BioLiP

>protein
MQTVIFGRSGCPYSVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVK
ENLDA

The query sequence (length=85) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1grx:A	85	85	1.0000	1.0000	1.0000	1.59e-60	1qfn:A
2	3msz:B	87	80	0.3647	0.3563	0.3875	1.04e-11	3msz:A
3	3grx:A	82	74	0.3765	0.3902	0.4324	2.15e-11
4	4rqr:A	107	80	0.3059	0.2430	0.3250	6.83e-07	1b4q:A
5	4tr0:A	92	73	0.3176	0.2935	0.3699	1.18e-06	4tr0:B, 4tr1:A, 4tr1:B
6	4i2u:A	109	82	0.3059	0.2385	0.3171	1.32e-05
7	5w1j:A	584	75	0.2941	0.0428	0.3333	1.51e-05	5w1j:B, 5w1l:A, 5w1l:B
8	3fz9:A	106	72	0.2588	0.2075	0.3056	2.13e-04	3fza:A
9	2ht9:B	111	79	0.3059	0.2342	0.3291	6.98e-04	2fls:A, 2ht9:A
10	3rhc:A	103	73	0.2706	0.2233	0.3151	0.003	3rhb:A, 3rhc:B
11	5kqa:A	110	71	0.2588	0.2000	0.3099	0.003
12	3uiw:A	110	72	0.2588	0.2000	0.3056	0.006	3uiw:B
13	2jac:A	108	73	0.2706	0.2130	0.3151	0.012	3c1s:A
14	4n11:A	108	84	0.2706	0.2130	0.2738	0.016	7din:A, 7dio:A, 7dip:A, 7diq:A
15	3d5j:A	112	78	0.2353	0.1786	0.2564	0.016	3d5j:B
16	8frl:F	316	53	0.2235	0.0601	0.3585	0.023	8frm:F, 8fro:F, 8ufg:F, 8ufh:F
17	8frn:F	289	37	0.2000	0.0588	0.4595	0.031
18	8a1r:A	593	71	0.2471	0.0354	0.2958	0.031	8a1r:B, 7b02:A, 6fmu:A, 6fmz:A, 6fp4:A, 6ftc:A, 3h4k:A, 4la1:A, 4la1:B, 7npx:A, 7npx:B, 8pdd:A, 8pdd:B, 8pl0:A, 8pl0:B, 8pl1:A, 8pl1:B, 8pl2:A, 8pl2:B, 8pl3:A, 8pl3:B, 8pl4:A, 8pl4:B, 8pl5:A, 8pl5:B, 8pl6:A, 8pl7:A, 8pl7:B, 8pl8:A, 8pl9:A, 8pl9:B, 8pla:A, 8pla:B, 8plb:A, 8plb:B, 8plc:A, 8plc:B, 8pld:A, 8pld:B, 8ple:A, 8ple:B, 8plf:A, 8plf:B, 8plg:A, 8plh:A, 8pli:A, 8pli:B, 8plj:A, 8plj:B, 8plk:A, 8plk:B, 8pll:A, 8plm:A, 8pln:A, 8plo:A, 8plo:B, 8plp:A, 8plp:B, 8plq:A, 8plq:B, 8plr:A, 8plr:B, 8pls:A, 8pls:B, 8plt:A, 8plt:B, 8plu:A, 8plu:B, 8plv:A, 8plv:B, 8plw:A, 8plw:B, 8plx:A, 8plx:B, 8ply:A, 8ply:B, 6rtj:A, 6rtm:A, 6rto:A, 2v6o:A, 2x8c:A, 2x8c:B, 2x8g:A, 2x8h:A, 2x99:A, 6zlb:A, 6zlp:A, 6zp3:A, 6zst:A
19	1bg1:A	559	40	0.1529	0.0233	0.3250	0.24	4e68:A, 6njs:A, 6nuq:A, 6qhd:A
20	3gme:A	482	31	0.1529	0.0270	0.4194	0.55
21	7ogk:A	695	31	0.1529	0.0187	0.4194	0.77	3gcm:A, 3gcm:B, 3gcm:C, 3h1c:A, 3h1c:B, 3h1c:C, 3h1c:K, 3h1c:G, 3h1c:I, 3h1c:M, 3h1c:O, 3h1c:R, 3h1c:T, 3h1c:V, 3h1c:X, 7ogk:B, 7ogk:C, 7ogm:L, 7ogm:N, 7ogm:O
22	6sl2:A	619	40	0.1765	0.0242	0.3750	1.7	5nl7:A, 6sl3:A
23	2wci:A	113	40	0.1647	0.1239	0.3500	1.8	2wci:B
24	2e7p:C	115	69	0.2235	0.1652	0.2754	3.1	2e7p:A, 2e7p:B, 2e7p:D
25	5j3r:A	114	71	0.2706	0.2018	0.3239	3.5	3l4n:A
26	6wmt:S	202	24	0.1294	0.0545	0.4583	4.4	6weg:D
27	5z6b:A	393	50	0.1647	0.0356	0.2800	4.6
28	1im2:A	346	53	0.1882	0.0462	0.3019	6.0	1g3i:T, 1g41:A
29	6lvw:A	668	44	0.1529	0.0195	0.2955	7.0
30	6zdu:A	693	61	0.1882	0.0231	0.2623	8.2	6zdq:A, 6zdu:B
31	1g3i:A	326	48	0.1882	0.0491	0.3333	8.3	1g3i:B, 1g3i:C, 1g3i:D, 1g3i:E, 1g3i:F, 1g3i:S, 1g3i:U, 1g3i:V, 1g3i:W, 1g3i:X, 1kyi:A, 1kyi:B, 1kyi:C, 1kyi:D, 1kyi:E, 1kyi:F, 1kyi:S, 1kyi:T, 1kyi:U, 1kyi:V, 1kyi:W, 1kyi:X
32	6lum:A	539	24	0.1059	0.0167	0.3750	9.2	6lum:J, 6lum:P

[Back]