BioLiP

>protein
LNLDSIIGRLLEVQGKNVQLTENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLKICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFL
GDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFLLRGNHECASINRIYGFYDECKRRYNIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIF
CCHGGLSPDLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKHDLDLICRAHQV
VEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPA

The query sequence (length=289) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6zej:I	351	293	1.0000	0.8234	0.9863	0.0	6alz:A, 6alz:B, 2bcd:A, 2bdx:A, 6czo:A, 6czo:C, 6dno:A, 8dwk:A, 8dwk:B, 8dwl:C, 8dwl:A, 3e7a:A, 3e7a:B, 3e7b:A, 3e7b:B, 3egg:A, 3egg:B, 3egh:A, 3egh:B, 1fjm:A, 1fjm:B, 6g0i:A, 6g0j:A, 4g9j:A, 4g9j:B, 6ghm:A, 6ghm:B, 3hvq:A, 3hvq:B, 1it6:A, 1it6:B, 1jk7:A, 4mov:A, 4mov:B, 4moy:A, 4mp0:C, 4mp0:A, 3n5u:A, 3n5u:B, 7nzm:B, 2o8g:A, 2o8g:B, 6obn:A, 6obn:B, 6obp:A, 6obq:A, 6obq:B, 6obr:A, 6obr:B, 6obs:A, 6obs:B, 6obu:A, 6obu:B, 7qfb:A, 7sd0:C, 8sw5:A, 8sw5:B, 8sw6:A, 8sw6:B, 7t0y:A, 7t0y:C, 7tvf:F, 7tvf:C, 7txh:C, 7txh:F, 1u32:A, 8u5g:A, 7upi:B, 4ut2:A, 4ut2:B, 4ut3:A, 4ut3:B, 4v0u:D, 4v0u:F, 4v0u:H, 4v0u:J, 4v0u:N, 4v0v:A, 4v0v:C, 4v0w:A, 4v0w:C, 4v0x:A, 3v4y:A, 3v4y:C, 3v4y:E, 3v4y:G, 4xpn:A, 4xpn:C, 6zee:P, 6zee:Q, 6zee:B, 6zee:A, 6zee:I, 6zee:K, 6zef:A, 6zef:B, 6zeg:A, 6zeg:B, 6zeh:A, 6zeh:B, 6zei:A, 6zei:B, 6zej:D, 6zej:A, 6zej:F, 6zej:L, 6zej:O, 6zk6:A, 5zqv:A, 5zqv:B, 5zqv:D, 5zqv:C, 5zt0:A, 5zt0:C, 5zt0:B, 5zt0:D, 5zt0:E, 5zt0:F
2	1s70:A	309	293	0.9343	0.8738	0.9215	0.0
3	7qwj:A	298	293	0.8685	0.8423	0.8567	0.0	8a8f:A
4	8pq7:C	289	288	0.8270	0.8270	0.8299	0.0	8pq7:A
5	5jpf:A	290	292	0.6574	0.6552	0.6507	1.60e-138
6	8uwb:C	309	288	0.4844	0.4531	0.4861	3.29e-99	7cun:Q, 3dw8:C, 3dw8:F, 3fga:C, 4i5l:F, 4i5l:C, 4i5n:F, 4i5n:C, 2iae:C, 2iae:F, 2ie3:C, 2ie4:C, 7k36:C, 3k7v:C, 3k7w:C, 4lac:C, 2npp:C, 2npp:F, 6nts:C, 2nyl:C, 2nyl:F, 2nym:C, 2nym:F, 3p71:C, 7pks:q, 8rbx:q, 8rbz:q, 8rc4:q, 8so0:C, 8ttb:C, 8twi:C, 8u1x:C, 8u89:C, 8uwb:F, 5w0w:F, 7ycx:Q
7	5b8i:A	359	275	0.4048	0.3259	0.4255	1.08e-74	6tz7:A
8	6tz6:A	361	275	0.3910	0.3130	0.4109	1.19e-73	6tz6:D
9	6tz8:D	373	275	0.3875	0.3003	0.4073	5.61e-73	6tz8:A
10	7obe:A	480	259	0.3875	0.2333	0.4324	1.19e-70	7obe:B
11	4or9:A	399	259	0.3668	0.2657	0.4093	6.36e-70	4ora:A, 4orc:A
12	4il1:A	529	278	0.3806	0.2079	0.3957	6.81e-69	1aui:A, 1aui:B, 9b9g:H, 9b9g:J, 5c1v:A, 5c1v:B, 4f0z:B, 4il1:B, 4il1:C, 4il1:D, 2jog:A, 3ll8:A, 3ll8:B, 3ll8:C, 3ll8:D, 1m63:A, 1m63:B, 1m63:E, 1m63:F, 1mf8:A, 1mf8:B, 6nuc:A, 6nuc:B, 6nuf:A, 6nuf:B, 6nuu:A, 6nuu:B, 4or9:B, 4ora:B, 4orb:A, 4orb:B, 4orc:B, 2p6b:A, 2p6b:C, 2p6b:B, 2p6b:D, 5sve:A, 5sve:B, 1tco:A, 1tco:B, 6uuq:A
13	1wao:1	471	241	0.3702	0.2272	0.4440	5.99e-66	2bug:A, 8gae:E, 8gft:E, 3h60:A, 3h60:B, 3h61:A, 3h61:D, 3h62:C, 3h62:B, 3h63:A, 3h63:C, 3h64:A, 3h64:D, 3h66:A, 3h66:B, 3h67:A, 3h67:D, 3h68:A, 3h68:D, 3h69:A, 3h69:D, 5hpe:A, 4ja7:A, 4ja9:A, 1s95:A, 1s95:B, 5ui1:A, 5ui1:B, 5ui1:C, 5ui1:D, 1wao:2, 1wao:3, 1wao:4, 5wg8:A, 4zvz:A, 4zvz:B, 4zvz:C, 4zvz:D, 4zx2:A
14	3icf:A	316	271	0.3529	0.3228	0.3764	8.93e-59	3icf:B
15	1g5b:B	221	90	0.1107	0.1448	0.3556	1.10e-04	1g5b:A, 1g5b:C
16	2dfj:A	267	137	0.1453	0.1573	0.3066	6.15e-04	2dfj:B
17	5vjv:A	298	76	0.0934	0.0906	0.3553	0.013	5vjw:A
18	4j6o:A	261	71	0.0830	0.0920	0.3380	0.019	4j6o:B
19	2z72:A	338	144	0.1419	0.1213	0.2847	0.41	1v73:A, 2zbm:A
20	2ex8:A	456	39	0.0519	0.0329	0.3846	1.2	2ex6:A, 2ex9:A, 2exa:A, 2exb:A
21	5hht:B	667	91	0.0865	0.0375	0.2747	2.3	5hht:A, 1qgd:A, 1qgd:B, 2r5n:A, 2r5n:B, 2r8o:A, 2r8o:B, 2r8p:A, 2r8p:B, 6rjc:A, 6rjc:B, 6tj8:A, 6tj8:B, 6tj9:A, 6tj9:B, 8wa7:A, 8wa7:B
22	3a3f:A	453	51	0.0588	0.0375	0.3333	9.2	3a3e:A, 3a3f:B, 3a3i:A, 3a3i:B

[Back]