BioLiP

>protein
MKIGIVTGIPGVGKSTVLAKVKEILDNQGINNKIINYGDFMLATALKLGYAKDRDEMRKLSVEKQKKLQIDAAKGIAEEA
RAGGEGYLFIDTHAVIRTPSGYLPGLPSYVITEINPSVIFLLEADPKIILSRQKRDTTRNRNDYSDESVILETINFARYA
ATASAVLAGSTVKVIVNVEGDPSIAANEIIRSMK

The query sequence (length=194) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1nks:C	194	194	1.0000	1.0000	1.0000	1.41e-140	1nks:D, 1nks:F
2	6ln3:A	202	132	0.3144	0.3020	0.4621	2.32e-37
3	3h86:B	191	183	0.3814	0.3874	0.4044	1.24e-36	3h86:A, 3h86:C, 3h86:G
4	6pjw:A	191	183	0.3918	0.3979	0.4153	1.20e-34	6pjw:B, 6pjw:C, 6pjw:D, 6pjw:E, 6pjw:F, 6pjw:G, 6pjw:H, 6pjw:I, 6pjw:J, 6pjw:K, 6pjw:L, 6psp:A, 6psp:B, 6psp:C, 6psp:D, 6psp:E, 6psp:F
5	6hf7:A	191	183	0.3763	0.3822	0.3989	1.02e-33	6hf7:B
6	1kht:B	191	169	0.3402	0.3455	0.3905	1.55e-31	1kht:C
7	7owj:F	197	176	0.3041	0.2995	0.3352	6.97e-21	7owe:E, 7owe:F, 7owe:D, 7owe:A, 7owe:B, 7owe:C, 7owj:A, 7owj:B, 7owj:C, 7owj:D, 7owj:E, 7owk:B, 7owk:A, 7owk:C, 7owk:D, 7owk:E, 7owk:F, 7owl:A, 7owl:B, 7owl:C, 7owl:D, 7owl:E, 7owl:F
8	3iij:A	175	128	0.1649	0.1829	0.2500	0.033	3iik:A, 3iil:A, 3iim:A, 5jzv:A
9	3add:A	251	27	0.0670	0.0518	0.4815	1.2	3a4l:A, 3a4l:B, 3a4m:A, 3a4m:B, 3adb:A, 3adb:B, 3adc:A, 3adc:B, 3add:B, 3am1:A
10	3eh2:A	758	110	0.1443	0.0369	0.2545	1.4	3eh2:B, 3eh2:C
11	3lv8:A	204	183	0.2320	0.2206	0.2459	2.0
12	3tk1:A	293	29	0.0773	0.0512	0.5172	2.4
13	3tk1:B	319	29	0.0773	0.0470	0.5172	2.4
14	5l3w:A	297	54	0.0876	0.0572	0.3148	2.7	5l3s:B, 5l3s:D, 5l3s:F, 5l3s:H
15	4jyb:A	323	29	0.0670	0.0402	0.4483	3.4	8dpb:A, 8dpb:B, 4jyb:B, 4jyc:D, 4lc1:A, 4lc1:B, 2qm7:A, 2qm7:B
16	2axn:A	451	36	0.0515	0.0222	0.2778	3.4	5ajv:B, 5ajw:A, 5ajx:A, 5ajy:A, 5ajz:A, 5ak0:A, 4d4j:A, 4d4k:A, 4d4l:A, 4d4m:A, 2dwo:A, 2dwp:A, 6etj:A, 6hvh:A, 6hvi:A, 6hvj:A, 2i1v:B, 6ibx:A, 6iby:A, 6ibz:A, 6ic0:A, 4ma4:A, 3qpu:A, 3qpv:A, 3qpw:A
17	3nxs:A	306	18	0.0619	0.0392	0.6667	4.3
18	6ecf:D	265	35	0.0670	0.0491	0.3714	5.9	6ece:A, 6ecf:A, 6ecf:B, 6ecf:C, 6ecf:E, 6ecf:F
19	4bzp:A	173	57	0.0979	0.1098	0.3333	7.2	4bzp:B, 4bzq:A, 4bzq:B, 4bzx:A, 4bzx:B
20	3h8f:A	497	81	0.1443	0.0563	0.3457	7.2	3h8f:B, 3h8f:C, 3h8f:D, 3h8f:E, 3h8f:F, 3h8g:F, 3h8g:A, 3h8g:B, 3h8g:C, 3h8g:D, 3h8g:E
21	1k6m:A	432	65	0.0979	0.0440	0.2923	8.3	1c7z:A, 1c7z:B, 1c80:A, 1c80:B, 1c81:A, 1fbt:A, 1fbt:B, 1k6m:B, 1tip:A, 1tip:B
22	3kfl:A	530	28	0.0722	0.0264	0.5000	9.8	6swx:A

[Back]