BioLiP

>protein
LRENILFGMGNPLLDISAVVDKDFLDKYSLKPNDQILAEDKHKELFDELVKKFKVEYHAGGSTQNSIKVAQWMIQQPHKA
ATFFGCIGIDKFGEILKRKAAEAHVDAHYYEQNEQPTGTCAACITGDNRSLIANLAAANCYKKEKHLDLEKNWMLVEKAR
VCYIAGFFLTVSPESVLKVAHHASENNRIFTLNLSAPFISQFYKESLMKVMPYVDILFGNETEAATFAREQGFETKDIKE
IAKKTQALPKMNSKRQRIVIFTQGRDDTIMATESEVTAFAVLDQDQKIDTNGAGDAFVGGFLSQLVSDKPLTECIRAGHY
AASIII

The query sequence (length=326) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2i6a:A	343	328	0.9969	0.9475	0.9909	0.0	1bx4:A, 2i6a:B, 2i6a:C, 2i6a:D, 2i6b:A, 2i6b:B, 5kb5:A, 5kb6:A, 5kb6:B, 4o1l:A, 4o1l:B
2	3loo:B	341	330	0.5215	0.4985	0.5152	1.74e-119	3loo:A, 3loo:C
3	4n09:A	345	320	0.3957	0.3739	0.4031	4.20e-75	4n09:B, 4n09:C, 4n09:D, 3otx:A, 3otx:B, 2xtb:A
4	3uq6:A	345	333	0.4018	0.3797	0.3934	1.38e-74	4dc3:A, 4dc3:B, 3uq6:B, 3uq9:A, 3uq9:B, 3vaq:A, 3vaq:B, 3vas:A, 3vas:B
5	2a9y:A	351	343	0.3344	0.3105	0.3178	4.35e-48	2a9z:A, 2aa0:A, 2ab8:A, 2abs:A, 1dgm:A, 1lii:A, 1lij:A, 1lik:A
6	3ubo:A	338	331	0.2577	0.2485	0.2538	1.84e-15	3ubo:B
7	4k8p:A	332	327	0.2546	0.2500	0.2538	5.00e-14	4e3a:A, 4e3a:B, 4jks:A, 4jks:B, 4jku:A, 4jku:B, 4k8c:A, 4k8c:B, 4k8k:A, 4k8k:B, 4k8p:B, 4k8t:A, 4k8t:B, 4k93:A, 4k93:B, 4k9c:A, 4k9c:B, 4k9i:A, 4k9i:B, 4kad:A, 4kad:B, 4kah:A, 4kah:B, 4kal:A, 4kal:B, 4kan:A, 4kan:B, 4kbe:A, 4kbe:B, 4lbg:A, 4lbg:B, 4lbx:A, 4lbx:B, 4lc4:A, 4lc4:B, 4lca:A, 4lca:B
8	1gqt:B	307	235	0.1902	0.2020	0.2638	4.86e-12	1gqt:A, 1gqt:C, 1gqt:D, 1rk2:A, 1rk2:B, 1rk2:C, 1rk2:D, 1rkd:A, 1rks:A
9	2c49:A	299	274	0.1871	0.2040	0.2226	1.06e-08	2c49:B
10	6wb7:A	296	81	0.0951	0.1047	0.3827	2.42e-07	6wb7:B, 6wb7:C, 6wb7:D
11	6ils:B	313	252	0.1718	0.1789	0.2222	4.90e-07	6ils:A, 6ilt:A, 6ilt:B
12	8cqx:A	300	299	0.2086	0.2267	0.2274	1.97e-06	8cqx:B, 8cqx:C, 8cqx:D, 6znx:A, 6znx:B, 6znx:D
13	5c41:A	317	221	0.1626	0.1672	0.2398	2.76e-06	5byf:A, 5byf:B, 5c3y:A, 5c3y:B, 5c3y:C, 5c3y:D, 5c3y:E, 5c3y:F, 5c3y:G, 5c3y:H, 5c3y:I, 5c3y:J, 5c3y:K, 5c3y:L, 5c3z:A, 5c3z:B, 5c40:A, 5c40:B, 5c41:B, 5c41:C, 5c41:D, 2fv7:A, 2fv7:B, 6wjz:A, 6wjz:B, 6wk0:A, 6wk0:B, 6wk0:C, 6wk0:D
14	3in1:A	312	287	0.2025	0.2115	0.2300	5.75e-06	3in1:B
15	6znx:C	265	278	0.2025	0.2491	0.2374	9.12e-06
16	1v1a:A	301	279	0.1963	0.2126	0.2294	1.27e-05	1v1a:B, 1v1b:A, 1v1b:D, 1v1b:B, 1v1b:C
17	3ih0:A	304	259	0.1871	0.2007	0.2355	2.48e-05	3gbu:A, 3gbu:B, 3gbu:C, 3gbu:D
18	4xck:A	306	238	0.1810	0.1928	0.2479	7.46e-05	4xck:B, 4xck:C, 4xck:D, 4xda:A, 4xda:B, 4xda:C, 4xda:D
19	6a8a:A	327	135	0.1104	0.1101	0.2667	1.01e-04	6a8a:B, 6a8b:A, 6a8b:B, 6a8c:A, 6a8c:B, 5zwy:A, 5zwy:B
20	3kd6:A	300	139	0.1074	0.1167	0.2518	7.03e-04	3kd6:B
21	6vwp:A	435	239	0.1626	0.1218	0.2218	0.005	6vwo:A, 6vwp:B, 6vwp:C, 6vwp:D, 6vwp:E, 6vwp:F, 6vwp:G, 6vwp:H
22	3ie7:A	309	31	0.0399	0.0421	0.4194	0.18	3jul:A
23	2var:A	311	279	0.1840	0.1929	0.2151	0.23	2var:B, 2var:C
24	5ygg:A	310	51	0.0644	0.0677	0.4118	0.26	5eyn:A, 5f0z:A, 5f11:A
25	6xk2:A	320	43	0.0491	0.0500	0.3721	0.37	6xk2:B, 6xk2:C, 6xk2:D
26	1tz3:A	299	46	0.0583	0.0635	0.4130	1.2	1tz6:A, 1tz6:B
27	3ktn:A	340	174	0.1104	0.1059	0.2069	1.8
28	4wjm:A	312	59	0.0583	0.0609	0.3220	2.2
29	3b1n:B	320	137	0.0951	0.0969	0.2263	2.9	3b1n:A, 3b1p:A, 3b1q:A, 3b1q:B, 3b1q:C, 3b1q:D, 3b1q:E, 3b1q:F, 3b1r:A, 3b1r:B, 3b1r:C, 3b1r:D, 3b1r:E, 3b1r:F
30	2w3z:A	238	34	0.0460	0.0630	0.4412	3.6
31	8v3w:H	581	20	0.0337	0.0189	0.5500	3.8	8v3w:x, 8v3w:b
32	3lki:B	322	53	0.0613	0.0621	0.3774	5.8
33	4idb:A	321	49	0.0552	0.0561	0.3673	5.8	4idc:A, 4idd:A, 4ide:A, 4idf:A
34	4gw9:A	628	29	0.0337	0.0175	0.3793	7.5	4gw9:B, 4gw9:C, 4gw9:D, 5oy5:A, 5vik:A, 5viq:A, 5viv:A, 4xtq:A
35	3din:A	816	95	0.0798	0.0319	0.2737	7.7	3din:B, 3jux:A, 4ys0:A
36	6wb4:B	306	15	0.0307	0.0327	0.6667	9.8	6wb4:A, 6wb5:A, 6wb5:B

[Back]