BioLiP

>protein
LSRHWHTVVLASSDRSLIEEEGPFRNFIQNITVESGNLNGFFLTRKNGQCIPLYLTAFKTEEARQFKLNYYGTNDVYYES
SKPNEYAKFIFYNYHDGKVNVVANLFGRTPNLSNEIKKRFEEDFMNRGFRRENILDISEVDHC

The query sequence (length=143) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2ra6:C	143	143	1.0000	1.0000	1.0000	1.05e-105	2r74:A, 2r74:B, 2ra6:A, 2ra6:B, 2ra6:D
2	8aei:A	152	143	0.3497	0.3289	0.3497	7.63e-27	8aei:B
3	2a2g:A	158	143	0.3497	0.3165	0.3497	1.79e-25	2a2g:B, 2a2g:C, 2a2g:D
4	2dm5:A	157	139	0.3427	0.3121	0.3525	1.04e-23	1i05:A, 1jv4:A, 2nnd:A, 1qy1:A, 1qy2:A, 1yp6:A, 1znd:A, 1zne:A, 1zng:A, 1znh:A, 1znl:A
5	3kff:A	152	139	0.3217	0.3026	0.3309	8.15e-22	3kfg:A, 3kfh:A, 3kfi:A
6	8aej:A	160	144	0.3007	0.2687	0.2986	1.29e-16
7	1gm6:A	158	144	0.2727	0.2468	0.2708	1.26e-15
8	1dzm:A	149	150	0.2937	0.2819	0.2800	3.41e-10	1dzj:A, 1dzj:B, 1dzk:A, 1dzm:B, 1dzp:A, 1dzp:B, 1e00:A, 1e00:B, 1e02:A, 1e02:B, 1e06:A, 1e06:B, 1hqp:A
9	1bso:A	162	120	0.1958	0.1728	0.2333	1.25e-08	1b0o:A, 7bf7:AAA, 7bf8:BBB, 7bf9:AAA, 4dq3:A, 4dq4:A, 7er3:A, 7er3:B, 7er3:C, 7er3:D, 6ge7:A, 6gf9:A, 6gfs:A, 6ghh:A, 2gj5:A, 4gny:A, 1gx8:A, 1gx9:A, 1gxa:A, 4ib6:A, 4ib7:A, 4ib8:A, 4ib9:A, 4iba:A, 4kii:A, 7kot:A, 7kp5:AA1, 7kp5:BA1, 5lke:A, 5lkf:A, 4lzu:A, 4lzv:A, 6nkq:B, 3nq9:A, 5nuj:A, 5nuk:A, 5num:A, 5nun:A, 4omw:C, 4omw:D, 4omx:A, 7q19:AAA, 7q2n:AAA, 7q2n:BBB, 7q2o:AAA, 7q2o:BBB, 7q2p:AAA, 7q2p:BBB, 6t42:AAA, 6t44:AAA, 6t44:BBB, 3uew:A, 7wql:A, 7wql:B, 4y0p:A, 4y0q:A, 4y0r:A, 4y0s:A, 5y5c:A, 5y5c:B, 7z9z:AAA, 7za0:AAA, 7zcd:AAA
10	8epv:A	136	143	0.2867	0.3015	0.2867	4.87e-07
11	1g85:A	159	142	0.2448	0.2201	0.2465	1.76e-05	1g85:B, 1gt1:A, 1gt1:B, 1gt3:A, 1gt3:B, 1gt4:A, 1gt4:B, 1gt5:B, 2hlv:A, 1hn2:A, 1hn2:B, 1pbo:A, 1pbo:B
12	3eyc:B	140	130	0.2238	0.2286	0.2462	0.33	3eyc:C, 1xki:A
13	5nkn:A	172	60	0.1049	0.0872	0.2500	1.2	6z6z:A
14	6dsz:B	1072	32	0.0839	0.0112	0.3750	1.6
15	7ukn:A	1059	32	0.0839	0.0113	0.3750	1.7
16	3i7h:A	1114	32	0.0839	0.0108	0.3750	1.7	4a0b:A, 9bbe:A, 9bbg:A, 9bbh:A, 9bbi:A, 6dsz:A, 3i7k:A, 3i7l:A, 3i7n:A, 3i7o:A, 3i7p:A, 3i89:A, 3i8c:A, 3i8e:A, 3i8e:B
17	8bu1:D	827	32	0.0839	0.0145	0.3750	1.8	8bu1:A, 8bu1:G, 8bu2:A, 8bu2:D, 8bu2:G, 8bu3:A, 8bu3:D, 8bu3:G, 8bu4:A, 8bu4:D, 8bu4:G, 8bu5:A, 8bu5:D, 8bu5:G, 8bu6:G, 8bu6:D, 8bu6:A, 8bu7:A, 8bu7:D, 8bu7:G, 8bua:A, 8bua:D, 8bua:G, 8bub:A, 8bub:D, 8bub:G, 8buc:A, 8buc:D, 8buc:G, 8bud:A, 8bud:D, 8bud:G, 8bue:A, 8bue:D, 8bue:G, 8buf:D, 8bug:A, 8bug:D, 8bug:G, 8buh:A, 8buh:D, 8buh:G, 8bui:A, 8bui:D, 8bui:G, 8buj:A, 8buj:G, 8buk:D, 8bul:A, 8bul:D, 8bul:G, 8bum:A, 8bum:D, 8bum:G, 8bun:A, 8bun:D, 8bun:G, 8buo:A, 8buo:D, 8buo:G, 8bup:A, 8bup:D, 8bup:G, 8buq:A, 8buq:D, 8buq:G, 8bur:D, 8bur:A, 8bur:G, 8bus:D, 8bus:A, 8bus:G, 8but:A, 8but:D, 8but:G, 6td3:A, 6td3:D, 6td3:G
18	8tl6:A	798	32	0.0839	0.0150	0.3750	1.9	8g46:A
19	8aeh:AA1	118	108	0.1888	0.2288	0.2500	2.3
20	1v03:A	487	41	0.0839	0.0246	0.2927	3.7
21	6z2c:A	178	60	0.1049	0.0843	0.2500	4.6	6z2c:B, 6z2c:C
22	6gr0:A	173	60	0.1049	0.0867	0.2500	4.8	6gr0:B, 6gr0:C
23	4iaw:A	180	60	0.1049	0.0833	0.2500	5.0	3dsz:A, 3dsz:B, 4iaw:B, 4iaw:C, 4iax:A
24	6bhd:A	217	28	0.0629	0.0415	0.3214	5.3	6au2:A, 6au3:A, 6bhe:A, 6bhg:A, 6bhh:A, 6bhi:A, 6bpi:A, 7c9n:B, 7c9n:A, 7caj:D, 7caj:A, 7cd9:A, 7cd9:B, 7cjt:D, 7cjt:A, 7cjt:B, 7cjt:C, 8g5e:A, 5kch:A, 5kco:A, 5ke2:A, 5ke3:A, 5kh6:A, 5qt1:A, 5qt2:A, 8uwp:A, 8uwp:B
25	4qae:B	175	60	0.1049	0.0857	0.2500	7.6	4qae:A, 4qae:C, 4qae:D, 4qae:F, 4qae:E

[Back]