Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LPLGPLPPGWEKRTDSNGRVYFVNHNTRITQWEDPRSQGQ

The query sequence (length=40) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5dws:C 40 40 1.0000 1.0000 1.0000 4.08e-25
2 5cq2:A 76 35 0.8750 0.4605 1.0000 4.27e-21 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
3 5cq2:A 76 33 0.4500 0.2368 0.5455 2.56e-06 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
4 1i5h:W 50 36 0.6500 0.5200 0.7222 4.62e-16
5 2lb1:A 35 34 0.5750 0.6571 0.6765 5.59e-13 2ltx:A
6 2kxq:A 90 34 0.6000 0.2667 0.7059 1.70e-12 2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
7 2kxq:A 90 31 0.3750 0.1667 0.4839 1.60e-05 2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
8 2djy:A 42 33 0.5750 0.5476 0.6970 2.20e-12
9 4lcd:A 419 34 0.5500 0.0525 0.6471 3.37e-11 4lcd:B
10 7lp3:A 37 33 0.5000 0.5405 0.6061 1.00e-10 7lp3:C
11 2laj:A 40 31 0.5000 0.5000 0.6452 3.70e-10
12 2jmf:A 43 33 0.5250 0.4884 0.6364 4.57e-10
13 2m3o:W 43 33 0.5000 0.4651 0.6061 1.39e-09 2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
14 2n8t:A 39 33 0.4250 0.4359 0.5152 6.82e-09
15 7lp2:E 37 30 0.4500 0.4865 0.6000 9.46e-09 2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
16 2ltv:A 36 33 0.4000 0.4444 0.4848 1.11e-08 2law:A
17 6jjy:A 128 33 0.4250 0.1328 0.5152 2.70e-08 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
18 6jjy:A 128 33 0.4500 0.1406 0.5455 3.17e-06 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
19 2nc3:A 33 30 0.4500 0.5455 0.6000 3.14e-08 2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
20 8sg2:A 163 31 0.5000 0.1227 0.6452 1.35e-07 6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
21 6jjz:B 96 32 0.4250 0.1771 0.5312 1.94e-07 6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
22 6jjz:B 96 35 0.3750 0.1562 0.4286 0.006 6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
23 1jmq:A 46 32 0.4250 0.3696 0.5312 3.77e-07 1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
24 2ez5:W 46 33 0.4000 0.3478 0.4848 4.50e-07
25 1eg4:A 260 27 0.2500 0.0385 0.3704 0.010
26 2vqd:A 447 22 0.3000 0.0268 0.5455 0.26
27 2oei:A 37 30 0.3250 0.3514 0.4333 0.32 2ho2:A
28 8pxx:A 99 26 0.2250 0.0909 0.3462 0.59 2dyf:A
29 8pxx:A 99 27 0.1750 0.0707 0.2593 3.8 2dyf:A
30 3wqv:A 383 28 0.2500 0.0261 0.3571 0.82 3wqw:A
31 2jup:W 37 27 0.2000 0.2162 0.2963 1.4 2rly:W, 2rm0:W
32 7kct:A 453 24 0.2750 0.0243 0.4583 1.8 7kbl:A, 7kbl:B, 7kc7:A, 7kct:B
33 1dv2:A 450 22 0.2750 0.0244 0.5000 2.6 1dv1:A, 1dv2:B, 3g8c:A, 3g8c:B, 3g8d:B, 2j9g:A, 2j9g:B, 3jzf:B, 3jzi:A, 3jzi:B, 6oi9:A, 6oi9:B, 3rup:A, 3rup:B, 3rv3:A, 3rv3:B, 3rv4:A, 2v58:A, 2v58:B, 2v59:A, 2v59:B, 2v5a:A, 2vr1:A, 2w6m:A, 2w6m:B, 2w6n:A, 2w6n:B, 2w6o:A, 2w6o:C, 2w6p:A, 2w6q:A, 2w6q:B, 2w6z:A, 2w70:A, 2w70:B, 2w71:A, 2w71:C
34 6ojh:A 445 22 0.2750 0.0247 0.5000 2.6 4mv1:A, 4mv3:A, 4mv4:A, 4mv8:A, 6oi8:A
35 4rzq:A 422 22 0.2750 0.0261 0.5000 2.7 4mv6:A, 4mv7:A, 4mv9:A
36 3jzf:A 380 22 0.2750 0.0289 0.5000 2.7
37 1dv1:B 428 22 0.2750 0.0257 0.5000 2.7
38 8hz5:A 350 24 0.2750 0.0314 0.4583 3.6
39 5go9:A 3423 18 0.2250 0.0026 0.5000 3.8 5go9:B, 5go9:C, 5go9:D, 5goa:A, 5goa:B, 5goa:C, 5goa:D
40 6jgz:B 3485 18 0.2250 0.0026 0.5000 3.8 6jg3:A, 6jg3:B, 6jg3:C, 6jg3:D, 6jgz:D, 6jgz:F, 6jgz:H, 6jh6:B, 6jh6:D, 6jh6:F, 6jh6:H, 6jhn:A, 6jhn:C, 6jhn:E, 6jhn:G, 6ji0:A, 6ji0:C, 6ji0:E, 6ji0:G, 6jrr:A, 6jrr:C, 6jrr:E, 6jrr:G
41 6jrs:A 3488 18 0.2250 0.0026 0.5000 3.8 6jrs:D, 6jrs:G, 6jrs:J
42 6jiy:A 3521 18 0.2250 0.0026 0.5000 3.8 6ji8:A, 6ji8:D, 6ji8:G, 6ji8:J, 6jii:B, 6jii:E, 6jii:H, 6jii:K, 6jiu:A, 6jiu:D, 6jiu:G, 6jiu:J, 6jiy:D, 6jiy:G, 6jiy:J, 6jv2:A, 6jv2:C, 6jv2:E, 6jv2:G
43 7vml:A 4044 18 0.2250 0.0022 0.5000 4.1 7aih:UA, 7am2:UA, 7ane:UA, 5dat:l1, 5gak:r, 6hd7:r, 6j3z:19, 6j40:19, 6j40:39, 5mc6:AZ, 6n8k:s, 6n8l:s, 6n8m:S, 6n8n:S, 6n8o:S, 7nrc:Lt, 6o1o:F, 6o1o:G, 6o1o:H, 6qik:p, 6qtz:p, 6ri5:p, 7rr5:L1, 6rzz:p, 6s05:p, 5t62:S, 5t6r:S, 6tnu:BT, 7vml:B, 7vml:C, 7vml:D, 7vmm:A, 7vmm:B, 7vmm:C, 7vmm:D, 7vmn:A, 7vmn:B, 7vmn:C, 7vmn:D, 7vmo:A, 7vmo:B, 7vmo:C, 7vmo:D, 7vmp:A, 7vmp:B, 7vmp:C, 7vmp:D, 7vmq:A, 7vmq:B, 7vmq:C, 7vmq:D, 7vmr:A, 7vmr:B, 7vmr:C, 7vmr:D, 7vms:A, 7vms:B, 7vms:C, 7vms:D
44 8dvv:A 3886 18 0.2250 0.0023 0.5000 4.2 8dvv:B, 8dvv:C, 8dvv:D
45 8uxh:A 4004 18 0.2250 0.0022 0.5000 4.2 8uxh:B, 8uxh:C, 8uxh:D, 8uxi:A, 8uxi:B, 8uxi:C, 8uxi:D
46 7ua3:A 4443 18 0.2250 0.0020 0.5000 4.2 7ua3:B, 7ua3:C, 7ua3:D, 7ua4:A, 7ua4:B, 7ua4:C, 7ua4:D
47 8dtz:A 4061 18 0.2250 0.0022 0.5000 4.2 8dtz:B, 8dtz:C, 8dtz:D
48 8uxl:A 4232 18 0.2250 0.0021 0.5000 4.2 7u9q:A, 7u9q:D, 7u9q:B, 7u9q:C, 7u9r:A, 7u9r:D, 7u9r:B, 7u9r:C, 7u9t:A, 7u9t:D, 7u9t:B, 7u9t:C, 7u9x:A, 7u9x:B, 7u9x:C, 7u9x:D, 7u9z:A, 7u9z:B, 7u9z:C, 7u9z:D, 7ua1:A, 7ua1:B, 7ua1:C, 7ua1:D, 7ua5:A, 7ua5:B, 7ua5:C, 7ua5:D, 7ua9:A, 7ua9:B, 7ua9:C, 7ua9:D, 8uq2:A, 8uq2:B, 8uq2:C, 8uq2:D, 8uq3:A, 8uq3:B, 8uq3:C, 8uq3:D, 8uq4:A, 8uq4:B, 8uq4:C, 8uq4:D, 8uq5:A, 8uq5:B, 8uq5:C, 8uq5:D, 8uxc:A, 8uxc:B, 8uxc:C, 8uxc:D, 8uxe:A, 8uxe:B, 8uxe:C, 8uxe:D, 8uxf:A, 8uxf:B, 8uxf:C, 8uxf:D, 8uxg:A, 8uxg:B, 8uxg:C, 8uxg:D, 8uxl:B, 8uxl:C, 8uxl:D, 8uxm:A, 8uxm:B, 8uxm:C, 8uxm:D
49 5wb2:A 421 15 0.1750 0.0166 0.4667 4.3 7rkm:R, 4xt1:A
50 8dty:A 4004 18 0.2250 0.0022 0.5000 4.3 8dty:B, 8dty:C, 8dty:D
51 6wou:A 3921 18 0.2250 0.0023 0.5000 4.3 6wou:B, 6wou:C, 6wou:D, 6wov:A, 6wov:B, 6wov:C, 6wov:D
52 3b69:A 626 29 0.2500 0.0160 0.3448 4.5 2ah2:A, 1ms0:A, 1ms0:B, 1ms1:A, 1ms1:B, 1ms8:A, 1ms8:B, 1ms9:A, 1ms9:B, 3pjq:A, 1s0i:A, 1s0j:A
53 5l9w:b 649 14 0.1750 0.0108 0.5000 5.3
54 5ofk:A 339 25 0.1750 0.0206 0.2800 6.1 5ofl:A
55 7e8e:D 459 30 0.2000 0.0174 0.2667 6.9 7e87:B, 7e87:A, 7e87:C, 7e87:D, 7e8e:B, 1nn7:A, 7ukg:A, 7ukg:B, 7ukg:C, 7ukg:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218