Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MRVRKRQSRRTSTKLKEGIKKKASAHRKKEKKMAKKDVTWRDPGIPSNFPYKAKILEEIEAKKMKDLEEREL

The query sequence (length=72) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7uoo:s 72 72 1.0000 1.0000 1.0000 3.72e-46 6elz:s, 6em5:s, 6ft6:s, 3jct:s, 6m62:s, 7nac:s, 7oh3:s, 7ohq:s, 7ohr:s, 7r7a:s, 7u0h:s, 7ug6:s, 7uqb:s, 7uqz:s, 7v08:s, 8v87:s, 6ylg:s, 6ylh:s, 6ylx:s, 6yly:s
2 8i9w:CL 397 60 0.3472 0.0630 0.4167 6.71e-09 8i9t:CL, 8i9v:CL, 8i9x:CL, 8i9y:CL, 8i9z:CL, 8ia0:CL, 8pv1:CL, 8pv2:CL, 8pv3:CL, 8pv4:CL, 8pv5:CL, 8pv6:CL, 8pv7:CL, 8pv8:CL, 8pvk:CL, 8pvl:CL
3 8fl2:NB 81 68 0.3472 0.3086 0.3676 5.95e-04 8fl3:NB, 8fl4:NB, 8ir1:u, 8ir3:u
4 8fkt:NB 387 65 0.3333 0.0620 0.3692 0.002 8fkp:NB, 8fku:NB, 8fkv:NB, 8fkw:NB, 8fkx:NB, 8fky:NB, 8fkz:NB, 8fl0:NB, 8ink:u, 8ipd:u, 8ipx:u, 8ipy:u
5 8y6o:C 2227 52 0.2083 0.0067 0.2885 1.0 8h6e:5B, 8h6j:5B, 8qp9:A, 6qw6:5A, 6qx9:5A, 8qxd:A, 8r08:A
6 5z56:A 2232 52 0.2083 0.0067 0.2885 1.0 7aav:A, 7abf:A, 8ch6:a, 7dvq:A, 8i0s:A, 5z58:A
7 8c6j:A 2261 52 0.2083 0.0066 0.2885 1.0 6ah0:A, 6ahd:A, 8bc8:J, 6ff4:A, 6ff7:A, 9fmd:A, 8i0r:A, 8i0t:A, 8i0w:A, 6icz:A, 6id0:A, 6id1:A, 4jk9:A, 4jk9:B, 4jka:A, 4jka:B, 5mqf:A, 5o9z:A, 6qdv:A, 8qoz:A, 8qpa:A, 8qpb:A, 8qpk:A, 8r09:A, 8r0a:A, 8r0b:A, 8rm5:A, 8ro2:A, 7w59:A, 7w5a:A, 7w5b:A, 5xjc:A, 5yzg:A, 6zym:A
8 8ro0:A 2231 52 0.1944 0.0063 0.2692 2.3 8ro1:A
9 3jb9:A 1964 48 0.1667 0.0061 0.2500 2.4
10 8cdu:C 708 48 0.2222 0.0226 0.3333 2.5 8cec:C, 8ced:C, 8cee:C
11 7abg:A 2174 52 0.2083 0.0069 0.2885 2.8 7abi:A, 8q91:A, 8rc0:A
12 8qp8:A 1918 52 0.2083 0.0078 0.2885 3.1
13 8q7x:A 1914 52 0.2083 0.0078 0.2885 3.3
14 8i0p:A 2149 52 0.2083 0.0070 0.2885 3.3 8q7q:A, 8q7v:A, 8q7w:A
15 8h6k:5B 2253 52 0.2083 0.0067 0.2885 3.7 8h6l:5B, 8i0u:A, 8i0v:A, 8q7n:A, 8qo9:A, 8qpe:A, 7qtt:a, 8qzs:A
16 5z57:A 1978 52 0.2083 0.0076 0.2885 4.2
17 6fvz:A 500 23 0.1528 0.0220 0.4783 5.3 4a79:A, 4a79:B, 4a7a:A, 4a7a:B, 7b0v:A, 7b0v:B, 7b0z:A, 7b0z:B, 2bk3:A, 2bk3:B, 2bk4:A, 2bk4:B, 2bk5:A, 2bk5:B, 2byb:A, 2byb:B, 2c64:A, 2c64:B, 2c65:A, 2c65:B, 2c66:A, 2c66:B, 2c67:A, 2c67:B, 2c70:A, 2c70:B, 2c72:A, 2c72:B, 2c73:A, 2c73:B, 2c75:A, 2c75:B, 2c76:A, 2c76:B, 4crt:A, 4crt:B, 6fvz:B, 6fw0:A, 6fw0:B, 6fwc:A, 6fwc:B, 1gos:A, 1gos:B, 5mrl:A, 5mrl:B, 1oj9:A, 1oj9:B, 1oja:A, 1oja:B, 1ojc:A, 1ojc:B, 1ojd:A, 1ojd:B, 1ojd:C, 1ojd:D, 1ojd:E, 1ojd:F, 1ojd:G, 1ojd:H, 1ojd:I, 1ojd:L, 7p4f:A, 7p4f:B, 7p4h:A, 7p4h:B, 3po7:A, 3po7:B, 6rkb:A, 6rkb:B, 6rkp:A, 6rkp:B, 6rle:A, 6rle:B, 1s2q:A, 1s2q:B, 1s2y:A, 1s2y:B, 1s3b:A, 1s3b:B, 1s3e:A, 1s3e:B, 2v5z:A, 2v5z:B, 2v60:A, 2v60:B, 2v61:A, 2v61:B, 2vrl:A, 2vrl:B, 2vrm:A, 2vrm:B, 2vz2:A, 2vz2:B, 2xcg:A, 2xcg:B, 2xfn:A, 2xfn:B, 2xfo:A, 2xfo:B, 2xfp:A, 2xfp:B, 2xfq:A, 2xfq:B, 2xfu:A, 2xfu:B, 6yt2:A, 6yt2:B, 7zw3:AAA, 7zw3:BBB, 3zyx:A, 3zyx:B
18 5xzr:A 519 25 0.1389 0.0193 0.4000 8.3 1aya:A, 1aya:B, 1ayb:A, 1ayc:A, 8b5y:A, 8b5y:B, 9blg:A, 9blg:B, 6bmr:A, 6cmr:A, 6cms:A, 5df6:A, 5ehp:A, 6md7:A, 6md7:B, 3mow:A, 3o5x:A, 7ppl:A, 7ppm:A, 7ppn:A, 4pvg:A, 4qsy:A, 6r5g:A, 7r75:A, 7r7d:A, 7r7d:B, 7r7i:A, 7rct:B, 7rct:A, 4rdd:A, 6roy:A, 6roy:B, 6roz:A, 6roz:C, 8rzw:A, 8rzw:B, 8rzy:A, 8rzy:B, 8s01:A, 8s01:B, 8s04:A, 8s04:B, 8s06:A, 8s06:B, 8s07:A, 8s07:B, 8s0h:A, 8s0h:B, 8s0i:A, 8s0i:B, 8s0j:A, 8s0j:B, 8s0k:A, 8s0k:B, 8s0o:A, 8s0o:B, 8s0p:A, 8s0p:B, 8s0q:A, 8s0q:B, 8s0s:A, 2shp:A, 2shp:B, 8t6d:A, 8t6d:B, 8t6g:A, 8t6g:B, 8t7q:A, 8t8q:A, 8t8q:B, 3tkz:A, 3tl0:A, 8u7w:A, 8u7w:B, 8u7x:A, 8u7x:B, 8wfy:A, 8wfy:B, 6wu8:A, 6wu8:B, 8wx7:B, 5x7b:A, 5x94:A, 5x94:B
19 2vbw:A 147 60 0.2361 0.1156 0.2833 9.4 2vbx:A, 2vby:A, 2vbz:A, 2vc0:A, 2vc1:A, 2w24:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417