BioLiP

>protein
LPVEKIIREAKKILDELLKRGLIDPELARIAREVLERARKLGNEEAARFVLELIERLRRELS

The query sequence (length=62) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8gqp:A	62	62	1.0000	1.0000	1.0000	1.50e-34	8gqp:C, 7yh8:A, 7yh8:C
2	8gad:A	105	38	0.2258	0.1333	0.3684	0.065	8gad:B
3	1fz0:C	388	39	0.2419	0.0387	0.3846	0.11	1fz1:C, 1fz2:C, 1fz8:C, 1fz8:D, 1fz9:D, 1fz9:C, 1xmf:C, 1xve:C, 1xvf:D, 1xvg:C, 1xvg:D
4	4fzf:B	279	49	0.2258	0.0502	0.2857	0.67	7b36:A, 7b36:C, 3ggf:A, 3ggf:B
5	7k3u:A	362	36	0.1613	0.0276	0.2778	1.3	7k3u:B, 7k3u:C, 7k3u:D, 7k3u:E, 7k3u:F, 7k3u:G, 7k3u:H, 7k3u:I, 7k3u:J, 7n02:A, 7n02:B, 6xmr:A, 6xmr:B, 4zng:C, 4zng:B, 4zng:A
6	3bul:A	577	38	0.2419	0.0260	0.3947	2.1	6bdy:A, 1bmt:A, 1bmt:B, 6bm5:A, 6bm6:A, 3iv9:A, 3iva:A, 1k7y:A, 1k98:A, 1msk:A
7	8cja:B	731	49	0.2903	0.0246	0.3673	3.1	8cjb:B, 8cjc:B, 8cmw:B, 7nyp:A, 7nyp:B, 7nys:A, 7nys:B, 7nz5:A, 7nz5:B, 7o0d:A, 1ru3:A, 7zkj:B, 7zkk:B, 7zkv:B
8	4wcx:A	454	51	0.2581	0.0352	0.3137	3.2	4wcx:C
9	7dxg:A	698	55	0.2258	0.0201	0.2545	3.4	7dxf:A, 7dxf:D, 7dxf:B, 7dxf:C, 7dxg:D, 7dxg:C, 7dxg:B
10	6d5d:A	627	27	0.1774	0.0175	0.4074	4.8	4el8:A, 4l0g:A, 4txt:A
11	3a09:A	490	40	0.2097	0.0265	0.3250	5.5	3vlu:A, 3vlv:A, 3vlw:A, 3vlw:B, 1y3n:A, 1y3p:A, 1y3q:A
12	1zs4:A	82	18	0.1290	0.0976	0.4444	5.6	8igr:A, 8igr:C, 8igr:B, 8igr:D, 1zs4:C, 1zs4:B, 1zs4:D
13	5dll:A	854	29	0.1935	0.0141	0.4138	6.0
14	1a6e:A	503	52	0.2419	0.0298	0.2885	6.2
15	6uz8:A	734	56	0.2581	0.0218	0.2857	6.4	6uz8:D, 6uz8:C, 6uz8:B, 6uza:A, 6uza:B, 6uza:C, 6uza:D
16	5gud:E	460	43	0.2419	0.0326	0.3488	7.1	5gud:A, 5gud:B, 5gud:C, 5gud:D, 5gud:F, 5ijz:A, 5ijz:B, 5ijz:C, 5ijz:D, 5ijz:E, 5ijz:F, 5ijz:G, 5ijz:H, 5ijz:J
17	4lrt:B	295	34	0.2581	0.0542	0.4706	8.2	4lrs:B, 4lrt:D
18	3qxe:A	201	49	0.2258	0.0697	0.2857	9.3	3qxe:C, 3qxe:E, 3qxe:G, 3qyg:A, 3qyg:C, 3qyg:E, 3qyg:G, 3qyh:A, 3qyh:C, 3qyh:E, 3qyh:G, 3qz5:A, 3qz5:C, 3qz5:E, 3qz5:G, 3qz9:A, 3qz9:C, 3qz9:E, 3qz9:G
19	6jam:A	406	43	0.2419	0.0369	0.3488	9.4	6j9w:A, 6j9y:A, 6jad:A, 6jag:A, 6jah:A, 6jai:A, 6jan:A, 6jao:A, 6jap:A, 6jaq:A, 6jar:A, 6jaz:A, 6jb0:A, 6jb4:A, 6jba:A, 6jbb:A, 6jbe:A
20	6jta:A	1298	27	0.1452	0.0069	0.3333	9.4	7dw7:A, 6jt7:A, 6jt8:A, 6jt9:A, 4l78:A, 4lgy:A, 6lyk:A, 6lyl:A, 6lym:A, 6lyo:A, 4mgh:A, 4r7g:A, 1t3t:A, 3ugj:A, 3ujn:A, 3umm:A
21	5iv5:O	526	22	0.1613	0.0190	0.4545	10.0	5iv5:P, 5iv5:Q, 5iv5:l, 5iv5:m, 5iv5:n, 5iv5:AI, 5iv5:AJ, 5iv5:BA, 5iv5:DB, 5iv5:DC, 5iv5:DD, 5iv5:FE, 5iv5:FF, 5iv5:FG, 5iv5:HH, 5iv5:HI, 5iv5:HJ, 1ocy:A

[Back]