BioLiP

>protein
MKIGVFDSGVGGFSVLKSLLKARLFDEIIYYGDSARVPYGTKDPTTIKQFGLEALDFFKPHEIELLIVACNTASALALEE
MQKYSKIPIVGVIEPSILAIKRQVEDKNAPILVLGTKATIQSNAYDNALKQQGYLNISHLATSLFVPLIEESILEGELLE
TCMHYYFTPLEILPEVIILGCTHFPLIAQKIEGYFMGHFALPTPPLLIHSGDAIVEYLQQKYALKNNACTFPKVEFHASG
DVIWLERQAKEWLKL

The query sequence (length=255) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7uj5:A	256	254	0.9294	0.9258	0.9331	2.28e-179	4b1f:A, 4b1f:B, 8eb3:A, 8eb3:B, 2jfx:A, 2jfx:B, 2jfy:A, 2jfy:B, 2jfz:A, 2jfz:B, 8tba:A, 8tba:B, 7uj5:B, 7uj5:C, 7uj5:D, 5w1q:A, 5w1q:B, 2w4i:A, 2w4i:B, 2w4i:E, 2w4i:F
2	3uhf:A	255	257	0.5412	0.5412	0.5370	1.12e-89	3uhf:B, 3uho:A, 3uho:B
3	1b74:A	252	196	0.3255	0.3294	0.4235	2.05e-49
4	2vvt:A	269	255	0.3569	0.3383	0.3569	7.35e-41	2jfo:A, 2jfo:B, 2jfp:A, 2jfp:B, 2vvt:B
5	1zuw:C	262	259	0.3294	0.3206	0.3243	7.92e-40	1zuw:A, 1zuw:B
6	2jfq:A	265	264	0.3569	0.3434	0.3447	1.79e-39	2jfq:B
7	2gzm:A	266	213	0.3255	0.3120	0.3897	1.05e-36	2gzm:B, 2gzm:C, 2gzm:D
8	3hfr:A	266	258	0.3333	0.3195	0.3295	1.30e-36	3hfr:B
9	6dli:A	256	198	0.2824	0.2812	0.3636	6.42e-36	6dli:B, 6dli:C, 6dli:D, 5w16:A, 5w16:B, 5w16:C, 5w16:D
10	3out:B	264	192	0.2784	0.2689	0.3698	6.80e-35	3out:A, 3out:C
11	5ijw:B	276	196	0.2667	0.2464	0.3469	1.13e-31	5ijw:A
12	5hj7:B	260	195	0.2627	0.2577	0.3436	1.60e-31	5hj7:A
13	2dwu:B	266	257	0.3294	0.3158	0.3268	1.94e-29	2dwu:A, 2dwu:C
14	2ohv:A	258	193	0.2392	0.2364	0.3161	4.31e-27
15	2jfn:A	266	186	0.2078	0.1992	0.2849	8.33e-13
16	3ojc:A	230	152	0.1412	0.1565	0.2368	0.13	3ojc:B
17	3hee:A	148	124	0.1294	0.2230	0.2661	1.6	3hee:B, 3ph3:A, 3ph3:B, 3ph4:A, 3ph4:B
18	8c8b:A	341	64	0.0824	0.0616	0.3281	2.5	5ahr:A, 4b87:A, 8c8d:A, 8c8s:A, 8cew:A, 8cf0:A, 8cg9:A, 5nzw:A, 5nzx:A, 5nzy:A, 5q1j:A, 5q1k:A, 5q1l:A, 5q1m:A, 5q1n:A, 5q1o:A, 5q1p:A, 5q1q:A, 5q1r:A, 5q1s:A, 5q1t:A, 5q1u:A, 5q1v:A, 5q1w:A, 5q1x:A, 5q1y:A, 5q1z:A, 5q20:A, 5q22:A, 5q23:A, 5q24:A, 5q25:A, 5q26:A, 5q27:A, 5q28:A, 5q29:A
19	3lfr:B	128	51	0.0627	0.1250	0.3137	2.5	3lfr:A
20	8qj4:A	402	46	0.0627	0.0398	0.3478	2.7	8qj4:B
21	2cjk:A	167	99	0.1020	0.1557	0.2626	2.7	2km8:C
22	7k5j:I	979	61	0.0863	0.0225	0.3607	5.6	7k5j:D, 7k5j:A, 7k5j:C, 7k5j:G, 7k5j:K, 7k5j:S, 5tr4:A, 5tr4:C
23	5l6i:A	1007	61	0.0863	0.0218	0.3607	6.1	3cmm:A, 3cmm:C, 5l6h:A, 5l6h:C, 5l6i:C, 5l6j:A, 5l6j:C, 4nnj:A, 4nnj:C, 6nya:A, 6nya:D, 6zhu:A, 6zhu:E, 6zhu:C, 6zhu:G, 7zh9:A
24	3nv8:B	464	39	0.0588	0.0323	0.3846	6.2	2b7o:A, 2b7o:B, 5ckv:A, 5ckv:B, 5ckx:A, 5ckx:B, 5e2l:A, 5e2l:B, 5e40:A, 5e40:B, 5e4n:A, 5e4n:B, 5e5g:A, 5e5g:B, 5e7z:A, 5e7z:B, 5ex4:A, 5ex4:B, 3kgf:A, 3kgf:B, 3nud:A, 3nud:B, 3nue:A, 3nue:B, 3nv8:A, 6pbj:A, 6pbj:B, 3pfp:A, 3pfp:B, 3rzi:A, 3rzi:B, 2w1a:A, 2w1a:B, 2ypo:A, 2ypo:B, 2ypp:A, 2ypp:B, 2ypq:A, 2ypq:B
25	3e70:C	307	57	0.0667	0.0554	0.2982	8.0
26	8any:g	134	52	0.0549	0.1045	0.2692	9.2	7a5f:g3, 7a5g:g3, 7a5h:g, 7a5i:g3, 7a5j:g, 7a5k:g3, 5aj4:Bl, 4ce4:l, 6gaw:Bl, 6gb2:Bl, 6i9r:g, 3j7y:g, 3j9m:g, 8k2a:Lw, 8k2b:Lw, 7l08:g, 7l20:g, 7nqh:Bl, 7nql:Bl, 7nsh:Bl, 7nsi:Bl, 7nsj:Bl, 6nu2:g, 6nu3:g, 7o9k:g, 7o9m:g, 7odr:g, 7ods:g, 7odt:g, 7of0:g, 7of2:g, 7of3:g, 7of4:g, 7of5:g, 7of6:g, 7of7:g, 7og4:g, 7oi6:g, 7oi7:g, 7oi8:g, 7oi9:g, 7oia:g, 7oib:g, 7oic:g, 7oid:g, 7oie:g, 8oin:Bx, 8oiq:Bx, 8oir:Bx, 8oit:Bx, 5ool:g, 5oom:g, 7pd3:g, 8pk0:g, 7po4:g, 7qh6:g, 7qh7:g, 7qi4:g, 7qi5:g, 7qi6:g, 8qsj:g, 8qu5:g, 6vlz:g, 6vmi:g, 8xt0:Lw, 8xt1:Lw, 8xt2:Lw, 8xt3:Lw, 6ydp:Bl, 6ydw:Bl, 6zm5:g, 6zm6:g, 6zs9:g, 6zsa:g, 6zsb:g, 6zsc:g, 6zsd:g, 6zse:g, 6zsg:g
27	8uu6:b	224	38	0.0510	0.0580	0.3421	9.9	7nhn:c, 8uu4:b, 8uu5:b, 8uu7:b, 8uu8:b, 8uu9:b

[Back]