Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LRPSGTVSCPICMDGYSEIVQNGRLIVSTECGHVFCSQCLRDSLKNANTCPTCRKKINHKRYHPIYI

The query sequence (length=67) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5ait:A 129 64 0.9552 0.4961 1.0000 1.55e-42 5aiu:A, 4ap4:A, 3ng2:A, 3ng2:B, 4ppe:A, 4ppe:B, 2xeu:A
2 5ait:A 129 64 0.9552 0.4961 1.0000 1.55e-42 5aiu:A, 4ap4:A, 3ng2:A, 3ng2:B, 4ppe:A, 4ppe:B, 2xeu:A
3 2ea6:A 69 60 0.8955 0.8696 1.0000 2.46e-40
4 7bbd:B 160 59 0.3433 0.1437 0.3898 3.20e-07 8a58:C, 8a58:D, 8c07:I, 8f1f:C, 8f1f:c, 6fga:A, 6fga:B, 6fga:C, 6fga:D, 6fga:E, 6fga:F, 6fga:G, 6fga:H, 5m93:B, 5m93:C, 7nbb:C, 5o44:E, 6s53:B, 6s53:A, 6s53:H, 6s53:G, 3zlz:B
5 5olm:B 132 59 0.3433 0.1742 0.3898 4.71e-07 5jpx:A, 5olm:A
6 6wi7:A 206 56 0.3433 0.1117 0.4107 1.30e-06 2ckl:A, 8grm:M, 2h0d:A, 7nd1:H, 8pp7:K, 8pp7:M, 4r8p:K, 4r8p:M, 3rpg:B, 6wi8:A, 6wi8:B
7 6wi7:A 206 32 0.1642 0.0534 0.3438 0.50 2ckl:A, 8grm:M, 2h0d:A, 7nd1:H, 8pp7:K, 8pp7:M, 4r8p:K, 4r8p:M, 3rpg:B, 6wi8:A, 6wi8:B
8 4r8p:L 254 54 0.3433 0.0906 0.4259 1.30e-06 2ckl:B, 8grm:N, 2h0d:B, 7nd1:A, 8pp7:L, 8pp7:N, 4r8p:N, 3rpg:C, 4s3o:B, 4s3o:E
9 7t92:C 317 29 0.1940 0.0410 0.4483 1.49e-05
10 2lxh:C 58 51 0.2985 0.3448 0.3922 2.46e-05 2lxp:C
11 4orh:H 142 59 0.2985 0.1408 0.3390 3.27e-05 4ayc:A, 4ayc:B, 4orh:C, 4orh:G, 4orh:K, 4orh:L, 4whv:C, 4whv:D, 4whv:I, 4whv:J
12 5din:B 124 34 0.2239 0.1210 0.4412 8.58e-05 5din:A
13 2ct2:A 88 52 0.2985 0.2273 0.3846 1.56e-04 5fey:A, 5fey:B
14 5dka:A 96 29 0.2687 0.1875 0.6207 1.99e-04 5dka:B, 8gbq:B, 8gcb:B
15 4lad:B 69 47 0.2836 0.2754 0.4043 2.88e-04
16 4txa:A 367 52 0.2836 0.0518 0.3654 4.01e-04 5f5f:A, 5f5f:G, 5f5f:C, 5f5f:E, 5f5h:A, 5f5h:B, 4qi2:A, 4qi2:B, 4qi2:C, 4qi2:D, 4qik:A, 4qik:B, 4qil:B, 4qil:A, 6tqa:A, 6tqa:B, 6tqa:C, 6tqa:D, 6tqb:A, 4ywq:A, 4zld:A
17 2ect:A 78 51 0.2239 0.1923 0.2941 0.001
18 7xyz:B 456 53 0.2388 0.0351 0.3019 0.002 7xv2:A, 7xyy:A, 7xyy:B, 7xyz:A, 7xyz:C, 7xyz:D, 7xz0:A, 7xz0:B, 7xz1:A, 7xz1:B, 7xz2:A, 7xz2:B, 7xz2:C, 7xz2:D
19 7jzv:A 253 57 0.2836 0.0751 0.3333 0.002 8grq:K, 1jm7:A, 7lyb:M
20 6a3z:A 56 47 0.2239 0.2679 0.3191 0.002
21 5vo0:D 159 58 0.2836 0.1195 0.3276 0.002 5vnz:A, 5vnz:D, 5vo0:A
22 2eci:A 86 58 0.2836 0.2209 0.3276 0.003
23 8gui:L 73 42 0.2388 0.2192 0.3810 0.004 8guj:L, 8iej:A
24 2ecv:A 85 54 0.2836 0.2235 0.3519 0.004
25 5eya:G 86 51 0.2687 0.2093 0.3529 0.004 5eya:F, 5fer:A, 5fer:D
26 6l8n:A 810 59 0.2687 0.0222 0.3051 0.005
27 2ecm:A 55 51 0.2537 0.3091 0.3333 0.006
28 3hcs:A 157 50 0.2687 0.1146 0.3600 0.009 3hcs:B, 3hct:A, 3hcu:A, 3hcu:C, 8hz2:A, 8hz2:B, 2jmd:A, 7l3l:B, 7l3l:D
29 4tkp:B 63 58 0.2687 0.2857 0.3103 0.010
30 8eaz:A 254 42 0.2239 0.0591 0.3571 0.013 8bvl:A, 8bvl:B, 8eaz:B, 7yuj:A, 7yuj:B
31 8gui:K 72 42 0.2239 0.2083 0.3571 0.016 8guj:K, 8iej:M, 5trb:A
32 7yui:B 232 47 0.2239 0.0647 0.3191 0.017 3b08:K, 3b08:B, 3b08:E, 3b08:H, 3b0a:B
33 2ecn:A 70 49 0.2239 0.2143 0.3061 0.019 5xek:A
34 4s3o:C 95 30 0.1642 0.1158 0.3667 0.019 4s3o:F
35 4r7e:A 69 48 0.2090 0.2029 0.2917 0.022 8ieg:A, 8ieg:B, 8t3t:K, 8t3t:L, 8t3w:K, 8t3w:L, 8t3y:K, 8t3y:L
36 5zbu:A 74 50 0.2388 0.2162 0.3200 0.030 5zbu:D, 5zc4:A, 5zc4:D
37 1iym:A 55 51 0.2239 0.2727 0.2941 0.035
38 2l0b:A 91 46 0.2388 0.1758 0.3478 0.046
39 2ecw:A 85 54 0.2985 0.2353 0.3704 0.050
40 5o6c:A 252 59 0.2836 0.0754 0.3220 0.052 6t7f:A
41 6w7z:B 71 50 0.2090 0.1972 0.2800 0.055 6w9a:B, 6w9a:D, 6w9d:B, 6w9d:E, 6w9d:H
42 6f98:A 78 24 0.1493 0.1282 0.4167 0.062
43 7dco:M 176 50 0.2239 0.0852 0.3000 0.076 5gm6:a
44 6yxe:A 89 67 0.2687 0.2022 0.2687 0.081 6yxe:B
45 1z6u:A 115 34 0.2090 0.1217 0.4118 0.082 1z6u:B
46 6k2k:A 57 60 0.2985 0.3509 0.3333 0.082 6m2c:E, 6m2c:F, 6m2c:G, 6m2c:H, 6m2d:A, 6m2d:B, 6m2d:C, 6m2d:D, 6m2d:E, 6m2d:F
47 4v3k:C 75 51 0.2388 0.2133 0.3137 0.089 7ojx:A, 4v3k:F, 4v3l:C
48 2y43:A 88 47 0.2388 0.1818 0.3404 0.094 2y43:B
49 5h7r:D 124 31 0.1791 0.0968 0.3871 0.095 5h7s:D, 5h7s:B
50 5j3x:B 389 60 0.2687 0.0463 0.3000 0.100 4a4b:A, 4a4c:A, 1b47:A, 1b47:B, 1b47:C, 3bum:B, 3bun:B, 3buo:B, 3buo:D, 3buw:B, 3buw:D, 3bux:B, 3bux:D, 2cbl:A, 1fbv:A, 4gpl:B, 5hkx:A, 5hky:A, 5hkz:A, 5hl0:A, 5j3x:A, 5j3x:C, 5j3x:D, 5j3x:E, 5j3x:F, 2k4d:A, 5o76:A, 5o76:C, 3ob1:B, 3ob2:B, 3plf:B, 3plf:D, 7siy:A, 6xar:A, 6xar:B, 2y1m:A, 2y1m:B, 2y1m:C, 2y1m:D, 2y1m:E, 2y1m:F, 2y1n:A, 2y1n:C, 1yvh:A
51 3zni:A 390 60 0.2687 0.0462 0.3000 0.10 4a49:A, 5axi:B, 5axi:A, 5axi:C, 9fqh:A, 9fqi:A, 9fqj:A, 9fqj:B, 8gcy:A, 2ldr:A, 3pfv:A, 3pfv:B, 8qng:A, 8qnh:A, 8qni:A, 8qtg:A, 8qth:A, 8qtj:A, 8qtk:A, 8vw4:A, 8vw4:B, 8vw5:A, 8vw5:B, 3zni:E, 3zni:I, 3zni:M
52 6sc6:A 365 60 0.2836 0.0521 0.3167 0.11 5edv:A, 5edv:B, 6gzy:A, 6gzy:B, 6kc5:B, 6kc6:A, 6kc6:C, 6kc6:E, 6kc6:G, 6kc6:I, 6kc6:K, 4ljo:A, 4ljp:A, 4ljq:B, 4ljq:C, 4ljq:A, 4ljq:D, 6sc5:A, 6sc7:A, 6sc8:A, 6sc9:A, 7v8f:B, 7v8g:D, 7v8g:C
53 1chc:A 68 50 0.2090 0.2059 0.2800 0.12
54 8fgw:C 1342 66 0.2388 0.0119 0.2424 0.17 8fh3:C
55 2yur:A 74 28 0.1642 0.1486 0.3929 0.18
56 1weo:A 93 57 0.2239 0.1613 0.2632 0.21
57 8aaf:e 1527 62 0.3134 0.0138 0.3387 0.28 8agt:e, 8agu:e, 8agv:e, 8agw:e, 8agx:e, 8agz:e
58 2djb:A 72 33 0.1642 0.1528 0.3333 0.28
59 3ztg:A 92 27 0.1642 0.1196 0.4074 0.29 3ztg:B
60 1v33:A 346 28 0.1940 0.0376 0.4643 0.30 1v34:A
61 2ysl:A 73 54 0.2687 0.2466 0.3333 0.34 2ysj:A
62 1x4j:A 75 46 0.2239 0.2000 0.3261 0.38
63 4kbl:A 395 41 0.2090 0.0354 0.3415 0.43 4kbl:B, 5udh:B
64 7oni:R 86 44 0.2090 0.1628 0.3182 0.43 2ecl:A, 6v9i:R
65 7r76:A 1834 27 0.1194 0.0044 0.2963 0.44 7r77:A
66 4qpl:A 153 31 0.1791 0.0784 0.3871 0.48 4qpl:C, 3v3l:A, 3v3l:B
67 2d8t:A 71 31 0.1791 0.1690 0.3871 0.50
68 2i4g:A 289 20 0.1493 0.0346 0.5000 0.60 2h02:A, 2h02:B, 2h03:A, 2h04:A, 2i4h:A, 2i5x:A, 2i5x:B, 8jbn:B, 8jby:A, 8jby:B
69 7r70:A 150 50 0.2090 0.0933 0.2800 0.60 5d0i:A, 5d0i:B, 5d0k:C, 5d0k:F, 5d0k:I, 5d0k:L, 7r70:B, 7r71:A
70 8ouw:4 619 42 0.1940 0.0210 0.3095 0.61
71 2ecy:A 66 30 0.1791 0.1818 0.4000 0.67
72 1rmd:A 116 50 0.2537 0.1466 0.3400 0.69
73 5d0m:C 60 51 0.2239 0.2500 0.2941 0.71 5ulh:C, 5ulk:C
74 4auq:B 57 53 0.2090 0.2456 0.2642 0.78 4auq:E
75 7ynx:A 188 47 0.2239 0.0798 0.3191 0.78 2jrj:A, 7ynx:B
76 7l3l:A 141 26 0.1940 0.0922 0.5000 0.84 7l3l:C
77 2kiz:A 69 52 0.2239 0.2174 0.2885 0.85 5lg0:A, 5lg7:A, 7p2k:A
78 7zj3:A 86 50 0.2239 0.1744 0.3000 0.88 8a38:A, 8a38:B, 8a38:C, 8ams:C, 8ams:D, 7zj3:D, 7zj3:G, 7zj3:J
79 2ecj:A 58 50 0.2388 0.2759 0.3200 1.6
80 6xyw:Ae 144 26 0.1493 0.0694 0.3846 1.7
81 1g71:A 344 28 0.1642 0.0320 0.3929 2.1 1g71:B
82 8a22:Ah 186 30 0.1343 0.0484 0.3000 3.3 8apn:Ah, 8apo:Ah
83 5tte:B 442 41 0.1940 0.0294 0.3171 3.5 7b5m:H, 2m9y:A, 1wd2:A
84 7mla:A 67 34 0.1940 0.1940 0.3824 3.6 5mnj:D, 5mnj:H, 2vje:B, 2vje:D, 2vjf:B, 2vjf:D
85 7t02:A 1752 13 0.1045 0.0040 0.5385 4.2
86 7r78:A 1880 13 0.1045 0.0037 0.5385 4.2
87 7b5l:H 423 36 0.1940 0.0307 0.3611 4.2 7b5n:H, 4kc9:A, 5udh:A
88 3hkz:D 264 31 0.1642 0.0417 0.3548 4.3 4ayb:D, 3hkz:O, 2pa8:D, 2pmz:D, 2pmz:S, 4v8s:AS, 4v8s:BD, 2waq:D, 2wb1:D, 2wb1:S, 2y0s:D, 2y0s:S
89 1jm7:B 97 37 0.1940 0.1340 0.3514 4.5 8grq:M, 7jzv:B, 7lyb:N
90 1joc:A 123 50 0.2687 0.1463 0.3600 5.6 1hyi:A, 1hyj:A, 1joc:B
91 6uca:D 416 43 0.2537 0.0409 0.3953 5.7 6uca:A, 6uca:B, 6uca:C, 6uca:E, 6uca:F
92 4cuk:A 330 48 0.1940 0.0394 0.2708 6.2 4cuk:D
93 2yho:E 70 32 0.1493 0.1429 0.3125 6.8 2yhn:A, 2yhn:B, 2yho:A, 2yho:C, 2yho:G
94 5aie:A 54 53 0.2090 0.2593 0.2642 7.2
95 2ma6:A 61 49 0.2388 0.2623 0.3265 7.2
96 7dvq:M 191 32 0.1493 0.0524 0.3125 7.8 8i0r:K, 8i0s:K, 8i0t:K, 5z56:M, 5z58:M
97 5caw:C 315 38 0.1940 0.0413 0.3421 7.8 5caw:A
98 7oik:A 4426 28 0.1493 0.0023 0.3571 7.9 7oim:A, 6tax:A, 6tay:A
99 6ff4:t 172 32 0.1493 0.0581 0.3125 8.7 8ch6:Z, 6ff7:t, 7qtt:Z
100 7x6v:B 48 53 0.1940 0.2708 0.2453 8.7
101 3a22:A 614 26 0.1343 0.0147 0.3462 9.8 3a22:B, 3a23:A, 3a23:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417