BioLiP

>protein
LYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEWGPF
DLVIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKRDISRFLECNPVMID
AIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKLKKVRTITTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVLWC
TELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE

The query sequence (length=291) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8eii:B	439	291	0.9759	0.6469	0.9759	0.0	8eih:A, 8eih:B, 8eih:C, 8eii:A, 8eii:C, 8eij:A, 8eij:B, 8eik:A, 8eik:B, 6kda:A, 6kda:D, 6kdb:A, 6kdb:D, 6kdl:A, 6kdl:D, 6kdp:A, 6kdp:D, 6kdt:A, 6kdt:D, 7o45:A, 7o45:B, 7o45:C, 6u8p:A, 6u8p:D, 6u8v:A, 6u8v:D, 6u8w:A, 6u8w:D, 6u8x:A, 6u8x:D, 6u90:A, 6u90:D, 6u91:A, 6u91:D, 7v0e:A, 7v0e:B, 7v0e:C, 7v0e:D, 7v0e:E, 7v0e:F, 7v0e:G, 7v0e:H, 7x9d:A, 7x9d:D
2	8eik:E	378	291	0.9278	0.7143	0.9278	0.0
3	8tci:A	283	283	0.8797	0.9046	0.9046	0.0	8tci:D
4	8eik:C	407	291	0.8900	0.6364	0.8900	0.0
5	4u7p:A	426	290	0.7595	0.5188	0.7621	1.70e-165	3a1a:A, 3a1b:A, 8ba5:A, 6brr:A, 6brr:D, 6f57:A, 6f57:D, 6pa7:K, 6pa7:P, 4qbq:C, 4qbq:A, 4qbr:A, 4qbr:C, 4qbs:A, 2qrv:A, 2qrv:D, 2qrv:E, 2qrv:H, 8tdr:A, 8tdr:B, 8tdr:C, 8tdr:D, 8te1:A, 8te1:B, 8te1:C, 8te1:D, 8te3:A, 8te3:B, 8te3:C, 8te3:D, 8te4:A, 8te4:B, 8te4:C, 8te4:D, 4u7t:A, 4u7t:C, 6w89:A, 6w89:D, 6w89:G, 6w89:J, 6w8b:A, 6w8b:D, 6w8b:H, 6w8b:K, 6w8d:A, 6w8d:D, 6w8j:A, 6w8j:D, 5yx2:A, 5yx2:D
6	8eih:D	256	189	0.5086	0.5781	0.7831	3.72e-96
7	8eih:D	256	25	0.0722	0.0820	0.8400	1.36e-05
8	2pv0:B	347	180	0.2062	0.1729	0.3333	2.99e-25	2pv0:A, 2pv0:C, 2pvc:B, 2pvc:A, 2pvc:C
9	7l4c:A	353	121	0.1478	0.1218	0.3554	1.57e-11	7l4f:B, 7l4f:A, 7l4h:A, 7l4k:A, 7l4m:B, 7l4m:A, 7l4n:A, 8t1u:A
10	7l4c:A	353	203	0.1924	0.1586	0.2759	1.26e-05	7l4f:B, 7l4f:A, 7l4h:A, 7l4k:A, 7l4m:B, 7l4m:A, 7l4n:A, 8t1u:A
11	4onj:B	333	90	0.1237	0.1081	0.4000	1.70e-09	4onj:A, 4onq:A, 4onq:B
12	4onj:B	333	213	0.1993	0.1742	0.2723	7.75e-06	4onj:A, 4onq:A, 4onq:B
13	3ubt:Y	328	128	0.1100	0.0976	0.2500	0.041	1dct:A, 1dct:B, 3ubt:B, 3ubt:A
14	10mh:A	327	117	0.1168	0.1040	0.2906	0.043	2c7o:A, 2c7p:A, 2c7q:A, 2c7r:A, 5ciy:A, 3eeo:A, 1fjx:A, 1hmy:A, 2hmy:B, 2hr1:A, 2i9k:A, 1m0e:A, 1mht:A, 3mht:A, 4mht:A, 5mht:A, 6mht:A, 7mht:A, 8mht:A, 9mht:A, 1skm:A, 1svu:B, 2uyc:A, 2uyh:A, 2uz4:A, 2z6a:A, 2z6q:A, 2z6u:A, 2zcj:A
15	8w0o:A	259	45	0.0584	0.0656	0.3778	1.0	8w0n:A, 8w0n:B, 8w0o:B, 8w0o:C, 8w0o:D, 8w0o:E, 8w0o:H, 8w0o:F, 8w0o:G
16	7znp:A	502	114	0.0962	0.0558	0.2456	1.2
17	3pt6:B	915	74	0.0653	0.0208	0.2568	2.2	4da4:A, 3pt6:A, 6w8v:A
18	3av4:A	1140	74	0.0653	0.0167	0.2568	2.3	3av5:A, 3av6:A, 4da4:B, 5gut:A, 5guv:A, 3pt9:A, 6w8v:B, 6w8w:A, 6w8w:B, 5wy1:A
19	7q3a:B	340	60	0.0653	0.0559	0.3167	4.3	7q3a:A
20	3swr:A	965	76	0.0619	0.0187	0.2368	4.6
21	4wxx:B	1178	76	0.0619	0.0153	0.2368	5.3	3epz:A, 3epz:B, 7lmk:A, 7lmk:B, 7lmk:C, 7lmk:D, 7lmm:A, 7lmm:B, 7lmm:C, 7lmm:D, 3pta:A, 7sfc:A, 7sfd:A, 7sfe:A, 7sff:A, 7sfg:A, 5wvo:C, 4wxx:A, 6x9i:A, 6x9j:A, 6x9k:A, 7xi9:A, 7xib:A, 5ydr:B, 4yoc:A
22	2fah:C	608	34	0.0481	0.0230	0.4118	5.9	2faf:A, 2faf:B, 2fah:D, 2fah:A, 2fah:B, 2qzy:A, 2qzy:B
23	7r7e:A	567	53	0.0481	0.0247	0.2642	7.1	7r7e:B, 7r7f:A, 7r7f:B, 7r7g:A, 7r7g:B
24	7ubu:A	708	64	0.0619	0.0254	0.2812	7.7	4ft4:A, 4ft4:B
25	3vma:A	708	47	0.0378	0.0155	0.2340	7.8	5fgz:A, 3fwl:A, 5hl9:A, 5hla:A, 6yn0:A
26	5hld:A	649	47	0.0378	0.0169	0.2340	7.8
27	5hlb:A	733	47	0.0378	0.0150	0.2340	7.9
28	4hiz:A	658	31	0.0447	0.0198	0.4194	8.6	4hiz:B, 4hiz:C
29	8ugp:1D	221	30	0.0481	0.0633	0.4667	8.7
30	8k49:T	627	34	0.0584	0.0271	0.5000	9.9	8k42:R, 8k42:S, 8k42:T, 8k42:U, 8k42:V, 8k42:W, 8k49:R, 8k49:S, 8w9p:R, 8w9p:S, 8w9p:T, 8w9p:U, 8w9p:V, 8w9p:W, 8w9q:R, 8w9q:S, 8w9q:T

[Back]