BioLiP

>protein
LSEYAVRMSRLSARLFGEVARPTDSKSMKVVKLFSEQPLAKRKETYDWYPNHNTYFALMGTLRFLGLYRDEHQDFRDEQL
RLKKLRGKGKPRKGEGKRA

The query sequence (length=99) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7pnt:Z	101	99	0.9192	0.9010	0.9192	1.22e-64	5aj3:i, 5aj4:Ai, 6gaw:Ai, 6gaz:Ai, 7nqh:Ai, 7nql:Ai, 7nsi:Ai, 7nsj:Ai, 8oin:AZ, 8oip:AZ, 7pnu:Z, 7pnv:Z, 7pnw:Z, 6ydp:Ai, 6ydw:Ai
2	3jd5:i	98	98	0.9192	0.9286	0.9286	5.96e-64	6neq:i, 6nf8:i
3	8any:AZ	100	86	0.7576	0.7500	0.8721	2.72e-50	7a5f:Z6, 7a5g:Z6, 7a5i:Z6, 7a5k:Z6, 8cst:Z, 8csu:Z, 3j9m:AZ, 8k2a:Si, 7l08:AZ, 6nu2:AZ, 6nu3:AZ, 7og4:AZ, 8oir:AZ, 8ois:AZ, 7p2e:Z, 7pnx:Z, 7pny:Z, 7pnz:Z, 7po0:Z, 7po1:Z, 7po2:Z, 7po3:Z, 7qi4:AZ, 7qi5:AZ, 7qi6:AZ, 8qrk:Z, 8qrl:Z, 8qrm:Z, 8qrn:Z, 6rw4:Z, 6rw5:Z, 6vlz:AZ, 6vmi:AZ, 8xt0:Si, 8xt2:Si, 6zm5:AZ, 6zm6:AZ, 6zs9:AZ, 6zsa:AZ, 6zsb:AZ, 6zsc:AZ, 6zsd:AZ, 6zse:AZ, 6zsg:AZ
4	1fat:B	233	21	0.1212	0.0515	0.5714	0.66	1fat:A, 1fat:C, 1fat:D, 1g8w:A, 1g8w:B, 1g8w:C, 1g8w:D
5	1v7v:A	779	19	0.1212	0.0154	0.6316	4.3	1v7w:A, 1v7x:A
6	2qlw:B	108	23	0.0909	0.0833	0.3913	4.6	2qlx:A, 2qlx:B
7	8om2:X	98	89	0.2323	0.2347	0.2584	6.9	8d8k:X, 8d8l:X, 5mrc:XX, 5mre:XX, 5mrf:XX, 8om3:X, 8om4:X
8	3m6w:A	460	26	0.1212	0.0261	0.4615	7.7	3m6v:A, 3m6v:B
9	4a0a:B	355	34	0.1111	0.0310	0.3235	7.7	4a08:B, 4a09:B, 4a0b:B, 4a0b:D, 4a0k:D, 4a0l:B, 4a0l:D, 3ei1:B, 3ei2:B
10	7t2r:D	447	33	0.1212	0.0268	0.3636	8.3	7t2r:I, 7t30:D, 7t30:I
11	7td5:B	373	52	0.1414	0.0375	0.2692	8.5	6c23:L, 6c24:L, 5gsa:A, 5gsa:B, 5h13:A, 5h14:B, 5h14:A, 5h15:A, 5h15:B, 5h17:A, 5h19:A, 5h24:A, 5h24:B, 5h25:A, 5h25:B, 5hyn:B, 5hyn:G, 5hyn:L, 5hyn:R, 3iiw:A, 3iiy:A, 3ij0:A, 3ij1:A, 3ijc:A, 5ij7:E, 5ij7:F, 5ij8:F, 5ij8:E, 3jpx:A, 3jzg:A, 3jzh:A, 5k0m:A, 3k26:A, 3k27:A, 7kxt:A, 7kxt:B, 6lo2:A, 6lo2:B, 5ls6:B, 5ls6:E, 5ls6:H, 5ls6:K, 7msb:A, 7msd:A, 7p3c:A, 7p3c:B, 7p3g:A, 7p3g:B, 7p3j:A, 7p3j:B, 7qjg:B, 7qjg:A, 7qju:A, 7qju:B, 7qk4:A, 2qxv:A, 6sfb:A, 6sfb:B, 6sfc:A, 6sfc:B, 7si4:A, 7si5:A, 8t9g:K, 7td5:G, 5ttw:A, 5ttw:C, 5u5h:A, 5u5k:A, 5u5t:A, 5u5t:B, 5u62:A, 5u62:B, 5u69:A, 5u6d:A, 5u8a:A, 5u8f:A, 6v3x:A, 6v3y:A, 6w7f:A, 6w7g:A, 5wuk:A, 4x3e:A, 6yvi:A, 6yvi:B, 6yvj:A, 6yvj:B
12	3c8e:A	284	33	0.1515	0.0528	0.4545	9.4	3c8e:B

[Back]