Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MKVLVAAPLHEKAIQVLKDAGLEVIYEEYPDEDRLVELVKDVEAIIVRSKPKVTRRVIESAPKLKVIARAGVGLDNIDVE
AAKEKGIEVVNAPAASSRSVAELAVGLMFSVARKIAFADRKMREGVWAKKEAMGIELEGKTIGIIGFGRIGYQVAKIANA
LGMNILLYDPYPNEERAKEVNGKFVDLETLLKESDVVTIHVPLVESTYHLINEERLKLMKKTAILINTSRGPVVDTNALV
KALKEGWIAGAGLDVFEEEPLPKDHPLTKFDNVVLTPHIGASTVEAQERAGVEVAEKVVKILKG

The query sequence (length=304) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1wwk:A 304 304 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 1wwk:B
2 7dkm:A 306 302 0.4276 0.4248 0.4305 2.43e-84 7cvp:B, 6cwa:A, 6cwa:B, 7dkm:B, 7ewh:A, 7ewh:B, 2g76:A, 2g76:B, 5n53:B, 5n53:A, 5n6c:A, 5n6c:B, 5nzo:B, 5nzo:A, 5nzp:B, 5nzp:A, 5nzq:B, 5nzq:A, 5ofm:B, 5ofm:A, 5ofv:B, 5ofv:A, 5ofw:B, 5ofw:A, 6plf:A, 6plf:B, 6plg:A, 6plg:B, 6plg:C, 6plg:D, 6plg:E, 6plg:F, 6plg:G, 6plg:H, 6rih:A, 6rih:B, 6rj2:A, 6rj2:B, 6rj3:A, 6rj3:B, 6rj5:A, 6rj5:B, 6rj6:A, 6rj6:B, 7va1:B, 7va1:A, 7va1:C, 7va1:D
3 5aov:A 334 279 0.4375 0.3982 0.4767 3.25e-82
4 6bii:A 332 312 0.4638 0.4247 0.4519 5.21e-76 6bii:B
5 2ekl:A 312 306 0.4276 0.4167 0.4248 2.57e-75
6 2dbq:A 333 315 0.5000 0.4565 0.4825 7.15e-73 2dbr:A, 2dbr:B, 2dbr:C, 2dbr:D, 2dbr:E, 2dbr:F, 2dbz:A, 2dbz:B
7 3dc2:A 526 302 0.4276 0.2471 0.4305 1.21e-72 3dc2:B, 3ddn:B
8 2p9e:A 406 311 0.4211 0.3153 0.4116 1.46e-68 2p9c:A, 2p9c:B, 2p9e:B, 2p9e:C, 2p9e:D, 2p9g:A, 2p9g:B, 2pa3:A, 1psd:A, 1psd:B, 1sc6:A, 1sc6:B, 1yba:A, 1yba:B, 1yba:C, 1yba:D
9 7cvp:A 254 261 0.3454 0.4134 0.4023 1.02e-57
10 1sc6:D 384 307 0.3914 0.3099 0.3876 9.13e-57 1sc6:C
11 3kb6:B 334 282 0.3618 0.3293 0.3901 1.55e-55 3kb6:A, 3kb6:C, 3kb6:D
12 5z20:F 336 281 0.3454 0.3125 0.3737 9.43e-55 5z20:A, 5z20:B, 5z20:C, 5z20:D, 5z20:E
13 4cuk:A 330 292 0.3289 0.3030 0.3425 5.27e-52 4cuk:D
14 6cdf:A 333 256 0.3257 0.2973 0.3867 2.59e-51 8ari:A, 8ari:G, 8ari:D, 8ari:F, 8ari:E, 8ari:J, 8ari:H, 8ari:K, 8ari:I, 8ari:P, 8ari:L, 8ari:M, 8ari:N, 8ari:T, 8ari:O, 8ari:Q, 8ari:R, 8ari:U, 8ari:S, 8ari:X, 8ari:B, 8ari:C, 8ari:V, 8ari:W, 6cdr:A, 1hku:A, 1hl3:A, 2hu2:A, 7kwm:A, 4lce:A, 1mx3:A, 4u6q:A, 4u6s:A, 6v89:A, 6v8a:A
15 8ati:A 330 256 0.3125 0.2879 0.3711 1.17e-48 8ati:B, 8ati:C, 8ati:D, 4lcj:A, 4lcj:B, 4lcj:C, 4lcj:D, 4lcj:E, 4lcj:F, 4lcj:G, 4lcj:H, 2ome:A, 2ome:B, 2ome:C, 2ome:D, 2ome:E, 2ome:F, 2ome:G, 2ome:H, 6wkw:D, 6wkw:C, 6wkw:B, 6wkw:A
16 3baz:A 311 292 0.3388 0.3312 0.3527 3.77e-48
17 2gcg:A 324 257 0.3026 0.2840 0.3580 3.38e-47 2gcg:B, 2gcg:C, 2gcg:D
18 4zgs:A 346 288 0.3355 0.2948 0.3542 5.98e-45 4zgs:B, 4zgs:C, 4zgs:D, 4zgs:E, 4zgs:F, 4zgs:G, 4zgs:H
19 6ttb:A 331 239 0.3026 0.2779 0.3849 9.82e-45
20 7arz:A 361 256 0.3026 0.2548 0.3594 1.20e-43
21 1dxy:A 330 291 0.3322 0.3061 0.3471 1.38e-42
22 2gsd:A 399 304 0.3257 0.2481 0.3257 2.12e-41
23 4njm:A 303 307 0.3257 0.3267 0.3225 7.44e-41 4njm:B, 4njo:A
24 2yq5:C 331 248 0.3026 0.2779 0.3710 1.15e-40 2yq5:A, 2yq5:B, 2yq5:D
25 5v6q:B 319 287 0.3125 0.2978 0.3310 9.13e-40 5j23:A, 5j23:B, 5j23:C, 5j23:D, 5v6q:A, 5v6q:C, 5v6q:D, 5v7g:A, 5v7g:B, 5v7g:C, 5v7g:D, 5v7n:A, 5v7n:B, 5v7n:C, 5v7n:D
26 4prl:A 330 228 0.2796 0.2576 0.3728 4.00e-39 4prl:B
27 5dt9:A 379 268 0.2993 0.2401 0.3396 5.33e-39
28 5z21:B 331 239 0.2763 0.2538 0.3515 2.06e-38 5z21:A, 5z21:C, 5z21:D
29 6p2i:A 307 279 0.3289 0.3257 0.3584 4.91e-38 6p2i:B
30 3wr5:A 401 275 0.2961 0.2244 0.3273 5.73e-38 6juj:A, 6juj:B, 6juk:A, 6juk:B, 2nad:A, 2nad:B, 8oq2:A, 8oq2:B, 8oq2:C, 8oq2:D, 8oq2:E, 8oq2:F, 3wr5:B, 3wr5:C
31 4xkj:A 332 303 0.3684 0.3373 0.3696 6.83e-38 4xkj:B
32 2w2l:A 346 263 0.3026 0.2659 0.3498 5.31e-37 2w2l:B, 2w2l:C, 2w2l:D
33 2dld:A 337 276 0.2895 0.2611 0.3188 9.00e-37 2dld:B
34 3jtm:A 351 239 0.2664 0.2308 0.3389 1.08e-36 3n7u:A, 3n7u:B, 3n7u:C, 3n7u:D, 3n7u:E, 3n7u:F, 3n7u:G, 3n7u:H, 3n7u:I, 3n7u:J, 3n7u:K, 3n7u:L
35 6ih6:A 330 317 0.3388 0.3121 0.3249 1.54e-36 6ih3:A, 6ih5:B, 6ih6:B
36 1j49:A 332 254 0.2763 0.2530 0.3307 3.13e-36 1j49:B
37 8j3p:A 374 264 0.2895 0.2353 0.3333 1.03e-34 8j3o:A, 8j3o:B, 8j3o:C, 8j3o:D, 8j3p:B, 8j3p:C
38 6t9w:B 383 255 0.2796 0.2219 0.3333 1.52e-34 8bxx:AA, 8bxx:BB, 8bxx:CC, 8bxx:DD, 6t9w:A, 6t9w:C, 6t9x:B, 6t9x:A, 6t9x:C, 6t9x:D, 6tb6:B
39 4e5p:A 332 317 0.2928 0.2681 0.2808 1.95e-34 4e5k:A, 4e5k:B, 4e5k:C, 4e5k:D, 4e5m:A, 4e5m:B, 4e5n:A, 4e5n:B, 4e5n:C, 4e5n:D, 4e5n:E, 4e5n:F, 4e5n:G, 4e5n:H, 4e5p:B, 4e5p:C, 4e5p:D, 4e5p:E, 4e5p:F, 4ebf:A, 4ebf:B, 4ebf:C, 4ebf:D, 4nu5:A, 4nu5:B, 4nu6:A, 4nu6:B
40 6d4b:A 361 296 0.3158 0.2659 0.3243 8.62e-34 6d4b:B, 6d4c:A, 6d4c:B, 5dn9:A, 5dn9:B
41 7ya3:B 384 223 0.2270 0.1797 0.3094 2.48e-32 7ya3:A, 7ya4:A, 7ya4:B
42 3oet:H 378 265 0.2862 0.2302 0.3283 5.81e-31 3oet:A, 3oet:B, 3oet:C, 3oet:D, 3oet:E, 3oet:F, 3oet:G
43 8grv:A 336 303 0.2697 0.2440 0.2706 8.20e-31
44 5mh5:A 308 237 0.2467 0.2435 0.3165 1.28e-30 5mh5:B, 5mh6:A, 5mh6:B, 5mh6:C, 5mh6:D, 5mha:A, 5mha:B
45 2o4c:A 380 296 0.2730 0.2184 0.2804 6.20e-30 2o4c:B
46 6t8y:BBB 375 265 0.3026 0.2453 0.3472 2.39e-28 6t8y:AAA, 6t8y:CCC, 6t8y:DDD, 6t8z:AAA, 6t8z:BBB, 6t8z:CCC, 6t8z:DDD, 6t92:AAA, 6t92:BBB, 6t92:CCC, 6t92:DDD, 6t94:AAA, 6t94:BBB, 6t94:CCC, 6t94:DDD
47 4xyb:A 384 225 0.2303 0.1823 0.3111 5.66e-28 4xyb:B, 4xye:A, 4xye:B
48 5vg6:B 315 252 0.2730 0.2635 0.3294 3.60e-25 5vg6:A, 5vg6:C, 5vg6:D, 5vg6:E, 5vg6:F, 5vg6:G, 5vg6:H, 5vg6:I, 5vg6:J
49 4zqb:B 316 187 0.1875 0.1804 0.3048 6.23e-22 4zqb:A
50 5bqf:A 317 239 0.2237 0.2145 0.2845 1.40e-17 5tsd:A, 5tsd:B, 4xcv:A
51 3kbo:A 312 147 0.1579 0.1538 0.3265 1.03e-15 3kbo:B, 3kbo:C, 3kbo:D
52 1qp8:A 301 240 0.2138 0.2159 0.2708 1.13e-15 1qp8:B
53 7jqh:A 313 189 0.1743 0.1693 0.2804 1.82e-14 7jqi:A, 7jqj:A, 6ovl:A, 6oxn:A, 6p35:A
54 4weq:A 316 254 0.2039 0.1962 0.2441 1.90e-11 4z0p:A
55 8hye:C 371 107 0.0987 0.0809 0.2804 0.005 8hye:A, 8hye:B
56 7o5l:A 417 116 0.1086 0.0791 0.2845 0.008 7o5l:C, 7o5m:A, 7o5m:C, 7zd7:A, 7zd7:C, 7zd8:A, 7zd8:C, 7zd9:A, 7zd9:C
57 3d64:A 462 100 0.0855 0.0563 0.2600 0.011 3d64:B, 3glq:A, 3glq:B
58 8xd5:A 419 37 0.0559 0.0406 0.4595 0.014 8hho:A, 8hiq:A, 8hiz:A, 8hj9:A, 8xco:A, 8xcp:A, 8xcq:A, 8xcr:A, 8xcs:A, 8xct:A, 8xcu:A, 8xcv:A, 8xcw:A, 8xcx:A, 8xcy:A, 8xcz:A, 8xd0:A, 8xd1:A, 8xd2:A, 8xd3:A, 8xd4:A, 8xd6:A, 8znb:A, 8znc:A, 8znd:A, 8zne:A, 8zng:A
59 2vhw:E 373 128 0.1118 0.0912 0.2656 0.016 4lmp:A, 6o7f:A, 2vhv:A, 2vhv:B, 2vhw:A, 2vhw:B, 2vhw:C, 2vhw:D, 2vhw:F, 2vhx:A, 2vhx:B, 2vhx:C, 2vhx:D, 2vhx:E, 2vhx:F, 2vhz:A, 2vhz:B, 2voj:A, 2voj:C, 2voj:E
60 5h81:B 354 39 0.0493 0.0424 0.3846 0.025 5h81:A, 5h82:A, 5h82:B
61 2c40:A 302 100 0.1086 0.1093 0.3300 0.037 2c40:B
62 6jcz:C 331 69 0.0757 0.0695 0.3333 0.065 6jcw:A, 6jcw:B, 6jcw:C, 6jcw:D, 6jcw:E, 6jcw:F, 6jcw:G, 6jcw:H, 6jcw:I, 6jcw:J, 6jcw:K, 6jcw:L, 6jcz:A, 6jcz:B, 6jcz:D, 6jcz:E, 6jcz:F, 6jcz:G, 6jcz:H, 6jcz:I, 6jcz:J, 6jcz:K, 6jcz:L, 6jd1:A, 6jd1:B, 6jd1:C, 6jd1:D, 6jd1:E, 6jd1:F, 6jd1:G, 6jd1:H, 6jd1:I, 6jd1:J, 6jd1:K, 6jd1:L, 6jd2:A, 6jd2:B, 6jd2:C, 6jd2:D, 6jd2:E, 6jd2:F, 6jd2:G, 6jd2:H, 6jd2:I, 6jd2:J, 6jd2:K, 6jd2:L, 6kou:A, 6kou:B, 6kou:C, 6kou:D, 6kou:E, 6kou:F, 6kou:G, 6kou:H, 6kou:I, 6kou:J, 6kou:K, 6kou:L, 6kpa:A, 6kpa:B, 6kpa:C, 6kpa:D, 6kpa:E, 6kpa:F, 6kpa:G, 6kpa:H, 6kpa:I, 6kpa:J, 6kpa:K, 6kpa:L, 6kph:A, 6kph:B, 6kph:C, 6kph:D, 6kph:E, 6kph:F, 6kph:G, 6kph:H, 6kph:I, 6kph:J, 6kph:K, 6kph:L, 6kpi:A, 6kpi:B, 6kpi:C, 6kpi:D, 6kpi:E, 6kpi:F, 6kpi:G, 6kpi:H, 6kpi:I, 6kpi:J, 6kpi:K, 6kpi:L, 6kpj:A, 6kpj:B, 6kpj:C, 6kpj:D, 6kpj:E, 6kpj:F, 6kpj:G, 6kpj:H, 6kpj:I, 6kpj:J, 6kpj:K, 6kpj:L, 6kq4:A, 6kq4:B, 6kq4:C, 6kq4:D, 6kq4:E, 6kq4:F, 6kq4:G, 6kq4:H, 6kq4:I, 6kq4:J, 6kq4:K, 6kq4:L, 6kqj:A, 6kqj:B, 6kqj:C, 6kqj:D, 6kqj:E, 6kqj:F, 6kqj:G, 6kqj:H, 6kqj:I, 6kqj:J, 6kqj:K, 6kqj:L, 6kqk:A, 6kqk:B, 6kqk:C, 6kqk:D, 6kqk:E, 6kqk:F, 6kqk:G, 6kqk:H, 6kqk:I, 6kqk:J, 6kqk:K, 6kqk:L, 6kqo:A, 6kqo:B, 6kqo:C, 6kqo:D, 6kqo:E, 6kqo:F, 6kqo:G, 6kqo:H, 6kqo:I, 6kqo:J, 6kqo:K, 6kqo:L
63 8qno:A 421 103 0.0822 0.0594 0.2427 0.43 8qno:B, 7r37:A, 7r37:B, 7r38:A, 7r38:B
64 7r39:A 412 115 0.1020 0.0752 0.2696 0.49 7r39:B, 7r39:C, 7r39:D, 7r39:E, 7r39:F, 7r39:G, 7r39:H
65 8hr6:A 359 43 0.0559 0.0474 0.3953 0.58 8hr6:B
66 4jn9:A 299 55 0.0592 0.0602 0.3273 0.66 4jn9:B, 4jna:A, 4jna:B, 4nte:A, 4nte:B
67 4kqx:B 335 68 0.0625 0.0567 0.2794 0.88 4kqw:A, 4kqw:B, 4kqx:A
68 7zp9:B 133 43 0.0559 0.1278 0.3953 1.2 7zp9:H, 7zp9:D, 7zp9:E, 7zp9:F, 7zp9:A, 7zp9:J, 7zp9:L, 7zpo:H, 7zpo:D, 7zpo:E, 7zpo:F, 7zpo:A, 7zpo:B, 7zpo:J, 7zpo:L, 7zpr:H, 7zpr:D, 7zpr:E, 7zpr:F, 7zpr:A, 7zpr:B, 7zpr:J, 7zpr:L
69 1cer:O 331 26 0.0428 0.0393 0.5000 1.3 1cer:P, 1cer:Q, 1cer:R, 1cer:A, 1cer:B, 1cer:C, 1cer:D, 2g82:O, 2g82:P, 2g82:Q, 2g82:R, 2g82:A, 2g82:B, 2g82:C, 2g82:D, 1vc2:A
70 3uoz:A 540 40 0.0428 0.0241 0.3250 1.6 3uov:A, 3uov:B, 3uox:A, 3uox:B, 3uoy:A, 3uoy:B, 3uoz:B, 3up4:A, 3up4:B, 3up5:A, 3up5:B
71 4xdy:A 331 102 0.0921 0.0846 0.2745 1.8 4xdy:B
72 4pzd:A 283 30 0.0329 0.0353 0.3333 2.4 4pzd:B, 4pzd:C, 4pzd:D, 4pzd:E, 4pzd:F, 4pzd:G, 4pzd:H, 4pzd:I, 4pze:A, 4pze:B, 4pze:C, 4pze:D, 4pze:G, 4pze:E, 4pze:F, 4pze:H, 4pze:I
73 2is4:B 632 31 0.0395 0.0190 0.3871 4.3
74 1v9l:A 418 81 0.0691 0.0502 0.2593 4.7 1v9l:B, 1v9l:C, 1v9l:D, 1v9l:E, 1v9l:F
75 5jfm:B 452 108 0.0921 0.0619 0.2593 5.3 6gvs:A, 6gvs:B, 6gvs:C, 6gvs:D, 6gvs:E, 6gvs:F, 6gvs:G, 6gvs:H, 6gvs:I, 6gvs:J, 5jfl:A, 5jfl:B, 5jfl:C, 5jfl:D, 5jfl:E, 5jfl:F, 5jfl:G, 5jfl:H, 5jfm:A, 5jfm:C, 5jfm:D, 5jfm:E, 5jfm:F, 5jfm:G, 5jfm:H, 5jfn:A, 5jfn:B, 5jfn:C, 5jfn:D
76 2rir:E 298 29 0.0329 0.0336 0.3448 5.4 2rir:A, 2rir:B, 2rir:C, 2rir:D, 2rir:F, 2rir:G, 2rir:H
77 3h9u:C 435 117 0.0987 0.0690 0.2564 7.2 3h9u:A, 3h9u:B, 3h9u:D
78 5c5j:F 342 47 0.0559 0.0497 0.3617 7.7 5c5j:A, 6ig1:F, 6ig1:A, 4ir1:F, 4ir1:A, 4ir9:F, 4ir9:A, 4irc:F, 4irc:A, 4ird:F, 4ird:A, 4irk:B, 4irk:A, 6jup:F, 6jup:A, 6juq:F, 6juq:A, 4q43:A, 4q43:F, 4q44:A, 4q44:F, 4q45:F, 4q45:A, 4r8u:A, 4r8u:B, 5yur:F, 5yur:A, 5yus:F, 5yus:A, 5yut:F, 5yut:A, 5yuu:F, 5yuu:A, 5yuv:F, 5yuv:A, 5yuw:A, 5yuw:F, 5yux:F, 5yux:A, 5yuy:F, 5yuy:A, 5yuz:F, 5yuz:A, 5yv0:F, 5yv0:A, 5yv1:F, 5yv1:A, 5yv2:F, 5yv2:A, 5yv3:F, 5yv3:A, 5yyd:F, 5yyd:A, 5yye:F, 5yye:A, 5zlv:F, 5zlv:A
79 3hja:A 334 33 0.0526 0.0479 0.4848 8.9 3hja:B, 3hja:C, 3hja:D
80 2is6:A 654 21 0.0329 0.0153 0.4762 9.3 2is1:A, 2is1:B, 2is2:A, 2is2:B, 2is4:A, 2is6:B
81 3aoe:B 424 39 0.0395 0.0283 0.3077 9.4 3aoe:A, 3aog:A, 3aog:E, 3aog:B, 3aog:D, 3aog:C, 3aog:F, 3aog:G, 3aog:I, 3aog:H, 3aog:J, 3aog:L, 3aog:K

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218