Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LFCPICGFTCRQKGNLLRHINLHTGEKLFKYHL

The query sequence (length=33) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8tnq:C 35 33 1.0000 0.9429 1.0000 4.68e-19 8tnp:C, 8tnr:C
2 8dey:C 57 28 0.5758 0.3333 0.6786 1.03e-06 8dey:F
3 8dey:C 57 22 0.2424 0.1404 0.3636 0.32 8dey:F
4 2ma7:A 73 28 0.5758 0.2603 0.6786 1.82e-06
5 2m9a:A 89 31 0.4242 0.1573 0.4516 2.86e-05
6 6h0f:C 32 23 0.4545 0.4688 0.6522 3.00e-04 6h0f:F, 6h0f:I, 6h0f:L
7 7w1m:H 322 31 0.4242 0.0435 0.4516 3.11e-04 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
8 7w1m:H 322 27 0.3333 0.0342 0.4074 0.009 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
9 7w1m:H 322 28 0.3333 0.0342 0.3929 0.072 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
10 7w1m:H 322 28 0.3030 0.0311 0.3571 0.072 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
11 7w1m:H 322 29 0.3939 0.0404 0.4483 4.1 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
12 1mey:F 84 28 0.4242 0.1667 0.5000 3.55e-04 1mey:C
13 1mey:F 84 28 0.3939 0.1548 0.4643 0.001 1mey:C
14 2i13:B 144 28 0.4242 0.0972 0.5000 0.001
15 2i13:B 144 27 0.3939 0.0903 0.4815 0.005
16 2i13:B 144 28 0.3636 0.0833 0.4286 0.047
17 2i13:B 144 28 0.3939 0.0903 0.4643 0.069
18 2i13:A 151 28 0.4242 0.0927 0.5000 0.001
19 2i13:A 151 27 0.3939 0.0861 0.4815 0.005
20 2i13:A 151 28 0.3939 0.0861 0.4643 0.017
21 2i13:A 151 28 0.3939 0.0861 0.4643 0.066
22 6h0g:C 30 24 0.4242 0.4667 0.5833 0.002 6h0g:F
23 2epu:A 45 25 0.4242 0.3111 0.5600 0.002
24 2d9h:A 78 24 0.4242 0.1795 0.5833 0.003
25 8e3e:F 121 28 0.4242 0.1157 0.5000 0.004 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
26 2lce:A 64 28 0.3939 0.2031 0.4643 0.008
27 2lce:A 64 27 0.3333 0.1719 0.4074 0.12
28 2emh:A 46 26 0.3333 0.2391 0.4231 0.010
29 2elq:A 36 25 0.3333 0.3056 0.4400 0.010 2rv2:A
30 2yrj:A 46 25 0.3939 0.2826 0.5200 0.021
31 2ytb:A 42 24 0.3636 0.2857 0.5000 0.034
32 5v3g:D 170 27 0.4242 0.0824 0.5185 0.046 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
33 5v3g:D 170 27 0.4242 0.0824 0.5185 0.046 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
34 5v3g:D 170 27 0.3939 0.0765 0.4815 0.28 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
35 5v3g:D 170 27 0.3939 0.0765 0.4815 0.33 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
36 5v3g:D 170 27 0.3636 0.0706 0.4444 4.1 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
37 2rsj:A 92 26 0.3636 0.1304 0.4615 0.056 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
38 2rsj:A 92 19 0.3030 0.1087 0.5263 3.2 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
39 2rsi:A 92 26 0.3636 0.1304 0.4615 0.058 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
40 2rsi:A 92 19 0.3030 0.1087 0.5263 4.1 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
41 2yrh:A 44 27 0.3939 0.2955 0.4815 0.075
42 2ept:A 41 23 0.3636 0.2927 0.5217 0.080
43 1g2d:C 89 30 0.4242 0.1573 0.4667 0.082 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
44 1g2d:C 89 27 0.3939 0.1461 0.4815 1.4 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
45 8gn3:B 60 29 0.3333 0.1833 0.3793 0.083 8gn3:A, 8gn4:A
46 7ysf:A 113 28 0.3333 0.0973 0.3929 0.085
47 7ysf:A 113 28 0.3030 0.0885 0.3571 0.11
48 2rpc:A 155 27 0.3939 0.0839 0.4815 0.15 2ej4:A
49 2rpc:A 155 27 0.3939 0.0839 0.4815 2.4 2ej4:A
50 2em3:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 0.17
51 2yts:A 46 26 0.3939 0.2826 0.5000 0.17
52 1f2i:G 66 30 0.3636 0.1818 0.4000 0.17 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
53 6ml4:A 143 27 0.3636 0.0839 0.4444 0.18 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
54 6ml4:A 143 25 0.3030 0.0699 0.4000 3.3 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
55 6ml4:A 143 27 0.3636 0.0839 0.4444 4.9 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
56 5wjq:D 281 28 0.3939 0.0463 0.4643 0.19 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
57 5wjq:D 281 28 0.3939 0.0463 0.4643 0.47 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
58 5wjq:D 281 28 0.3333 0.0391 0.3929 1.0 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
59 5wjq:D 281 28 0.3636 0.0427 0.4286 1.7 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
60 1yui:A 54 20 0.3333 0.2037 0.5500 0.21 1yuj:A
61 2em2:A 46 25 0.3636 0.2609 0.4800 0.21
62 2eq2:A 46 25 0.3636 0.2609 0.4800 0.23 2ytr:A
63 2enf:A 46 25 0.3636 0.2609 0.4800 0.23 2yti:A, 2ytn:A, 2yu8:A
64 2kmk:A 82 28 0.3636 0.1463 0.4286 0.23
65 2kmk:A 82 23 0.3030 0.1220 0.4348 1.3
66 2cot:A 77 28 0.3333 0.1429 0.3929 0.26
67 1p47:A 87 30 0.3636 0.1379 0.4000 0.29 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
68 1p47:A 87 27 0.3636 0.1379 0.4444 1.7 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
69 2ep3:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 0.32
70 2em6:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 0.33
71 7txc:E 84 27 0.3636 0.1429 0.4444 0.37
72 2eon:A 46 25 0.2727 0.1957 0.3600 0.45
73 5wak:B 196 31 0.3636 0.0612 0.3871 0.56
74 7kso:C 420 31 0.3636 0.0286 0.3871 0.60 6nq3:F
75 6nq3:B 291 31 0.3636 0.0412 0.3871 0.60
76 2en4:A 46 25 0.3636 0.2609 0.4800 0.61
77 2yta:A 41 23 0.3333 0.2683 0.4783 0.63
78 2emk:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 0.66
79 8tb9:D 443 31 0.3636 0.0271 0.3871 0.67 6c23:A, 6c23:Q, 6c24:A, 6c24:Q, 5wai:B, 5wai:F
80 2emm:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 0.68
81 2lvr:A 30 14 0.2727 0.3000 0.6429 0.68
82 2epq:A 45 24 0.2424 0.1778 0.3333 0.68
83 2ene:A 46 25 0.3636 0.2609 0.4800 0.76
84 2eq0:A 46 25 0.3636 0.2609 0.4800 0.80
85 2eme:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 0.82
86 2ytg:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 0.92
87 2epa:A 72 26 0.3636 0.1667 0.4615 0.94
88 2en6:A 46 25 0.3939 0.2826 0.5200 0.97
89 2eom:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 1.0
90 2dmd:A 96 28 0.2424 0.0833 0.2857 1.1
91 2dmd:A 96 28 0.3333 0.1146 0.3929 2.8
92 2dmd:A 96 24 0.2727 0.0938 0.3750 2.9
93 2eq1:A 46 25 0.3636 0.2609 0.4800 1.1
94 2em9:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 1.1
95 2ena:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 1.1
96 2emg:A 46 27 0.3333 0.2391 0.4074 1.3
97 2lv2:A 85 28 0.3030 0.1176 0.3571 1.3
98 1llm:C 87 27 0.3636 0.1379 0.4444 1.4 1llm:D
99 2rsh:A 37 19 0.3030 0.2703 0.5263 1.4 2ruv:A
100 2emw:A 44 26 0.3636 0.2727 0.4615 1.4
101 8tho:A 100 21 0.2424 0.0800 0.3810 1.5 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
102 8tho:A 100 31 0.3636 0.1200 0.3871 4.0 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
103 1x6e:A 72 28 0.3333 0.1528 0.3929 1.5
104 6wmi:A 146 24 0.3636 0.0822 0.5000 1.5 6wmi:D
105 1ubd:C 114 28 0.3636 0.1053 0.4286 1.6
106 2yt9:A 95 24 0.2424 0.0842 0.3333 1.6
107 2yt9:A 95 29 0.3636 0.1263 0.4138 5.6
108 3qjj:A 243 26 0.3333 0.0453 0.4231 1.6 3qjj:B, 3qjl:A, 3qjl:B, 3qjp:A
109 2csh:A 110 28 0.3030 0.0909 0.3571 1.9
110 6pv0:A 31 24 0.3333 0.3548 0.4583 2.0 6pv1:A, 6pv2:A, 6pv3:A, 1sp2:A, 6uco:A, 6ucp:A, 1va2:A
111 6rm3:SN0 147 23 0.3333 0.0748 0.4783 2.1
112 2emf:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 2.2
113 5yj3:C 70 29 0.3333 0.1571 0.3793 2.3 5yj3:D
114 2elr:A 36 25 0.3030 0.2778 0.4000 2.4 2rv3:A
115 5fql:A 507 32 0.3333 0.0217 0.3438 2.5 6ioz:A
116 2en7:A 44 25 0.3333 0.2500 0.4400 2.8
117 5ms0:F 181 23 0.3333 0.0608 0.4783 2.8 6c6u:N, 8e3f:F, 8e5k:F, 8e5o:F, 8e6x:F, 8e6z:F, 8g31:u, 8g34:u, 6gov:G, 7py0:G, 7py1:G, 7py5:G, 7py8:G, 6tqn:G, 6tqo:G, 6vu3:AB, 6vyq:AB, 6vyr:AB, 6vys:AB, 6vyt:AB, 6vyu:AB, 6vyw:AB, 6vyx:AB, 6vyy:AB, 6vyz:AB, 6vz2:AB, 6vz3:AB, 6vz5:AB, 6vz7:AB, 6x6t:AB, 6x7f:AB, 6x7k:AB, 6x9q:AB, 6xdq:AB, 6xdr:AB, 6xgf:AB, 6xii:AB, 6xij:AB, 6z9p:G, 6z9q:G, 6z9r:G, 6ztj:CF, 6ztl:CF, 6ztn:CF
118 4m9v:C 60 25 0.3333 0.1833 0.4400 3.1 4gzn:C, 4m9v:F
119 2epr:A 48 29 0.3636 0.2500 0.4138 3.3
120 2eq4:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 3.3
121 4is1:D 54 28 0.3636 0.2222 0.4286 3.5 4f2j:C, 4is1:C, 3uk3:C, 3uk3:D
122 5ke9:A 88 24 0.3030 0.1136 0.4167 4.1 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
123 1bbo:A 57 18 0.2424 0.1404 0.4444 4.1 3znf:A, 4znf:A
124 2nab:A 41 28 0.3030 0.2439 0.3571 4.3
125 2dlq:A 124 28 0.3333 0.0887 0.3929 4.6
126 2ytq:A 46 25 0.3030 0.2174 0.4000 4.7 2eog:A
127 2ee8:A 106 28 0.3333 0.1038 0.3929 4.8
128 5oj5:A 310 20 0.3030 0.0323 0.5000 5.0 5ojr:A, 5ojr:B
129 7y3l:A 57 27 0.3636 0.2105 0.4444 5.2
130 7y3l:A 57 21 0.3030 0.1754 0.4762 9.0
131 3k13:C 287 26 0.2727 0.0314 0.3462 5.3 3k13:A, 3k13:B
132 6skg:Bo 43 19 0.2424 0.1860 0.4211 5.3
133 2en1:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 5.4 2yth:A
134 2ytf:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 5.6 2eof:A
135 2ema:A 46 25 0.3030 0.2174 0.4000 5.8
136 2en9:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 6.0
137 3pun:A 302 25 0.3333 0.0364 0.4400 6.3 3pun:B, 3pvd:A, 3pvd:B
138 2ep0:A 46 25 0.3030 0.2174 0.4000 6.4
139 7mu2:C 316 23 0.2424 0.0253 0.3478 6.7 7f69:A, 7mu2:A
140 2emi:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 6.8 2ytp:A
141 2lvh:A 45 18 0.2727 0.2000 0.5000 6.8
142 8uux:B 515 27 0.3333 0.0214 0.4074 7.0 6c6q:A, 6c6q:B, 6e47:A, 6e47:B, 6e48:A, 6e48:B, 6h6l:A, 6h6l:B, 6h6l:C, 6h6l:D, 6h6m:A, 6h6m:B, 6h6m:C, 6h6m:D, 6p4j:A, 6p4j:B, 6p4j:C, 6p4k:A, 6p4k:B, 6p4k:C, 8uux:A, 8uv3:A, 8uv3:C, 6xw6:A, 6xw6:B, 6xw7:A, 6xw7:B, 6xw7:E, 6xw7:F
143 2ysp:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 7.2
144 2ytj:A 46 26 0.2727 0.1957 0.3462 7.3
145 2em8:A 46 26 0.3333 0.2391 0.4231 7.4
146 2eoq:A 46 25 0.3333 0.2391 0.4400 7.5
147 2eow:A 46 25 0.3030 0.2174 0.4000 8.8
148 2ebt:A 100 27 0.3030 0.1000 0.3704 9.6
149 2eos:A 42 24 0.3030 0.2381 0.4167 9.9
150 2emj:A 46 25 0.3030 0.2174 0.4000 10.0

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218