Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LVLIRMKPDENGRFGFNVKGGYDQKMPVIVSRVAPGTPADLCVPRLNEGDQVVLINGRDIAEHTHDQVVLFIKASCERHS
GELMLLVRP

The query sequence (length=89) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5ez0:D 95 89 1.0000 0.9368 1.0000 3.89e-62 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
2 6hks:B 94 88 0.7191 0.6809 0.7273 2.40e-46 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
3 2pdz:A 86 72 0.2584 0.2674 0.3194 1.72e-10
4 7p70:A 407 85 0.3146 0.0688 0.3294 1.68e-09 7pc4:A, 7qql:A
5 4ydp:A 83 65 0.2697 0.2892 0.3692 2.50e-08 4ydp:B
6 4e34:A 87 68 0.2360 0.2414 0.3088 7.84e-08 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
7 5heb:A 119 64 0.2472 0.1849 0.3438 8.39e-07 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
8 7qqn:C 414 77 0.2697 0.0580 0.3117 3.46e-06 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
9 3jxt:A 96 60 0.2472 0.2292 0.3667 8.60e-06 3jxt:B
10 2r4h:C 98 65 0.2247 0.2041 0.3077 1.27e-05
11 2l4t:A 124 76 0.2697 0.1935 0.3158 1.83e-05 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
12 7d6f:A 87 65 0.2472 0.2529 0.3385 4.78e-05
13 2m0u:A 117 62 0.2472 0.1880 0.3548 7.16e-05
14 7p73:A 420 67 0.2921 0.0619 0.3881 1.08e-04 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
15 6xa7:B 96 69 0.2584 0.2396 0.3333 1.45e-04 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
16 1ihj:B 95 48 0.1798 0.1684 0.3333 6.33e-04 1ihj:A
17 4wyu:A 201 89 0.3146 0.1393 0.3146 0.002 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
18 7qqm:A 413 77 0.2472 0.0533 0.2857 0.003
19 2qt5:A 194 77 0.2360 0.1082 0.2727 0.003 2qt5:B
20 2qt5:A 194 68 0.2247 0.1031 0.2941 0.008 2qt5:B
21 7pcb:A 415 97 0.3483 0.0747 0.3196 0.006 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
22 2egn:A 83 73 0.2360 0.2530 0.2877 0.007
23 2i0i:A 81 47 0.1910 0.2099 0.3617 0.009 2i0i:B, 2i0i:C
24 5wou:A 95 47 0.2022 0.1895 0.3830 0.013
25 1rzx:A 98 69 0.2360 0.2143 0.3043 0.014 5i7z:A, 1x8s:A
26 7x2e:A 163 63 0.2360 0.1288 0.3333 0.017 2kbs:A
27 1n7t:A 103 79 0.2360 0.2039 0.2658 0.038 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
28 3bpu:A 86 78 0.2809 0.2907 0.3205 0.062
29 5n7d:A 423 56 0.2135 0.0449 0.3393 0.14 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
30 1u38:A 89 44 0.1798 0.1798 0.3636 0.26
31 8blu:B 195 59 0.2135 0.0974 0.3220 0.32 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
32 2kpl:A 129 61 0.2135 0.1473 0.3115 0.35
33 8bq8:C 93 85 0.2247 0.2151 0.2353 0.45 8bq8:A, 8bq8:B
34 7qct:A 90 34 0.1573 0.1556 0.4118 0.48 7qct:B
35 1zub:A 109 72 0.2472 0.2018 0.3056 0.51
36 6x23:A 89 75 0.2697 0.2697 0.3200 0.52
37 3tsz:A 341 58 0.2022 0.0528 0.3103 0.61 3shw:A
38 5ujv:A 192 39 0.1461 0.0677 0.3333 0.72 5ujv:B, 5ujv:C
39 2os6:A 89 69 0.2360 0.2360 0.3043 0.80
40 6ar4:B 87 70 0.2022 0.2069 0.2571 0.95 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
41 3ch8:A 190 70 0.2135 0.1000 0.2714 1.1 2qbw:A
42 2m0z:A 97 87 0.2472 0.2268 0.2529 1.3 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
43 5t63:A 283 43 0.1685 0.0530 0.3488 1.5 5b6l:A, 5gnd:A
44 4wsi:A 372 58 0.2135 0.0511 0.3276 1.6 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
45 6yx0:B 112 83 0.2584 0.2054 0.2771 2.2 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
46 2mnj:B 88 38 0.1124 0.1136 0.2632 2.3
47 3w3w:A 1028 25 0.1124 0.0097 0.4000 2.5 5h2v:A, 3w3x:A, 3w3y:A, 4zj7:A
48 7pc3:A 405 69 0.2022 0.0444 0.2609 2.9 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
49 1u96:A 69 22 0.1011 0.1304 0.4091 4.1
50 5tr1:A 606 57 0.1685 0.0248 0.2632 4.4 5tr1:B
51 2q5l:A 538 20 0.1236 0.0204 0.5500 6.0 2nxw:A, 2nxw:B, 2q5j:A, 2q5j:B, 2q5l:B, 2q5o:A, 2q5o:B, 2q5q:A, 2q5q:B
52 2ejy:A 85 30 0.1124 0.1176 0.3333 6.2
53 6agb:J 293 35 0.1236 0.0375 0.3143 7.5 6agb:I, 6ah3:I, 6ah3:J, 7c79:I, 7c79:J, 7c7a:I, 7c7a:J, 6w6v:I, 6w6v:J
54 1kit:A 757 54 0.1798 0.0211 0.2963 8.9 6eks:A, 6eku:A, 1w0o:A, 1w0p:A, 2w68:A, 2w68:B, 2w68:C
55 1php:A 394 32 0.1573 0.0355 0.4375 9.1

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218