Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MKEVNVRESSQEREQRIQQQWQKGNVFQQSVQNREGYPSFVFYEGPPTANGLPHVGHALGRTIKDVVARYKTMTGHQVIR
KAGWDTHGLPVELGVEKQLGISGKHDIEKYGVEAFINKCKESVFVYEKQQRTFTEQLGYWVDMEDPYITLENSYIESVWN
VLGTIHDKGLLYKGHRVSPYCPSCQTSLSSHEVAQGYKDVKDLTVTVKFKVKNRDNEYFLGWTTTPWTLPSNVALAVHEE
MSYVRAEQGDSVYIVAEALADKVLKGEYSVLSHHKGNELKGMSYEPPFNFVKVEKGHEVVTADYVTDQSGTGVVHLAPAY
GEDDYRVVKENGFSFVNVVDEKGQYTSEVPPFQGRFVKDCDVDIVRYLANQDVLYHKEKHEHSYPFCWRCDSPLLYYANE
SWFIQTTALKEQFLKNNESVKWYPDHIKHGRFGKFLENMVDWNISRKRYWGTPLNVWECEGCQHQVAPKSIKELQKHASH
YVDDSIELHKPYVDDVQLTCPVCSGEMKRTPEVIDVWFDSGSMPFAQYHYPFENSELFQKQFPADVIAEGIDQTRGWFYS
LMAVSTLFTGKAPYKRVLSLGHVLDENGQKMSKSKGNALDPVDLIHTFGADALRWALLADSAPWNPKKFSERVVQEAKSK
VIDTLVNVYGFYVLYAKLDGYDPEQTYELKKTKLDEWILSRLHSTVKRATVHLEDYGFTSAAREIAVFIEELSNWYVRRS
RDRFWSEGMDGEKAAAYDTLHEVLVTLSQLLAPFTPFVADDVHENLTGKSVHLADYPACDQTKVNEKLEKEMAAVLQVVE
LGRSIRNTHSLKVKQPLQSLSLVVTEEDVEWKAYRDVIKDELNVKNFNVEQDDDKLVSYVLKLDFKQAGPKFGKQVNEVN
QALKNLSEEKGKEFVEQGKLSVTLASGENLTLETEDVLVEKVPKEGFAVASNGMYTAVLDTALTEELVQEGVAREVIRAV
QDYRKKLDLPVNSRINLELSGDEEVQKAVAKFETLLQENLLLHSLSVKETIKNGETVKVGTKQVVLRVLNQS

The query sequence (length=1032) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8c8v:A 1032 1032 0.9990 0.9990 0.9990 0.0 8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
2 1ile:A 821 812 0.3808 0.4787 0.4840 0.0 1jzq:A, 1jzs:A, 1ue0:A, 1wk8:B, 1wnz:A
3 7d5c:A 919 886 0.3266 0.3667 0.3804 0.0
4 6ldk:A 813 816 0.2946 0.3739 0.3725 0.0
5 8c9e:A 921 821 0.2500 0.2801 0.3143 6.29e-119 8c9f:A, 8c9g:A, 8c9g:B
6 1ffy:A 917 800 0.2442 0.2748 0.3150 6.74e-115 1qu2:A, 1qu3:A
7 8wnf:A 918 812 0.2190 0.2462 0.2783 9.88e-89 8wng:A, 8wni:A, 8wnj:A, 8wo2:A, 8wo3:A
8 1gax:A 862 816 0.2171 0.2599 0.2745 1.77e-74 1gax:B, 1ivs:A, 1ivs:B, 1wk9:A
9 1wz2:A 948 987 0.2345 0.2553 0.2452 7.83e-37 1wz2:B
10 5ah5:A 789 388 0.1037 0.1356 0.2758 1.51e-19 5ah5:B
11 5ah5:A 789 188 0.0475 0.0621 0.2606 1.70e-08 5ah5:B
12 6q89:A 852 393 0.0921 0.1115 0.2417 2.24e-18 7ntz:A, 7nu3:A, 7nu6:A, 7nu7:A, 7nub:A, 6q8b:A, 6q8c:A
13 6q89:A 852 372 0.0795 0.0962 0.2204 1.23e-09 7ntz:A, 7nu3:A, 7nu6:A, 7nu7:A, 7nub:A, 6q8b:A, 6q8c:A
14 7nu2:A 875 416 0.0930 0.1097 0.2308 7.31e-16 7a0p:A, 7ap2:A, 7nty:A, 7nu0:A, 7nu1:A, 7nu4:A, 7nu5:A, 7nu8:A, 7nu9:A, 7nua:A, 7nuc:A, 6q8a:A, 6ykk:A, 6ykl:A, 6ykn:A, 6yko:A, 6ykq:A, 6yks:A, 6ykt:A, 6yku:A, 6ykv:A, 6ykw:A, 6ykx:A, 7yp8:A
15 7nu2:A 875 372 0.0795 0.0937 0.2204 2.05e-09 7a0p:A, 7ap2:A, 7nty:A, 7nu0:A, 7nu1:A, 7nu4:A, 7nu5:A, 7nu8:A, 7nu9:A, 7nua:A, 7nuc:A, 6q8a:A, 6ykk:A, 6ykl:A, 6ykn:A, 6yko:A, 6ykq:A, 6yks:A, 6ykt:A, 6yku:A, 6ykv:A, 6ykw:A, 6ykx:A, 7yp8:A
16 3ziu:A 621 454 0.0950 0.1578 0.2159 9.46e-16 3ziu:B
17 3ziu:A 621 188 0.0523 0.0870 0.2872 2.11e-12 3ziu:B
18 2bte:A 876 469 0.1056 0.1244 0.2324 1.29e-12 2bte:D, 2byt:A, 2byt:D, 1h3n:A, 1obc:A, 2v0c:A, 2v0g:A, 2v0g:D
19 2bte:A 876 152 0.0426 0.0502 0.2895 5.12e-12 2bte:D, 2byt:A, 2byt:D, 1h3n:A, 1obc:A, 2v0c:A, 2v0g:A, 2v0g:D
20 2bte:A 876 43 0.0155 0.0183 0.3721 0.67 2bte:D, 2byt:A, 2byt:D, 1h3n:A, 1obc:A, 2v0c:A, 2v0g:A, 2v0g:D
21 3zgz:D 867 383 0.0862 0.1027 0.2324 5.27e-12 2ajh:A, 2ajh:B, 2aji:A, 2aji:B, 4aq7:A, 4aq7:D, 4cqn:A, 4cqn:D, 5omw:A, 5omw:D, 5on2:A, 5on2:D, 5on3:A, 5on3:D, 5onh:A, 5onh:D, 3zgz:A
22 3zgz:D 867 450 0.0969 0.1153 0.2222 1.08e-07 2ajh:A, 2ajh:B, 2aji:A, 2aji:B, 4aq7:A, 4aq7:D, 4cqn:A, 4cqn:D, 5omw:A, 5omw:D, 5on2:A, 5on2:D, 5on3:A, 5on3:D, 5onh:A, 5onh:D, 3zgz:A
23 3zgz:D 867 42 0.0136 0.0161 0.3333 0.051 2ajh:A, 2ajh:B, 2aji:A, 2aji:B, 4aq7:A, 4aq7:D, 4cqn:A, 4cqn:D, 5omw:A, 5omw:D, 5on2:A, 5on2:D, 5on3:A, 5on3:D, 5onh:A, 5onh:D, 3zgz:A
24 7wpi:A 520 290 0.0766 0.1519 0.2724 5.73e-11 4qrd:A, 4qre:A, 7wpk:A, 7wpl:A, 7wpm:A, 7wpx:A, 7wq0:A
25 7wpi:A 520 69 0.0252 0.0500 0.3768 0.002 4qrd:A, 4qre:A, 7wpk:A, 7wpl:A, 7wpm:A, 7wpx:A, 7wq0:A
26 7wpt:A 483 290 0.0766 0.1636 0.2724 5.79e-11 7wpn:A
27 7wpt:A 483 69 0.0252 0.0538 0.3768 0.002 7wpn:A
28 6lpf:B 1006 727 0.1628 0.1670 0.2311 1.02e-10 6kid:A, 6kie:A, 6kqy:A, 6kr7:A, 6lpf:A, 6lr6:A, 6lr6:B
29 2x1l:A 511 107 0.0388 0.0783 0.3738 2.94e-10 2x1m:A
30 2x1l:A 511 39 0.0165 0.0333 0.4359 0.002 2x1m:A
31 2x1l:C 476 107 0.0388 0.0840 0.3738 3.09e-10 2x1l:B
32 2x1l:C 476 39 0.0165 0.0357 0.4359 0.002 2x1l:B
33 1obh:A 762 319 0.0746 0.1010 0.2414 3.12e-10
34 1obh:A 762 201 0.0514 0.0696 0.2637 0.002
35 1obh:A 762 89 0.0271 0.0367 0.3146 0.006
36 1obh:A 762 35 0.0136 0.0184 0.4000 2.2
37 4ari:A 821 353 0.0766 0.0962 0.2238 2.19e-08 4arc:A, 4as1:A, 8pot:A, 3zjt:A, 3zju:A, 3zjv:A
38 4ari:A 821 450 0.0969 0.1218 0.2222 9.98e-08 4arc:A, 4as1:A, 8pot:A, 3zjt:A, 3zju:A, 3zjv:A
39 6ax8:A 509 106 0.0349 0.0707 0.3396 3.40e-08 5xet:C
40 6ax8:A 509 42 0.0174 0.0354 0.4286 0.069 5xet:C
41 1pfu:A 547 146 0.0426 0.0804 0.3014 4.97e-06 8bru:A, 8brv:A, 8brw:A, 8brx:A, 1f4l:A, 3h97:A, 3h99:A, 3h9b:A, 3h9c:A, 1p7p:A, 1pfv:A, 1pfw:A, 1pfy:A, 1qqt:A, 6spn:A, 6spo:A, 6spp:A, 6spq:A, 6spr:A
42 1pfu:A 547 183 0.0426 0.0804 0.2404 0.10 8bru:A, 8brv:A, 8brw:A, 8brx:A, 1f4l:A, 3h97:A, 3h99:A, 3h9b:A, 3h9c:A, 1p7p:A, 1pfv:A, 1pfw:A, 1pfy:A, 1qqt:A, 6spn:A, 6spo:A, 6spp:A, 6spq:A, 6spr:A
43 2ct8:A 465 254 0.0659 0.1462 0.2677 2.06e-05 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
44 2ct8:A 465 70 0.0242 0.0538 0.3571 1.79e-04 2csx:A, 2csx:B, 2ct8:B
45 1a8h:A 500 110 0.0329 0.0680 0.3091 2.09e-05 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
46 1a8h:A 500 225 0.0504 0.1040 0.2311 2.41e-04 2d54:A, 2d5b:A, 3vu8:A, 1woy:A
47 1pg0:A 492 56 0.0242 0.0508 0.4464 2.77e-05 1pg2:A
48 1pg0:A 492 183 0.0426 0.0894 0.2404 0.14 1pg2:A
49 4eg6:B 515 110 0.0310 0.0621 0.2909 3.15e-05 4eg4:B, 4eg5:B, 5tqu:B
50 4eg6:B 515 62 0.0223 0.0447 0.3710 0.006 4eg4:B, 4eg5:B, 5tqu:B
51 4eg7:B 536 110 0.0310 0.0597 0.2909 3.24e-05 6cml:A, 6cml:B, 4eg1:A, 4eg1:B, 4eg3:A, 4eg3:B, 4eg4:A, 4eg5:A, 4eg6:A, 4eg7:A, 4eg8:A, 4eg8:B, 4ega:A, 4ega:B, 5j58:A, 5j58:B, 5j59:A, 5j59:B, 5j5a:A, 5j5a:B, 6mes:A, 6mes:B, 4mvw:A, 4mvw:B, 4mvx:A, 4mvx:B, 4mvy:A, 4mvy:B, 4mw0:A, 4mw0:B, 4mw1:A, 4mw1:B, 4mw2:A, 4mw2:B, 4mw4:A, 4mw4:B, 4mw5:A, 4mw5:B, 4mw6:A, 4mw6:B, 4mw7:A, 4mw7:B, 4mw9:A, 4mw9:B, 4mwb:A, 4mwb:B, 4mwc:A, 4mwc:B, 4mwd:A, 4mwd:B, 4mwe:A, 4mwe:B, 5nfh:A, 5nfh:B, 5tqu:A, 5v49:A, 5v49:B, 4zt2:A, 4zt2:B, 4zt3:A, 4zt3:B, 4zt4:A, 4zt4:B, 4zt5:A, 4zt5:B, 4zt6:A, 4zt6:B, 4zt7:A, 4zt7:B
52 4eg7:B 536 160 0.0426 0.0821 0.2750 0.003 6cml:A, 6cml:B, 4eg1:A, 4eg1:B, 4eg3:A, 4eg3:B, 4eg4:A, 4eg5:A, 4eg6:A, 4eg7:A, 4eg8:A, 4eg8:B, 4ega:A, 4ega:B, 5j58:A, 5j58:B, 5j59:A, 5j59:B, 5j5a:A, 5j5a:B, 6mes:A, 6mes:B, 4mvw:A, 4mvw:B, 4mvx:A, 4mvx:B, 4mvy:A, 4mvy:B, 4mw0:A, 4mw0:B, 4mw1:A, 4mw1:B, 4mw2:A, 4mw2:B, 4mw4:A, 4mw4:B, 4mw5:A, 4mw5:B, 4mw6:A, 4mw6:B, 4mw7:A, 4mw7:B, 4mw9:A, 4mw9:B, 4mwb:A, 4mwb:B, 4mwc:A, 4mwc:B, 4mwd:A, 4mwd:B, 4mwe:A, 4mwe:B, 5nfh:A, 5nfh:B, 5tqu:A, 5v49:A, 5v49:B, 4zt2:A, 4zt2:B, 4zt3:A, 4zt3:B, 4zt4:A, 4zt4:B, 4zt5:A, 4zt5:B, 4zt6:A, 4zt6:B, 4zt7:A, 4zt7:B
53 3kfl:A 530 110 0.0339 0.0660 0.3182 6.74e-05 6swx:A
54 3kfl:A 530 158 0.0397 0.0774 0.2595 4.64e-04 6swx:A
55 6wq6:A 547 151 0.0378 0.0713 0.2583 0.007 6wqi:A, 6wqi:B, 6wqs:A, 6wqt:A
56 7ulz:A 521 67 0.0213 0.0422 0.3284 0.009
57 5urb:A 546 61 0.0223 0.0421 0.3770 0.010 5urb:B
58 5k0t:B 468 66 0.0213 0.0470 0.3333 0.012
59 5k0s:C 497 66 0.0213 0.0443 0.3333 0.014 5k0s:A, 5k0s:B, 5k0t:A, 5k0t:C, 4py2:A, 4py2:B, 4py2:C
60 5k0s:C 497 209 0.0417 0.0865 0.2057 2.3 5k0s:A, 5k0s:B, 5k0t:A, 5k0t:C, 4py2:A, 4py2:B, 4py2:C
61 1rqg:A 606 53 0.0184 0.0314 0.3585 0.018
62 5agi:A 252 121 0.0281 0.1151 0.2397 0.23 5agj:A, 2wfg:A
63 7bzj:A 183 152 0.0417 0.2350 0.2829 0.27 4k47:A
64 2ftw:A 484 73 0.0213 0.0455 0.3014 0.82
65 4yws:B 393 46 0.0136 0.0356 0.3043 1.8
66 6ujd:A 406 46 0.0165 0.0419 0.3696 3.2
67 3lcz:A 53 19 0.0087 0.1698 0.4737 3.6 3lcz:B, 3lcz:C, 3lcz:D, 3ld0:A, 3ld0:B, 3ld0:C, 3ld0:D, 3ld0:E, 3ld0:F, 3ld0:G, 3ld0:H, 3ld0:I, 3ld0:J, 3ld0:K, 3ld0:L, 3ld0:M, 3ld0:N, 3ld0:O, 3ld0:P, 3ld0:Q, 3ld0:R, 3ld0:S, 3ld0:T, 3ld0:U, 3ld0:V, 3ld0:W, 3ld0:X, 3ld0:Y, 3ld0:Z, 3ld0:1, 3ld0:2, 3ld0:3, 3ld0:4, 3ld0:5, 3ld0:6, 3ld0:7, 3ld0:8, 3ld0:9, 3ld0:a, 3ld0:b, 3ld0:c, 3ld0:d, 3ld0:e, 3ld0:f, 3ld0:g, 3ld0:h, 3ld0:i, 3ld0:j, 3ld0:k, 3ld0:l, 3ld0:m
68 8fx3:B 223 107 0.0310 0.1435 0.2991 3.8 8fwy:A, 8fwy:B, 8fwz:A, 8fwz:B, 8fx0:A, 8fx0:B, 8fx1:A, 8fx1:B, 8fx2:A, 8fx2:B, 8fx3:A
69 1kc7:A 872 97 0.0242 0.0287 0.2577 4.4
70 6ao8:A 569 60 0.0213 0.0387 0.3667 4.6
71 3pz0:B 211 57 0.0155 0.0758 0.2807 4.9
72 3ch8:A 190 54 0.0174 0.0947 0.3333 5.0 2qbw:A
73 8qhp:A 410 64 0.0184 0.0463 0.2969 6.1 8qhp:B
74 6wya:A 756 95 0.0262 0.0357 0.2842 8.2 6wyb:A
75 8q9t:A 1075 73 0.0213 0.0205 0.3014 8.4
76 8qca:A 805 30 0.0116 0.0149 0.4000 8.4 8qcf:M
77 5mc6:h 1121 73 0.0213 0.0196 0.3014 8.6 4a4k:A, 4a4k:C, 4a4k:E, 4a4k:G, 4a4k:I
78 5exd:H 291 96 0.0271 0.0962 0.2917 8.8 5exd:B, 5exd:K, 5exe:E
79 4a4z:A 874 30 0.0116 0.0137 0.4000 8.9
80 3ju5:C 367 82 0.0213 0.0599 0.2683 9.0 3ju5:A, 3ju6:A
81 5c4i:E 312 96 0.0271 0.0897 0.2917 9.3 5c4i:B, 5exd:E, 5exe:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218