BioLiP

>protein
MNDYKLFRCIQCGFEYDEALGWPEDGIAAGTRWDDIPDDWSCPDCGAAKSDFEMVEVARS

The query sequence (length=60) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2kn9:A	81	60	1.0000	0.7407	1.0000	1.70e-41	7a9a:A, 7a9a:B, 7a9a:C, 7a9a:D, 7a9a:E, 7a9a:F, 7a9a:G, 7a9a:H
2	2v3b:B	53	52	0.5833	0.6604	0.6731	3.49e-22
3	1s24:A	56	53	0.5000	0.5357	0.5660	1.14e-15
4	1yk5:A	53	50	0.4667	0.5283	0.5600	2.18e-15	2pya:A, 1yk4:A, 1yk5:B, 1yk5:C, 1yk5:D
5	2dsx:A	52	48	0.4333	0.5000	0.5417	3.81e-15	1rdg:A
6	2kkd:A	52	49	0.4500	0.5192	0.5510	4.69e-15	2ql0:A, 1rb9:A, 1rdv:A, 2rdv:A, 2rdv:B, 2rdv:C, 7rxn:A, 8rxn:A
7	8f6t:A	428	47	0.4333	0.0607	0.5532	3.53e-14
8	5ai2:A	54	48	0.4333	0.4815	0.5417	5.42e-14	5ai3:A, 4ar3:A, 4ar4:A, 4ar5:A, 4ar6:A, 9bkl:A, 9bkp:A, 9bkt:A, 1bq8:A, 1bq9:A, 1brf:A, 1caa:A, 1cad:A, 1iu5:A, 1iu6:A, 4k9f:A, 3kyu:A, 3kyv:A, 3kyw:A, 3kyx:A, 3kyy:A, 5nw3:A, 5ome:A, 3ryg:A, 3rz6:A, 3rzt:A, 3ss2:A, 1vcx:A, 1zrp:A
9	6gps:A	330	52	0.4167	0.0758	0.4808	1.66e-13	6gpx:A
10	4xnw:C	350	52	0.4167	0.0714	0.4808	1.74e-13	4xnv:A, 4xnw:A
11	2pvx:B	54	52	0.4167	0.4630	0.4808	2.91e-13	2pvx:A, 2pvx:C, 2pvx:D, 2pvx:E, 2pvx:F, 2pvx:G, 2pvx:H
12	6li2:A	347	52	0.4167	0.0720	0.4808	5.30e-13
13	2pve:A	52	51	0.4333	0.5000	0.5098	5.92e-13	2pve:B, 2pve:C
14	6me8:A	449	52	0.4167	0.0557	0.4808	6.88e-13	6me6:A, 6me7:A, 6me9:A
15	5xpd:A	269	51	0.4000	0.0892	0.4706	7.08e-13
16	5vbl:B	353	55	0.4333	0.0737	0.4727	7.78e-13	6knm:B, 7sus:A
17	6iiv:A	461	52	0.4167	0.0542	0.4808	8.97e-13	1b13:A, 1b2j:A, 1b2o:A, 1b2o:B, 1be7:A, 1bfy:A, 1c09:A, 1c09:B, 1c09:C, 1fhh:A, 1fhm:A, 6iiu:A, 1irn:A, 1iro:A, 1r0h:A, 4rxn:A, 5rxn:A, 1smm:A, 1smu:A, 1smw:A, 1t9o:A, 1t9o:B, 1t9o:C, 1t9p:A, 1t9p:B, 1t9p:C, 1t9q:A
18	6bd4:A	379	55	0.4167	0.0660	0.4545	1.32e-12
19	6ln2:A	437	52	0.4167	0.0572	0.4808	5.52e-12	3c59:A, 3c5t:A, 3iol:A, 5otu:A, 5otu:C, 5otv:C, 5otv:A, 5otw:C, 5otw:A, 5otx:A, 5otx:C, 4zgm:A
20	7f1t:A	423	52	0.4000	0.0567	0.4615	3.14e-11	6akx:A, 6akx:B, 6aky:A, 5d65:B, 5d65:A, 5d65:D, 4mbs:A, 4mbs:B, 5uiw:A
21	7e0l:A	491	47	0.3333	0.0407	0.4255	5.03e-09	7e0l:B, 7e0l:K, 7e0l:M, 7wsx:A, 7wsx:B
22	8ito:B	74	56	0.3500	0.2838	0.3750	5.47e-08	8ito:A
23	2ms3:A	57	47	0.3167	0.3333	0.4043	8.36e-08
24	6rxn:A	45	46	0.3167	0.4222	0.4130	4.10e-05
25	1dx8:A	70	50	0.2667	0.2286	0.3200	9.72e-05	1h7v:A
26	2lcq:A	161	41	0.2000	0.0745	0.2927	0.26
27	2i13:B	144	47	0.2167	0.0903	0.2766	1.7
28	8ivz:A	165	38	0.1667	0.0606	0.2632	2.5	8ivz:B
29	6knb:B	1120	42	0.2667	0.0143	0.3810	2.6	6knc:B
30	2c7j:B	172	25	0.1667	0.0581	0.4000	4.3	2c7k:B, 2c7l:B
31	7r7j:B	574	28	0.1833	0.0192	0.3929	9.8	8h5y:B, 8h5y:A, 8h5z:B, 8h5z:A, 6jde:B, 6jde:A, 7r7j:A

[Back]