BioLiP

>protein
MKTVVFAYHDMGCLGIEALLAAGYEISAIFTHTDNPGEKAFYGSVARLAAERGIPVYAPDNVNHPLWVERIAQLSPDVIF
SFYYRHLIYDEILQLAPAGAFNLHGSLLPKYRGRAPLNWVLVNGETETGVTLHRMVKRADAGAIVAQLRIAIAPDDIAIT
LHHKLCHAARQLLEQTLPAIKHGNILEIAQRENEATCFGRRTPDDSFLEWHKPASVLHNMVRAVADPWPGAFSYVGNQKF
TVWSSRVHPKAQPGSVISVAPLLIACGDGALEIVTGQAGDGITMQGSQLAQTLGLVQGSRLN

The query sequence (length=302) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1z7e:D	644	305	0.9735	0.4565	0.9639	0.0	2bln:A, 2bln:B, 5j63:A, 5j63:B, 5j63:C, 5j63:D, 1z7e:A, 1z7e:B, 1z7e:C, 1z7e:E, 1z7e:F
2	8gjh:A	639	304	0.7252	0.3427	0.7204	1.10e-159	8gjh:B, 8gjh:C, 8gjh:D, 8gjh:E, 8gjh:F
3	3r8x:A	309	292	0.2947	0.2880	0.3048	6.36e-37
4	2fmt:A	314	309	0.3013	0.2898	0.2945	6.74e-37	2fmt:B
5	5vyt:C	256	236	0.2550	0.3008	0.3263	1.50e-26	5vyr:A, 5vyr:B, 5vys:A, 5vys:B, 5vyt:A, 5vyt:B, 5vyt:D, 5vyu:A, 5vyu:B
6	2cfi:A	310	298	0.2517	0.2452	0.2550	9.87e-21	1s3i:A
7	4qpd:A	308	314	0.2483	0.2435	0.2389	5.76e-17	4qpd:B, 4tt8:A, 4tts:A
8	5uin:A	399	178	0.1854	0.1404	0.3146	3.92e-16	5uij:A, 5uij:B, 5uik:A, 5uik:B, 5uil:A, 5uil:B, 5uim:A, 5uim:B, 5uin:B
9	4xcz:A	397	197	0.1623	0.1234	0.2487	1.90e-14	4xd0:A, 4xd1:A
10	4lxq:B	274	174	0.1424	0.1569	0.2471	2.10e-12	4lxq:A, 4lxt:A, 4lxt:B, 4lxu:A, 4lxu:B, 4lxx:A, 4lxx:B, 4lxy:A, 4lxy:B, 4ly0:A, 4ly0:B, 4ly3:A, 4ly3:B
11	7n7b:B	271	174	0.1391	0.1550	0.2414	2.61e-11	7n7b:A, 7n7c:A, 7n7c:B
12	6edk:A	193	114	0.1159	0.1813	0.3070	3.69e-11	6ci4:A, 6ci5:A
13	6mfz:A	1789	109	0.1291	0.0218	0.3578	1.29e-10	5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
14	6mg0:B	1687	109	0.1291	0.0231	0.3578	1.46e-10
15	4ew2:A	205	147	0.1258	0.1854	0.2585	4.64e-08	4ew3:A, 8fdx:A, 8fdy:A, 8fdz:A, 8fe0:A, 8fjv:A, 8fjw:A, 8fjx:A, 8fjy:A, 5j9f:A, 7jg0:A, 7jg3:A, 7jg4:A, 1men:A, 1men:B, 1men:C, 1njs:A, 1njs:B, 1rbm:A, 1rbm:B, 1rbq:A, 1rbq:B, 1rbq:C, 1rbq:D, 1rby:A, 1rby:B, 1rby:C, 1rby:D, 1rbz:A, 1rbz:B, 1rc0:A, 1rc0:B, 1rc1:A, 1rc1:B, 1zly:A, 4zyt:A, 4zyu:A, 4zyv:A, 4zyw:A, 4zyx:A, 4zyy:A, 4zyz:A, 4zz0:A, 4zz1:A, 4zz2:A, 4zz3:A
16	3da8:A	213	133	0.1225	0.1737	0.2782	6.32e-06	3da8:B, 3dcj:A, 3dcj:B
17	6nbp:A	246	126	0.1159	0.1423	0.2778	1.56e-05
18	5vyq:A	235	124	0.1126	0.1447	0.2742	1.91e-05	4q12:A, 4q12:B, 5vyq:B
19	2ywr:A	216	100	0.0861	0.1204	0.2600	3.29e-05
20	1c2t:A	209	94	0.0828	0.1196	0.2660	5.09e-05	1c2t:B, 1c3e:A, 1c3e:B, 1cde:A, 1cde:B, 1cde:C, 1cde:D, 1gar:A, 1gar:B, 1jkx:A, 1jkx:B, 1jkx:C, 1jkx:D
21	4yfy:A	241	81	0.0728	0.0913	0.2716	3.71e-04	4yfy:B
22	6v2t:B	251	85	0.0762	0.0916	0.2706	0.009	6v2t:A
23	6j0p:A	564	236	0.1689	0.0904	0.2161	0.039	6j0p:B, 6j1e:A, 6j1f:A, 6j1f:B, 6j1g:A, 6j1i:A, 6j1j:A
24	5l8e:A	517	78	0.0728	0.0426	0.2821	1.8
25	3a6o:A	585	53	0.0596	0.0308	0.3396	2.5	3a6o:B, 2d2o:A, 2d2o:B, 1g1y:A, 1g1y:B, 1jf5:A, 1jf5:B, 1jf6:A, 1jf6:B, 1ji2:A, 1ji2:B, 1jib:A, 1jib:B, 1jl8:A, 1jl8:B, 1vb9:A, 1vb9:B, 1vfm:A, 1vfm:B, 1vfo:A, 1vfo:B, 1vfu:A, 1vfu:B, 1wzk:A, 1wzk:B, 1wzl:A, 1wzl:B, 1wzm:A, 1wzm:B
26	2j1p:A	276	45	0.0464	0.0507	0.3111	3.2
27	3l12:A	297	46	0.0563	0.0572	0.3696	4.1	3l12:B
28	8ro1:T	389	55	0.0596	0.0463	0.3273	5.3	8ro0:T
29	5u2o:A	543	57	0.0497	0.0276	0.2632	5.8
30	1pyt:C	248	86	0.0828	0.1008	0.2907	6.9
31	7wnu:B	554	114	0.0993	0.0542	0.2632	7.6	7wnt:A, 7wnu:A
32	5ipf:A	201	57	0.0596	0.0896	0.3158	9.5	5ipf:B, 5ipf:C, 5ipf:D

[Back]