Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MSNAEAFYASIRTELESIRAAGLFKNERVIATPQGARVRTTDGREVINLCANNYLGLSSHPQVIEAAHEALRTHGFGLSS
VRFICGTQDLHKTLEARLSAFLGTEDTILYGSAFDANGGLFETLLGAEDAVISDALNHASIIDGVRLSKARRYRYQHNDM
DDLRVQLEQARADGARYTLVFSDGVFSMDGTVARLDEMRAICDEYGALLGIDECHATGFMGQRGRGTHEARGVFGKIDII
TGTLGAALGGASGGFTSARKEVVALLRQRSRPYLFSNTVAPAIVGASIAVLDILEASTELRDRLEGNTRFFRAGLDRLGF
DVKAGDHPIIPIMVYDADKAQQLAQRLLELGVYVVGFFYPVVPKGQARIRVQMSALHDEAALQAALDAFGQAGRELGLI

The query sequence (length=399) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7bxq:A 399 399 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7bxq:B, 7bxr:A, 7bxr:B, 7bxs:A, 7bxs:B
2 1fc4:A 401 393 0.6015 0.5985 0.6107 2.16e-177 1fc4:B
3 3tqx:A 396 396 0.5614 0.5657 0.5657 2.75e-170 3tqx:B
4 7v58:B 400 396 0.5865 0.5850 0.5909 7.86e-169 7v58:A, 7v5i:A, 7v5i:B, 7v5i:C, 7v5i:D
5 7poa:A 398 391 0.3885 0.3894 0.3964 5.73e-92 7poa:B, 7pob:A, 7pob:D, 7pob:B, 7pob:C, 7poc:A, 7poc:D, 7poc:B, 7poc:C
6 8guh:A 394 382 0.3358 0.3401 0.3508 1.01e-79 3a2b:A, 8h1q:A, 8h1y:A, 8h20:A, 8h21:A, 8h29:A, 8iyp:A, 8iyt:A
7 4bmk:A 398 372 0.3308 0.3317 0.3548 5.59e-69 4bmk:B, 2jg2:A, 2w8j:A, 2w8t:A, 2w8u:A, 2w8v:A, 2w8w:A, 2xbn:A
8 2x8u:A 399 360 0.3158 0.3158 0.3500 1.19e-64 2x8u:B
9 6hrh:A 429 362 0.3133 0.2914 0.3453 1.02e-60 6hrh:B, 5qqq:B, 5qqq:A, 5qqr:B, 5qqr:A, 5qqs:B, 5qqs:A, 5qqt:B, 5qqt:A, 5qqu:B, 5qqu:A, 5qqv:B, 5qqv:A, 5qqw:B, 5qqw:A, 5qqx:B, 5qqx:A, 5qqy:B, 5qqy:A, 5qqz:B, 5qqz:A, 5qr0:B, 5qr0:A, 5qr1:B, 5qr1:A, 5qr2:B, 5qr2:A, 5qr3:B, 5qr3:A, 5qr4:B, 5qr4:A, 5qr5:B, 5qr5:A, 5qr6:B, 5qr6:A, 5qr7:B, 5qr7:A, 5qr8:B, 5qr8:A, 5qr9:B, 5qr9:A, 5qra:B, 5qra:A, 5qrb:B, 5qrb:A, 5qrc:B, 5qrc:A, 5qrd:B, 5qrd:A, 5qre:B, 5qre:A, 5qt3:B, 5qt3:A
10 2bwo:B 399 355 0.3133 0.3133 0.3521 2.14e-58 2bwn:A, 2bwn:B, 2bwn:D, 2bwn:E, 2bwo:A, 2bwo:D, 2bwo:E, 2bwp:A, 2bwp:B, 2bwp:D, 2bwp:E
11 7u7h:A 423 355 0.2882 0.2719 0.3239 4.11e-55 7u7h:B
12 7yj1:B 502 371 0.3108 0.2470 0.3342 1.61e-54 7cqi:T, 7cqk:T, 7k0i:B, 7k0i:E, 7k0j:B, 7k0k:B, 7k0l:B, 7k0m:B, 7k0m:F, 7k0n:B, 7k0n:F, 7k0o:B, 7k0o:F, 7k0p:B, 7k0p:F, 7k0q:B, 6m4n:B, 6m4n:F, 6m4o:T, 7yiu:B, 7yiy:B, 7yj2:B
13 5txr:A 479 392 0.2882 0.2401 0.2934 2.87e-52 8eim:A, 8eim:B, 5txr:B
14 7yjm:B 471 375 0.2957 0.2505 0.3147 3.17e-52 7yjk:B, 7yjk:F, 7yjn:B, 7yjo:B
15 1dj9:A 383 349 0.2907 0.3029 0.3324 6.90e-51 1dje:A, 8dle:A, 2g6w:A
16 8c81:C 561 369 0.2957 0.2103 0.3198 1.93e-49 8c80:C, 8c82:C, 8c82:G, 8iaj:B, 8iaj:F, 8iak:B, 8iak:F, 8iam:B, 8iam:F, 8qof:C, 8qof:G, 8qog:C
17 7yjk:A 445 378 0.2732 0.2449 0.2884 5.93e-43 7yjk:E, 7yjn:A, 7yjo:A
18 3hqt:B 386 336 0.2406 0.2487 0.2857 3.57e-31 3hqt:A, 3kki:A, 3kki:B, 2wk8:A, 2wk9:A, 2wk9:B, 2wka:A, 2wka:B
19 2wk8:B 364 334 0.2256 0.2473 0.2695 4.13e-29
20 8qog:B 500 273 0.1980 0.1580 0.2894 1.12e-27 8iaj:A, 8iaj:E, 8iak:A, 8iak:E, 8qof:F, 8qof:B
21 7k0n:A 464 281 0.2155 0.1853 0.3060 1.28e-27 7cqi:S, 7cqk:S, 7k0i:A, 7k0i:D, 7k0j:A, 7k0k:A, 7k0l:A, 7k0n:E, 7k0o:A, 7k0o:E, 7k0p:A, 7k0p:E, 7k0q:A, 6m4n:A, 6m4n:E, 7yiy:A, 7yj2:A
22 8xha:A 401 394 0.2607 0.2594 0.2640 1.61e-20 8i7u:C, 8i7u:F, 8i7u:A, 8i7u:E, 8i7u:B, 8i7u:D, 8xha:B, 8xhd:A, 8xhd:B, 8xhk:C, 8xhk:A, 8xhk:B, 8xhk:E, 8xhk:D, 8xhk:F
23 8cpl:C 499 147 0.1053 0.0842 0.2857 0.003 8cpl:A, 8cpl:B, 8cpl:D, 1lp1:B, 4uox:A, 4uox:B, 4uox:C, 4uox:D, 4uoy:A, 4uoy:B, 4uoy:C, 4uoy:D
24 2cfb:A 360 285 0.1855 0.2056 0.2596 0.007
25 6smr:A 473 95 0.0727 0.0613 0.3053 0.023 6smr:B, 6smr:C, 6smr:D
26 6erk:A 420 116 0.1028 0.0976 0.3534 0.073 6erk:B
27 2ord:A 393 75 0.0576 0.0585 0.3067 0.13 2e54:A, 2ord:B
28 6enz:A 487 52 0.0451 0.0370 0.3462 0.14 6enz:B
29 5k8b:A 394 37 0.0376 0.0381 0.4054 0.15 5k8b:B, 5k8b:C, 5k8b:D
30 6ymd:A 420 156 0.1028 0.0976 0.2628 0.16 6ymd:B, 6ymf:A
31 2zsm:A 425 299 0.2130 0.2000 0.2843 0.32 2epj:A, 2zsl:A, 2zsm:B, 2zsm:C
32 8ht4:B 390 144 0.1078 0.1103 0.2986 0.33 8ht4:A
33 4ysn:C 448 97 0.0802 0.0714 0.3299 0.35 5ll3:A, 5ll3:B, 5ll3:C, 5ll3:D, 5wya:A, 5wya:B, 5wya:C, 5wya:D, 5wyf:A, 5wyf:B, 5wyf:C, 5wyf:D, 4ysn:A, 4ysn:B, 4ysn:D
34 8rt6:A 221 44 0.0451 0.0814 0.4091 0.38 7o3j:A, 7o3j:D, 7o3j:G, 7o3j:J, 7o3j:M, 7o3j:P, 7o3j:S, 7o3j:V, 7o3j:Y, 7o3j:b, 7o3j:e, 7o3j:h, 7o3j:k, 7o3j:n, 8rt4:A, 8rt4:D, 8rt4:G, 8rt4:J, 8rt4:M, 8rt4:P, 8rt4:S, 8rt4:V, 8rt4:Y, 8rt4:b, 8rt4:e, 8rt4:h, 8rt4:k, 8rt4:n, 8rt6:D, 8rt6:J, 8rt6:P, 8rt6:S, 8rt6:V, 8rt6:Y, 8rt6:h, 8rt6:k, 8rt6:n, 8rt7:A, 8rt7:D, 8rt7:G, 8rt7:J, 8rt7:M, 8rt7:P, 8rt7:S, 8rt7:V, 8rt7:Y, 8rt7:b, 8rt7:e, 8rt7:h, 8rt7:k, 8rt7:n, 8rt8:A, 8rt8:D, 8rt8:G, 8rt8:J, 8rt8:M, 8rt8:P, 8rt8:S, 8rt8:V, 8rt8:Y, 8rt8:b, 8rt8:e, 8rt8:h, 8rt8:k, 8rt8:n
35 7qzj:A 422 96 0.0802 0.0758 0.3333 0.41 7qzj:B
36 6uld:A 428 315 0.1779 0.1659 0.2254 0.46 6uld:B
37 6cd1:A 452 88 0.0627 0.0553 0.2841 1.6 6ccz:A, 6ccz:B, 6cd1:B, 6cd1:C, 6cd1:D, 6cd1:E, 6cd1:F, 6cd1:G, 6cd1:H
38 1fg3:A 354 34 0.0401 0.0452 0.4706 1.8 1fg7:A, 1gew:A, 1gex:A, 1gey:A, 1iji:A
39 3d1v:A 288 38 0.0376 0.0521 0.3947 1.8 2a0w:A, 2a0x:A, 2a0y:A, 3bgs:A, 4ear:A, 4ear:B, 4ear:C, 4eb8:A, 4eb8:B, 4eb8:C, 5etj:A, 5etj:B, 5etj:C, 5etj:D, 5etj:E, 5etj:F, 3gb9:A, 3gb9:B, 3gb9:C, 3ggs:A, 3ggs:B, 3ggs:C, 4gka:A, 4gka:B, 4gka:C, 4gka:D, 4gka:E, 4gka:F, 3iny:A, 3k8o:E, 3k8o:Q, 3k8o:S, 3k8o:T, 3k8o:U, 3k8o:Y, 3k8q:A, 2oc4:A, 2oc9:A, 2on6:A, 1pf7:E, 3phb:E, 3phb:Q, 3phb:S, 3phb:T, 3phb:U, 3phb:Y, 1pwy:E, 2q7o:E, 1rct:E, 1rfg:E, 1rr6:A, 1rsz:A, 1rt9:A, 5ugf:A, 5ugf:B, 5ugf:C, 5ugf:D, 5ugf:E, 5ugf:F, 1v2h:E, 1v3q:E, 1v41:E, 1v45:E, 1yry:E, 7zsl:A, 7zsl:B, 7zsl:C, 7zsl:D, 7zsl:E, 7zsl:F, 7zsm:A, 7zsn:A, 7zso:A, 7zso:B, 7zso:C, 7zsp:A
40 4yzg:A 294 52 0.0401 0.0544 0.3077 2.9 4yzg:B, 4yzh:A
41 4b98:A 441 129 0.0877 0.0794 0.2713 3.3 4b98:B, 4b98:C, 4b98:D, 4b9b:A, 4b9b:B, 4b9b:C, 4b9b:D, 4b9b:E, 4b9b:F, 4b9b:G, 4b9b:H, 4bq0:A, 4bq0:B, 4bq0:C, 4bq0:D
42 1a9o:A 289 38 0.0376 0.0519 0.3947 3.9 1a9p:A, 1a9q:A, 1a9r:A, 1a9s:A, 1a9t:A, 2ai1:A, 2ai2:A, 2ai3:A, 1b8n:A, 1b8o:A, 3fuc:A, 3fuc:B, 3fuc:C, 1fxu:A, 1lv8:A, 1lv8:B, 1lv8:C, 1lv8:D, 1lv8:E, 1lv8:F, 1lvu:A, 1lvu:B, 1lvu:C, 1lvu:D, 1lvu:E, 1lvu:F, 2qpl:A, 1v48:A, 1vfn:A
43 1vef:A 387 322 0.1955 0.2016 0.2422 4.1 1vef:B, 1wkg:A, 1wkg:B, 1wkh:A, 1wkh:B
44 5m4b:A 439 45 0.0476 0.0433 0.4222 5.0 5m46:A, 5m49:A, 5m4d:A
45 4m1e:B 273 79 0.0551 0.0806 0.2785 6.3 4m1e:A, 4m1e:F, 4m1e:E, 4m1e:C, 4m1e:D
46 7cep:A 414 100 0.0677 0.0652 0.2700 6.3 7ceo:A, 7cer:A, 7ces:A, 7e6b:A, 7e6c:A, 7e6e:A, 7e6f:A, 5j8q:A, 6kfz:A, 7xej:A, 7xek:A, 7xen:A, 7xep:A, 7xet:A, 5xt5:A, 5xt5:B, 5xt6:A, 5xt6:B, 5zsk:A, 5zso:A
47 6k0v:A 562 30 0.0301 0.0214 0.4000 6.6 6k0m:A, 6k0n:A, 6k0p:A, 6k0q:A, 6k0s:A, 6k0u:A, 6k0v:B, 6k0v:C, 6k0v:D
48 6hbv:A 414 216 0.1404 0.1353 0.2593 7.2 6hbs:A, 6hbs:B, 6hbv:B
49 3jtx:B 393 65 0.0501 0.0509 0.3077 7.2
50 7ypn:D 455 101 0.0702 0.0615 0.2772 7.3 7ypm:A, 7ypm:B, 7ypm:D, 7ypm:C, 7ypn:B
51 6w80:A 430 124 0.0852 0.0791 0.2742 8.2
52 6cja:A 381 170 0.1153 0.1207 0.2706 8.9 6cja:B, 6cja:C, 6cja:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218