BioLiP

>protein
MNKEEIILSAKNWMHSHFHDWSHIKRVWKLSKEIQSKEGGDLFTIELAALFHDYSDQEATKTLINWMETKEIPSELIKKI
IRIIQSVSALTIEEKIVQDADRLDAIGAIGIARTFTYGGAHNREIANQNPKNTTLQHFYDKLLLIKDQLNTETAKTIAKE
KQKIMQDFIQALEKELKVLE

The query sequence (length=180) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3b57:A	180	180	1.0000	1.0000	1.0000	4.50e-131
2	3djb:A	188	164	0.4111	0.3936	0.4512	4.38e-41	3djb:B
3	5dqw:A	188	179	0.4000	0.3830	0.4022	7.76e-38	5dqw:B
4	2qgs:A	209	180	0.3444	0.2967	0.3444	2.40e-27	2qgs:B
5	2pq7:A	174	166	0.2889	0.2989	0.3133	1.28e-12
6	5azi:A	513	72	0.1000	0.0351	0.2500	0.30	5azi:B, 5azi:C, 5azi:D, 5azj:A, 5azj:B, 5azj:C, 5azj:D, 5gn5:A, 5gn5:B, 5gn5:C, 5gn5:D, 5gn6:A, 5gn6:B, 5gn6:C, 5gn6:D, 6j9q:A, 6j9q:B, 6j9q:C, 6j9q:D, 6j9v:A, 6j9v:B, 6jaf:A, 3wxj:A, 3wxj:B, 3wxj:C, 3wxj:D, 3wxk:A, 3wxk:B, 3wxk:C, 3wxk:D, 3wxl:A, 3wxl:B, 3wxl:C, 3wxl:D
7	2o08:A	187	49	0.0944	0.0909	0.3469	0.36	2o08:B
8	7lbm:W	574	110	0.1111	0.0348	0.1818	1.8
9	8ebu:A	604	110	0.1111	0.0331	0.1818	1.8	8ebt:A, 8ebx:A, 8eby:A
10	7ena:6	652	110	0.1111	0.0307	0.1818	2.1	7ad8:A, 8bvw:0, 8ebs:A, 8ebv:A, 8ebw:A, 7egb:6, 7egc:6, 7enc:6, 8gxq:HH, 8gxs:HH, 5ivw:V, 5iy6:V, 5iy7:V, 5iy8:V, 5iy9:V, 7nvr:7, 7nvv:7, 7nvw:7, 7nvx:7, 7nvy:7, 7nvz:7, 7nw0:7, 6o9l:7, 6ro4:A, 8wak:6, 8wal:6, 8wan:6, 8wao:6, 8wap:6, 8waq:6, 8war:6, 8was:6
11	7way:A	960	54	0.1056	0.0198	0.3519	3.8	7waz:A, 7wb1:A
12	7wb0:A	797	54	0.1056	0.0238	0.3519	3.9
13	8uzv:A	442	12	0.0444	0.0181	0.6667	5.3	9b3b:A, 9b3b:B, 8cvq:A, 8cvq:B, 8cw2:A, 8cw2:B, 6dhu:A, 6dhu:B, 6die:A, 6die:B, 6dih:A, 6dih:B, 6dim:A, 6dim:B, 6djd:A, 6djd:B, 6dje:A, 6dje:B, 6djf:A, 6djf:B, 6djg:A, 6djg:B, 6djh:A, 6djh:B, 6dji:A, 6dji:B, 6djj:A, 6djj:B, 6mj5:A, 6mj5:B, 1mu7:A, 1mu7:B, 1mu9:A, 1mu9:B, 6myz:A, 6mz0:A, 6mz0:B, 6n0d:A, 6n0d:B, 6n0n:A, 6n0n:B, 6n0o:A, 6n0o:B, 6n0r:A, 6n0r:B, 6n17:A, 6n17:B, 6n19:A, 6n19:B, 1nop:A, 1nop:B, 5nw9:A, 5nwa:A, 1rff:A, 1rff:B, 1rfi:A, 1rfi:B, 1rg1:A, 1rg1:B, 1rg2:A, 1rg2:B, 1rgt:A, 1rgt:B, 1rgu:A, 1rgu:B, 1rh0:A, 1rh0:B, 7ufy:A, 7ufy:B, 7ufz:A, 7ufz:B, 8uv1:A, 8uv1:B, 8uzv:B, 8uzz:A, 8uzz:B, 8v0b:A, 8v0b:B, 8v0c:A, 8v0c:B, 6w4r:A, 6w4r:B, 6w7j:A, 6w7j:B, 6w7k:A, 6w7k:B, 6w7l:A, 6w7l:B
14	1pv9:A	337	82	0.1389	0.0742	0.3049	8.6
15	1k96:A	89	56	0.1056	0.2135	0.3393	8.7	1k9k:A, 1k9k:B, 4p2y:B, 4ybh:B
16	8wmy:A	198	58	0.0778	0.0707	0.2414	9.0	8wmy:B

[Back]