Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MKASRLYTLVLVLQPQRVLLGMKKRGFGAGRWNGFGGKVQEGETIEDGARRELQEESGLTVDALHKVGQIVFEFVGEPEL
MDVHVFCTDSIQGTPVESDEMRPCWFQLDQIPFKDMWPDDSYWFPLLLQKKKFHGYFKFQGQDTILDYTLREVDTV

The query sequence (length=156) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6aa3:A 162 154 0.9872 0.9506 1.0000 2.66e-113 8a07:A, 8a07:B, 8a0s:A, 8a0t:A, 8a0t:B, 8a34:A, 8a34:B, 8a3a:A, 6aa4:A, 6aa5:A, 5ans:A, 5ant:A, 5ant:B, 5ant:C, 5anu:A, 5anv:A, 5anw:A, 4c9w:A, 4c9x:A, 6eq2:A, 6eq3:A, 6eq4:A, 6eq5:A, 6eq6:A, 6eq7:A, 6f1x:A, 6f1x:B, 6f20:A, 6f20:B, 6f22:A, 6f22:B, 6f23:A, 6f23:B, 5fsi:A, 5fsk:A, 5fsl:A, 5fsm:A, 5fsn:A, 5fso:A, 5ghi:A, 5ghi:B, 5ghj:A, 5ghj:B, 5ghm:A, 5ghm:B, 5ghn:A, 5ghn:B, 5gho:B, 5ghq:A, 5ghq:B, 6gle:A, 6glg:A, 6glh:A, 6gli:A, 6glj:A, 6gll:A, 6gll:B, 6glm:A, 6gln:A, 6glp:A, 6glp:B, 6glq:A, 6glq:B, 6glr:A, 6glr:B, 6gls:A, 6gls:B, 6glu:A, 6glv:A, 8i18:A, 8i18:B, 8i19:A, 8i19:B, 8i1a:A, 8i1a:B, 8i1d:A, 8i1d:B, 8i1e:A, 8i1e:B, 8i1f:A, 8i1f:B, 8i1g:A, 8i1i:A, 8i1i:B, 8i1j:A, 8i1j:B, 8i8s:A, 8i8s:B, 8i8t:A, 8i8t:B, 6ijy:A, 6ijy:B, 6ili:A, 6ili:B, 6imz:A, 6jvg:A, 6jvg:B, 6jvh:A, 6jvh:B, 6jvi:A, 6jvi:B, 6jvj:A, 6jvj:B, 6jvk:A, 6jvl:A, 6jvm:A, 6jvn:A, 6jvn:B, 6jvo:A, 6jvo:B, 6jvp:A, 6jvp:B, 6jvq:A, 6jvq:B, 6jvr:A, 6jvs:A, 6jvt:A, 6jvt:B, 7n03:A, 4n1t:A, 4n1u:A, 4n1u:B, 7n13:A, 7n13:B, 5ngr:A, 5ngr:B, 5ngs:A, 5ngs:B, 5ngt:A, 5nhy:A, 5nhy:B, 5otm:A, 5otm:B, 6qvo:A, 6qvo:B, 6qvo:C, 6qvo:D, 6us2:A, 6us3:A, 6us4:A, 3whw:A, 3whw:B, 5ws7:A, 5ws7:B, 3zr0:A, 3zr0:B
2 5mzg:A 155 154 0.8269 0.8323 0.8377 3.98e-95 6ehh:A, 6ehh:B, 6ehh:C, 6ehh:D, 5mze:A, 5mze:B, 5mze:C, 5mze:D, 5mzg:B
3 5otn:A 156 154 0.6987 0.6987 0.7078 5.98e-79 5hzx:A, 5hzx:B
4 5gp0:I 139 125 0.2115 0.2374 0.2640 1.31e-06 6dbz:A, 6dbz:B, 6fl4:A, 6fl4:B, 5gp0:E, 5gp0:F, 5gp0:A, 5wwd:A, 5wwd:B
5 6scx:A 328 63 0.1603 0.0762 0.3968 3.55e-06 6o3p:A, 6scx:B, 6scx:C
6 5zrk:A 129 102 0.2051 0.2481 0.3137 4.43e-06 5zrg:A, 5zrh:A, 5zri:A, 5zrk:B, 5zrl:A, 5zrl:B, 5zro:A, 5zro:B
7 6o3p:B 320 63 0.1603 0.0781 0.3968 5.77e-06
8 7b66:A 161 131 0.2500 0.2422 0.2977 1.77e-05 7aom:A, 7aom:B, 7aop:A, 7b63:A, 7b63:B, 7b64:A, 7b65:A, 7b65:B, 7b66:B, 7b66:C, 7b66:D, 7b67:A, 7b67:B, 7b7v:A, 7b7v:B, 5bon:A, 5bon:B, 5bon:C, 5bon:D, 5bon:E, 5bon:F, 5bon:G, 5bon:H, 5lpg:A, 5lpg:B, 7nr6:A, 7nr6:B, 7r0d:AAA, 7r0d:BBB, 6t5j:A, 6t5j:B
9 3hhj:B 131 55 0.1667 0.1985 0.4727 4.08e-05 3hhj:A
10 6ypf:A 129 126 0.2115 0.2558 0.2619 5.69e-04
11 2b06:A 150 107 0.1987 0.2067 0.2897 0.001
12 3r03:A 131 60 0.1603 0.1908 0.4167 0.002
13 3ffu:A 133 111 0.1795 0.2105 0.2523 0.002 3ef5:A, 3ef5:B, 3ffu:B
14 1g9q:A 205 43 0.1218 0.0927 0.4419 0.005 1g9q:B, 1khz:B, 1khz:A
15 3i7v:A 134 122 0.1987 0.2313 0.2541 0.005 3i7v:B
16 5ddg:A 226 53 0.1282 0.0885 0.3774 0.005 5ddg:B, 5deq:A, 5deq:B
17 4nfw:F 153 58 0.1090 0.1111 0.2931 0.005 4nfw:A, 4nfw:B, 4nfw:C, 4nfw:D, 4nfw:E, 4nfw:G, 4nfw:H, 4nfw:J, 4nfw:K, 3shd:A, 3shd:B, 3shd:C, 3shd:D, 3shd:E, 3shd:F, 3shd:G, 3shd:H, 3shd:I, 3shd:J, 3shd:K, 3shd:L
18 2yvm:A 182 29 0.1090 0.0934 0.5862 0.006 2yvo:A, 2yvp:A
19 7syc:A 122 64 0.1474 0.1885 0.3594 0.008
20 1v8m:A 159 107 0.1795 0.1761 0.2617 0.016 1v8l:A, 1v8r:A, 1v8s:A, 1v8t:A, 1v8v:A, 1v8y:A, 3x0k:A, 3x0l:A, 3x0m:A, 3x0n:A, 3x0o:A, 3x0p:A, 3x0q:A, 3x0r:A
21 9b21:A 205 72 0.1474 0.1122 0.3194 0.020 9b20:A, 9b20:B, 9b21:B, 9b22:A, 9b22:B
22 1ppx:A 129 39 0.1090 0.1318 0.4359 0.022 3a6t:A, 3a6u:A, 3a6v:A, 3a6v:B, 1pun:A, 1puq:A, 1pus:A, 1tum:A, 7ww5:A, 7ww6:A, 7ww7:A, 7ww8:A, 7ww9:A, 7wwa:A, 7x9h:A, 7x9i:A, 7x9j:A, 7x9k:A, 7x9l:A, 7x9n:A, 7x9o:A
23 1su2:A 159 83 0.1731 0.1698 0.3253 0.025 1su2:B, 1sz3:A, 1sz3:B
24 4jzt:A 158 54 0.1090 0.1076 0.3148 0.025 4jzu:A, 4jzv:A, 4jzv:B
25 2gb5:A 265 105 0.1795 0.1057 0.2667 0.079 7e44:A, 7e44:B, 7e44:E, 7e44:F, 2gb5:B, 5isy:A, 5isy:C, 5iw4:A, 5iw4:B, 5iw5:B, 5iw5:A, 1vk6:A
26 7sez:A 210 48 0.0962 0.0714 0.3125 0.093 7sf0:A, 7t7h:A, 7t7h:B
27 2o1c:A 147 55 0.1154 0.1224 0.3273 0.10 2o1c:B, 2o1c:C, 2o5w:A, 2o5w:C, 5u7e:A, 5u7f:A, 5u7h:A
28 2qjo:B 336 79 0.1667 0.0774 0.3291 0.16 2qjo:A, 2qjo:C
29 5gg6:B 295 91 0.1603 0.0847 0.2747 0.21 5gg6:A, 5gg7:A, 5gg7:B, 5gg8:A, 5gg9:A, 5gga:A, 5ggb:A, 5ggc:A, 5ggc:B, 5ggd:A, 5ggd:B, 6m65:A, 6m69:A, 6m6y:A, 6m72:A, 5xd1:A, 5xd2:A, 5xd3:A, 5xd4:A, 5xd5:B, 5xd5:A
30 1jkn:A 165 48 0.1154 0.1091 0.3750 0.33
31 3cng:C 178 109 0.1859 0.1629 0.2661 0.40 3cng:A, 3cng:B, 3cng:D
32 4hvy:A 135 104 0.1731 0.2000 0.2596 0.54
33 1k26:A 150 54 0.1090 0.1133 0.3148 0.63
34 4s2v:A 139 39 0.1026 0.1151 0.4103 0.65
35 7zc0:AAA 710 29 0.0769 0.0169 0.4138 0.70
36 3efr:A 233 98 0.1474 0.0987 0.2347 0.77 3efr:B, 3efs:A, 3efs:B
37 2gt4:A 160 61 0.1218 0.1187 0.3115 0.82 2gt4:B, 2gt4:C, 2i8t:A, 2i8t:B, 2i8u:A, 2i8u:B, 1rya:A, 1rya:B
38 6vcr:A 161 39 0.1026 0.0994 0.4103 1.00 6d1v:B, 4s2x:A, 4s2y:A, 7sp3:A, 6vck:B, 6vcl:B, 6vcm:B, 6vcn:A, 6vco:A, 6vcp:A, 6vcq:A
39 4zbp:C 262 31 0.0833 0.0496 0.4194 1.1
40 2r5w:B 345 69 0.1282 0.0580 0.2899 1.1 2qjt:B, 2qjt:A, 2r5w:A
41 3bm4:A 197 69 0.1282 0.1015 0.2899 1.7 3ac9:A, 3ac9:B, 3aca:A, 3aca:B, 3bm4:B, 2dsc:A, 2dsc:B, 2dsd:A, 2dsd:B, 6gru:A, 6gru:B, 6gru:C, 6gru:D, 3l85:A, 3l85:B, 5nqr:A, 5nqr:B, 5nwh:A, 5nwh:B, 8ptt:A, 8ptt:B, 8ptt:C, 8ptt:D, 5qj4:A, 5qj4:B, 5qj4:C, 5qj4:D, 5qj5:A, 5qj5:B, 5qj5:C, 5qj5:D, 5qj6:A, 5qj6:B, 5qj6:C, 5qj6:D, 5qj7:A, 5qj7:B, 5qj7:C, 5qj7:D, 5qj8:A, 5qj8:B, 5qj8:C, 5qj9:A, 5qj9:B, 5qj9:C, 5qj9:D, 5qja:A, 5qja:B, 5qja:C, 5qja:D, 5qjb:A, 5qjb:B, 5qjb:C, 5qjb:D, 5qjc:A, 5qjc:B, 5qjc:C, 5qjc:D, 5qjd:A, 5qjd:B, 5qjd:C, 5qjd:D, 5qje:A, 5qje:B, 5qje:C, 5qje:D, 5qjf:A, 5qjf:B, 5qjf:C, 5qjf:D, 5qjg:A, 5qjg:B, 5qjg:C, 5qjg:D, 5qjh:A, 5qjh:B, 5qjh:C, 5qji:A, 5qji:B, 5qji:C, 5qji:D, 5qjj:A, 5qjj:B, 5qjj:C, 5qjj:D, 5qjk:A, 5qjk:B, 5qjk:C, 5qjk:D, 5qjl:A, 5qjl:B, 5qjl:C, 5qjl:D, 5qjm:A, 5qjm:B, 5qjm:C, 5qjm:D, 5qjn:A, 5qjn:B, 5qjn:C, 5qjo:A, 5qjo:B, 5qjo:C, 5qjo:D, 5qjp:A, 5qjp:B, 5qjp:C, 5qjp:D, 5qjq:A, 5qjq:B, 5qjq:C, 5qjq:D, 5qjr:A, 5qjr:B, 5qjr:C, 5qjr:D, 5qjs:A, 5qjs:B, 5qjs:C, 5qjs:D, 5qjt:A, 5qjt:B, 5qjt:C, 5qjt:D, 5qju:A, 5qju:B, 5qju:C, 5qju:D, 5qjv:A, 5qjv:B, 5qjv:C, 5qjv:D, 5qjw:A, 5qjw:B, 5qjw:C, 5qjw:D, 5qjx:A, 5qjx:B, 5qjx:C, 5qjx:D, 5qjy:A, 5qjy:B, 5qjy:C, 5qjy:D, 5qjz:A, 5qjz:B, 5qjz:C, 5qjz:D, 5qk0:A, 5qk0:B, 5qk0:C, 5qk0:D, 5qk1:A, 5qk1:B, 5qk1:C, 5qk1:D, 5qk2:A, 5qk2:B, 5qk2:C, 5qk2:D, 5qk3:A, 5qk3:B, 5qk3:C, 5qk3:D, 5qk4:A, 5qk4:B, 5qk4:C, 5qk4:D, 5qk5:A, 5qk5:B, 5qk5:C, 5qk5:D, 5qk6:A, 5qk6:B, 5qk6:C, 5qk6:D, 5qk7:A, 5qk7:B, 5qk7:C, 5qk7:D, 5qk8:A, 5qk8:B, 5qk8:C, 5qk8:D, 5qk9:A, 5qk9:B, 5qk9:C, 5qk9:D, 5qka:A, 5qka:B, 5qka:C, 5qka:D, 5qkb:A, 5qkb:B, 5qkb:C, 5qkb:D, 5qtl:A, 5qtl:B, 5qtl:C, 5qtl:D, 5qtm:A, 5qtm:B, 5qtm:C, 5qtm:D, 5qtn:A, 5qtn:B, 5qtn:C, 5qtn:D, 5qto:A, 5qto:B, 5qto:C, 5qto:D, 5qtp:A, 5qtp:B, 5qtp:C, 5qtp:D, 5qtq:A, 5qtq:B, 5qtq:C, 5qtq:D, 5qtr:A, 5qtr:B, 5qtr:C, 5qtr:D, 5qts:A, 5qts:B, 5qts:C, 5qts:D, 8rdz:A, 8rdz:C, 8rdz:B, 8rdz:D, 8riy:AAA, 8riy:BBB
42 1jkf:A 466 86 0.1410 0.0472 0.2558 1.8 1jkf:B
43 1dbg:A 481 27 0.0577 0.0187 0.3333 2.6 1dbo:A, 1ofl:A, 1ofm:A
44 7tbj:A5 1276 61 0.1218 0.0149 0.3115 2.6 5hax:A, 5hb0:B, 5hb0:C, 5hb0:A, 7tbi:A1, 7tbi:A2, 7tbi:A3, 7tbi:A4, 7tbj:A1, 7tbj:A3, 7tbj:A6, 7tbk:A1, 7tbk:A3, 7tbk:A5, 7tbk:A6, 7tbl:A1, 7tbl:A3, 7tbl:A5, 7tbl:A6, 7tbm:A1, 7tbm:A3, 7tbm:A5, 7tbm:A6
45 7tbj:A2 1269 61 0.1218 0.0150 0.3115 2.7 7tbj:A4, 7tbk:A2, 7tbk:A4, 7tbl:A2, 7tbl:A4, 7tbm:A2, 7tbm:A4
46 1vc8:A 126 54 0.1090 0.1349 0.3148 4.8 1vc8:B, 1vc9:A, 1vc9:B
47 8c4t:A 1268 60 0.1026 0.0126 0.2667 5.2
48 8qh3:A 1310 60 0.1026 0.0122 0.2667 5.6 8c4u:A, 8c4v:A, 8p1m:A, 8p1n:A, 8qgt:A
49 5qoh:A 149 91 0.1538 0.1611 0.2637 6.2 5qoi:A, 5qoj:A, 5qok:A, 5qom:A, 5qon:A, 5qoo:A, 5qop:A, 5qoq:A, 5qor:A, 5qos:A, 5qot:A, 5qou:A, 5qov:A, 5qow:A, 5qox:A, 5qoy:A, 5qoz:A, 5qp0:A, 5qp1:A, 5qp2:A, 5qp3:A, 5qp4:A, 5qp5:A, 5qp6:A, 5qp7:A, 5qp8:A, 5qp9:A, 5qpa:A, 5qpb:A
50 1p1i:B 498 86 0.1410 0.0442 0.2558 6.2 1p1h:B, 1p1h:D
51 1jki:A 525 86 0.1410 0.0419 0.2558 6.3 1jki:B, 1la2:A, 1la2:B, 1la2:C, 1la2:D, 1p1h:A, 1p1h:C, 1p1i:A, 1p1j:A, 1p1j:B, 1p1k:A, 1p1k:B, 1rm0:A, 1rm0:B
52 7dnu:A 247 43 0.0962 0.0607 0.3488 8.7
53 6d7j:A 799 30 0.0705 0.0138 0.3667 9.7 6d7j:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218