BioLiP

>protein
MASMSVSTASTEMSVRKIAAHMKSNPNAKVIFMVGAGISTSCGIPDFRSPGTGLYHNLARLKLPYPEAVFDVDFFQSDPL
PFYTLAKELYPGNFRPSKFHYLLKLFQDKDVLKRVYTQNIDTLERQAGVKDDLIIEAHGSFAHCHCIGCGKVYPPQVFKS
KLAEHPIKDFVKCDVCGELVKPAIVFFGEDLPDSFSETWLNDSEWLREKITTQQPLVIVVGTSLAVYPFASLPEEIPRKV
KRVLCNLETVGDFKANKRPTDLIVHQYSDEFAEQLVEELGWQEDFEKILTA

The query sequence (length=291) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1q17:C	295	292	0.9931	0.9797	0.9897	0.0	7f4e:A, 7f51:A, 2od2:A, 2od7:A, 2od9:A, 1q14:A, 1q17:A, 1q17:B, 1q1a:A, 2qqf:A, 2qqg:A, 1szc:A, 1szd:A
2	8bbk:A	274	280	0.4192	0.4453	0.4357	8.47e-74	8bbk:B, 8bbk:C, 8bbk:D, 8bbk:E, 8bbk:F, 4bn4:A, 4bn5:A, 4bn5:B, 4bn5:C, 4bn5:D, 4bn5:E, 4bn5:F, 4bn5:G, 4bn5:H, 4bn5:I, 4bn5:J, 4bn5:K, 4bn5:L, 4bv3:A, 4bvb:A, 4bve:A, 4bvf:A, 4bvg:A, 4bvh:A, 4bvh:B, 4bvh:C, 5bwn:A, 5bwo:A, 4c78:A, 4c7b:A, 9cbt:A, 9cbt:B, 8ccw:A, 8ccz:A, 8ccz:B, 5d7n:A, 5d7n:B, 5d7n:C, 5d7n:D, 5d7n:E, 5d7n:F, 4fvt:A, 4fz3:A, 3glr:A, 3gls:A, 3gls:B, 3gls:C, 3gls:D, 3gls:E, 3gls:F, 3glt:A, 3glu:A, 5h4d:H, 5h4d:A, 4hd8:A, 8hlw:A, 8hly:A, 8hn9:A, 8hn9:B, 6iso:A, 6iso:B, 6iso:E, 6iso:G, 4jsr:A, 4jt8:A, 4jt9:A, 4o8z:A, 8v15:A, 8v15:C, 8v2n:A, 5y4h:A, 5ytk:A, 5ytk:D, 5ytk:E, 5ytk:F, 5ytk:B, 5ytk:C, 5z93:A, 5z94:A, 5z94:B, 5zgc:A, 5zgc:B, 5zgc:C, 5zgc:E, 5zgc:D
3	3zgo:A	318	296	0.4296	0.3931	0.4223	3.09e-72	7bos:A, 5d7o:A, 5d7o:B, 5d7p:A, 5d7p:B, 5d7q:A, 5d7q:B, 5dy4:A, 5dy5:A, 5fyq:A, 5g4c:B, 5g4c:A, 1j8f:A, 1j8f:B, 1j8f:C, 4l3o:A, 4l3o:B, 4l3o:C, 4l3o:D, 6l65:A, 6l66:A, 6l71:A, 6l72:A, 5mar:A, 5mar:B, 5mat:A, 5mat:C, 6nr0:A, 6nr0:B, 8owz:A, 8py3:A, 6qcn:A, 6qcn:B, 4r8m:A, 4r8m:B, 4rmg:A, 4rmh:A, 4rmj:A, 4rmj:B, 7t1d:A, 7t1d:B, 4x3o:A, 4x3p:A, 8xe7:A, 5y0z:A, 5y0z:B, 4y6q:A, 4y6q:B, 4y6q:C, 5yql:A, 5yqm:A, 5yqn:A, 5yqo:A, 3zgo:B, 3zgo:C, 3zgv:A, 3zgv:B
4	5y5n:A	288	280	0.4021	0.4062	0.4179	2.12e-64	7bot:A, 5fyq:B, 4rmi:A, 8tgp:A, 4y6l:A, 4y6l:B, 4y6o:A, 4y6o:B, 4y6q:D
5	5ol0:A	283	279	0.3643	0.3746	0.3799	2.09e-59
6	6iso:I	248	280	0.3643	0.4274	0.3786	3.57e-53
7	5ol0:B	263	278	0.3299	0.3650	0.3453	3.26e-49
8	5btr:A	370	228	0.3162	0.2486	0.4035	9.16e-46	5btr:B, 4i5i:A, 4i5i:B, 4if6:A, 4ig9:A, 4ig9:E, 4ig9:C, 4ig9:G, 4kxq:A, 4zzh:A, 4zzi:A, 4zzj:A
9	5zgc:F	212	280	0.3265	0.4481	0.3393	1.85e-40	6iso:K
10	2h59:A	246	263	0.3471	0.4106	0.3840	9.72e-39	4buz:A, 4bv2:A, 4bv2:B, 3d4b:A, 3d81:A, 2h2d:A, 2h2f:A, 2h2g:A, 2h2h:A, 2h2i:A, 2h4f:A, 2h4h:A, 2h4j:A, 2h59:B, 3jr3:A, 3pdh:A, 1yc5:A
11	4iao:B	429	285	0.3196	0.2168	0.3263	2.66e-36	2hjh:A, 2hjh:B, 4iao:A
12	5btr:C	322	186	0.2509	0.2267	0.3925	4.97e-35
13	1s7g:A	252	226	0.2577	0.2976	0.3319	2.72e-22	1ma3:A, 1s7g:B, 1s7g:C, 1s7g:D, 1s7g:E, 4twj:A, 1yc2:A, 1yc2:B, 1yc2:C, 1yc2:D, 1yc2:E
14	1ici:A	256	207	0.2234	0.2539	0.3140	1.99e-21	1ici:B, 1m2g:A, 1m2h:A, 1m2j:A, 1m2k:A, 1m2n:A, 1m2n:B, 4twi:A
15	5y2f:A	297	263	0.2405	0.2357	0.2662	1.40e-16	8ak5:A, 8ak5:B, 8ak6:A, 8ak6:B, 8ak7:A, 8ak7:B, 8ak8:A, 8ak8:B, 8ak9:A, 8ak9:B, 8aka:A, 8aka:B, 8akb:A, 8akb:B, 8akc:A, 8akc:B, 8akd:A, 8akd:B, 8ake:A, 8ake:B, 8akf:A, 8akf:B, 8akg:A, 8akg:B, 8bl0:A, 8bl0:B, 8bl1:A, 8bl1:B, 7cl0:A, 7cl1:A, 8cnm:A, 8cnm:B, 8cno:A, 8cno:B, 8f86:K, 8g57:K, 9g7h:A, 9g7h:B, 6hoy:A, 6hoy:B, 8i2b:A, 8i2b:B, 3k35:A, 3k35:B, 3k35:C, 3k35:D, 3k35:E, 3k35:F, 5mf6:A, 5mf6:B, 5mfp:A, 5mfp:B, 5mfz:A, 5mfz:B, 5mgn:A, 5mgn:B, 3pki:A, 3pki:B, 3pki:C, 3pki:D, 3pki:E, 3pki:F, 3pkj:A, 3pkj:B, 3pkj:C, 3pkj:D, 3pkj:E, 3pkj:F, 6qcd:A, 6qcd:B, 6qce:A, 6qce:B, 6qch:A, 6qch:B, 6qcj:A, 6qcj:B, 5x16:A, 6xuy:A, 6xuy:B, 6xv1:A, 6xv1:B, 6xv6:A, 6xv6:B, 6xv6:C, 6xv6:D, 6xv6:E, 6xv6:F, 6xvg:A, 6xvg:B, 6xvg:C, 6xvg:D, 6xvg:E, 6xvg:F, 3zg6:A, 6zu4:A, 6zu4:B
16	6eqs:D	275	249	0.2612	0.2764	0.3052	1.33e-15	6ace:A, 6acl:A, 6aco:A, 6acp:A, 2b4y:A, 2b4y:B, 2b4y:C, 2b4y:D, 5bwl:A, 6eqs:A, 6eqs:B, 6eqs:C, 4f4u:A, 4f4u:B, 4f56:A, 4f56:B, 4g1c:A, 4g1c:B, 8gbl:A, 8gbl:B, 8gbn:A, 8gbn:B, 4hda:A, 4hda:B, 6ljk:A, 6ljm:A, 6ljn:A, 2nyr:A, 2nyr:B, 3rig:A, 3rig:B, 3riy:B, 3riy:A, 7x3p:A, 5xhs:A
17	5oj7:A	286	227	0.2131	0.2168	0.2731	2.84e-15	5ojn:A
18	6eo0:B	275	247	0.2509	0.2655	0.2955	9.10e-15	6enx:A, 6eo0:A, 6eo0:C, 6eo0:D, 6fky:A, 6fky:B, 6fkz:A, 6fkz:B, 6flg:A, 6flg:B, 5ojo:A, 5ojo:B, 4utn:A, 4utn:B, 4utr:A, 4utr:B, 4utv:A, 4utv:B, 4utx:A, 4utx:B, 4utz:A, 4utz:B, 4uu7:A, 4uu7:B, 4uu8:A, 4uu8:B, 4uua:A, 4uua:B, 4uub:A, 4uub:B
19	8of4:L	237	220	0.1856	0.2278	0.2455	6.74e-10
20	6rxj:A	235	261	0.2474	0.3064	0.2759	6.12e-09	6rxj:B, 6rxk:A, 6rxl:A, 6rxm:A, 6rxm:B, 6rxm:C, 6rxm:D, 6rxm:E, 6rxm:F, 6rxo:A, 6rxo:B, 6rxp:A, 6rxp:B, 6rxq:A, 6rxq:B, 6rxq:C, 6rxq:D, 6rxr:A, 6rxr:B, 6rxr:C, 6rxr:D, 1s5p:A
21	3u31:A	263	216	0.1718	0.1901	0.2315	8.93e-09	3jwp:A, 3u3d:A
22	6rxs:A	218	260	0.2302	0.3073	0.2577	7.65e-06
23	8zc9:B	971	78	0.0859	0.0257	0.3205	0.23	8wyb:A, 8wyb:B, 8wyb:C, 8wyb:D, 8wyc:A, 8wyc:B, 8wyf:A, 8wyf:B, 8zc9:E
24	8zc9:A	1000	78	0.0859	0.0250	0.3205	0.24	8wyc:C, 8wyc:D, 8wyf:C, 8wyf:D, 8ylt:A, 8ylt:B, 8ylt:C, 8ylt:D, 8zc9:D
25	8teg:A	539	46	0.0481	0.0260	0.3043	0.58
26	4z4k:A	282	49	0.0550	0.0567	0.3265	0.88	5aas:A, 4bmj:A, 4bmj:B, 4bmj:D, 4bmj:E, 4bmj:F, 4bmj:G, 4bmj:I, 4bmj:K, 3vht:B, 5yt6:D, 4z4k:B, 4z4m:A, 4z4m:B
27	8crv:A	312	50	0.0687	0.0641	0.4000	1.4
28	2p2v:A	275	71	0.0756	0.0800	0.3099	1.7
29	1oah:B	482	31	0.0378	0.0228	0.3548	5.2	1oah:A
30	6rm3:SR0	117	30	0.0309	0.0769	0.3000	5.8
31	5x2n:B	459	47	0.0447	0.0283	0.2766	7.5	5x2m:B, 5x2n:D, 5x2o:B, 5x2o:D, 5x2p:B, 5x2q:B, 5x2q:D
32	6s6t:E	472	65	0.0756	0.0466	0.3385	9.6	6s6s:G, 6s6s:E, 6s6s:F, 6s6s:H, 6s6t:F, 6s6t:G, 6s6u:G, 6s6u:H, 6s6u:I, 6s6u:J, 6s6x:G, 6s6x:H, 6s6x:I, 6s6x:J, 6s6x:K, 6s6x:L, 2vdc:G, 2vdc:H, 2vdc:I, 2vdc:J, 2vdc:K, 2vdc:L

[Back]