BioLiP

>protein
MIEIKDKQLTGLRFIDLFAGLGGFRLALESCGAECVYSNEWDKYAQEVYEMNFGEKPEGDITQVNEKTIPDHDILCAGFP
CQAFSISGKQKGFEDSRGTLFFDIARIVREKKPKVVFMENVKNFASHDNGNTLEVVKNTMNELDYSFHAKVLNALDYGIP
QKRERIYMICFRNDLNIQNFQFPKPFELNTFVKDLLLPDSEVEHLVIDRKDLVMTNQEIEQTTPKTVRLGIVGKGGQGER
IYSTRGIAITLSAYGGGIFAKTGGYLVNGKTRKLHPRECARVMGYPDSYKVHPSTSQAYKQFGNSVVINVLQYIAYNIGS
SLNFKPY

The query sequence (length=327) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	10mh:A	327	327	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	2c7o:A, 2c7p:A, 2c7q:A, 2c7r:A, 5ciy:A, 3eeo:A, 1fjx:A, 1hmy:A, 2hmy:B, 2hr1:A, 2i9k:A, 1m0e:A, 1mht:A, 3mht:A, 4mht:A, 5mht:A, 6mht:A, 7mht:A, 8mht:A, 9mht:A, 1skm:A, 1svu:B, 2uyc:A, 2uyh:A, 2uz4:A, 2z6a:A, 2z6q:A, 2z6u:A, 2zcj:A
2	1svu:A	307	327	0.9358	0.9967	0.9358	0.0
3	3ubt:Y	328	336	0.3028	0.3018	0.2946	7.12e-41	1dct:A, 1dct:B, 3ubt:B, 3ubt:A
4	8c56:A	388	284	0.2355	0.1985	0.2711	1.54e-19	8c57:A, 8c58:A, 8c59:A, 4dkj:A
5	6fdf:A	325	332	0.2324	0.2338	0.2289	3.52e-13	6fdf:B, 6fdf:C, 6fdf:D
6	4h0n:A	331	329	0.2477	0.2447	0.2462	4.38e-13	4h0n:B, 4h0n:C, 4h0n:D
7	3pt6:B	915	184	0.1468	0.0525	0.2609	1.05e-11	4da4:A, 3pt6:A, 6w8v:A
8	3pt6:B	915	64	0.0642	0.0230	0.3281	0.018	4da4:A, 3pt6:A, 6w8v:A
9	1g55:A	313	325	0.2508	0.2620	0.2523	1.85e-11
10	3av4:A	1140	182	0.1437	0.0412	0.2582	6.65e-11	3av5:A, 3av6:A, 4da4:B, 5gut:A, 5guv:A, 3pt9:A, 6w8v:B, 6w8w:A, 6w8w:B, 5wy1:A
11	3av4:A	1140	64	0.0642	0.0184	0.3281	0.016	3av5:A, 3av6:A, 4da4:B, 5gut:A, 5guv:A, 3pt9:A, 6w8v:B, 6w8w:A, 6w8w:B, 5wy1:A
12	3swr:A	965	188	0.1529	0.0518	0.2660	1.29e-10
13	3swr:A	965	60	0.0581	0.0197	0.3167	0.017
14	4wxx:B	1178	182	0.1407	0.0390	0.2527	4.14e-10	3epz:A, 3epz:B, 7lmk:A, 7lmk:B, 7lmk:C, 7lmk:D, 7lmm:A, 7lmm:B, 7lmm:C, 7lmm:D, 3pta:A, 7sfc:A, 7sfd:A, 7sfe:A, 7sff:A, 7sfg:A, 5wvo:C, 4wxx:A, 6x9i:A, 6x9j:A, 6x9k:A, 7xi9:A, 7xib:A, 5ydr:B, 4yoc:A
15	4wxx:B	1178	60	0.0581	0.0161	0.3167	0.014	3epz:A, 3epz:B, 7lmk:A, 7lmk:B, 7lmk:C, 7lmk:D, 7lmm:A, 7lmm:B, 7lmm:C, 7lmm:D, 3pta:A, 7sfc:A, 7sfd:A, 7sfe:A, 7sff:A, 7sfg:A, 5wvo:C, 4wxx:A, 6x9i:A, 6x9j:A, 6x9k:A, 7xi9:A, 7xib:A, 5ydr:B, 4yoc:A
16	3qv2:A	320	319	0.2263	0.2313	0.2320	1.55e-08
17	7ubu:A	708	117	0.0887	0.0410	0.2479	2.87e-06	4ft4:A, 4ft4:B
18	7ubu:A	708	52	0.0550	0.0254	0.3462	0.002	4ft4:A, 4ft4:B
19	4fsx:A	680	113	0.0917	0.0441	0.2655	1.75e-05	4fsx:B, 4ft2:B, 4ft2:A
20	4fsx:A	680	52	0.0550	0.0265	0.3462	0.002	4fsx:B, 4ft2:B, 4ft2:A
21	7r78:A	1880	195	0.1621	0.0282	0.2718	6.27e-04
22	9baq:A	1001	183	0.1437	0.0470	0.2568	0.001
23	7t02:A	1752	192	0.1590	0.0297	0.2708	0.001
24	7r76:A	1834	192	0.1590	0.0284	0.2708	0.002	7r77:A
25	9baz:A	965	181	0.1407	0.0477	0.2541	0.004	9bap:A
26	4u7p:A	426	60	0.0612	0.0469	0.3333	0.011	3a1a:A, 3a1b:A, 8ba5:A, 6brr:A, 6brr:D, 6f57:A, 6f57:D, 6pa7:K, 6pa7:P, 4qbq:C, 4qbq:A, 4qbr:A, 4qbr:C, 4qbs:A, 2qrv:A, 2qrv:D, 2qrv:E, 2qrv:H, 8tdr:A, 8tdr:B, 8tdr:C, 8tdr:D, 8te1:A, 8te1:B, 8te1:C, 8te1:D, 8te3:A, 8te3:B, 8te3:C, 8te3:D, 8te4:A, 8te4:B, 8te4:C, 8te4:D, 4u7t:A, 4u7t:C, 6w89:A, 6w89:D, 6w89:G, 6w89:J, 6w8b:A, 6w8b:D, 6w8b:H, 6w8b:K, 6w8d:A, 6w8d:D, 6w8j:A, 6w8j:D, 5yx2:A, 5yx2:D
27	8eii:B	439	117	0.1040	0.0774	0.2906	0.38	8eih:A, 8eih:B, 8eih:C, 8eii:A, 8eii:C, 8eij:A, 8eij:B, 8eik:A, 8eik:B, 6kda:A, 6kda:D, 6kdb:A, 6kdb:D, 6kdl:A, 6kdl:D, 6kdp:A, 6kdp:D, 6kdt:A, 6kdt:D, 7o45:A, 7o45:B, 7o45:C, 6u8p:A, 6u8p:D, 6u8v:A, 6u8v:D, 6u8w:A, 6u8w:D, 6u8x:A, 6u8x:D, 6u90:A, 6u90:D, 6u91:A, 6u91:D, 7v0e:A, 7v0e:B, 7v0e:C, 7v0e:D, 7v0e:E, 7v0e:F, 7v0e:G, 7v0e:H, 7x9d:A, 7x9d:D
28	6m1c:A	184	47	0.0550	0.0978	0.3830	0.60
29	6vwf:A	450	41	0.0428	0.0311	0.3415	1.1	6vwf:B
30	6vr6:D	493	41	0.0428	0.0284	0.3415	1.2	6vr6:A, 6vr6:B, 6vr6:C, 6vr6:E, 6vr6:F, 6vr6:G, 6vr6:H
31	4b65:A	456	56	0.0581	0.0417	0.3393	1.8	4b63:A, 4b64:A, 4b66:A, 4b67:A, 4b68:A, 4b69:A, 5cku:A, 7jvk:A, 7jvk:B, 7jvk:C, 7jvk:D, 7jvl:A, 7jvl:B, 7jvl:C, 7jvl:D, 4nzh:A, 6x0h:A, 6x0h:B, 6x0h:C, 6x0h:D, 6x0i:A, 6x0i:B, 6x0i:C, 6x0i:D, 6x0j:A, 6x0j:B, 6x0j:C, 6x0j:D, 6x0k:A, 6x0k:B, 6x0k:C, 6x0k:D, 6x0k:E, 6x0k:F, 6x0k:G, 6x0k:H
32	7l4c:A	353	117	0.0887	0.0822	0.2479	2.3	7l4f:B, 7l4f:A, 7l4h:A, 7l4k:A, 7l4m:B, 7l4m:A, 7l4n:A, 8t1u:A
33	8p4e:O	695	26	0.0336	0.0158	0.4231	3.3	4n48:A, 4n48:B, 4n49:A, 8p4f:O
34	8xvg:I	349	50	0.0489	0.0458	0.3200	4.0	8xvt:I
35	5k2o:A	585	104	0.0856	0.0479	0.2692	4.3	3e9y:A, 3ea4:A, 8et4:A, 8et5:A, 5k3s:A, 5k6q:A, 5k6r:A, 5k6t:A, 7stq:A, 7tzz:A, 7u1d:A, 7u1u:A, 7u25:A, 6u9h:A, 6u9h:B, 6u9h:H, 6u9h:I, 6u9h:L, 6u9h:M, 6u9h:P, 6u9h:Q, 6vz8:E, 6vz8:I, 6vz8:M, 6vz8:Q, 5wj1:A, 1ybh:A, 1yhy:A, 1yhz:A, 1yi0:A, 1yi1:A, 1z8n:A
36	1bpw:A	503	91	0.0765	0.0497	0.2747	4.7	1bpw:B, 1bpw:C, 1bpw:D
37	7cya:A	139	46	0.0398	0.0935	0.2826	4.9
38	9c57:L	404	50	0.0489	0.0396	0.3200	5.2	9c6n:L, 8x15:T, 8x19:T, 8x1c:T, 8xvg:J, 8xvt:J
39	4bjr:A	500	75	0.0703	0.0460	0.3067	6.3	4b0t:A, 4b0t:B, 4bjr:B
40	5x7m:A	443	63	0.0520	0.0384	0.2698	7.1	5x7m:B, 5x7n:A, 5x7n:B
41	3vb9:B	462	51	0.0459	0.0325	0.2941	7.3	3vb9:D
42	2esr:B	160	43	0.0459	0.0938	0.3488	8.6

[Back]