Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
MDELDLNPRIIYSIKKAHLHDYGTILSLSAADIQRMTRLSASDVHQLQKTVAERIRRTPHTTAFHLHRRSGPAELNRDHL
TTGCQQLDSFLRGGILTRTLTEIAGESASGKTQLCMQLCLTVQLPEQMGGLGGGAVYICTEDVFPNKRLVQMISQLKQRA
HDVKVKDICFTDNIFIEHAAELDDLHYCVSKKVPVLLAQRHVKLIIIDSIAALFRCEHDSQSLQERARLMQLIASKLLQL
ANQFNVPAICVNQVSDVVRKVIPTLGISWANHVTVRLMLMRTNYKLPVQQKNIEGDVIGSLDVQIRTMEVLFAPHLPNSL
CRFIVDQDGVKGLPAK

The query sequence (length=336) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8gja:F 342 342 0.9911 0.9737 0.9737 0.0 8gja:B, 8gja:D
2 8gbj:C 317 315 0.2857 0.3028 0.3048 7.75e-30 8faz:C, 8ouy:B, 8ouz:B
3 6hqu:G 194 176 0.1905 0.3299 0.3636 1.55e-26 6hqu:H
4 8bsc:D 313 336 0.2738 0.2939 0.2738 4.43e-26 8bq2:A, 8bq2:B, 8bq2:C, 8bq2:D, 8bq2:E, 8bq2:F, 8bq2:G, 8bq2:H, 8bq2:I, 8br2:A, 8br2:B, 8br2:C, 8br2:D, 8br2:E, 8br2:F, 8bsc:A, 8bsc:B, 8bsc:C, 8bsc:E, 8bsc:F, 8bsc:G, 7c9a:A, 7c9a:B, 7c9a:C, 7ejc:A, 7ejc:C, 7ejc:B, 7eje:A, 7eje:B, 7eje:C, 8gyk:A, 8gyk:B, 8gyk:C, 8gyk:D, 8gyk:E, 8gyk:F, 8gyk:G, 8gyk:H, 5h1b:A, 5h1b:B, 5h1b:C, 5h1c:A, 5h1c:B, 5h1c:C, 5np7:A, 5np7:B, 5np7:C, 5np7:D, 5np7:E, 5np7:F, 5np7:G, 5nwl:A, 5nwl:B, 5nwl:C, 5nwl:D, 5nwl:E, 5nwl:F, 5nwl:G, 5nwl:H, 5nwl:I, 5nwl:J, 5nwl:K, 5nwl:L, 5nwl:M, 5nwl:N, 8pbc:J, 8pbc:K, 8pbc:I, 8pbc:H, 8pbc:G, 8pbc:F, 8pbc:E, 8pbc:D, 8pbc:C, 8pbc:B, 8pbc:A, 8pbd:I, 8pbd:J, 8pbd:H, 8pbd:G, 8pbd:F, 8pbd:E, 8pbd:D, 8pbd:C, 8pbd:B, 8pbd:A, 8rcd:A, 8rcd:B, 8rcd:C, 8rcd:D, 8rcd:E, 8rcd:F, 8rcd:G, 8rcd:H, 8rcf:A, 8rcf:B, 8rcf:C, 8rcf:D, 8rcf:E, 8rcf:F, 8rcf:G, 8rcf:H
5 7ej6:B 316 345 0.2738 0.2911 0.2667 1.65e-25 7ej6:C, 7ej6:A, 7ej7:B, 7ej7:A, 7ej7:C
6 6hqu:B 219 176 0.1905 0.2922 0.3636 6.25e-25 8br9:A, 8c3n:A, 6hqu:C, 6hqu:F, 6hqu:A, 6hqu:D, 6hqu:E
7 7c98:A 309 310 0.2560 0.2783 0.2774 1.08e-24 7c98:B, 7c98:C, 7c99:A, 7c99:B, 7c99:C, 7c9c:A, 7c9c:B, 7c9c:C, 7cgy:A, 7cgy:B, 7cgy:C, 8qqe:B, 8qqe:A, 8r2g:C, 8r2g:G, 8r2g:H, 8r2g:A, 8r2g:D, 8r2g:E, 8r2g:B
8 8jnf:L 283 304 0.2500 0.2968 0.2763 2.80e-24 8jnf:M, 8jnf:N, 8jnf:O, 1n0w:A, 8xbt:O, 8xbu:M, 8xbu:R, 8xbu:L
9 4d6p:B 229 253 0.2321 0.3406 0.3083 2.72e-23 4a6x:A, 4a6x:B, 4b2i:A, 4b2l:A, 4b2p:A, 4b32:A, 4b33:A, 4b34:A, 4b35:A, 4b3b:A, 4b3d:A, 4b3d:C, 4d6p:A, 5fos:A, 5fot:A, 5fou:A, 5fov:A, 5fov:C, 5fow:A, 5fow:C, 5fox:A, 5fpk:A, 5j4h:A, 5j4k:A, 5jee:A, 5jfg:A, 5lbi:A, 5qub:A, 5quc:A, 5qud:A, 5que:A, 5quf:A, 5qug:A, 5quh:A, 5qui:A, 5quj:A, 5qur:A, 5qus:A, 5qut:A, 6tuu:A, 6tuu:B, 6tuu:C, 6tuu:D, 6tv3:A, 6tw3:A, 6tw4:A, 6tw9:A, 4uqo:A, 4uqo:B, 6xtw:A, 6xuf:A, 6xuj:A
10 7qv8:A 208 178 0.1845 0.2981 0.3483 9.37e-23
11 8gja:C 274 241 0.2232 0.2737 0.3112 1.50e-22 8gj8:A, 8gja:A, 8gja:E
12 3ew9:A 314 264 0.2232 0.2389 0.2841 7.37e-21 3etl:A, 3ewa:A
13 1xu4:A 318 264 0.2113 0.2233 0.2689 1.15e-18 2b21:A, 2f1h:A, 2f1i:A, 2f1j:A, 2fpk:A, 2fpl:A, 2fpm:A, 2i1q:A, 3ntu:A, 1t4g:A
14 3fyh:A 296 263 0.2143 0.2432 0.2738 3.22e-18 2gdj:A
15 8gbj:D 308 269 0.2024 0.2208 0.2528 2.27e-05 8faz:D, 8ouy:C, 8ouz:C
16 5jrj:A 306 208 0.1667 0.1830 0.2692 0.001
17 2g88:A 331 204 0.1577 0.1601 0.2598 0.008 2odn:A, 2odw:A, 2oep:A, 1ube:A, 1ubf:A, 1ubg:A, 2zr9:A, 2zra:A, 2zrd:A, 2zre:A, 2zrf:A, 2zrg:A, 2zri:A, 2zrj:A, 2zrk:A, 2zrl:A, 2zrm:A, 2zro:A, 2zrp:A
18 8faz:X 236 189 0.1220 0.1737 0.2169 0.017 8gbj:X, 8ouy:D, 8ouz:D
19 1mo4:A 324 188 0.1488 0.1543 0.2660 0.033 1g18:A, 1mo3:A, 1mo5:A, 1mo6:A
20 5lkm:A 390 159 0.1220 0.1051 0.2579 0.074 5lkm:C
21 3cmu:A 1937 183 0.1339 0.0232 0.2459 0.30 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
22 3cmu:A 1937 186 0.1339 0.0232 0.2419 0.51 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
23 3cmu:A 1937 186 0.1339 0.0232 0.2419 0.51 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
24 3cmu:A 1937 186 0.1339 0.0232 0.2419 0.51 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
25 3cmu:A 1937 186 0.1339 0.0232 0.2419 0.51 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
26 3cmu:A 1937 181 0.1339 0.0232 0.2486 0.61 3cmt:A, 3cmw:A, 8gms:F, 8gms:G, 8gmt:F, 8gmt:G, 8gmu:F, 8gmu:G, 7jy6:A, 7jy6:B, 7jy6:C, 7jy6:D, 7jy6:E, 7jy6:F, 7jy6:G, 7jy6:H, 7jy6:I, 7jy7:A, 7jy7:B, 7jy7:C, 7jy7:D, 7jy7:E, 7jy7:F, 7jy7:G, 7jy7:H, 7jy7:I, 7jy8:A, 7jy8:B, 7jy8:C, 7jy8:D, 7jy8:E, 7jy8:F, 7jy8:G, 7jy8:H, 7jy8:I, 7jy9:A, 7jy9:C, 7jy9:D, 7jy9:G, 7jy9:E, 7jy9:B, 7jy9:F, 7jy9:H, 7jy9:I, 8trg:A, 8trg:B, 8trg:C, 8trg:D, 8trg:E, 8trg:F, 8trg:G, 8trg:H, 4twz:A, 7ywa:F, 7ywa:G
27 3cmt:D 1609 181 0.1310 0.0273 0.2431 0.46 3cmw:C, 3cmx:A, 3cmx:D
28 3cmt:D 1609 186 0.1339 0.0280 0.2419 0.50 3cmw:C, 3cmx:A, 3cmx:D
29 3cmt:D 1609 186 0.1339 0.0280 0.2419 0.50 3cmw:C, 3cmx:A, 3cmx:D
30 3cmt:D 1609 186 0.1339 0.0280 0.2419 0.50 3cmw:C, 3cmx:A, 3cmx:D
31 3cmt:D 1609 181 0.1339 0.0280 0.2486 0.60 3cmw:C, 3cmx:A, 3cmx:D
32 6yq0:AAA 254 115 0.1101 0.1457 0.3217 0.46 6ypz:AAA, 6ypz:BBB, 6yq0:BBB, 6yq3:AAA, 6yq3:BBB
33 5j14:A 450 87 0.0625 0.0467 0.2414 0.48 5j14:B, 5j7z:A
34 3cmv:A 1190 186 0.1339 0.0378 0.2419 0.49 3cmv:C, 3cmv:D, 3cmv:F, 3cmv:H, 1n03:A, 1n03:B, 1n03:C, 1n03:D, 1n03:E, 1n03:F, 1n03:G, 1rea:A, 1u94:A, 1u99:A, 1xms:A
35 3cmv:A 1190 186 0.1310 0.0370 0.2366 0.96 3cmv:C, 3cmv:D, 3cmv:F, 3cmv:H, 1n03:A, 1n03:B, 1n03:C, 1n03:D, 1n03:E, 1n03:F, 1n03:G, 1rea:A, 1u94:A, 1u99:A, 1xms:A
36 3cmv:A 1190 186 0.1339 0.0378 0.2419 1.1 3cmv:C, 3cmv:D, 3cmv:F, 3cmv:H, 1n03:A, 1n03:B, 1n03:C, 1n03:D, 1n03:E, 1n03:F, 1n03:G, 1rea:A, 1u94:A, 1u99:A, 1xms:A
37 3cmv:A 1190 186 0.1310 0.0370 0.2366 1.8 3cmv:C, 3cmv:D, 3cmv:F, 3cmv:H, 1n03:A, 1n03:B, 1n03:C, 1n03:D, 1n03:E, 1n03:F, 1n03:G, 1rea:A, 1u94:A, 1u99:A, 1xms:A
38 8hkx:AS7P 193 98 0.0744 0.1295 0.2551 0.64 8hky:AS7P, 8hkz:AS7P, 8hl1:AS7P, 8hl2:AS7P, 8hl3:AS7P, 8hl4:AS7P, 8hl5:AS7P, 8wkp:AS7P, 8wq2:AS7P, 8wq4:AS7P
39 3cmv:G 1167 186 0.1339 0.0386 0.2419 1.1 3cmv:B, 3cmv:E
40 3cmv:G 1167 187 0.1339 0.0386 0.2406 1.2 3cmv:B, 3cmv:E
41 3cmv:G 1167 187 0.1339 0.0386 0.2406 1.2 3cmv:B, 3cmv:E
42 3cmv:G 1167 186 0.1310 0.0377 0.2366 1.8 3cmv:B, 3cmv:E
43 8amd:A 333 187 0.1399 0.1411 0.2513 1.2 8amd:B, 8amd:F, 8amd:G, 8amf:A, 8amf:B, 8amf:F, 8amf:G
44 6qfd:B 116 97 0.0833 0.2414 0.2887 1.3 6qfd:A, 6qfd:C, 6qfd:D, 6qh0:C, 6qh0:D, 6qh0:A, 6qh0:B, 6qil:A, 6qil:B, 6qil:C, 6qil:D, 6qua:A, 6qua:B, 6qua:C, 6qua:D
45 2dr3:D 242 85 0.0714 0.0992 0.2824 1.6 2dr3:A, 2dr3:B, 2dr3:C, 2dr3:E, 2dr3:F
46 5ue1:A 233 34 0.0387 0.0558 0.3824 2.6 5ue1:B
47 2w0m:A 220 65 0.0536 0.0818 0.2769 3.1
48 6uvn:J 389 112 0.0744 0.0643 0.2232 3.2 8fuk:J, 6lnd:K, 6uvn:I, 6v9p:A, 6v9q:J, 6v9q:I, 6vbw:I, 6vbw:J
49 8hh1:D 471 74 0.0655 0.0467 0.2973 4.0 8hh1:E, 8hh1:F, 8hh2:D, 8hh2:E, 8hh2:F, 8hh3:D, 8hh3:E, 8hh3:F, 8hh4:D, 8hh4:E, 8hh4:F, 8hh5:D, 8hh5:E, 8hh5:F, 8hh6:D, 8hh6:E, 8hh6:F, 8hh7:D, 8hh7:F, 8hh8:D, 8hh8:F, 8hh9:D, 8hh9:F, 8hha:D, 8hha:F, 8hhb:D, 8hhb:F, 8hhc:D, 8hhc:F, 7l1q:D, 7l1q:E, 7l1q:F, 7l1r:D, 7l1r:E, 7l1r:F, 7l1s:D, 7l1s:F, 6n2y:E, 6n2y:F, 6n2z:F, 6n2z:D, 6n30:D, 6n30:E, 8spw:D, 8spw:E, 8spx:D, 8spx:E, 8spx:F, 8u1h:D, 8u1h:F, 4xd7:F, 7xkp:F, 7xkq:D, 7xkq:E, 7xkq:F, 7xkr:D, 7xkr:E, 7xkr:F
50 1xmv:A 293 50 0.0506 0.0580 0.3400 4.6
51 4qur:A 415 41 0.0357 0.0289 0.2927 5.1 5hl4:A, 4qup:A, 4quq:A, 3vca:A, 3vcp:A
52 4wkb:A 237 34 0.0387 0.0549 0.3824 8.2 3dp9:A, 3dp9:C, 4wkb:B, 4x24:A, 4x24:B
53 8jma:A 381 40 0.0357 0.0315 0.3000 8.7 8jma:B, 8jma:C, 8jma:D, 8x83:A, 8x83:B, 8x83:C, 8x83:D, 8x84:A, 8x84:B, 8x84:C, 8x84:D
54 4fwi:B 310 43 0.0506 0.0548 0.3953 9.1
55 1ion:A 243 81 0.0565 0.0782 0.2346 9.5

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218