Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MRTRSTISTPNGITWYYEQEGTGPDVVLVPDGLGECQMFDSSVSQIAAQGFRVTTFDMPGMSRSAKAPPETYTEVTAQKL
ASYVISVLDALDIKHATVWGCASGASTVVALLLGYPDRIRNAMCHELPTKLLDHLSNTAVLEDEEISKILANVMLNDVSG
GSEAWQAMGDEVHARLHKNYPVWARGYPRTIPPSAPVKDLEALRGKPLDWTVGAATPTESFFDNIVTATKAGVNIGLLPG
MHFPYVSHPDVFAKYVVETTQKHL

The query sequence (length=264) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6jr9:A 269 264 0.9621 0.9442 0.9621 0.0 5c7y:A, 5c7y:B, 5c81:A, 5c81:B, 5c8x:A, 5c8x:B, 5c8z:A, 5c8z:B, 5ie4:A, 5ie4:B, 5ie5:A, 5ie5:B, 5ie6:A, 5ie6:B, 5ie7:A, 5ie7:B, 6jqz:A, 6jqz:B, 6jr2:A, 6jr2:B, 6jr5:A, 6jr5:B, 6jr9:B, 6jra:A, 6jra:B, 6jrb:A, 6jrb:B, 6jrc:A, 6jrc:B, 6jrd:A, 6jrd:B, 3wzm:A, 3wzm:B, 3wzm:C
2 5xo7:F 264 263 0.6439 0.6439 0.6464 3.05e-123 5xo7:A, 5xo7:B, 5xo7:C, 5xo7:D, 5xo7:E, 5xo7:G, 5xo7:H, 5xo8:A, 5xo8:B, 5xo8:C, 5xo8:D, 5xo8:E, 5xo8:F, 5xo8:G, 5xo8:H, 5z7j:A, 5z7j:B, 5z7j:C, 5z7j:D, 5z7j:E, 5z7j:F, 5z7j:G, 5z7j:H, 5z97:A, 5z97:B, 5z97:C
3 1cr6:B 541 110 0.1288 0.0628 0.3091 8.18e-06 1cr6:A, 1ek1:A, 1ek1:B, 1ek2:A, 1ek2:B
4 6eb3:B 268 110 0.1364 0.1343 0.3273 9.18e-06 6eb3:A, 6eb3:C, 6eb3:D
5 4hai:A 548 112 0.1288 0.0620 0.3036 1.23e-05 7a7g:A, 7a7g:B, 5ai0:A, 5ai4:A, 5ai5:A, 5ai6:A, 5ai8:A, 5ai9:A, 5aia:A, 5aib:A, 5aic:A, 5ak3:A, 5ak4:A, 5ak5:A, 5ak6:A, 5ake:A, 5akg:A, 5akh:A, 5aki:A, 5akj:A, 5akk:A, 5akl:A, 5akx:A, 5aky:A, 5akz:A, 5ald:A, 5ale:A, 5alf:A, 5alg:A, 5alh:A, 5ali:A, 5alk:A, 5all:A, 5alm:A, 5aln:A, 5alo:A, 5alp:A, 5alq:A, 5alr:A, 5als:A, 5alt:A, 5alu:A, 5alv:A, 5alw:A, 5alx:A, 5aly:A, 5alz:A, 5am0:A, 5am1:A, 5am2:A, 5am3:A, 5am4:A, 5am5:A, 3ans:A, 3ans:B, 3ant:A, 3ant:B, 6aum:A, 4c4x:A, 4c4x:B, 4c4y:A, 4c4z:A, 4c4z:B, 7eba:A, 7eba:B, 5fp0:A, 6fr2:A, 6hgv:A, 6hgw:A, 6hgx:A, 3i1y:A, 3i28:A, 6i5g:A, 6i5g:B, 4j03:A, 4jnc:A, 3koo:A, 5mwa:A, 4ocz:A, 4od0:A, 3otq:A, 7p4k:A, 7p4k:B, 3pdc:A, 3pdc:B, 8qmz:A, 8qmz:B, 8qmz:C, 8qmz:D, 8qn0:A, 8qn0:B, 8qvf:A, 8qvg:A, 8qvh:A, 8qvk:A, 8qvl:A, 8qwi:A, 8qzd:A, 1vj5:A, 3wk4:A, 3wk5:A, 3wk6:A, 3wk7:A, 3wk8:A, 3wk9:A, 3wka:A, 3wkb:A, 3wkc:A, 3wkd:A, 3wke:A, 4x6x:A, 4x6x:B, 4x6y:A, 4x6y:B, 4y2j:A, 4y2p:A, 4y2q:A, 4y2r:A, 4y2s:A, 4y2t:A, 4y2u:A, 4y2v:A, 4y2x:A, 4y2y:A, 6yl4:A, 1zd2:P, 1zd3:A, 1zd4:A, 1zd5:A
6 5alj:A 523 105 0.1174 0.0593 0.2952 1.27e-05
7 1hl7:A 279 108 0.1174 0.1111 0.2870 1.90e-05 1hl7:B
8 2xua:H 261 121 0.1515 0.1533 0.3306 2.45e-05
9 2og1:A 285 108 0.1250 0.1158 0.3056 9.95e-05 2puh:A, 2puj:A, 2rht:A, 2rhw:A, 3v1m:A, 3v1n:A
10 8pi1:B 276 104 0.0909 0.0870 0.2308 7.57e-04 3hea:A, 3hea:B, 3hea:C, 3hea:D, 3hea:E, 3hea:F, 3hi4:A, 3hi4:B, 3hi4:C, 3hi4:D, 3hi4:E, 3hi4:F, 3ia2:A, 3ia2:B, 3ia2:C, 3ia2:D, 3ia2:E, 3ia2:F, 8pi1:A, 8pi1:C, 8pi1:D, 8pi1:E, 8pi1:F, 8pi1:G, 8pi1:H, 8pi1:I, 8pi1:J, 8pi1:K, 8pi1:M, 8pi1:N, 8pi1:O
11 5h3h:B 269 109 0.1061 0.1041 0.2569 0.002 5h3h:A
12 2ocg:A 254 113 0.1061 0.1102 0.2478 0.002 2oci:A, 2ock:A, 2ocl:A
13 4g8b:A 277 113 0.0985 0.0939 0.2301 0.016 4g8b:B, 4g8c:A, 4g8c:B, 4g9e:A, 4g9e:B
14 2zjf:A 346 106 0.1061 0.0809 0.2642 0.019
15 2xmr:A 281 83 0.0833 0.0783 0.2651 0.086
16 8sbq:A 277 124 0.0985 0.0939 0.2097 0.13 8g49:A, 8sbq:B, 8t88:A, 8t88:B, 8tfw:A, 8tfw:B
17 8qd2:A 398 123 0.1212 0.0804 0.2602 0.28 8qd2:B, 8qd2:C, 8qd2:D, 8qd3:A, 8qd3:B, 8qd3:C, 8qd3:D
18 2e7i:A 344 42 0.0568 0.0436 0.3571 0.28 2e7i:B, 2e7j:A, 2e7j:B
19 6qe2:A 257 100 0.1023 0.1051 0.2700 0.51 6qe2:B
20 6brt:A 285 170 0.1477 0.1368 0.2294 0.64 6ap8:A, 6ap8:B, 5dj5:A, 4iha:A, 4iha:B, 3wio:A, 5yz7:A, 5yz7:B, 5zhr:A, 5zhr:B, 5zhs:A, 5zht:A
21 4uhf:A 278 116 0.1212 0.1151 0.2759 0.80 4uhd:A, 4uhe:A
22 4ayg:A 1028 62 0.0795 0.0204 0.3387 0.99 4ayg:B, 3hz3:A, 3klk:A, 3kll:A
23 5hzg:A 257 170 0.1515 0.1556 0.2353 1.0 5hzg:E
24 5veu:L 448 175 0.1667 0.0982 0.2514 1.3 7lad:A, 8sg5:H, 7sv2:D, 5veu:E
25 5veu:C 469 175 0.1667 0.0938 0.2514 1.3 6mjm:A, 8sg5:A, 8sg5:B, 8sg5:C, 8sg5:D, 8sg5:E, 8sg5:F, 8sg5:G, 7sv2:A, 7sv2:B, 7sv2:C, 5veu:A, 5veu:B, 5veu:D, 5veu:F, 5veu:G, 5veu:H, 5veu:I, 5veu:J, 5veu:K
26 5z7w:B 271 203 0.1780 0.1734 0.2315 1.9 5z7w:A
27 5g3z:A 215 57 0.0530 0.0651 0.2456 2.1 5g40:A, 5g41:A
28 1q0r:A 297 84 0.0871 0.0774 0.2738 3.9 1q0z:A
29 4nvr:A 302 110 0.1061 0.0927 0.2545 4.4 4nvr:B, 4nvr:C, 4nvr:D
30 6khm:K 312 52 0.0720 0.0609 0.3654 5.7 6khl:A, 6khl:B, 6khm:A, 6khm:B, 6khm:C, 6khm:D, 6khm:E, 6khm:F, 6khm:G, 6khm:H, 6khm:I, 6khm:J, 6khm:L, 6khm:M, 6khm:N, 6khm:O, 6khm:P, 6khm:Q, 6khm:R, 6khm:S, 6khm:T, 6khm:U, 6khm:V, 6khm:X, 6khm:Y, 6khm:W, 6khm:Z
31 8u5y:B 700 52 0.0606 0.0229 0.3077 7.4 8u5y:A, 8u5y:C, 8u61:B, 8u61:A, 8u61:C
32 1d3a:A 303 51 0.0606 0.0528 0.3137 7.4 1d3a:B, 1hlp:A, 1hlp:B, 2hlp:A, 1o6z:A, 1o6z:B, 1o6z:C, 1o6z:D, 2x0r:A, 2x0r:B
33 5y5r:D 253 97 0.0795 0.0830 0.2165 7.7 5y5r:A, 5y5r:B, 5y5r:C, 5y5r:E, 5y5r:F
34 2o2h:A 294 93 0.0833 0.0748 0.2366 8.4 2o2i:A
35 7ryt:B 368 64 0.0606 0.0435 0.2500 8.5 8f2l:B, 8f2l:A, 8f2l:C, 8f2l:D, 8f2l:F, 8f2l:G, 8f2l:H, 8f2l:I, 8f2l:J, 8f2l:K, 8f2l:L, 6pux:A, 6pux:B, 7ryt:A, 7ryt:C, 7ryt:D, 7ryt:E, 7ryt:F
36 3naz:C 613 137 0.1402 0.0604 0.2701 8.6 3naz:D, 3o3c:A, 3o3c:B, 3o3c:C, 3o3c:D, 3rsz:C, 3rsz:D, 3rsz:A, 3rsz:B
37 6tz8:C 111 39 0.0455 0.1081 0.3077 9.1 6tz8:F
38 3rfv:A 265 108 0.1061 0.1057 0.2593 9.4 3rfv:B, 3rfv:C, 3rfx:A, 3rfx:B, 3rfx:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218