BioLiP

>protein
MSKDIKQVIEIAKKHNLFLKEETIQFNESGLDFQAVFAQDNNGIDWVLRLPRREDVMPRTKVEKQALDLVNKYAISFQAP
NWIIYTEELIAMKKLDGVPAGTIDHNIGNYIWEIDINNVPELFHKSLGRVLAELHSIPSNKAAALDLVVHTPEEARMSMK
QRMDAVRAKFGVGENLWNRWQAWLNDDDMWPKKTGLIHGDVHAGHTMIDKDANVTGLIDWTEAKVTDVSHDFIFNYRAFG
EEGLEALILAYKEIGGYYWPKMKEHIIELNAAYPVSIAEFALVSGIEEYEQMAKEALEV

The query sequence (length=299) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5uxa:A	301	298	0.9933	0.9867	0.9966	0.0	5igv:A, 5igw:A, 5igy:A, 5igz:A, 5ih0:A, 5ih1:A, 5iwu:A
2	5igi:A	300	288	0.3545	0.3533	0.3681	9.22e-62	5igj:A, 5igp:A, 5igr:A, 5igs:A, 5igt:A
3	7w15:A	294	295	0.3612	0.3673	0.3661	3.12e-61	7w15:B, 7w19:A, 7w19:B, 7w1a:B, 7w1a:A
4	5uxd:A	300	272	0.3311	0.3300	0.3640	5.44e-56	5uxc:A, 5uxd:B
5	6iy9:A	325	115	0.1070	0.0985	0.2783	2.84e-05	6iy9:B
6	7f0b:A	282	75	0.0736	0.0780	0.2933	1.49e-04	7f0c:A, 7f0f:A
7	4dfb:B	301	112	0.1003	0.0997	0.2679	5.81e-04	5c4k:A, 5c4l:A, 5c4l:B, 6cd7:B, 4dfb:A, 4dfu:A, 4dfu:B, 4dt8:A, 4dt8:B, 4dt9:A, 4dt9:B, 4dta:A, 4dta:B, 4dtb:A, 4dtb:B, 4n57:A, 4n57:B, 3sg8:A, 3sg8:B, 3sg9:A, 3sg9:B
8	3tdw:A	302	210	0.1572	0.1556	0.2238	0.001	6ctz:A, 3tdv:A, 3tdv:B
9	5iqc:A	301	55	0.0535	0.0532	0.2909	0.002	5byl:A, 5byl:B, 5byl:C, 5byl:D, 6c5u:A, 6c5u:B, 6c5u:C, 6c5u:D, 6cav:A, 6cav:B, 6cav:C, 6cav:D, 6cey:A, 6cey:B, 6cey:C, 6cey:D, 6cgd:A, 6cgd:B, 6cgd:C, 6cgd:D, 6cgg:A, 6cgg:B, 6cgg:C, 6cgg:D, 6ch4:A, 6ch4:B, 6ch4:C, 6ch4:D, 5iqa:A, 5iqa:B, 5iqa:C, 5iqa:D, 5iqb:A, 5iqb:B, 5iqb:C, 5iqb:D, 5iqc:B, 5iqc:C, 5iqc:D, 5iqd:A, 5iqd:B, 5iqd:C, 5iqd:D, 5iqe:A, 5iqe:B, 5iqe:C, 5iqe:D, 5iqf:A, 5iqf:B, 5iqf:C, 5iqf:D, 5iqg:A, 5iqg:B, 5iqg:C, 5iqg:D, 5iqh:A, 5iqh:B, 5iqh:C, 5iqh:D, 5iqi:A, 5iqi:B, 5iqi:C, 5iqi:D, 4ork:A, 4ork:B, 4ork:C, 4ork:D
10	3ham:A	299	238	0.1672	0.1672	0.2101	0.005	4dca:A, 3ham:B, 3hav:A, 3hav:B, 3hav:C, 3uzr:A
11	8i85:A	280	105	0.0870	0.0929	0.2476	0.050	8i82:A, 8i84:A, 8i86:A, 8i89:A, 8i8g:A, 8i8h:A
12	5yk1:A	401	30	0.0435	0.0324	0.4333	0.20	5yk0:A, 5yk2:A
13	3i0o:A	329	165	0.1237	0.1125	0.2242	0.22	3i0q:A, 3q2m:A
14	3w0s:A	298	85	0.0669	0.0671	0.2353	1.4	3tyk:A, 3w0n:A, 3w0o:A, 3w0p:A, 3w0q:A, 3w0r:A
15	6o6q:A	326	35	0.0435	0.0399	0.3714	1.7	6o6q:B
16	2b0q:A	263	157	0.1204	0.1369	0.2293	2.1	2bkk:A, 2bkk:C, 1j7l:A, 1j7l:B, 1j7u:A, 1j7u:B, 1l8t:A, 3q2j:A, 3q2j:B, 3tm0:A
17	2pyw:A	417	65	0.0602	0.0432	0.2769	2.6	2pyw:B
18	5xya:A	1358	46	0.0468	0.0103	0.3043	3.8	5xxz:A
19	4v8p:BW	110	51	0.0602	0.1636	0.3529	7.7	4v8p:CW, 4v8p:EW, 4v8p:GW
20	8bc1:A	527	74	0.0702	0.0398	0.2838	7.8	8bc1:B
21	8bc0:B	636	74	0.0702	0.0330	0.2838	8.1	6p48:A, 6p48:B, 6p49:A, 6p49:B, 6qpc:A, 6qpc:B
22	6zu5:LDD	103	80	0.0669	0.1942	0.2500	8.7
23	8b8m:B	682	74	0.0702	0.0308	0.2838	8.7
24	6mvd:A	376	66	0.0669	0.0532	0.3030	9.0	6mvd:B
25	8b8j:A	709	74	0.0702	0.0296	0.2838	9.4	8b8j:B, 8b8q:A, 8b8q:B, 8bc0:A, 6p46:A, 6p46:B, 8sun:A, 8sur:A, 8tag:A, 8tai:A, 8tal:A
26	3j0a:B	632	61	0.0669	0.0316	0.3279	9.7

[Back]