BioLiP

>protein
LGPLPPGWEVRSTVSGRIYFVDHNNRTTQFTDPRL

The query sequence (length=35) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2lb1:A	35	35	1.0000	1.0000	1.0000	4.59e-21	2ltx:A
2	2kxq:A	90	35	0.8571	0.3333	0.8571	1.08e-18	2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
3	2djy:A	42	34	0.8286	0.6905	0.8529	1.37e-18
4	5dws:C	40	34	0.6571	0.5750	0.6765	4.89e-13
5	2jmf:A	43	33	0.6286	0.5116	0.6667	5.63e-12
6	1i5h:W	50	35	0.5714	0.4000	0.5714	6.24e-12
7	5cq2:A	76	33	0.6286	0.2895	0.6667	6.42e-12	5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
8	5cq2:A	76	32	0.6286	0.2895	0.6875	7.91e-10	5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
9	4lcd:A	419	35	0.6571	0.0549	0.6571	2.48e-11	4lcd:B
10	2ltv:A	36	34	0.5429	0.5278	0.5588	6.30e-10	2law:A
11	2m3o:W	43	34	0.5714	0.4651	0.5882	1.90e-09	2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
12	7lp3:A	37	35	0.5714	0.5405	0.5714	2.79e-09	7lp3:C
13	2laj:A	40	32	0.5429	0.4750	0.5938	4.28e-09
14	6jjz:B	96	33	0.5143	0.1875	0.5455	5.23e-09	6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
15	6jjz:B	96	32	0.4571	0.1667	0.5000	0.003	6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
16	6jjy:A	128	32	0.4857	0.1328	0.5312	1.18e-08	6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
17	6jjy:A	128	32	0.4571	0.1250	0.5000	6.82e-05	6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
18	7lp2:E	37	30	0.5143	0.4865	0.6000	3.13e-08	2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
19	2n8t:A	39	32	0.4571	0.4103	0.5000	6.55e-08
20	1jmq:A	46	32	0.4857	0.3696	0.5312	2.86e-07	1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
21	2ez5:W	46	32	0.4286	0.3261	0.4688	2.63e-06
22	2nc3:A	33	30	0.3714	0.3939	0.4333	5.81e-05	2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
23	8sg2:A	163	31	0.4286	0.0920	0.4839	2.84e-04	6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
24	6zj3:SE	265	17	0.2571	0.0340	0.5294	1.9
25	5m11:A	748	14	0.2286	0.0107	0.5714	2.2
26	5dv4:A	344	16	0.2286	0.0233	0.5000	3.0	5dv2:A, 3ngn:A, 3ngo:A, 3ngq:A
27	6kr6:A	713	24	0.3143	0.0154	0.4583	3.6
28	8bao:A	368	16	0.2000	0.0190	0.4375	4.7	8bao:B
29	8pzv:B	369	15	0.2286	0.0217	0.5333	6.6	8pzu:B, 4xga:A
30	5wde:A	320	16	0.2000	0.0219	0.4375	6.7
31	7p7q:0	534	26	0.2000	0.0131	0.2692	7.6	7p7r:0, 7p7s:0, 7p7t:0
32	4bts:AW	259	17	0.2000	0.0270	0.4118	8.8	4bts:BW, 4bts:CW, 4bts:DW, 5jpq:p, 4v5o:AW, 4v5o:BW
33	7y5f:B	341	19	0.2571	0.0264	0.4737	9.2	7vgn:A, 7y5f:A, 7y5i:A, 7y5i:B, 7y5p:A, 7y5p:B, 7yhe:A, 7yhe:B, 7yw9:A
34	5hzt:A	192	18	0.2000	0.0365	0.3889	9.8	5hzt:K

[Back]