Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LFVLTILTLISGTIFYSTVEGLRPIDALYFSVVTLTTVGETPPPQTDFGKIFTILYIFIGIGLVFGFIHKLAVNVQLPSI
LS

The query sequence (length=82) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8ctn:B 96 83 0.9512 0.8125 0.9398 1.19e-45 8cts:B, 8ctu:B, 8cu2:B, 8cu3:B, 8cu4:B, 6dz1:B, 6fiz:C, 6fiz:D, 6fiz:E, 6fiz:G, 6fiz:H, 6fiz:J, 6fiz:L, 6fiz:N, 6fiz:A, 6fiz:O, 6fiz:P, 4r50:B, 4r6z:A, 4r6z:B, 4r7c:C, 4r8c:A, 4ro2:A, 4ro2:B, 4ro2:D
2 2q67:A 104 78 0.8902 0.7019 0.9359 3.08e-43 2q67:B, 2q68:A, 2q68:B, 2q69:A, 2q6a:A, 2q6a:B, 4ro2:C, 6v8y:A
3 7rhg:A 454 42 0.2439 0.0441 0.4762 4.62e-06 7lft:A, 7lft:B, 7lft:C, 7lft:D, 7lfw:A, 7lfw:B, 7lfw:C, 7lfw:D, 7lfx:A, 7lfx:B, 7lfx:C, 7lfx:D, 7lfy:A, 7lfy:B, 7lfy:C, 7lfy:D, 7lg1:A, 7lg1:B, 7lg1:C, 7lg1:D, 7rhg:C, 7rhg:D, 7rhh:A, 7rhh:C, 7rhh:D, 7rhi:A, 7rhi:C, 7rhi:D, 7rhj:A, 7rhj:C, 7rhj:D, 7rhk:C, 7rhk:A, 7rhk:D
4 8etp:C 454 44 0.2439 0.0441 0.4545 1.07e-05 8etp:A, 8etp:B, 8eu3:A, 8eu3:B, 8eu3:C, 8euc:A, 8euc:B, 8euc:C, 8ev8:A, 8ev8:B, 8ev8:C, 8ev9:A, 8ev9:B, 8ev9:C, 8eva:A, 8eva:B, 8eva:C, 8evb:A, 8evb:C, 8evc:A, 8evc:B, 8evc:C
5 8evb:B 432 42 0.2317 0.0440 0.4524 4.38e-05
6 6oly:C 318 63 0.2683 0.0692 0.3492 4.05e-04 2aef:A, 2aef:B, 5bkj:A, 5bkj:C, 5bkj:E, 5bkj:G, 5bkk:A, 5bkk:C, 5bkk:G, 8fz7:A, 8fz7:C, 8fz7:E, 8fz7:G, 3kxd:A, 3kxd:B, 4l73:A, 4l73:B, 4l74:A, 4l74:B, 4l75:A, 4l75:B, 4l75:C, 4l75:D, 4l75:E, 4l75:F, 4l76:A, 4l76:B, 4l76:C, 4l76:D, 4l76:E, 4l76:F, 1lnq:A, 1lnq:B, 1lnq:C, 1lnq:D, 1lnq:E, 1lnq:F, 1lnq:G, 1lnq:H, 6oly:A, 6oly:B, 6oly:D, 3rbx:A, 3rbx:B, 3rbx:C, 3rbx:D, 3rbx:E, 3rbx:F, 6u5n:A, 6u5n:E, 6u5n:B, 6u5n:F, 6u5n:C, 6u5n:G, 6u5n:D, 6u5n:H, 6u5p:A, 6u5p:E, 6u5p:B, 6u5p:F, 6u5p:C, 6u5p:G, 6u5p:D, 6u5p:H, 6u5r:A, 6u5r:B, 6u5r:C, 6u5r:D, 6u5r:E, 6u5r:F, 6u5r:G, 6u5r:H, 6uwn:A, 6uwn:E, 6uwn:B, 6uwn:F, 6uwn:C, 6uwn:G, 6uwn:D, 6uwn:H, 6ux4:A, 6ux4:E, 6ux4:B, 6ux4:F, 6ux4:C, 6ux4:G, 6ux4:D, 6ux4:H
7 5cbf:A 102 54 0.2317 0.1863 0.3519 0.003 5cbf:B, 5cbf:D, 5cbg:A, 5cbg:D, 5cbg:F, 5cbh:A, 5cbh:B, 5cbh:D, 5cbh:E
8 4twk:B 241 53 0.2195 0.0747 0.3396 0.003
9 4twk:B 241 44 0.2195 0.0747 0.4091 0.10
10 3rbz:A 289 62 0.2561 0.0727 0.3387 0.004 3rbz:B, 3rbz:C, 3rbz:D
11 7rhh:B 434 43 0.2317 0.0438 0.4419 0.004 7rhg:B, 7rhi:B, 7rhj:B, 7rhk:B
12 8etp:D 441 42 0.2073 0.0385 0.4048 0.004 8eu3:D, 8euc:D, 8ev8:D, 8ev9:D, 8eva:D, 8evb:D, 8evc:D
13 6rv2:D 261 47 0.1951 0.0613 0.3404 0.010 6rv2:A, 6rv2:B, 6rv2:C, 6rv3:A, 6rv3:B, 6rv3:C, 6rv3:D, 6rv4:A, 6rv4:B, 6rv4:C, 6rv4:D
14 6rv2:D 261 81 0.2561 0.0805 0.2593 9.5 6rv2:A, 6rv2:B, 6rv2:C, 6rv3:A, 6rv3:B, 6rv3:C, 6rv3:D, 6rv4:A, 6rv4:B, 6rv4:C, 6rv4:D
15 7rjt:A 902 48 0.2317 0.0211 0.3958 0.012 7rjt:B, 7rjt:C, 7rjt:D, 7rk6:A, 7rk6:B, 7rk6:C, 7rk6:D, 5tj6:A
16 6cq6:B 282 27 0.1463 0.0426 0.4444 0.025 6cq6:A, 6cq8:A, 6cq8:B, 6cq9:A, 6cq9:B, 4twk:A, 8ue2:A, 8ue2:B, 8ue9:A, 8ue9:B, 8uec:A, 8uec:B, 8uf6:A, 8uf6:B, 6v36:B, 6v37:A, 6v37:B, 6v3i:B, 6w7b:B, 6w7c:A, 6w7c:B, 6w7d:B, 6w7e:B, 6w82:A, 6w82:B, 6w83:A, 6w83:B, 6w84:A, 6w84:B, 6w85:A, 6w85:B, 6w86:A, 6w86:B, 6w87:A, 6w87:B, 6w88:A, 6w88:B, 6w8a:A, 6w8a:B, 6w8c:A, 6w8c:B, 6w8f:A, 6w8f:B
17 6cq6:B 282 43 0.2195 0.0638 0.4186 0.086 6cq6:A, 6cq8:A, 6cq8:B, 6cq9:A, 6cq9:B, 4twk:A, 8ue2:A, 8ue2:B, 8ue9:A, 8ue9:B, 8uec:A, 8uec:B, 8uf6:A, 8uf6:B, 6v36:B, 6v37:A, 6v37:B, 6v3i:B, 6w7b:B, 6w7c:A, 6w7c:B, 6w7d:B, 6w7e:B, 6w82:A, 6w82:B, 6w83:A, 6w83:B, 6w84:A, 6w84:B, 6w85:A, 6w85:B, 6w86:A, 6w86:B, 6w87:A, 6w87:B, 6w88:A, 6w88:B, 6w8a:A, 6w8a:B, 6w8c:A, 6w8c:B, 6w8f:A, 6w8f:B
18 6v3c:B 260 27 0.1463 0.0462 0.4444 0.026 6v36:A, 6v3c:A, 6v3i:A, 6w7b:A, 6w7d:A, 6w7e:A
19 6v3c:B 260 43 0.2195 0.0692 0.4186 0.090 6v36:A, 6v3c:A, 6v3i:A, 6w7b:A, 6w7d:A, 6w7e:A
20 7n15:A 520 46 0.1951 0.0308 0.3478 0.029 5h3o:A, 5h3o:B, 5h3o:C, 5h3o:D, 7n15:B, 7n15:C, 7n15:D, 7n16:D, 7n16:A, 7n16:B, 7n16:C, 7n17:A, 7n17:B, 7n17:C, 7n17:D, 6wej:A, 6wej:B, 6wej:C, 6wej:D, 6wek:A, 6wek:B, 6wek:C, 6wek:D, 6wel:A, 6wel:B, 6wel:C, 6wel:D
21 8qz3:B 266 44 0.2439 0.0752 0.4545 0.054 4bw5:A, 4bw5:B, 4bw5:D, 8qz2:A, 8qz2:B, 8qz3:A, 8qz4:A, 8qz4:B, 4xdj:A, 4xdj:B, 4xdj:D, 4xdk:A, 4xdk:B, 4xdl:A, 4xdl:B, 4xdl:D
22 8qz3:B 266 43 0.2195 0.0677 0.4186 0.11 4bw5:A, 4bw5:B, 4bw5:D, 8qz2:A, 8qz2:B, 8qz3:A, 8qz4:A, 8qz4:B, 4xdj:A, 4xdj:B, 4xdj:D, 4xdk:A, 4xdk:B, 4xdl:A, 4xdl:B, 4xdl:D
23 8qz1:A 242 44 0.2439 0.0826 0.4545 0.064 4bw5:C, 8qz1:B, 4xdj:C, 4xdk:C, 4xdk:D, 4xdl:C
24 8qz1:A 242 43 0.2195 0.0744 0.4186 0.11 4bw5:C, 8qz1:B, 4xdj:C, 4xdk:C, 4xdk:D, 4xdl:C
25 7yid:A 660 37 0.1585 0.0197 0.3514 0.098 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
26 2wll:B 266 50 0.2439 0.0752 0.4000 0.14
27 8zyq:A 166 39 0.1951 0.0964 0.4103 0.18
28 8de8:B 276 44 0.2073 0.0616 0.3864 0.19 8de7:B, 8de7:A, 8de8:A, 8de9:A, 8de9:B
29 8de8:B 276 27 0.1220 0.0362 0.3704 0.44 8de7:B, 8de7:A, 8de8:A, 8de9:A, 8de9:B
30 3um7:A 259 70 0.2317 0.0734 0.2714 0.26 4i9w:A, 7lj4:A, 7lj5:A, 7lja:A, 7ljb:A, 4rue:A, 4rue:B, 4ruf:A, 4ruf:B, 3um7:B, 4wfe:A, 4wff:A, 4wfg:A, 4wfh:A
31 3um7:A 259 36 0.1707 0.0541 0.3889 1.7 4i9w:A, 7lj4:A, 7lj5:A, 7lja:A, 7ljb:A, 4rue:A, 4rue:B, 4ruf:A, 4ruf:B, 3um7:B, 4wfe:A, 4wff:A, 4wfg:A, 4wfh:A
32 8zyo:A 210 39 0.1951 0.0762 0.4103 0.27 8zyo:B, 8zyo:D, 8zyp:A, 8zyp:C, 8zyp:D, 8zyq:B, 8zyq:C, 8zyq:D
33 8x43:A 327 39 0.1707 0.0428 0.3590 0.29 8j00:A, 8j00:B, 8j00:C, 8j00:D, 8x43:G, 8x43:C, 8x43:E
34 7cr7:A 354 39 0.1707 0.0395 0.3590 0.29 7cr1:A, 7cr1:B, 7cr1:C, 7cr1:D, 7cr2:B, 7cr2:C, 7cr2:D, 7cr2:A, 7cr4:A, 7cr4:B, 7cr4:D, 7cr4:F, 7cr7:G, 7cr7:B, 7cr7:D, 8ijk:A, 8ijk:C, 8ijk:B, 8ijk:D, 8izy:A, 8izy:B, 8izy:D, 8izy:C, 8j01:G, 8j01:A, 8j01:B, 8j01:D, 8j02:G, 8j02:A, 8j02:B, 8j02:D, 8j03:A, 8j03:D, 8j03:G, 8j03:I, 8j04:A, 8j04:G, 8j04:B, 8j04:D, 8w4u:A, 8w4u:B, 8w4u:D, 8w4u:G
35 7e8e:D 459 59 0.2317 0.0414 0.3220 0.97 7e87:B, 7e87:A, 7e87:C, 7e87:D, 7e8e:B, 1nn7:A, 7ukg:A, 7ukg:B, 7ukg:C, 7ukg:D
36 7ryr:A 389 65 0.2561 0.0540 0.3231 1.4 7ru0:A, 7ru0:B, 7ru0:C, 7ru0:D, 7ryr:C, 7ryr:D, 7ryr:B, 7rys:A, 7rys:B, 7rys:C, 7rys:D
37 3ukm:A 252 37 0.1951 0.0635 0.4324 1.6 3ukm:B, 3ukm:C, 3ukm:D
38 8vt9:A 406 65 0.2561 0.0517 0.3231 1.6 6cjq:A, 6cjq:B, 6cjq:C, 6cjq:D, 6cjt:A, 6cjt:B, 6cjt:C, 6cjt:D, 6cju:A, 6cju:B, 6cju:C, 6cju:D, 4d7s:A, 4d7s:B, 4d7t:A, 7rsh:A, 7rsh:B, 7rsh:C, 7rsh:D, 7rtf:A, 7rtf:B, 7rtf:C, 7rtf:D, 7rtj:A, 7rtj:B, 7rtj:C, 7rtj:D, 7tj5:A, 7tj5:B, 7tj5:C, 7tj5:D, 7tj6:A, 7tj6:B, 7tj6:C, 7tj6:D, 7tkt:A, 7tkt:B, 7tkt:C, 7tkt:D, 8vt9:D, 8vt9:B, 8vt9:C, 8vta:A, 8vta:B, 8vta:C, 8vta:D, 8vtb:A, 8vtb:B, 8vtb:C, 8vtb:D, 6vxz:A, 6vxz:B, 6vxz:C, 6vxz:D
39 7vnr:A 333 39 0.1463 0.0360 0.3077 3.1 7vnr:C, 7vnr:E, 7vnr:G
40 7byl:A 354 39 0.1463 0.0339 0.3077 3.6 7byl:C, 7byl:E, 7byl:G, 7bym:A, 7bym:C, 7bym:E, 7bym:G, 7byn:A, 7byn:C, 7byn:E, 7byn:G, 7vnp:A, 7vnp:C, 7vnp:G, 7vnp:E, 7vnq:A, 7vnq:C, 7vnq:E, 7vnq:G
41 1cs1:D 384 57 0.1829 0.0391 0.2632 5.7
42 6v1x:A 446 47 0.1951 0.0359 0.3404 6.1 6v1x:B, 6v1x:C, 6v1x:D, 6v1y:A, 6v1y:B, 6v1y:C, 6v1y:D, 6v1y:M, 6v1y:N, 6v1y:O, 6v1y:P
43 8k1j:B 242 72 0.2439 0.0826 0.2778 6.2 8k1j:A, 8k1q:A, 8k1q:B, 8k1v:A, 8k1v:B, 8k1z:A, 8k1z:B
44 8odt:C 230 42 0.1707 0.0609 0.3333 8.1 8odt:D, 8odt:E, 8odt:A, 8odt:B
45 7xnk:A 348 26 0.1707 0.0402 0.5385 8.5 7tci:A, 7tci:G, 7tci:E, 7tci:C, 4umo:A, 6v01:A, 6v01:J, 6v01:D, 6v01:G, 7xnk:C, 7xnk:E, 7xnk:G, 7xnl:A, 7xnl:C, 7xnl:E, 7xnl:G, 7xnn:B, 7xnn:G, 7xnn:C, 7xnn:E

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417