BioLiP

>protein
MVKVKFKYKGEEKEVDTSKIKKVWRVGKMVSFTYDDNGKTGRGAVSEKDAPKELLDMLARAEREKKGVLKKLRAVENELH

The query sequence (length=80) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1wvl:A	80	80	1.0000	1.0000	1.0000	1.18e-52	1azp:A, 1azq:A, 1ca5:A, 1ca6:A, 8cmn:AA, 8q2m:AA, 8qpc:AA, 1wd0:A, 1wd1:A, 1wto:A, 1wtp:A, 1wtp:B, 1wtq:A, 1wtr:A, 1wtv:A, 1wtw:A, 1wtx:A, 1xyi:A
2	5b03:D	333	67	0.6750	0.1622	0.8060	2.85e-28	5b00:A, 5b00:B, 5b00:C, 5b03:A, 5b03:B, 5b03:C, 5b0k:A, 5b0k:B, 5b0k:C, 5b0k:D, 1bbx:C, 1bbx:D, 1bf4:A, 1bnz:A, 1c8c:A, 5gwv:D, 6j8v:D, 6j8w:D
3	7c1m:A	67	67	0.5375	0.6418	0.6418	6.91e-21
4	2o7p:A	358	50	0.2000	0.0447	0.3200	1.6	2o7p:B, 2obc:A
5	7ej3:B	401	47	0.1750	0.0349	0.2979	2.5	7eev:A, 7eev:B, 7ej3:A
6	8bsj:SL	109	21	0.1375	0.1009	0.5238	2.5	8br8:SL, 8brm:SL, 8bsi:SL, 8btd:SL, 8btr:SL, 8fvy:K, 8g4s:K
7	6djv:C	615	61	0.2375	0.0309	0.3115	3.1	6dju:A, 6dju:B, 6dju:C, 6djv:A, 6djv:B
8	6w6h:C	636	61	0.2375	0.0299	0.3115	3.5	6w6e:B, 6w6e:C, 6w6g:A, 6w6g:B, 6w6g:C, 6w6h:A, 6w6h:B, 6w6h:F, 6w6i:A, 6w6i:B, 6w6i:C, 6w6j:A, 6w6j:B, 6w6j:C
9	6k0a:I	116	25	0.1625	0.1121	0.5200	5.5	6k0a:J, 6k0b:I, 6k0b:J, 1sds:A, 1sds:C, 1sds:B
10	7ev9:A	382	53	0.1750	0.0366	0.2642	8.3	7ev9:E, 7ev9:I, 8oyi:A, 8oyi:E, 8oyi:I, 3rgb:A, 3rgb:E, 3rgb:I, 7s4h:A, 7s4h:E, 7s4h:I, 7s4i:A, 7s4i:E, 7s4i:I, 7s4j:A, 7s4j:E, 7s4j:I, 7s4k:A, 7s4k:E, 7s4k:I, 8sqw:A, 8sqw:E, 8sqw:I, 8sr1:A, 8sr1:E, 8sr1:I, 8sr2:A, 8sr2:E, 8sr2:I, 8sr4:A, 8sr4:E, 8sr4:I, 8sr5:A, 8sr5:E, 8sr5:I, 7t4o:A, 7t4o:E, 7t4o:I, 7t4p:A, 7t4p:E, 7t4p:I, 1yew:A, 1yew:E, 1yew:I
11	7k5k:A	545	55	0.1625	0.0239	0.2364	9.5	7k5k:B, 7k5k:C, 7k5k:D, 7k5k:E, 7k5k:F, 6wvv:A, 6wvv:B, 6wvv:C, 6wvv:D, 6wvv:E

[Back]