BioLiP

>protein
MTMMDMNFKYCHKIMKKHSKSFSYAFDLLPEDQRKAVWAIYAVCRKIDDSIIQFLNQIKEDIQSIEKYPYEYHHFQSDRR
IMMALQHVAQHKNIAFQSFYNLIDTVYKDQHFTMFETDAELFGYCYGVAGTVGEVLTPILSDHETHQTYDVARRLGESLQ
LINILRDVGEDFENERIYFSKQRLKQYEVDIAEVYQNGVNNHYIDLWEYYAAIAEKDFRDVMDQIKVFSIEAQPIIELAA
RIYIEILDEVRQANYTLHERVFVEKRKKAKLFHEINSKY

The query sequence (length=279) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3acw:A	284	284	1.0000	0.9824	0.9824	0.0	3acx:A, 3acy:A, 3adz:A, 3ae0:A, 3ae0:B, 4e9u:A, 4e9z:A, 4ea0:A, 4ea0:B, 4ea1:A, 4ea2:A, 4f6v:A, 4f6x:A, 3lgz:B, 3npr:A, 3nri:A, 3tfn:A, 3tfp:A, 3tfv:A, 3vje:A, 3vje:B, 3w7f:A, 3w7f:B, 2zcq:A, 2zcr:A, 2zcs:A, 2zy1:A
2	8is7:A	275	272	0.3297	0.3345	0.3382	7.58e-46	8is8:A, 8is9:A, 8isa:A
3	5iys:A	283	273	0.3154	0.3110	0.3223	7.41e-41
4	3asx:A	335	213	0.1828	0.1522	0.2394	8.40e-07	1ezf:A, 1ezf:B, 1ezf:C, 3lee:A, 3lee:B, 3lee:C, 3lee:D, 3lee:E, 3q2z:A, 3q30:A, 3v66:A, 3vj9:A, 3vjc:A, 3vjc:B, 3vjc:C, 3vjc:D, 3vjc:E, 3vjc:F, 3wc9:A, 3wc9:B, 3wc9:C, 3wc9:D, 3wc9:E, 3wc9:F, 3wcd:A, 3wcd:B, 3wcd:D, 3wcd:E, 3wcf:A, 3wcf:B, 3wcf:C, 3wcf:D, 3wcf:E, 3wcf:F, 3wch:A, 3wch:B, 3wch:C, 3wch:D, 3wch:E, 3wch:F, 3wci:A, 3wci:B, 3wci:C, 3wci:D, 3wci:E, 3wci:F, 3wcj:A, 3wcj:B, 3wcj:C, 3wcj:D, 3wcj:E, 3wcj:F, 3wcl:A, 3wcm:A, 3wcm:B, 3wcm:C, 3wcm:D, 3wcm:E, 3wcm:F, 3wef:A, 3wef:B, 3wef:C, 3wef:D, 3wef:E, 3weg:A, 3weh:A, 3wei:A, 3wej:A, 3wek:A, 3wsa:A, 3wsa:B, 3wsa:C, 3wsa:E, 8wtq:A, 8wtr:A
5	3wcc:C	342	210	0.1756	0.1433	0.2333	4.67e-06	3wca:A, 3wca:B, 3wca:C, 3wca:D, 3wcb:A, 3wcb:B, 3wcb:D, 3wcc:A, 3wcc:B, 3wcc:D, 3wce:A, 3wce:B, 3wce:C, 3wce:D, 3wcg:A, 3wcg:B, 3wcg:C, 3wcg:D, 3wsb:A, 3wsb:B, 3wsb:C, 3wsb:D
6	7wgh:A	350	78	0.0932	0.0743	0.3333	2.35e-05	7wgi:A
7	3lee:F	262	187	0.1613	0.1718	0.2406	0.002
8	8snb:8F	265	41	0.0573	0.0604	0.3902	0.17
9	5u23:D	366	46	0.0573	0.0437	0.3478	0.67	5u21:A, 5u21:B, 5u21:C, 5u21:D, 5u23:C, 5u23:A, 5u23:B, 5u24:A, 5u24:B, 5u24:C, 5u24:D
10	6exn:a	171	57	0.0538	0.0877	0.2632	0.75	6bk8:N
11	8vsi:B	579	95	0.0824	0.0397	0.2421	0.78
12	4o98:B	307	33	0.0394	0.0358	0.3333	1.6	4o98:A
13	5yhw:A	453	84	0.0717	0.0442	0.2381	6.0	5yhw:B, 5yhw:C, 5yhw:F

[Back]