BioLiP

>protein
MDEFEMIKRNTSEIISEEELREVLKKDEKSALIGFEPSGKIHLGHYLQIKKMIDLQNAGFDIIILLADLHAYLNQKGELD
EIRKIGDYNKKVFEAMGLKAKYVYGSEFQLDKDYTLNVYRLALKTTLKRARRSMELIAREDENPKVAEVIYPIMQVNGCH
YRGVDVAVGGMEQRKIHMLARELLPKKVVCIHNPVLTGLDGEGKMSSSKGNFIAVDDSPEEIRAKIKKAYCPAGVVEGNP
IMEIAKYFLEYPLTIKRPEKFGGDLTVNSYEELESLFKNKELHPMDLKNAVAEELIKILEPIRKRLL

The query sequence (length=307) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4nx2:A	313	306	0.9707	0.9521	0.9739	0.0	2ag6:A, 7ckg:B, 3d6u:A, 3d6v:A, 2hgz:A, 4hjx:A, 4hjx:B, 4hpw:A, 1j1u:A, 5l7p:B, 3n2y:A, 3n2y:B, 5n5u:A, 4nda:A, 5nsf:B, 5nsf:A, 5nsf:C, 5nsf:D, 4pbr:A, 4pbs:A, 4pbt:A, 2pxh:A, 3qe4:A, 3qe4:B, 6wrk:A, 6wrn:A, 6wrq:A, 6wrt:A, 7ynw:A, 7ynw:B, 1zh0:A, 1zh6:A, 2zp1:A
2	2cyb:A	319	317	0.5700	0.5486	0.5521	3.24e-120	2cyb:B
3	2cyc:A	371	347	0.4332	0.3585	0.3833	5.13e-60	2cyc:B
4	7rou:A	335	322	0.3746	0.3433	0.3571	2.41e-53	1q11:A, 4q93:A, 4qbt:A, 5thh:A
5	2dlc:X	339	330	0.3518	0.3186	0.3273	5.65e-53
6	7sc6:A	349	329	0.3811	0.3352	0.3556	4.91e-50	7scq:A, 7scq:B
7	7ror:B	362	316	0.3648	0.3094	0.3544	2.32e-47	7ror:A, 7ros:A, 7ros:B, 7rot:A, 7rot:B, 3vgj:A, 3vgj:B
8	5usf:A	682	340	0.3225	0.1452	0.2912	2.60e-31	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
9	5usf:A	682	250	0.2280	0.1026	0.2800	2.06e-10	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
10	3p0j:A	657	343	0.3290	0.1537	0.2945	8.09e-30	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
11	3p0j:A	657	218	0.2052	0.0959	0.2890	1.38e-10	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
12	2j5b:A	321	295	0.2769	0.2648	0.2881	6.89e-23	2j5b:B
13	1h3f:B	406	248	0.2150	0.1626	0.2661	5.89e-15	1h3f:A
14	1h3e:A	427	258	0.2248	0.1616	0.2674	1.59e-13
15	6bqz:A	215	209	0.1792	0.2558	0.2632	4.32e-13	6bqz:B
16	2a4m:C	331	301	0.2410	0.2236	0.2458	3.32e-11	1yi8:C, 1yia:B, 1yid:B
17	3a04:A	367	217	0.2085	0.1744	0.2949	1.10e-10	3a05:A
18	6ncr:A	342	310	0.2476	0.2222	0.2452	2.94e-10	6ncr:B
19	4j75:A	374	250	0.2248	0.1845	0.2760	6.05e-08	4j75:B, 4jfa:A, 4jfa:B, 4jfa:D
20	2g36:A	322	235	0.1987	0.1894	0.2596	2.30e-07
21	2yy5:B	346	326	0.2573	0.2283	0.2423	4.86e-07	2yy5:A, 2yy5:C, 2yy5:D
22	4jfa:C	348	232	0.1889	0.1667	0.2500	6.85e-06
23	5ekd:A	327	239	0.1987	0.1865	0.2552	2.58e-05	5ekd:B
24	3jxe:B	363	206	0.1596	0.1350	0.2379	2.00e-04	3jxe:A
25	3tzl:B	320	247	0.1954	0.1875	0.2429	2.42e-04	3tzl:A
26	6dfu:A	332	298	0.2150	0.1988	0.2215	0.057	6dfu:B
27	3ts1:A	317	57	0.0554	0.0536	0.2982	0.23	4ts1:A, 4ts1:B, 1tya:E, 1tyb:E, 1tyd:E
28	3sz3:A	341	299	0.2150	0.1935	0.2207	0.36
29	8i1w:B	333	297	0.2182	0.2012	0.2256	0.43	8i1y:A, 8i1y:B, 8i1z:A, 8i1z:B, 8i27:A, 8i27:B, 8i2a:B, 8i2a:A, 8i2c:A, 8i2c:B, 8i2j:A, 8i2j:B, 8i2l:B, 8i2l:A, 8i2m:A, 8i2m:B, 8i4i:A, 8i4i:B, 5v0i:A, 5v0i:B
30	3kws:A	265	62	0.0717	0.0830	0.3548	0.80	3kws:B
31	7cms:A	328	298	0.2117	0.1982	0.2181	1.3	7cki:A, 7cms:B, 5dk4:A, 7eer:A, 7eer:B, 7eer:C, 7eer:D, 1i6k:A, 1i6l:A, 1i6m:A, 1m83:A, 1mau:A, 1maw:A, 1maw:B, 1maw:C, 1maw:D, 1maw:E, 1maw:F, 1mb2:A, 1mb2:B, 1mb2:C, 1mb2:D, 1mb2:E, 1mb2:F, 2ov4:A
32	3ct4:A	318	45	0.0521	0.0503	0.3556	1.4	3ct4:B, 3ct4:C
33	3ziu:A	621	80	0.0749	0.0370	0.2875	2.9	3ziu:B
34	4nv0:B	300	55	0.0651	0.0667	0.3636	3.6	4nv0:A, 4nwi:A, 4nwi:B
35	4v6w:Ch	123	31	0.0391	0.0976	0.3871	3.6	6xu6:Ch, 6xu7:Ch, 6xu8:Ch
36	5ko7:B	200	77	0.0651	0.1000	0.2597	5.7
37	3fhj:D	286	44	0.0423	0.0455	0.2955	7.3	3fhj:C
38	6tm0:A	811	65	0.0586	0.0222	0.2769	7.4	6tlz:A, 6tlz:B, 6tm0:B
39	5u75:A	144	43	0.0554	0.1181	0.3953	10.0

[Back]