Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
MDQREILQKFLDEAQSKKITKEEFANEFLKLKRQSTKYKADKTYPTTVAEKPKNIKKNRYKDILPYDYSRVELSLITSDE
DSSYINANFIKGVYGPKAYIATQGPLSTTLLDFWRMIWEYSVLIIVMACMEYEMGKKKCERYWAEPGEMQLEFGPFSVSC
EAEKRKSDYIIRTLKVKFNSETRTIYQFHYKNWPDPSSIDPILELIWDVRCYQEDDSVPICIHSSAGCGRTGVICAIDYT
WMLLKDGIIPENFSVFSLIREMRTQRPSLVQTQEQYELVYNAVLELFKRQM

The query sequence (length=291) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3h2x:A 302 294 0.9966 0.9603 0.9864 0.0 3brh:A, 3brh:B, 4j51:A, 4j51:B, 3olr:A, 3olr:B, 3olr:C, 3olr:D, 3omh:A, 3omh:B, 3omh:C, 3omh:D, 2qct:A
2 4gfv:B 288 267 0.4502 0.4549 0.4906 2.53e-93 4gfu:A, 4gfv:A, 4nnd:A, 4nnd:B, 4nnd:D, 4nnd:G
3 3qck:A 289 268 0.3540 0.3564 0.3843 5.99e-57 3qce:A, 3qce:B, 3qcf:A, 3qcf:B, 3qcg:A, 3qch:A, 3qci:A, 3qcj:A, 3qcl:A, 3qcm:A, 3qcm:B
4 5h08:A 282 243 0.3058 0.3156 0.3663 1.18e-53
5 1ygu:B 582 294 0.3918 0.1959 0.3878 2.15e-53 1ygr:A, 1ygr:B, 1ygu:A
6 1ygu:B 582 255 0.2612 0.1306 0.2980 1.57e-34 1ygr:A, 1ygr:B, 1ygu:A
7 6kr4:C 575 254 0.3436 0.1739 0.3937 6.21e-51
8 6kr4:C 575 266 0.3196 0.1617 0.3496 3.16e-43
9 3s3e:A 287 268 0.3093 0.3136 0.3358 1.46e-50 3s3e:B, 3s3f:B, 3s3h:B, 3s3h:A, 3s3k:B
10 3ps5:A 529 288 0.3677 0.2023 0.3715 1.60e-50 1fpr:A, 4gry:A, 4grz:A, 4gs0:B, 4hjq:A, 4hjq:B
11 6bn5:B 448 278 0.3643 0.2366 0.3813 3.56e-50
12 5xzr:A 519 285 0.3746 0.2100 0.3825 1.04e-48 1aya:A, 1aya:B, 1ayb:A, 1ayc:A, 8b5y:A, 8b5y:B, 9blg:A, 9blg:B, 6bmr:A, 6cmr:A, 6cms:A, 5df6:A, 5ehp:A, 6md7:A, 6md7:B, 3mow:A, 3o5x:A, 7ppl:A, 7ppm:A, 7ppn:A, 4pvg:A, 4qsy:A, 6r5g:A, 7r75:A, 7r7d:A, 7r7d:B, 7r7i:A, 7rct:B, 7rct:A, 4rdd:A, 6roy:A, 6roy:B, 6roz:A, 6roz:C, 8rzw:A, 8rzw:B, 8rzy:A, 8rzy:B, 8s01:A, 8s01:B, 8s04:A, 8s04:B, 8s06:A, 8s06:B, 8s07:A, 8s07:B, 8s0h:A, 8s0h:B, 8s0i:A, 8s0i:B, 8s0j:A, 8s0j:B, 8s0k:A, 8s0k:B, 8s0o:A, 8s0o:B, 8s0p:A, 8s0p:B, 8s0q:A, 8s0q:B, 8s0s:A, 2shp:A, 2shp:B, 8t6d:A, 8t6d:B, 8t6g:A, 8t6g:B, 8t7q:A, 8t8q:A, 8t8q:B, 3tkz:A, 3tl0:A, 8u7w:A, 8u7w:B, 8u7x:A, 8u7x:B, 8wfy:A, 8wfy:B, 6wu8:A, 6wu8:B, 8wx7:B, 5x7b:A, 5x94:A, 5x94:B
13 4ge6:A 303 254 0.3127 0.3003 0.3583 7.41e-47 4ge2:A, 4ge5:A, 4icz:A, 6kzq:A, 6l03:A
14 7r7l:A 490 282 0.3677 0.2184 0.3794 8.34e-47 6bmr:B, 6bmu:A, 6bmu:B, 6bmv:A, 6bmv:B, 6bmw:A, 6bmw:B, 6bmx:A, 6bmx:B, 6bmy:A, 6bmy:B, 8cbh:A, 8cbh:B, 6crg:A, 5ehp:B, 5ehr:A, 5ehr:B, 8gww:A, 8gww:B, 7jvm:A, 7jvm:B, 7jvn:A, 7jvn:B, 6md9:A, 6md9:B, 6mda:A, 6mda:B, 6mdb:A, 6mdb:B, 6mdc:A, 6mdc:B, 6mdd:A, 6mdd:B, 7r7i:B, 7r7l:B, 8s0s:B, 8t7q:B, 7vxg:A, 7vxg:B, 7vxg:C, 7vxg:D, 8wx7:A, 7xhq:A, 7xhq:B
15 4ri5:A 284 264 0.3230 0.3310 0.3561 8.11e-46 4qum:A, 4rh5:A, 4rh9:A, 4rhg:A, 4ri5:B, 4s0g:A
16 8eya:A 301 264 0.3265 0.3156 0.3598 1.69e-45 1aax:A, 2azr:A, 2b07:A, 6b8z:A, 6b95:A, 2bgd:A, 2bge:A, 4bjo:A, 4bjo:B, 1bzc:A, 1bzh:A, 1bzj:A, 1c83:A, 1c84:A, 1c85:A, 1c86:A, 1c87:A, 1c88:A, 2cm7:A, 2cm8:A, 2cma:A, 2cmb:A, 2cmc:A, 2cne:A, 2cnf:A, 2cng:A, 2cnh:A, 2cni:A, 3cwe:A, 3d9c:A, 3eax:A, 3eb1:A, 1ecv:A, 1een:A, 1eeo:A, 8exj:A, 8exk:A, 8exm:A, 8exn:A, 8eya:B, 8eyb:A, 8eyb:B, 8eyc:A, 2f6t:A, 2f6v:A, 2f6w:A, 2f6y:A, 2f6z:A, 2f70:A, 2f71:A, 8f88:A, 8f88:B, 8f88:C, 2fjm:A, 2fjm:B, 2fjn:A, 2fjn:B, 7fqm:A, 7fqn:A, 7fqo:A, 7fqp:A, 7fqq:A, 7fqs:A, 7fqt:A, 7fqu:A, 7fqx:A, 7fqy:A, 7fqz:A, 7frf:A, 7frg:A, 7fri:A, 7frj:A, 7frl:A, 7frm:A, 7frn:A, 7fro:A, 7frp:A, 7frq:A, 7frr:A, 1g1f:A, 1g1g:A, 1g1h:A, 8g65:A, 8g65:B, 8g67:A, 8g68:A, 8g68:B, 8g69:A, 8g69:B, 8g6a:A, 1g7f:A, 1g7g:A, 1gfy:A, 7gs7:A, 7gs8:A, 7gs9:A, 7gsa:A, 7gsb:A, 7gsc:A, 7gse:A, 7gsf:A, 7gsg:A, 7gsh:A, 7gsi:A, 7gsj:A, 7gsk:A, 7gsl:A, 7gsm:A, 7gsn:A, 7gso:A, 7gsq:A, 7gsr:A, 7gst:A, 7gsu:A, 7gsv:A, 7gsx:A, 7gsy:A, 7gsz:A, 7gt0:A, 7gt1:A, 7gt2:A, 7gt3:A, 7gt4:A, 7gt5:A, 7gt6:A, 7gt7:A, 7gt8:A, 7gt9:A, 7gta:A, 7gtb:A, 7gtc:A, 7gtd:A, 7gte:A, 7gtf:A, 7gtg:A, 7gth:A, 7gti:A, 7gtj:A, 7gtk:A, 7gtl:A, 7gtm:A, 7gtn:A, 7gto:A, 7gtp:A, 7gtq:A, 7gtr:A, 7gts:A, 7gtt:A, 7gtu:A, 7gtv:A, 2h4g:A, 2h4k:A, 2hb1:A, 2hnq:A, 3i7z:A, 3i80:A, 4i8n:A, 1jf7:B, 5k9w:A, 1kak:A, 1kav:A, 5ka1:A, 5ka3:A, 5ka7:A, 5ka9:A, 5kab:A, 5kad:A, 5kad:B, 7klx:A, 1l8g:A, 1lqf:A, 1lqf:B, 1lqf:C, 1lqf:D, 7mm1:A, 7mn7:A, 7mna:A, 7mnb:A, 7mnd:A, 7mnf:A, 7mow:A, 1nl9:A, 1nny:A, 1no6:A, 2nt7:A, 2nta:A, 1nwe:A, 1nwl:A, 1nz7:A, 1oeu:A, 1ony:A, 1onz:A, 1ph0:A, 1ptt:A, 1ptu:A, 1ptv:A, 1pty:A, 1pxh:A, 1pyn:A, 1q1m:A, 1q6j:A, 1q6m:A, 1q6n:A, 1q6n:B, 1q6p:A, 1q6p:B, 1q6s:A, 1q6s:B, 1q6t:A, 1q6t:B, 2qbp:A, 2qbq:A, 2qbr:A, 2qbs:A, 5qde:A, 5qdf:A, 5qdh:A, 5qdi:A, 5qdj:A, 5qdk:A, 5qdl:A, 5qdm:A, 5qdn:A, 5qdo:A, 5qdp:A, 5qdq:A, 5qdr:A, 5qds:A, 5qdt:A, 5qdu:A, 5qdv:A, 5qdw:A, 5qdx:A, 5qdy:A, 5qdz:A, 5qe0:A, 5qe1:A, 5qe2:A, 5qe4:A, 5qe5:A, 5qe6:A, 5qe8:A, 5qe9:A, 5qea:A, 5qeb:A, 5qec:A, 5qed:A, 5qef:A, 5qeg:A, 5qeh:A, 5qei:A, 5qej:A, 5qek:A, 5qel:A, 5qem:A, 5qen:A, 5qeo:A, 5qep:A, 5qeq:A, 5qer:A, 5qes:A, 5qet:A, 5qeu:A, 5qew:A, 5qex:A, 5qey:A, 5qez:A, 5qf0:A, 5qf1:A, 5qf2:A, 5qf3:A, 5qf4:A, 5qf5:A, 5qf6:A, 5qf7:A, 5qf8:A, 5qf9:A, 5qfa:A, 5qfb:A, 5qfc:A, 5qfd:A, 5qfe:A, 5qff:A, 5qfg:A, 5qfh:A, 5qfi:A, 5qfj:A, 5qfk:A, 5qfl:A, 5qfm:A, 5qfn:A, 5qfo:A, 5qfp:A, 5qfq:A, 5qfr:A, 5qfs:A, 5qft:A, 5qfu:A, 5qfv:A, 5qfw:A, 5qfx:A, 5qfy:A, 5qfz:A, 5qg0:A, 5qg1:A, 5qg2:A, 5qg3:A, 5qg4:A, 5qg5:A, 5qg6:A, 5qg7:A, 5qg8:A, 5qg9:A, 5qga:A, 5qgb:A, 5qgc:A, 5qgd:A, 5qge:A, 5qgf:A, 1qxk:A, 8skl:A, 5t19:A, 1t48:A, 1t49:A, 1t4j:A, 2veu:A, 2vev:A, 2vew:A, 2vex:A, 2vey:A, 6w30:A, 1wax:A, 1xbo:A, 6xe8:A, 6xed:A, 6xef:A, 6xeg:A, 4y14:A, 4y14:B, 2zmm:A, 3zmp:B, 3zmp:A, 3zmq:A, 2zn7:A, 4zrt:A
17 3d42:A 289 246 0.3093 0.3114 0.3659 1.89e-45 3d44:A, 1zc0:A
18 1wch:A 308 250 0.3162 0.2987 0.3680 1.55e-43
19 9c55:A 288 255 0.3196 0.3229 0.3647 1.86e-43 9c56:A, 8u0h:A, 8u0h:B, 7uad:A, 8uh6:C
20 6crg:B 462 281 0.3471 0.2186 0.3594 2.86e-43 6bn5:A
21 2i4g:A 289 291 0.3299 0.3322 0.3299 1.54e-42 2h02:A, 2h02:B, 2h03:A, 2h04:A, 2i4h:A, 2i5x:A, 2i5x:B, 8jbn:B, 8jby:A, 8jby:B
22 6h8s:A 291 249 0.3093 0.3093 0.3614 2.70e-42 2cjz:A, 6h8r:A, 5ovr:A, 5ovx:A, 5ow1:A
23 8gwh:A 295 260 0.3127 0.3085 0.3500 5.71e-41
24 1xxp:A 287 255 0.2062 0.2091 0.2353 2.50e-06 3blt:A, 3blu:A, 3bm8:A, 6drb:A, 3f9a:A, 3f9b:A, 2i42:A, 1pa9:A, 1qz0:A, 1qz0:B, 3u96:A, 3u96:B, 1xxp:B, 1xxv:A, 1xxv:B, 2y2f:A, 2ydu:A, 1ytn:A, 1yts:A, 1ytw:A, 4z6b:A, 4zi4:A, 4zn5:A
25 5z5a:A 148 102 0.0928 0.1824 0.2647 4.94e-04 5z5a:B, 5z5a:C
26 2i6j:A 161 55 0.0756 0.1366 0.4000 0.004 2dxp:A, 2i6m:A, 2i6o:A, 2i6p:A, 7mpc:A, 7mpd:A
27 1g4u:S 360 85 0.0962 0.0778 0.3294 0.084
28 4erc:A 150 88 0.0790 0.1533 0.2614 0.16 4erc:B
29 7tui:B 2033 62 0.0722 0.0103 0.3387 0.32 6u5v:B, 6u5w:B
30 3v0h:B 327 53 0.0687 0.0612 0.3774 1.5 3v0h:A
31 5bx1:A 153 82 0.0653 0.1242 0.2317 4.0 3rz2:A, 3rz2:B, 1xm2:A, 1xm2:B, 1xm2:C, 1xm2:D, 1xm2:E, 1zcl:A, 1zcl:B
32 8ag6:B 975 95 0.0825 0.0246 0.2526 4.2 2o8b:B, 2o8c:B, 2o8d:B, 2o8e:B, 2o8f:B
33 8htu:O 90 72 0.0687 0.2222 0.2778 6.4 7ksq:O, 7ku5:O, 7xqp:O
34 5gjf:A 298 39 0.0412 0.0403 0.3077 6.9 2eva:A, 5gjd:A, 5gjg:A, 4gs6:A, 5j8i:A, 5j9l:A, 5jga:A, 5jgb:A, 5jgd:A, 5jh6:A, 5jk3:A, 4l3p:A, 4l52:A, 4l53:A, 7nth:A, 7nti:A, 4o91:A, 5v5n:A, 2yiy:A
35 7zve:E 500 82 0.0687 0.0400 0.2439 7.8 2bh9:A, 2bhl:A, 2bhl:B, 6e07:L, 6e07:C, 6e07:F, 6e07:N, 6e07:Q, 6e07:T, 6e07:W, 6e07:B, 6e08:L, 6jyu:A, 1qki:A, 1qki:B, 1qki:C, 1qki:D, 1qki:E, 1qki:F, 1qki:G, 1qki:H, 7snh:A, 7snh:B, 7snh:C, 7snh:D, 7sni:A, 7sni:B, 7sni:C, 7sni:D, 7ual:A, 7ual:B, 7ual:C, 7ual:D, 7uc2:A, 7uc2:B, 7uc2:C, 7uc2:D, 5ukw:A, 7zvd:N
36 4adg:C 432 17 0.0309 0.0208 0.5294 8.3 4adg:A, 4adg:B, 4adj:A, 4adj:B, 4adj:C, 4b3v:A, 4b3v:B, 4b3v:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218