Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LNIITVTLNMEKYNFLGISIVGGGIYIGSIMKGGAVAADGRIEPGDMLLQVNEINFENMSNDDAVRVLREIVHKPGPITL
TVAKS

The query sequence (length=85) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6zbq:A 89 86 1.0000 0.9551 0.9884 1.19e-55 6zc4:A
2 1l6o:A 95 89 0.9294 0.8316 0.8876 2.59e-50 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
3 2kaw:A 90 90 0.8706 0.8222 0.8222 4.53e-47 6lcb:A, 2mx6:A
4 8bq8:C 93 65 0.3059 0.2796 0.4000 2.65e-10 8bq8:A, 8bq8:B
5 2exg:A 101 91 0.4118 0.3465 0.3846 3.48e-10 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
6 2m0z:A 97 71 0.3176 0.2784 0.3803 5.53e-09 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
7 8bp4:A 93 77 0.3176 0.2903 0.3506 1.05e-08 8bp4:C, 8bp4:B
8 7p73:A 420 64 0.3059 0.0619 0.4062 3.04e-08 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
9 8cn1:H 101 74 0.3176 0.2673 0.3649 4.60e-08 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
10 2ka9:A 189 64 0.2941 0.1323 0.3906 1.48e-07 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
11 2ka9:A 189 74 0.3176 0.1429 0.3649 4.36e-06 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
12 7pc3:A 405 64 0.2824 0.0593 0.3750 2.46e-07 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
13 8bv7:A 95 46 0.2118 0.1895 0.3913 2.27e-06 8buw:A, 8buw:B
14 2koh:A 111 92 0.3647 0.2793 0.3370 2.32e-06 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
15 3jxt:A 96 58 0.2471 0.2188 0.3621 1.30e-05 3jxt:B
16 1b8q:A 127 74 0.2941 0.1969 0.3378 2.10e-05
17 5heb:A 119 58 0.2588 0.1849 0.3793 4.56e-05 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
18 4xh7:A 110 71 0.2824 0.2182 0.3380 8.12e-05
19 4wyu:A 201 70 0.2824 0.1194 0.3429 1.21e-04 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
20 3tsz:A 341 67 0.2235 0.0557 0.2836 1.37e-04 3shw:A
21 7x2e:A 163 59 0.2588 0.1350 0.3729 2.28e-04 2kbs:A
22 6xa7:B 96 64 0.2471 0.2188 0.3281 4.45e-04 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
23 7qqn:C 414 84 0.3059 0.0628 0.3095 5.89e-04 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
24 5zys:A 90 81 0.3059 0.2889 0.3210 7.54e-04
25 8c1t:A 90 64 0.2471 0.2333 0.3281 0.001 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
26 8b82:A 108 77 0.2941 0.2315 0.3247 0.003 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
27 7p70:A 407 59 0.2588 0.0541 0.3729 0.004 7pc4:A, 7qql:A
28 3cyy:B 81 44 0.1882 0.1975 0.3636 0.005 3cyy:A
29 6ar4:B 87 71 0.2353 0.2299 0.2817 0.006 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
30 2qt5:A 194 80 0.2706 0.1186 0.2875 0.007 2qt5:B
31 2qt5:A 194 71 0.2000 0.0876 0.2394 0.60 2qt5:B
32 7qqm:A 413 75 0.2706 0.0557 0.3067 0.008
33 7pc5:A 405 72 0.3059 0.0642 0.3611 0.008
34 5f67:A 98 70 0.2824 0.2449 0.3429 0.009 5f67:B
35 5n7d:A 423 61 0.2000 0.0402 0.2787 0.010 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
36 4xhv:A 94 46 0.1882 0.1702 0.3478 0.014
37 6gbe:A 119 56 0.1882 0.1345 0.2857 0.015
38 2pdz:A 86 70 0.2824 0.2791 0.3429 0.015
39 2kpl:A 129 61 0.2000 0.1318 0.2787 0.020
40 6nid:B 88 59 0.2000 0.1932 0.2881 0.022 6nid:A, 6nid:C
41 2i0i:A 81 46 0.2000 0.2099 0.3696 0.027 2i0i:B, 2i0i:C
42 1n7t:A 103 77 0.2588 0.2136 0.2857 0.030 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
43 2ejy:A 85 56 0.2000 0.2000 0.3036 0.036
44 1n7f:A 86 72 0.2588 0.2558 0.3056 0.042 1n7f:B
45 6kz1:A 97 61 0.2118 0.1856 0.2951 0.065 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
46 2jk8:A 291 39 0.1765 0.0515 0.3846 0.072 5nh2:A
47 7pcb:A 415 44 0.1529 0.0313 0.2955 0.10 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
48 3ch8:A 190 67 0.2353 0.1053 0.2985 0.13 2qbw:A
49 1zub:A 109 78 0.2235 0.1743 0.2436 0.17
50 7qct:A 90 61 0.1765 0.1667 0.2459 0.23 7qct:B
51 4wsi:A 372 47 0.1529 0.0349 0.2766 0.44 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
52 1ihj:B 95 76 0.2353 0.2105 0.2632 0.79 1ihj:A
53 2r4h:C 98 74 0.2118 0.1837 0.2432 0.81
54 6vbg:B 397 32 0.1882 0.0403 0.5000 0.96 6c9w:A, 4oaa:A, 4oaa:B, 6vbg:A, 2y5y:A, 2y5y:B, 4zyr:A, 4zyr:B
55 8sxg:A 366 49 0.2118 0.0492 0.3673 1.4 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
56 6gua:A 821 31 0.1412 0.0146 0.3871 2.4 6gua:B, 6gua:C, 6gua:D, 6gua:E, 6gua:F, 6gua:G, 6gua:H
57 6q0m:B 94 79 0.2235 0.2021 0.2405 3.2
58 3vqg:A 85 41 0.1529 0.1529 0.3171 3.3
59 8blu:B 195 26 0.1294 0.0564 0.4231 4.1 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
60 1u38:A 89 54 0.1765 0.1685 0.2778 4.1
61 7ri3:C 583 62 0.1765 0.0257 0.2419 4.5 7ri3:A, 7ri3:B, 7ri3:D
62 5ocs:A 369 70 0.2471 0.0569 0.3000 4.6 5ocs:C
63 4od5:A 274 17 0.1294 0.0401 0.6471 7.2 4od5:B, 4od5:C, 4od5:D, 4od5:E
64 7yiv:A 484 35 0.1529 0.0269 0.3714 7.5 7yiv:D, 7yiv:C, 7yiv:B, 7yiv:G, 7yiv:H, 7yiv:F, 7yiv:E, 7yiw:A, 7yiw:D, 7yiw:C, 7yiw:B, 7yiw:G, 7yiw:H, 7yiw:F, 7yiw:E, 7yix:A, 7yix:B
65 7re7:H 212 22 0.1176 0.0472 0.4545 8.6

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417