BioLiP

>protein
MVSLAQVRGALCGALLGDCMGAEFEGSDAVELPDVLEFVRLLEKEKKAGTLFYTDDTAMTRAVIQSLIAKPDFDEVDMAK
RFAEEYKKEPTRGYGAGVVQVFKKLLSPKYSDVFQPAREQFDGKGSYGNGGAMRVASIALAYPNIQDVIKFARRSAQLTH
ASPLGYNGAILQALAVHFALQGELKRDTFLEQLIGEMERIEGKLPFCSRLKKIKEFLASSNVPKADIVDELGHGIAALES
VPTAIYSFLHCMESDPDIPDLYNNLQRTIIYSISLGGDTDTIATMAGAIAGAYYGMDQVTPSWKRSCEAIVETEESAVKL
YELYCKQL

The query sequence (length=328) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6g1q:B	331	329	1.0000	0.9909	0.9970	0.0	7aqm:A, 7aqm:B, 6g1p:A, 6g1p:B, 6g1q:A, 6hgz:A, 6hgz:B, 6hh3:A, 6hh3:B, 6hh4:A, 6hh4:B, 6hh5:A, 6hh5:B, 6hoz:A, 6hoz:B
2	6d3a:A	347	344	0.6555	0.6196	0.6250	9.34e-149	7akr:AAA, 7akr:BBB, 7akr:CCC, 7akr:DDD, 7aks:AAA, 7aks:CCC, 7aks:EEE, 7aks:GGG, 7arw:A, 7arw:B, 6d36:C, 6d36:D, 6d36:A, 6d36:B, 6d3a:C, 6d3a:D, 6d3a:B, 2foz:A, 2fp0:A, 2fp0:B, 2g4k:A, 7l9f:C, 7l9f:D, 7l9f:A, 7l9f:B, 7l9h:C, 7l9h:D, 7l9h:A, 7l9h:B, 7l9i:C, 7l9i:D, 7l9i:A, 7l9i:B, 2qty:A, 2qty:B, 5zqy:A
3	1t5j:A	301	330	0.2774	0.3023	0.2758	6.42e-20
4	2yzv:A	286	318	0.2622	0.3007	0.2704	5.63e-19
5	2woc:A	291	311	0.2348	0.2646	0.2476	1.41e-10	2woc:B, 2woc:C, 2wod:A, 2wod:B, 2woe:A, 2woe:C, 2woe:B
6	3o5t:A	295	315	0.2256	0.2508	0.2349	9.11e-09	3g9d:A, 3g9d:B, 5ovo:A
7	6g2a:A	361	306	0.2195	0.1994	0.2353	1.09e-07	6g28:A, 3hfw:A, 6iux:A
8	6dre:A	365	316	0.2043	0.1836	0.2120	7.43e-07	6drh:C
9	7yeh:A	1020	76	0.0640	0.0206	0.2763	0.30	4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
10	5lwv:A	711	72	0.0640	0.0295	0.2917	0.45	5bnw:A, 6e37:A, 8fe6:A, 8fe6:C, 8fe6:E, 8fe6:G, 4gyw:A, 4gyy:A, 4gyy:C, 4gz3:A, 5hgv:A, 5nps:A, 6tka:AAA, 5vie:A, 5vie:C, 5vif:A
11	4dyd:A	283	102	0.0945	0.1095	0.3039	1.9	4e13:A
12	5a01:A	681	72	0.0610	0.0294	0.2778	2.0	5a01:B, 5a01:C
13	7dnu:A	247	135	0.0915	0.1215	0.2222	5.8
14	6j7k:A	385	73	0.0579	0.0494	0.2603	6.6	6j7l:A, 6j7m:A, 6j7m:C
15	8spo:I	371	97	0.0823	0.0728	0.2784	8.2
16	8spo:M	394	97	0.0823	0.0685	0.2784	8.2	8spo:E
17	2f4f:A	130	26	0.0366	0.0923	0.4615	9.0	2f4f:B
18	4or2:B	366	34	0.0396	0.0355	0.3824	9.5	4or2:A

[Back]