf:C, 3bbf:D, 3bbf:E, 3bbf:F, 7kpf:B, 7kpf:C, 1nue:A, 1nue:B, 1nue:C, 1nue:D, 1nue:E, 1nue:F, 8pie:A, 8pie:B, 8pie:C, 8pie:D, 8pie:E, 8pie:F, 8pyw:A, 8pyw:B, 8pyw:C, 8pyw:D, 8pyw:E, 8pyw:F
3 4uof:A 151 148 0.7667 0.7616 0.7770 1.83e-87 4uof:B, 4uof:C, 4uog:A, 4uog:B, 4uog:C, 4uoh:B, 4uoh:C
4 7kpf:F 135 150 0.7933 0.8815 0.7933 1.14e-83
5 8qvz:C 155 148 0.6667 0.6452 0.6757 6.18e-77 8qvz:A, 8qvz:B, 8qvz:D, 8qvz:E, 8qvz:F, 8qw0:A, 8qw0:B, 8qw0:C, 8qw0:D, 8qw0:E, 8qw0:F, 8qw0:G, 8qw0:H, 8qw0:I, 8qw0:J, 8qw0:K, 8qw0:L, 8qw1:A, 8qw1:B, 8qw1:C, 8qw1:D, 8qw1:E, 8qw1:F, 8qw2:A, 8qw2:B, 8qw2:C, 8qw2:D, 8qw2:E, 8qw2:F, 8qw3:A, 8qw3:B, 8qw3:C, 8qw3:D, 8qw3:E, 8qw3:F, 1zs6:A, 1zs6:B, 1zs6:D
6 5bxi:B 153 148 0.6600 0.6471 0.6689 9.35e-75 5bxi:A, 5bxi:C, 5bxi:I
7 4fkx:A 153 149 0.6733 0.6601 0.6779 1.89e-74 4f4a:A, 4f4a:B, 4f4a:C, 4fkx:B, 4fkx:C, 4fky:A, 4fky:B, 4fky:C
8 6xpw:C 158 148 0.6400 0.6076 0.6486 6.01e-72 6xp7:A, 6xp7:B, 6xp7:C, 6xps:A, 6xps:B, 6xps:C, 6xpt:A, 6xpt:B, 6xpt:C, 6xpt:E, 6xpt:G, 6xpt:H, 6xpu:A, 6xpu:B, 6xpu:C, 6xpv:A, 6xpv:B, 6xpv:C, 6xpv:E, 6xpv:G, 6xpv:H, 6xpw:A, 6xpw:B, 6xpw:E, 6xpw:G, 6xpw:H
9 3ngs:A 151 150 0.6467 0.6424 0.6467 3.01e-71 4kpc:A, 4kpc:B, 3ngs:C, 3ngt:A, 3ngt:B, 3ngt:C, 3ngt:D, 3ngt:E, 3ngt:F, 3ngt:G, 3ngt:H, 3ngt:I, 3ngt:J, 3ngt:K, 3ngt:M, 3ngt:N, 3ngu:A, 3ngu:B
10 5u2i:B 151 148 0.6200 0.6159 0.6284 1.80e-67 5u2i:D
11 5kk8:A 149 148 0.6067 0.6107 0.6149 1.00e-65 5kk8:B
12 4cp5:A 151 150 0.6200 0.6159 0.6200 3.22e-63 1b4s:A, 1b4s:B, 1b4s:C, 1b99:A, 1b99:C, 1b99:D, 1b99:E, 2bef:A, 2bef:B, 2bef:C, 1bux:A, 1bux:B, 1bux:C, 4cp5:B, 4cp5:C, 4cp5:D, 4cp5:E, 4cp5:F, 1f3f:A, 1f3f:B, 1f3f:C, 1f6t:A, 1f6t:B, 1f6t:C, 3fkb:A, 3fkb:B, 3fkb:C, 3fkb:D, 3fkb:E, 3fkb:F, 1hiy:A, 1hiy:B, 1hiy:C, 1kdn:A, 1kdn:B, 1kdn:C, 1lwx:A, 1lwx:B, 1lwx:C, 1mn7:A, 1mn7:B, 1mn9:A, 1mn9:B, 1mn9:C, 1ndc:A, 1ndp:A, 1ndp:B, 1pae:X, 1s5z:A
13 1s59:A 153 150 0.5400 0.5294 0.5400 1.53e-60 1s59:C
14 1wkk:A 137 137 0.5267 0.5766 0.5766 1.86e-57 1wkl:A, 1wkl:B
15 3q86:A 149 149 0.5133 0.5168 0.5168 2.22e-55 3q86:B, 3q89:B, 3q89:E, 3q8u:A, 3q8u:B, 3q8u:C, 3q8u:D, 3q8u:E, 3q8u:F, 3q8v:A, 3q8v:B, 3q8v:D, 3q8y:A, 3q8y:B, 3q8y:C, 3q8y:D, 3q8y:E, 3q8y:F, 3q8y:G, 3q8y:H
16 2az1:A 155 150 0.5133 0.4968 0.5133 6.30e-55 2az1:C, 2az1:D, 2az3:A, 2az3:B, 2az3:F, 2az3:C, 2az3:D, 2az3:E, 2az3:G, 2az3:H, 2az3:I
17 2dya:B 155 153 0.5067 0.4903 0.4967 6.78e-50 2dxd:A, 2dxd:B, 2dxe:A, 2dxf:A, 2dy9:A, 2dya:A
18 1nhk:R 144 139 0.4267 0.4444 0.4604 4.20e-41 1nhk:L, 1nlk:R, 1nlk:L
19 4s0m:D 143 139 0.4200 0.4406 0.4532 7.82e-39 5yol:E, 5yol:H
20 3ejm:A 134 134 0.3800 0.4254 0.4254 1.35e-36 3b6b:A, 3b6b:B, 3b6b:C, 3b6b:D, 3b6b:E, 3b6b:F, 2b8q:A, 2b8q:B, 2b8q:C, 2b8q:D, 2b8q:E, 2b8q:F, 3ddi:A, 3ddi:B, 3dkd:A, 3dkd:B, 3ee3:A, 3ee3:B, 3ee3:C, 3ee3:D, 3ee3:E, 3ee3:F, 3eic:A, 3eic:B, 3eic:C, 3eic:D, 3eic:E, 3eic:F, 3ejm:B, 3em1:A, 3em1:B, 3emt:A, 3emt:B, 3ena:A, 3ena:B, 3etm:A, 3etm:B, 3evm:A, 3evm:B, 3evo:A, 3evo:B, 3evw:A, 3evw:B, 3evw:C, 3evw:D, 3evw:E, 3evw:F, 3fbb:A, 3fbb:B, 3fbb:C, 3fbb:D, 3fbb:E, 3fbb:F, 3fbc:A, 3fbc:B, 3fbc:C, 3fbc:D, 3fbc:E, 3fbc:F, 3fbe:A, 3fbe:B, 3fbe:C, 3fbe:D, 3fbe:E, 3fbe:F, 3fbf:A, 3fbf:B, 3fbf:C, 3fbf:D, 3fbf:E, 3fbf:F, 3fc9:A, 3fc9:B, 3fc9:C, 3fc9:D, 3fc9:E, 3fc9:F, 3fcw:A, 3fcw:B, 3fcw:C, 3fcw:D, 3fcw:E, 3fcw:F, 3g2x:A, 3g2x:B, 3g2x:C, 3g2x:D, 3g2x:E, 3g2x:F, 3gp9:A, 3gp9:B, 3gp9:C, 3gp9:D, 3gp9:E, 3gp9:F, 3gpa:A, 3gpa:C, 3gpa:E, 3gpa:B, 3gpa:D, 3gpa:F
21 4ek2:A 142 134 0.3533 0.3732 0.3955 1.51e-31 4hr2:A, 4hr2:B
22 4dz6:A 168 153 0.3533 0.3155 0.3464 4.77e-28 4dz6:B, 4dz6:C, 4dz6:D, 4dz6:E, 4dz6:F
23 3or1:B 385 48 0.1200 0.0468 0.3750 0.34 3or1:E, 3or2:B, 3or2:E
24 7tby:A 1788 69 0.1000 0.0084 0.2174 0.69 7tc0:A
25 7roq:A 1831 39 0.0667 0.0055 0.2564 1.9
26 7tbw:A 1928 39 0.0667 0.0052 0.2564 1.9
27 6m0q:A 504 65 0.1200 0.0357 0.2769 2.3 4fas:A, 4fas:C, 4fas:B, 1fgj:A, 1fgj:B, 6m0p:A, 6m0p:C, 6m0p:E, 6m0q:C, 6m0q:E, 6m0q:G, 6m0q:I, 6m0q:K, 4n4n:A, 4n4n:C, 4n4n:E, 4n4o:A, 4n4o:C, 4n4o:E
28 2xzl:A 756 54 0.1200 0.0238 0.3333 3.0
29 6kif:J 41 16 0.0467 0.1707 0.4375 5.9 6kif:T, 6kif:l, 6kig:J, 6kig:T, 6kig:l
30 6peu:B 385 96 0.1267 0.0494 0.1979 7.4 6pe3:A, 6peu:A, 6peu:C, 6peu:D
31 8g1e:A 1037 29 0.0733 0.0106 0.3793 9.6 8g1e:B, 8g1e:D, 8g1e:C, 8g1f:A, 8g1f:C, 8g1f:B, 8g1f:D, 8g5c:A, 8g5c:B, 8g5c:C, 8g5c:D, 8g5d:A, 8g5d:B, 8g5d:C, 8g5d:D, 6hxh:A, 6hxh:B, 6hxh:C, 6hxh:D, 6hxh:E, 6hxh:F, 6hxh:G, 6hxh:H, 6hxk:A, 6hxk:B, 6hxk:C, 6hxk:D, 6hxl:A, 6hxl:B, 6hxl:C, 6hxl:D, 6hxl:E, 6hxl:F, 6hxl:G, 6hxl:H, 6hxm:A, 6hxm:B, 7liw:B, 7liw:D, 7lj9:A, 7lj9:B, 7lj9:C, 7lj9:D, 7lla:A, 7lla:C, 7lla:B, 7lla:D, 3mwe:A, 6o0h:A, 6o0h:B, 6o0h:C, 6o0h:D, 3pff:A, 6poe:B, 6poe:D, 6poe:A, 6poe:C, 6qfb:A, 6qfb:B, 6qfb:D, 7rig:A, 7rig:C, 7rig:B, 7rig:D, 7rkz:A, 7rkz:C, 7rkz:B, 7rkz:D, 7rmp:A, 7rmp:C, 7rmp:B, 7rmp:D, 5tde:A, 5tde:B, 5tdf:A, 5tdm:A, 5tdm:B, 5tdz:A, 5te1:A, 5te1:B, 5teq:A, 5teq:B, 5tes:A, 5tet:A, 6ui9:A, 6ui9:C, 6ui9:B, 6ui9:D, 6uia:C, 6uia:A, 6uia:D, 6uia:B, 6uuw:A, 6uuw:C, 6uuw:B, 6uuw:D, 6uuz:A, 6uuz:C, 6uuz:B, 6uuz:D, 6uv5:A, 6uv5:C, 6uv5:B, 6uv5:D, 6z2h:A, 6z2h:C, 6z2h:D
32 6qfb:C 1011 29 0.0733 0.0109 0.3793 9.8

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218