BioLiP

>protein
LYFQGMDYFRLAEKFLREMHAKYMKRVSRPGNTPRPWFDFSEERLLSRLFEEMDELREAVEKEDWENLRDELLDVANFCM
YLWGKLSV

The query sequence (length=88) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2p06:B	88	88	1.0000	1.0000	1.0000	4.48e-61	2p06:A
2	2yxh:A	114	41	0.2045	0.1579	0.4390	0.098	2yxh:B
3	5zvw:A	335	60	0.2386	0.0627	0.3500	2.5
4	8dwe:A	355	46	0.1477	0.0366	0.2826	4.3	8dvp:A, 8dvy:A, 8dw0:A, 8dw4:A, 8dw7:A, 8dw7:D, 8dwd:A, 8dwe:D, 8dwf:A, 8dwf:D, 3g0q:A, 5kn8:A, 5kn9:A, 6q0c:A, 1rrq:A, 1rrs:A, 6u7t:A, 1vrl:A, 4yoq:A, 4yph:A, 4ypr:A, 4ypr:B
5	4mag:A	307	42	0.1364	0.0391	0.2857	5.2	7a5q:A, 7a5q:B
6	9avv:D	429	28	0.1705	0.0350	0.5357	5.7	9avu:D, 9awj:D, 9awk:D
7	4eue:A	398	31	0.1250	0.0276	0.3548	6.0	4euf:A
8	6gov:B	139	55	0.1705	0.1079	0.2727	6.4	5lm7:B, 5lm7:D, 5ms0:L, 6tqn:B, 6tqo:B
9	3sxj:A	245	44	0.1591	0.0571	0.3182	7.5	3sxj:B, 3t0i:A, 3t0i:B
10	3rwl:A	404	46	0.1591	0.0347	0.3043	8.2
11	5uqe:D	507	34	0.1250	0.0217	0.3235	8.3	8bsk:A, 8bsl:A, 8bsl:B, 8bsl:C, 8bsl:D, 8bsm:A, 8bsn:A, 3czd:A, 8ec6:A, 8ec6:B, 8ec6:C, 8ec6:D, 8ec6:E, 8ec6:F, 8ec6:G, 8ec6:H, 5fi2:A, 5fi2:D, 5fi6:A, 5fi6:B, 5fi6:C, 5fi6:D, 5fi7:A, 5fi7:C, 8gwr:B, 5hl1:A, 5hl1:D, 5hl1:B, 5hl1:C, 5i94:A, 5i94:D, 5i94:B, 5i94:C, 4jkt:B, 4jkt:C, 4jkt:A, 4jkt:D, 8jub:A, 8jub:B, 8jub:C, 8jub:D, 8jue:A, 8jue:B, 8jue:C, 8jue:D, 5jyo:D, 5jyo:E, 5jyo:B, 5jyo:C, 5jyo:F, 5jyp:A, 6lox:A, 6lox:D, 6lox:B, 6lox:C, 4o7d:A, 7ren:A, 7ren:B, 7ren:C, 7ren:D, 7rgg:A, 7rgg:B, 7rgg:C, 7rgg:D, 7sbm:A, 7sbm:B, 7sbm:C, 7sbm:D, 7sbn:A, 7sbn:B, 7sbn:C, 7sbn:D, 3ss4:A, 3ss4:B, 3ss4:C, 3ss4:D, 3ss5:A, 3ss5:B, 3ss5:C, 3ss5:D, 8szj:A, 8szj:B, 8szj:C, 8szj:D, 8szj:E, 8szj:G, 8szj:I, 8szj:K, 8szj:F, 8szj:H, 8szj:J, 8szj:L, 6ujg:C, 6ujg:H, 6ujg:D, 6ujg:G, 6ujg:B, 6ujg:E, 6ujg:A, 6ujg:F, 6ujm:A, 6ujm:B, 6ujm:C, 6ujm:D, 6uk6:A, 6uk6:B, 6uk6:C, 6uk6:D, 6ukb:A, 6ukb:B, 6ul9:B, 6ul9:D, 6ula:A, 6ula:B, 6ula:C, 6ula:D, 6ula:F, 6ula:H, 6ula:E, 6ula:G, 6ulj:A, 6ulj:B, 6ulj:C, 6ulj:D, 6umc:C, 6umc:B, 6umd:B, 6umd:D, 6ume:A, 6ume:D, 6umf:A, 6umf:B, 6umf:C, 6umf:D, 3unw:A, 3unw:B, 3unw:C, 3unw:D, 3uo9:A, 3uo9:B, 3uo9:C, 3uo9:D, 5uqe:A, 5uqe:B, 5uqe:C, 5uqe:F, 3voz:A, 3vp0:A, 3vp1:A, 3vp2:A, 3vp3:A, 3vp4:A, 5w2j:B, 5wj6:A, 5wj6:C
12	1gqi:A	708	47	0.1591	0.0198	0.2979	9.3	1gqi:B, 1gqj:A, 1gqj:B, 1gqk:A, 1gqk:B, 1gql:A, 1gql:B, 1h41:A, 1h41:B

[Back]